5.12: אגוניסטים כולינרגיים הפועלים באופן לא ישיר: כימיה ויחסי מבנה-פעילות

אגוניסטים כולינרגיים הפועלים בעקיפין הם חומרים המקיימים אינטראקציה עם האנזים אצטילכולין אסטראז בשסע הסינפטי, ומונעים את פירוק אצטילכולין לכולין ואצטט. כתוצאה מכך, ריכוז אצטילכולין בשסע הסינפטי עולה. אגוניסטים אלה יכולים להיות מסווגים למעכבים הפיכים ובלתי הפיכים בהתבסס על משך הפעולה שלהם. מעכבים הפיכים מציגים משכי פעולה קצרים עד בינוניים. חומרים קצרי טווח כוללים אלכוהולים פשוטים עם קבוצות אמוניום רבעוני, כגון אדרופוניום. חומרים בעלי פעולה בינונית הם בעלי משכי פעולה בינוניים והם אסטרים של חומצה קרבמית המכילים קבוצות אמוניום שלישוניות או רבעוניות. לפיזוסטיגמין, קרבמט טבעי, יש קבוצת אמין שלישונית, ואילו לנאוסטיגמין, אסטר קרבמי סינתטי, יש קבוצת אמוניום רבעונית.

מעכבים בלתי הפיכים הם נגזרות של חומצה זרחתית עם מספר תחליפים, כאשר מרכיב אחד משמש כקבוצה שפתיים. אכותיאופאט, למשל, מורכב משתי קבוצות אלקוקסי וקבוצה אחת של תיוכולין לאבילי. באופן דומה, סארין, גז עצבים רעיל, מכיל קבוצת אלקוקסי אחת, קבוצת אלקיל אחת וקבוצת הלוגן לאבילי.