שתואר כאן הוא פרוטוקול להדמיה חצי אוטומטית של הקרינה רקמות ספציפיות בעוברי דג הזברה.
מאמר שיטה
שתואר כאן הוא פרוטוקול להדמיה חצי אוטומטית של הקרינה רקמות ספציפיות בעוברי דג הזברה.
עוברי דג הזברה הם כלי רב עוצמה להקרנה בקנה מידה גדולה של מולקולות קטנות. דג הזברה מהונדס המבטאים את חלבוני כתב ניאון משמש לעתים קרובות כדי לזהות כימיקלים המווסתים את ביטוי הגנים. מסכי כימיים שassay הקרינה בדג הזברה לחיות לעתים קרובות מסתמכים על ציוד יקר, מיוחד להקרנת תוכן גבוה. אנו מתארים הליך באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence רגיל עם במה ממונעת באופן אוטומטי לעוברי דג הזברה תמונה ולזהות הקרינה רקמות ספציפיות. שימוש בדג זברה מהונדס שלדווח על פעילות קולטן אסטרוגן דרך ביטוי של ה-GFP, פיתחנו הליך חצי אוטומטי למסך לligands קולטן אסטרוגן המפעיל את הכתב באופן רקמות ספציפיות. בסרטון זה אנו מתארים נהלים לעריכת עוברי דג הזברה ב24-48 שעות שלאחר הפריה (hpf) בצלחת 96 היטב והוספת מולקולות קטנות אשר נקלטות קולטני אסטרוגן. ב72-96 hpf, תמונות של כל אחד גם מכל הצלחת באופן אוטומטי שנאספו ונבדקה באופן ידני לקרינת רקמות ספציפיות. פרוטוקול זה מדגים את היכולת לזהות אסטרוגנים המפעילים קולטנים במסתמי לב, אך לא בכבד.
דג הזברה מהונדס פותחו המאפשרת הדמיה הישירה של פעילות במסלולי איתות, כגון צמיחת פיברובלסטים גורמי 1, חומצה רטינואית 2 ואסטרוגנים 3, בעוברים בשידור חי. כלים אלה מאפשרים הקרנה של כימיקלים שיוצרים הפרעת מסלולי איתות (assayed כשינוי בעוצמת הקרינה) או לכימיקלים המווסתים איתות באופן רקמות ספציפיות (שינוי בלוקליזציה הקרינה) 4. לכידת תמונה אוטומטית מגדילה את התפוקה של מסכי כימיים באופן דרמטי 5,6. מסכים שהקרינה באופן אוטומטי assay בדג הזברה לחיות לעתים קרובות מסתמכת על ציוד יקר, מיוחד. מה שנקרא גבוה הקרנת תוכן מספקת את היתרון של רזולוציה גבוהה, הדמיה כמותית אך במחיר של שימוש בקוראי צלחת מיוחדים מצוידים למיקרוסקופיה confocal 7,8. מטרתה של שיטה זו היא באופן אוטומטי הקרינה רקמות ספציפיות assay בעוברי דג הזברהבצלחת 96 היטב באמצעות מיקרוסקופ epifluorescence סטנדרטי. הקרינה רקמות ספציפיות ניתן להבחין באמצעות טכניקה זו ועלולה להיות גישה סבירה למעבדות שאין גישה לקוראי צלחת מיוחדות או ציוד גבוה הקרנת תוכן.
בפרוטוקול זה, אנו משתמשים בהדמיה אוטומטית כדי לזהות קולט רקמות ספציפיות אסטרוגן (ER) אגוניסטים בדג הזברה לחיות ב3 ימים לאחר הפריה (DPF). הקו המהונדס Tg (5xERE: GFP) c262/c262 מכיל 5 רצפי טנדם תגובת אסטרוגן אלמנט ה-DNA (ERE) במעלה הזרם של חלבון פלואורסצנטי ירוק (GFP) 3. בהעדר ליגנד, מיונים הם בדרך כלל לא פעילים. ליגנד מחייב מעורר שינוי קונפורמציה, המאפשר הקולטנים להיקשר ERE-DNA ולווסת את השעתוק 9. 5xERE: ניתן להשתמש בדגים GFP למסך ספריות כימיות למאפנני ER ויכולים לשמש מסך דגימות מים סביבתיים למזהמים אסטרוגניים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: פרוטוקול זה אושר על ידי אוניברסיטת אלבמה בועדת טיפול בבעלי חיים ושימוש המוסדית ברמינגהאם.
