מיזוג מיטוכונדריאלי ממלא תפקיד חיוני בהומיאוסטזיס של סידן מיטוכונדריאלי, בביואנרגטיקה, באוטופגיה ובבקרת איכות. המיזוג נמדד בתאים חיים באמצעות המרה פוטו-כימית של GFP הניתן להפעלה פוטו-כימית המכוון למטריקס (mtPAGFP) בתת-אוכלוסייה של מיטוכונדריה. הקצב שבו המולקולות שהומרו פוטו-כימית מגיעות לשיווי משקל בכלל אוכלוסיית המיטוכונדריה משמש כמדד לפעילות המיזוג. עד כה, המדידות בוצעו בגישת time lapse של תא בודד, המכמתת את שיווי המשקל בתא אחד לאורך שעה. כאן, אנו מגדילים ומסרטגים שיטה קודמת שפורסמה לתאים חיים, המבוססת על שימוש ב-mtPAGFP ובריכוז נמוך של TMRE (15 nm). שיטה זו כוללת הפעלה פוטו-כימית של חלק קטן מהרשת המיטוכונדריאלית, איסוף סדרות (stacks) ברזולוציה גבוהה של חתכים קונפוקאליים בכל 15 דקות למשך שעה, וכימות השינוי בעוצמת האות. בהתאם למספר גורמים, כגון קלות מציאת תאים המבטאים PAGFP והאות של האזורים שהופעלו פוטו-כימית, ניתן לאסוף כ-10 תאים בתוך מרווחי הזמן של 15 דקות. הדבר מספק שיפור משמעותי ביעילות הזמן של בדיקה זו, תוך שמירה על כימות תת-תאי ברזולוציה גבוהה וכן על הפרמטרים הקינטיים הדרושים כדי ללכוד את פרטי ההתנהגות המיטוכונדריאלית בסביבתה הציטוארכיטקטונית הטבעית.
דינמיקה מיטוכונדריאלית ממלאת תפקיד בתהליכים תאיים רבים, כולל נשימה, ויסות סידן ואפופטוזה1,2,3,13. מבנה הרשת המיטוכונדריאלית משפיע על תפקוד המיטוכונדריה ועל האופן שבו הן מקימות אינטראקציה עם שאר התא. רשתות מיטוכונדריאליות, העוברות תהליכי חלוקה ומיזוג מתמידים, מקבלות צורות שונות הנעות בין רשתות ממוזגות מאוד לרשתות מפוfragmented יותר. באופן מעניין, מחלת אלצהיימר, מחלת פרקינסון, Charcot Marie Tooth 2A ואטרופיה אופטית דומיננטית נמצאו במתאם עם מורפולוגיה מיטוכונדריאלית משובשת, ובייחוד רשתות מפוfragmented4,10,13. לעיתים קרובות, בעקבות הפיצול (fragmentation), המיטוכונדריה הופכות לדה-פולריזיות, וצבירה של תופעה זו מובילה לפגיעה בתפקוד התא18. הוכח כי פיצול מיטוכונדריאלי (fission) מהווה אות המדרבן את התא להתקדם לעבר אפופטוזה. הוא יכול גם לספק מנגנון להפרדת מיטוכונדריה דה-פולריות ולא פעילות כדי לשמור על חוסנה של מרבית הרשת14. מנגד, מיזוג (fusion) של מיטוכונדריה מוביל לשיתוף של חלבוני מטריקס, מומסים, mtDNA והמדרג האלקטרוכימי, ונראה כי הוא מונע התקדמות לאפופטוזה9. השפעתם של פיצול ומיזוג מיטוכונדריה על ההומאוסטזיס התאי ובסופו של דבר על תפקוד האורגניזם דורשת הבנה מעמיקה יותר, ולכן נדרשים פיתוח ואופטימיזציה מתמשכים של הדרכים לאיסוף מידע על תופעות אלו.
בדיקות קיימות של היתוך מיטוכונדריאלי חשפו תובנות שונות לגבי פיזיולוגיה מיטוכונדריאלית, כאשר לכל אחת מהן יש יתרונות משלה. בדיקת היתוך היברידית המבוססת על PEG7 מערבבת שתי אוכלוסיות של תאים המסומנים באופן שונה (mtRFP ו-mtYFP), ומנתחת את כמות הערבוב והקו-לוקליזציה של פלואורופורים בתאים מותכים ורב-גרעיניים. למרות ששיטה זו סיפקה מידע בעל ערך, לא כל סוגי התאים מסוגלים להתמזג, והתנאים שבהם מוגבר ההיתוך כוללים שימוש בתרופות רעילות שעשויות להשפיע על תהליך ההיתוך הנורמלי. לאחרונה פותחה טכניקה נטולת-תאים, המשתמשת במיטוכונדריה מבודדות כדי לצפות באירועי היתוך על בסיס בדיקת לוסיפראז1,5. שניים מקווי תאים אנושיים מסומנים עם החלק הקצבי האמינו או הקרבוקסילי של Renilla luciferase, יחד עם leucine zipper להבטחת דימריזציה בעת הערבוב. מיטוכונדריה מבודדות מכל קו תאים וממוזגות. תגובת ההיתוך יכולה להתרחש ללא ציטוזול בתנאים פיזיולוגיים בנוכחות אנרגיה, טמפרטורה מתאימה ופוטנציאל ממבנה מיטוכונדריאלי פנימי. באופן מעניין, נמצא כי הציטוזול מווסת את מידת ההיתוך, מה שמעיד על כך שסיגנל תאי דרוש לוויסות תהליך ההיתוך 4,5. בדיקה זו תהיה שימושית מאוד לסריקה בthroughput גבוה לזיהוי רכיבים במנגנון ההיתוך וכן תרכובות פרמקולוגיות שעשויות להשפיע על דינמיקה מיטוכונדריאלית. עם זאת, יהיה צורך בבדיקות מיטוכונדריאליות מפורטות יותר של התא השלם כדי להשלים בדיקה זו in vitro ולצפות באירועים אלה בתוך סביבה תאית.
טכניקה לניטור דינמיקה מיטוכונדריאלית בתאים שלמים נמצאת בשימוש כבר תקופה מסוימת והיא מבוססת על GFP המכוון למיטוכונדריה וניתן להפעלה פוטו-כימית (mtPAGFP)6,11. עם ביטוי של mtPAGFP, חלק קטן מרשת המיטוכונדריה עובר הפעלה פוטו-כימית (10-20%), והתפשטות האות לשאר רשת המיטוכונדריה נרשמת מדי 15 דקות למשך שעה באמצעות דימות קונפוקאלי בשיטת time lapse. כל אירוע מיזוג מוביל לדילול של עוצמת האות, מה שמאפשר כימות של קצב המיזוג. למרות שמיזוג וביקוע מתרחשים ללא הרף בתאים, טכניקה זו מנטרת רק מיזוג, שכן ביקוע אינו מוביל לדילול של אות ה-PAGFP6. סימון משותף ברמות נמוכות של TMRE (במינון של 7-15 nM בתאי INS1) מאפשר כימות של פוטנציאל הממברנה של המיטוכונדריה. כאשר מיטוכונדריה נמצאות במצב של היפר-פולריזציה הן קולטות יותר TMRE, וכאשר הן עוברות דפולריזציה הן מאבדות את צבע ה-TMRE. מיטוכונדריה שעברו דפולריזציה אינן בעלות פוטנציאל ממברנה מספיק ונוטות לא להתמזג ביעילות, אם בכלל. לכן, ניתן לעקוב אחר מיטוכונדריה הממזגות באופן פעיל באמצעות רמות נמוכות אלו של TMRE9,15. הצטברות של מיטוכונדריה שעברו דפולריזציה וחסרות אות TMRE עשויה להוות סימן לפוטוטוקסיות או למוות תאי. ריכוזים גבוהים יותר של TMRE הופכים את המיטוכונדריה לרגישות מאוד לאור לייזר, ולכן יש לנקוט משנה זהירות כדי להימנע מסימון יתר ב-TMRE. אם השפעת הדפולריזציה של המיטוכונדריה היא נושא העניין, ניתן להשתמש בטכניקה המעסיקה רמות מעט גבוהות יותר של TMRE ואור לייזר אינטנסיבי יותר כדי לגרום לדפולריזציה של מיטוכונדריה באופן מבוקר (Mitra and Lippincott-Schwartz, 2010). כדי להבטיח שרעילות עקב TMRE אינה מהווה בעיה, אנו מציעים לחשוף תאים טעונים (3-15 nM TMRE) לפרמטרי הדימות שבהם ייעשה שימוש במערך (אולי 7 ערימות של 6 חתכים אופטיים ברצף), ולהעריך את בריאות התאים לאחר שעתיים. אם המיטוכונדריה נראות מפוצלות מדי ותאים מתים, ניתן להשתמש במסמנים מיטוכונדריאליים אחרים, כגון dsRED או Mitotracker red, במקום TMRE.
שיטת ה-mtPAGFP חשפה פרטים על התנהגות הרשת המיטוכונדריאלית שלא ניתן היה להדגים בשיטות אחרות. לדוגמה, ידוע כעת כי איחוי מיטוכונדריאלי יכול להיות מלא או חולף, כאשר תכולת המטריקס יכולה להתערבב ללא שינוי במורפולוגיה הכללית של הרשת. בנוסף, ידוע כי ההסתברות לאיחוי אינה תלויה במשך המגע ובממדי האורגנלה, ומושפעת מניידות האורגנלה, מפוטנציאל הממברנה ומהיסטוריה של פעילות איחוי קודמת8,15,16,17.
בכתב יד זה, אנו מתארים מתודולוגיה להרחבה (scaling up) של הפרוטוקול שפורסם בעבר המשתמש ב-mtPAGFP וב-15nM TMRE8, במטרה לבחון מספר תאים בו-זמנית ולשפר את יעילות הזמן של איסוף הנתונים מבלי להקריב את הרזולוציה התת-תאית. דבר זה התאפשר הודות לשימוש בבמה אוטומטית של מיקרוסקופ ובתוכנה ניתנת לתכנות לרכישת תמונות. תוכנת Zen מבית Zeiss מאפשרת למשתמש לסמן ולעקוב אחר מספר תאים ייעודיים המבטאים mtPAGFP. ניתן להפעיל פוטו-אקטיבציה בכל אחד מהתאים הללו באזור עניין (region of interest) מסוים, ולנטר ערימות של חתכים קונפוקאליים עבור אות mtPAGFP וכן עבור TMRE במרווחי זמן מוגדרים. ניתן להשתמש במערכות קונפוקאליות אחרות לביצוע פרוטוקול זה, בתנאי שקיימת במה אוטומטית ניתנת לתכנות, אינקובטור עם CO2, ואמצעי להפעלת פוטו-אקטיבציה של ה-PAGFP; לזרן מולטי-פוטוני או ללייזר דיודה של 405 nm.