1. Transgenesis: הכנת ה-DNA
- סמן דומיננטי שיתוף הזרקה: pRL3 [PPA-PRL-1 (tu92)]
הפלסמיד pRL3 הוא סמן דומיננטי שיתוף הזרקה עבור חזותית זיהוי אירועים טרנספורמציה מוצלחת. פלסמיד זה מקודד עבור אלל מוטנט דומיננטי (tu92) של הגן PPA-PRL-1 קשור קשר הדוק הגן sqt 1-קולגן ב C. elegans והופך תנועה סינוסי wildtype לתוך תנועות סיבוב עם כיוון השעון לאורך הגוף של התולעת ציר 1,5. החיה הפכה דומה מאוד סמן הבחירה הפופולרית השלטת רול-6 (su1006) המשמשים ג elegans במשך 20 השנים האחרונות. - כתב יעד transgene: PPA-EGL-4P: GFP
הגן של עניין יכול להיות מקושר transcriptionally או translationally ל-GFP קידוד רצף 9. במחקר זה, PPA-EGL-4promoter: GFP (EGL-4, חלבון קינאז תלוי cGMP) היה להשתמשד כדי לקבוע אם קטע 2 קילו במעלה הזרם של תחילת התרגום יכול להעניק ביטוי של GFP ב P. פקיפיקוס PS312. זה וקטור GFP מכיל באזור ה-GFP עם קידוד שונה
אינטרונים ואת תכליתי PPA-RPL-23 UTR 3 "שליחות קטלנית 5 מספקים בנדיבותם ידי Xiaoyue וואנג ראלף ג'זומר (מכון מקס פלנק, Tuebingen, גרמניה, האיחוד האירופי). - הדנ"א הגנומי: PS312
תוספת של wildtype פ פקיפיקוס הדנ"א הגנומי PS312 נדרש לקבל ירושה transgene יציבה, במיוחד מהונדס F 1 חיות לצאצאים 2 ו 5. זה עדיין לא בטוח אם הדנ"א הגנומי צורות מורכבות מערכים כרומוזומלית נוספת עם שני transgenes (הסמן שיתוף הזרקת PRL-3 ו-PPA EGL-4P:: כתב ה-GFP) דומים לאלה שנצפו יציב 2 קווים F מהונדס ב ג elegans 3. עם זאת, הדרישה לקבל את הדנ"א הגנומי ו transgenes לשתף cohesi זההיש המסוכך מצביעים היווצרות חוץ כרומוזומלית מערכים מורכבים התאים לארח יכול לזהות להעברת DNA תקין (gDNA מוכן באמצעות סיגמא G1N10 קיט). - ה-DNA העיכול
אנזימי הגבלה משמשים linearize PPA-EGL-4P:: DNA-GFP וקטור לייצר המסוכך דביק תואם שיתוף הזרקת סמן pRL3 ו PS312 gDNA. מערבבים על ידי לחיצה, לא vortexing. דגירה למשך שעה אחת ב 37 ° C.
| pRL3 | 4 מיקרוגרם |
| 10xbuffer | 10 μl |
| PstI (10 U / μl) | 4 μl |
| DH 2 O | ~ |
| סך הכל: | 100 μL |
| PPA-EGL-4P: GFP | 4 מיקרוגרם |
| 10x חיץ | 10 μl |
| סאלי (10 U / μl) | 4 μl |
| DH 2 O | ~ |
| סך הכל: | 100 μl |
| gDNA PS312 | 10 מיקרוגרם |
| 10x חיץ | 10 μl |
| Pst אני וסאל אני (10 U / μl) | 8 μl |
| DH 2 O | ~ |
| סך הכל: | 100 μl |
טבלה 1. תערובת של אנזים הגבלה דייג'סט.
- ה-DNA המשקעים הכנה
- הוסף נתרן אצטט 01:10 (3 מ 3 NaCOOCH pH 5.2) ונפח 2.5x של אתנול 100% על המוצר את מעוכל; להוסיף 20 ng / μl של גליקוגן לראות גלולה קלה יותר.
- צנטריפוגה 14,000 סל"ד במשך 15 דקות 4 ° C.
- למזוג supernatant ידי tipping לאט את צינור צנטריפוגות הפוך ולאחר מכן הקשה על זה על ממחטת נייר, ולוודא כי גלולה הינו מאובטח בפינה התחתונה של הצינור חופשי של אתנול.
- הוסף 1 מ"ל של אתנול 75%.
- מיד ספין בסל"ד 14,000 במשך 5 דקות ב 4 ° C.
- למזוג supernatant ידי לאט מפנה את הצינור צנטריפוגות הפוך ולאחר מכן הקשה על הנייר רקמה לוודא כי גלולה זה מאובטח בפינה התחתונה של הצינור חופשי של אתנול.
- יבש גלולה בצנטריפוגה ואקום ב 14,000 סל"ד במשך 5 דקות על 25-30 מעלות צלזיוס, עד יבש ונקי לחלוטין של אתנול.
- הוסף 30 μl של TE או סטרילי DH 2 O ולהשאיר לילה בשעה 4 ° C לפני זמן קצר ערבוב עם מערבולת.
- לוח 2 מתאר כיצד ליצור את התערובת זריקה מ-DNA כל מטוהרים להזרקה.
- חנות ב -20 ° C. לאחר ההפשרה את התערובת להזרקה, ספין למטה התחתית 14,000 סל"ד במשך 5 דקות כדי להיפטר חלקיקי פסולת שעלוליםלהדביק את מחט הזריקה.
| חומר גנטי | ריכוז |
| PPA-EGL-4P: GFP (סאלי) | > 5 ng / μl (0.1-10ng/μl) |
| pRL3 (PstI) | > 1 ng / μl |
| gDNA PS312 (PstI + סאלי) | > 60 ng / μl |
| DH 2 O | ~ |
| סך הכל: | 30 μl |
2. טבלה PPA-PRL-1 הזרקת תערובת
2. התערבות RNA: ב סינתזת RNA במבחנה כפולה תקועים
- השתמש ב-PCR כדי להגביר את הגן של עניין. RHL091 5'-agtggatccGAAGGTCCATACGGGAGC-3 "(אתר BamHI) ו RHL092 5'-tatctgcagGTGAGGAGTACCAGGAGAG-3" (אתר PstI) שימשו כדי להגביר Frag 464 נ"ב גנומיתment (עמדה 3-466) של וקטור pRL3 המכיל את האלל PPA-PRL-1 (tu92).
- תקציר המוצר PCR עם BamHI ו PstI.
- ולקשור שבר את BamHI / PstI מתעכל pL4440 RNAi האכלה וקטור 2.
- המרה וקטור מוכנס לתוך תאים המוסמכת ולגדל אותם על צלחות אמפיצילין LB מדיה (50 מיקרוגרם / מ"ל).
- בחר את וקטור מוכנס בהצלחה על ידי PCR בעזרת פריימרים T7.
- השתמש T7 מוקף מוצר PCR המכיל את PRL-1 הגן לעשות פעמיים תקועים RNA dsRNA) באמצעות BLOCK-IT RNAi סינתזה הערכה (Invitrogen).
- ריכוז dsRNA היא הטובה ביותר אם> 200 ng / μl, עד 1 מיקרוגרם / μl להזרקה.
- חנות ב -20 ° C. לאחר ההפשרה את התערובת להזרקה, ספין למטה התחתית 14,000 סל"ד במשך 5 דקות כדי להיפטר של חלקיקי פסולת שעלולים לסתום את המזרק.
3. Microinjection: פרוטוקול הזרקת transgenes ו / או dsRNA
- הזרקת מחטים
- הגדר את המחט Narishige חולץ (מודל #: PC-10) טמפרטורה:
- הפעל את הכפתור התחתון "מחמם מס '2".
- הפעל את "Adj מחמם מס '2". הידית עד פאנל קורא 55.0-60.0 מעלות צלזיוס במשך חוד המחט של קוני באורכים שונים.
- סובבו את כפתור בתחתית בחזרה "שלב 1" (מושך מחט בצעד אחד).
- טען מחט לתוך החדר כדי לוודא שהיא מאובטחת.
- לחצו על כפתור "התחל" (כפתור אדום) ולאפשר מחט להיות משך כל משקולות (זה צריך לעשות שתי מחטים זהים בכיוונים מנוגדים).
- הסר מחט מן החדר ולאחסן בצלחת תרבות פלסטיק במקום מאובטח על ידי פלסטלינה כדי למנוע אבק המצטבר על המחטים.
- הרכבה רפידות
- בתוך צינור 1.5 צנטריפוגות מ"ל, להפוך את פתרון 2% אגר נובל על ידי הוספת 0.02 גרם של אגר נובל ל 1 מ"ל של H 2 O. אגר ניתן לאחסן 4 מעלות צלזיוס למשך עד שנה.
- מערבבים ביסודיותלהמיס אגר בתוך גוש חום מוגדר כ> 88 ° C.
- שימוש 1 מ"ל micropipette, במקום ירידה של אגר נוזלי נובל 2% עד אמצע השקופית זכוכית (פישר, 12-544-F).
- שטחו ידי הצבת אחר שקופית זכוכית על גבי הירידה.
- חזור על "שלב Drop" עד שיש שכבה של שקופית חמש זכוכית.
- הסר כל שקופית זכוכית ידי הזזה מזכוכית שקופיות אחד את השני.
- לרדד משטח יבש אגר בשקופיות זכוכית בתנור ואקום ב 70 מעלות צלזיוס למשך 4 שעות עד לילה (או בטמפרטורת החדר למשך הלילה).
- הפוך את רפידות הזרקת מרובים לאחסן לשימוש עתידי.
- Microinjection לתוך בלוטות המין hermaphroditic

באיור 1. ציור סכמטי של פ האנטומיה פקיפיקוס. התאים בעלי הגרעין ברורים בתאי הנבט הנשי (ביציות) ואת החלק מוצל אפור הוא המעי. רק אחד שחלה קדמית דיסטלי מוצגאבל לשים לב לשני בלוטות המין דיסטלי לחצות אחד את השני dorsally ליד אמצע הגוף.

באיור 2. תמונות של microinjection. (א) קצה מחט הזריקה היא להתמקד עם הקו השמאלי של היצירה נימי שלף. על ידי נוגעות קלות את קצה המחט אל קצה, קצה מחט צריך לשבור תוך שמירה על נקודה חדה. (ב) מחדיר מחט אל תוך החלק העליון שחלה בדיוק מעל עקמומיות המעיים עבור הזריקה הראשונה. (ג) מחדיר מחט לתוך התחתון בלוטת המין ממש מתחת עקמומיות המעיים להזרקה השנייה.
- ודא כי בניגוד וקביעת DIC הגז הוא אידיאלי עבור הצגת בלוטות המין אנדרוגינוס.
- טען 1.0-2.0 μl של תערובת זריקה לתוך המחט נימי שלף.
- מניחים את המחט המניפולטור microinjection, מודד לחץ מיכל חנקן יש להגדיר תנאים אידיאליים (10-20 psiעבור 0.5-1 שניות).
- שוברים את קצה המחט על ידי נגיעה בו מעט קצה צינור נימי דק משך להציב בשקופית (תמונה 2A).
- מחט שקופיות מפסק: החלק הדק של נימי משך דגש על שקופיות זכוכית טיפה של שמן
- לאחר מחט שבורה זה יכול להיות מקום בעמדת המתנה תוך כדי לקטוף תולעת שלך לרפד את (פ 'פקיפיקוס יש חלון 5 דקות לפני שהם הזרקת יבש החוצה למות).
- בעזרת צלחת מלאה J4 צעירים תולעים בוגרות, לשפוך שמן פרפין מספיק (כבד), רק כדי לכסות את כל התולעים הדשא OP50 חיידקי.
- פיק תולעת ולמקם אותו על משטח הזריקה.
- מניחים את השקף זכוכית עם התולעת על המיקרוסקופ, עמדה בלוטת המין של התולעת לכיוון של המחט ואת הפות מן המחט (תרשים 2B, 2C).
- מנמיכים את מחט אל המיקום של התצוגה מיקרוסקופ.
- מקם את בלוטת המין העליון את המחט המטוס מוקד זהה (תרשים 2B).
- נקבו את התולעת בעדינות בתערובת משאבת הזרקה, ooctyes הפרדת לקראת קצה דיסטלי מצביעים על זריקה מוצלחת (כדי למטב transgene או מסירה dsRNA, אתה צריך לראות על זריקה גל של התרחבות אשך אשר ממשיך עד שהוא קרוב דיסטלי טיפ).
- שנה את מיקום המחט להזריק אל בלוטת המין התחתון הזרקה חוזרת, אולם מאז שחלה זה תחת במעיים הפצת ביציות לא יראו ועל כן קשה יותר להשיג (איור 2C).
- תולעת מחפש רגיל מצביע על זריקה מוצלחת לאחר ההזרקה, לא צריכה להיות שום נזק בלוטות המין (בולטות החוצה מן הנרתיק או קפץ בתוך חלל הגוף).
- מניחים את המחט בחזרה בעמדה סרק.
- הכן כדי להציל את התולעת.
- הוסף ירידה (0.5 μl) של חיץ M9 על כרית שבו תולעת מוזרק ממוקם.
- באמצעות כמה OP50 חיידקים על להרים שלך, למגע עם תולעת OP50, והוא צריך להישאר. Wהדואר לא להשתמש פיפטה בפה.
- מניחים את התולעת לצלחת seeded עם 50 נקודות μl של OP50, 2-4 תולעים יכולים להינצל על הצלחות כאלה.
- לאחר הזרקת אחסון ועבודה הקרנת עבור Transgenesis
- חנות מוזרק תולעים (P 0) על 20 מעלות צלזיוס למשך 4 ימים ~ להטיל ביצים לגדול F 1.
- מסך תולעים ביום הרביעי של פנוטיפ שנבחר (למסך לחיפוש transgenesis, לבעלי חיים מתגלגל המבטא את PPA-PRL-1 סמן דומיננטי).
- פיק יחיד עצמאית F 1 "חיות ים עם פנוטיפ הנצפה לצלחת seeded חדשים בחנות של 25 ° C, הטמפרטורה הזו מעודדת היווצרות של שורות יציב מ 1 נ 's.
- F סינגל 2 מתוך עצמאית F-1 שורות. הפרט F 2 קווי תמסורת דומה יש שיעורי transgene. לעתים קרובות אנו להשיג> 15 F 2 שורות לכל בעל חיים טרנספורמציה 1 F.
- חנות הדורות הבאים של 25 ° C.
- קצב שידור של הגלילים בדרך כלל נשאר קבוע אחרי דור ה-F 4, ולכן יש צורך בשלב זה לקבוע את רמת הביטוי של transgene היעד (PPA-EGL-4P: GFP) עבור כל קו הפרט. ביטוי של GFP לא יכול לתאם עם היקף של פנוטיפ penetrance ההרים דומיננטי.
- לאחר הזרקת אחסון ועבודה הקרנת עבור פנוטיפים RNAi
- חנות מוזרק תולעים (P 0) על 20 מעלות צלזיוס למשך 4 ימים ~ להניח ולגדול F 1.
- מסך F 1 תולעים ביום הרביעי של פנוטיפ שנבחר (למסך עבור פנוטיפ מציאה RNAi, לחפש פנוטיפים penetrant כי עשויה להיות קשורה לאובדן פעילות הגן היעד, במקרה שלנו אובדן של פנוטיפ PPA-PRL-1).
- מניסיוננו, פנוטיפ הלא רולר מציאה הוא איבד 97%> של ה-F 2.
4. נציג תוצאות:
p "> 1. תוצאת Transgenesis
| מושב | הזריקו P 0 | F 1 רולרס | מהונדס% F 2 | % ממוצע לאחר שידור F 2 |
| 1 | 60 | 2 | (קו 1) 0% (שורה 2) 13% | NA 13% ± 10 |
| 2 | 40 | 1 * | (שורה 3) 0% | NA |
| 3 | 40 | 0 | 0% | NA |
| 4 | 40 | 1 | (שורה 4) 0% | NA |
| 5 | 20 | 0 | 0% | NA |
| 6 | 40 | 1 | (קו 5) 26% | 22% ± 10 |
"תוכן> * הרים זכר שלא לחצות; NA: לא ישים
. לוח 3 תוצאות PS312 הזריקו PPA-EGL-4P: GFP (סאל אני מעוכל), pRL3 (גלגלת) (PST אני מעוכל), ו gDNA PS312 (PstI ואת סאלי מעוכל).

איור 3 (א) wildtype (B, C) יציב F 4 pRL3; PPA-EGL-4P:.: GFP קו מהונדס מראה ראש עצב ביטוי של GFP.
2. תוצאת התערבות RNA

איור 4. RNA מוזרק PRL-1 מוטנטים להראות מציאה שלם של תנועה "מתגלגלת". (א) PRL-1 מכבש רווח של פונקציית מוטציה tu92. (ב) "הפיל" PRL-1 התערוכה מוטציה נורמלי wildtype יציבה תנועה. (ג) הזריקה PRL-1 (למטה) יש גם ב יותרody מאשר PRL-1 מוטציה (למעלה). (ד) גוף ארוך יותר מוזרק PRL-1 (למטה) הוא גם ארוך יותר PS312 wildtype (למעלה). פנוטיפ הגוף כבר נצפתה גם את רול-5 (sqt-1) מציאה RNAi של C. elegans N2 (מידע לא מוצג).
| גליל | אי - רול |
| PRL-1 dsRNA (200 ng / μl) | 13 | 21 |
| ב PRL-1 dsRNA (1000 ng / μl) | 9 | 16 |
| שליטה | 20 | 2 |
לוח 4. סיכום PPA-PRL-1 dsRNA זריקות. (א) [dsRNA] = 200 ng / μl; (ב) [dsRNA] = 1000 ng / μl. P = 0.0019 לבין 0.041 ידי בדיקה מדוקדקת של פישר, שני זנב, עבור 200 ו 1000 זריקות ng / μl, בהתאמה.