1. רבייה דג הזברה ואוספי ביצה
2. טיפול הכימי של עוברים
3. אוטומטית הדמיה של עוברים בצלחות 96 היטב
4. לכידת תמונה ידנית של עוברים בצלחת 96 היטב
הערה: כדי לאשר את התוצאות, השתמש מטרת 20x מרחק עבודה ארוכה לacמקהלת תמונות מפורטות יותר באופן ידני (איור 2).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
איור 1 מציג תמונות מרוכבים מבארות בודדות של צלחת 96 היטב. כל תמונה מורכבת מורכבת מ59 תמונות בודדות עם 5% חפיפה תמונה. שים לב שדג הזברה לחיות מכוונים באופן אקראי בתוך כל טוב, אך אנו מסוגלים להבחין הקרינה בלב מהכבד. תמונות brightfield שימושיות כמו אזכור להעריך נטייה דג הזברה ולדמיין מומים מורפולוגיים (איורים 1 א ו 1 ג). הדמיה אוטומטית באמצעות מטרת 10x משמשת לסינון כימיקלים ולקבוע איזו מתחייב הערכה ידנית בהגדלה גבוהה יותר. איור 2 מרא...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מתאר שיטה פשוטה לאוטומטי הקרינה רקמות ספציפיות תמונה בעוברי דג הזברה. הפרוטוקול פותח באמצעות Zeiss Axio אובזרוור. Z1 עם תוכנת זן 2011 כחול, עם זאת הטכניקה יכולה להיות מותאם באמצעות כל מיקרוסקופ הפוכה עם במה ממונעת ותוכנת שליטת מיקרוסקופ שיכול לבצע ריצוף כדי ליצור תמונות מורכבות. הצטיידות מיקרוסקופ הפוכה עם במה ממונעת יכולה לספק אלטרנטיבה מעשית, פחות יקרה לרכישת ציוד מיוחד לסינון גבוה תוכן. שלבים ממונעים נעים בין כמה אלף לעשרות אלפי דולרים בארה"ב, בהתאם לסוג והדגם ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
יש המחברים אין אינטרסים כלכליים מתחרים.
אנו מודים לסוזן פארמר ואת צוות של מתקן מחקר דג הזברה UAB לטיפול בדג זברה. מימון הניתן על ידי קופות הזנק מהמחלקה לפרמקולוגיה וטוקסיקולוגיה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| פיפטות העברת פלסטיק; פיפטות העברה מפלסטיק רחבות פישר | 13-711-23 | ||
| פיפטות העברת פלסטיק; קצה עדין | פישר | 13-711-26 | |
| 96 בארות, צלחות תחתונות עגולות ושטוחות | פישר | 21-377-203 | |
| צלחות 100 x 35 מ"מ | פישר | 08-757-100D | |
| 35 x 60 מ"מ צלחות | פישר | 08-757-100B | |
| Dumont #5 מלקחיים עדינים | Fine Science Tools | 11254-20 | מידות קצה 0.05 x 0.01 מ"מ, להסרה ידנית של כוריון מעוברים |
| Tricaine methanesulfonate | Sigma Aldrich | A5040-25G | ראה ספר דג הזברה למתכון (http://zfin.org/zf_info/zfbook/chapt10.html#wptohtml63) |
| 1-פניל 2-תיאוריאה (PTU) | סיגמא אולדריץ' | P7629-10G | הכן מלאי של 20 מ"מ (פי 100) והשתמש ב-200 μ M ב-E3B |
| פרוטוקול Zeiss Axio Observer Z1 | Carl Zeiss | דורש מיקרוסקופ פלואורסצנטי הפוך עם שלב ממונע | |
| 20x מטרת מרחק עבודה | ארוך Carl Zeiss | אנו משתמשים במטרה עם מרחק עבודה של 0.4 NA ו-8.4 מ"מ | |
| מצלמה דיגיטלית Axiocam HRm Carl | Zeiss | ||
| ZenBlue 2011 תוכנת בקרת מיקרוסקופ | Carl Zeiss | הפרוטוקול דורש תוכנת אוטומציה ובקרה של מיקרוסקופיה כדי לאפשר לכידת תמונות מרוצפות באמצעות שלב ממונע | |
| מתילן כחול | סיגמא אולדריץ' | MB-1; 25 גרם | מייצרים תמיסה של 2% במי RO לשימוש ב-E3B (להלן) |
| E3B | 60X E3 תמיסה: NaCl - 17.2 גרם KCl - 0.76 גרם CaCl2-2H2O - 2.9 גרם MgSO4-7H2O - 4.9 גרם או MgSO4 - 2.39 גרם ממיסים ב-1 ליטר מים Milli-Q; יש לאחסן בבקבוק סטרילי של 1 ליטר.תמיסת 1X E3B לדגי זברה: 60X E3 150 מ"ל 2% מתילן כחול 100 μ l מביאים ל-9 ליטר עם Milli-Q מים |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה