הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.

מאמר שיטה

ניתוח "מטען מיפוי" המאפיין את ההרכב מולקולרי מוטורס על העברת axonal מטענים שימוש

9.3K צפיות

DOI:

10.3791/52029

30 באוקטובר 2014

* These authors contributed equally

במאמר זה

סיכום

הובלה תוך-תאית של מטענים, כגון שלפוחיות או אברונים, מתבצעת על ידי חלבונים מוטוריים מולקולריים העוקבים אחר מיקרו-צינורות מקוטבים. פרוטוקול זה מתאר את המתאם בין כיווניות ההובלה של חלקיקי מטען בודדים הנעים בתוך נוירונים, לכמות היחסית והסוג של חלבונים מוטוריים קשורים.

תקציר

הבנת המנגנונים שבאמצעותם מנועים מולקולריים לתאם את פעילותם להובלת מטענים בּוּעִי בתוך הנוירונים דורשת ניתוח כמותי של עמותות מנוע / מטען ברמת השלפוחית ​​אחת. מטרת פרוטוקול זה היא להשתמש במיקרוסקופ פלואורסצנטי כמותי כדי לתאם ("המפה") העמדה והכיווניות של תנועת מטענים בשידור חי לסכומי ההרכב ויחסיים של מנועים הקשורים לאותו מטען. "מיפוי מטענים" מורכב מהדמית חיה של מטענים שכותרתו fluorescently נעו באקסונים בתרבית על מכשירי microfluidic, ואחריו קיבעון כימי בזמן ההקלטה של ​​תנועה חיות, ומכתים immunofluorescence שלאחר מכן (IF) של אותו האזורים axonal המדויקים עם נוגדנים כנגד מנועים. Colocalization בין מטענים ומנועים הקשורים בם נבחנים על ידי הקצאת עמדה תת פיקסלים קואורדינטות ערוצי מנוע ומטען, על ידי פונקציות גאוס הולמים לעקיפה-ליפונקציות נקודת התפשטות mited מייצגות מקורות נקודות ניאון פרט. תמונות מטען ומנוע קבועים לאחר מכן הן על גבי לחלקות של תנועת מטענים, ל" המפה "אותם למסלולים במעקב שלהם. כוחו של פרוטוקול זה הוא השילוב של חיה ואם הנתונים לרשום גם את הובלת מטענים בּוּעִי בתאים חיים ולקבוע את מנועים הקשורים למדויקת אותו שלפוחית ​​אלה. טכניקה זו מתגברת על אתגרים קודמים שמשתמשים בשיטות ביוכימיות כדי לקבוע את הרכב המנוע הממוצע של אוכלוסיות שלפוחית ​​תפזורת מטוהרות הטרוגנית, שיטות אלה לא חושפות יצירות על מטענים מרגשים אחד. יתר על כן, פרוטוקול זה יכול להיות מותאם לניתוח של מסלולי תחבורה ו / או סחר אחרים בסוגי תאים אחרים, כדי לקשר בין התנועה של מבנים תאיים בודדים עם הרכב החלבון שלהם. מגבלות של פרוטוקול זה הן התפוקה נמוכה יחסית בשל יעילות transfection הנמוכה של תרביתנוירונים עיקרי ושדה מוגבל של תצוגה זמינה עבור הדמיה ברזולוציה גבוהה. יישומים עתידיים יכולים לכלול את שיטות כדי להגדיל את מספר תאי העצב להביע מטענים שכותרתו fluorescently.

מבוא

תחבורה תאית היא קריטית בכל סוגי התאים לאספקת חלבונים, ממברנות, האברונים, ומולקולות איתות לתחומים תאיים שונים 1. נוירונים הם מאוד מיוחדים תאים עם תחזיות ארוכות, מקוטבות שהאנושות תלויה בתחבורה תאית של מטענים חיוניים למסירה למרחקים ארוכים שלהם לmicrodomains axonal השונים. תחבורה זה מתווכת על ידי kinesins וdyneins - שתי משפחות גדולות של חלבוני מנוע מולקולריים - לאגד את זה למטענים ולעקוב אחר לאורך microtubules המקוטב בכיוונים אנטרוגרדית ומדרדר, בהתאמה. בעוד שתנועת מדרדר בעיקר בתיווכו של dynein, תנועה בכיוון אנטרוגרדית היא הקלה על ידי משפחה גדולה, פונקציונלי מגוונת של מנועים kinesin. כתוצאה מכך, תחבורת האנטרוגרד מטעני axon....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

כל הניסויים שנערכו בעקבות פרוטוקולים שאושרו ובהתאם להנחיות מוסדיות לטיפול האנושי בבעלי חיים במחקר. עכברי ילוד היו מורדמים על ידי עריפת ראש.

1. הכנה של המכשירים microfluidic תרבות תאים

  1. הכן siloxane polydimethyl (PDMS) מכשירי microfluidic לגדילה של נוירונים בהיפוקמפוס כפי שתואר על ידי האריס ועמיתי 17-19. להלן כמה שינויים שהותאמו לפרוטוקול מיפוי מטען.
    הערה: המכשירים microfluidic גם זמינים מסחרי (חומרי רשימה), ובכך גישה למתקן ייצור אינה הכרחית.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

איור 1 מציג סקירה כללית של מכשיר microfluidic משמשת לגידול תאי עצב בהיפוקמפוס (איור 1 א, ב '). נוירונים הם מצופים במאגר 1. הגודל של microchannels מונע דיפוזיה של גופי תא (סומה) לתוך תא axonal ואילו האורך של הערוצים מונע תחזיות דנדריטים לחצות את כל הדרך לתא axonal. לאחר ~ 2-3 ימים בתרבות, תאי עצב מתחילים הארכת האקסונים שלהם על פני microchannels לתוך תא axonal (איור 1 ב, ג). האקסונים transfected לבטא חלבון פריון הנורמלי שכותרתו עם ח.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

הפרוטוקול המובא כאן מאפשר המתאם של כיווניות של תנועה של חלקיקי מטען נע פרט ניאון מבוסס microtubule עם הסוג היחסי וכמות חלבוני מנוע הקשורים בתאי עצב חיים. בעבר, הרכב המנוע הכולל של מטעני לפוחי axonal היה assayed על אוכלוסיות הטרוגניות של שלפוחית ​​ואברונים 9,15 מטוהרים מבחינה ביוכימית. עם זאת, הרכב מנוע אפיון לסוג אחד של מטען בתוך תאים היה מאתגר בגלל הקושי בטיהור אוכלוסיות שלפוחית ​​הומוגנית. יתר על כן, בעוד שמדידות של דוכן-כוחות מנוע הציגו אומ.......

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

למחברים אין מה לחשוף.

תודות

אנו מודים ל-Ge Yang, Gaudenz Danuser, Khuloud Jaqaman ו-Daniel Whisler על הסיוע בהתאמה ובפיתוח של התוכנה לכימות ניתוחי מיפוי מטענים, ולאמילי נידרסט על העזרה בייצור המכשירים המיקרופלואידיים. עבודה זו נתמכה בחלקה על ידי מענק NIH-NIA AG032180 ל-L.S.B.G., והמכון הרפואי הווארד יוז. L.S. נתמך בחלקו על ידי מענק הכשרה בביואינפורמטיקה של NIH T32 GM008806, S.E.E. נתמך על ידי מלגת קרן דיימון ראניון לחקר הסרטן, מענק הכשרה לנוירופלסטיות של NIH AG000216, ועל ידי מענק מפרס החוקר החדש בהזדקנות של הקרן הרפואית אליסון, GEC נתמך על ידי פרס NIH/NCATS 1 TL1 TR001114 ועל ידי קרן תגמולי הישגים למדעני מכללה.

....

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
פולי-L-ליזיןסיגמאP5899-20 מ"ג
D-MEM (Dulbecco' s Modified Eagle Medium) גלוקוז גבוה, עם L-גלוטמין, עם נתרן פירובט (1x)Life Technologies11965092
FBS (סרום בקר עוברי)Life Technologies10082147
Neurobasal-A Medium (1x)Life Technologies10888022
תוסף תזונה ללא סרום B-27Technologies10888022
תוסף GlutaMAX I (100x)Life טכנולוגיות35050061
HBSS (1x) (Hank' s תמיסת מלח מאוזנת)Life Technologies24020117
DPBS (Dulbecco' s תמיסת מלח חוצצת פוספט, ללא מגנזיום, ללא סידן (1x)Life Technologies14190250
פניצילין/סטרפטומיצין (100x)Life Technologies15140122
מי קורנינג סלגרו לתרבית תאים פישר סיינטיפיקMT46000CM
פפאיןUSB Corporation19925
DL-ציסטאין HClסיגמא-אולדריץ'C9768
BSA (אלבומין בסרום בקר)סיגמא-אולדריץ'A7906
D-גלוקוזסיגמא-אולדריץ'G6152
DNAse I דרגה IIרוש מדעים יישומיים10104159001
ליפופקטמין 2000טכנולוגיות חיים 
תמיסת פורמלדהיד 16% EMFisher Grade Scientific50980487אזהרה: מזיק בשאיפה, במגע עם העור ובמקרה של בליעה. מגרה את העיניים, מערכת הנשימה והעור. השלך בהתאם לתקנות הרשמיות.
סוכרוזפישר סיינטיפיקS5-500
HEPESSigmaH-3375
סרום חמור רגילJackson Immuno Research017-000-0121
חומצת שומן BSA וללא IgGJackson Immuno Research001-000-162
אצטוןפישר סיינטיפיקBP2403-4
אתנולפישר סיינטיפיקBP2818-100
ProLong Gold מגיב נגד דהייהLife TechnologiesP36934
כיסוי זכוכית 1 1/2. 24 x 40 מ"מCorning2980-244
מכשיר מיקרופלואידי, 450 ומיקרו; mMilliporeAX450
Adobe PhotoshopAdobe
Nikon Eclipse TE2000-U מצלמת Nikon
Coolsnap HQ צלחת
60 מ"מפישר סיינטיפיק12-565-95
צלחת תרבית תאים 150 מ"מפישר סיינטיפיק12-565-100
נוגדנים בשימוש:
שרשרת קלה נגד קינסין, V-17סנטה קרוז sc-13362אומתה באמצעות נוירונים KLC1-/- (הפניה 16), דילול מומלץ 1:100.
אנטי דיניין שרשרת כבדה 1, R-325סנטה קרוז sc-9115אומתה באמצעות shRNA כנגד DYN1HC1 (הפניה 16), דילול מומלץ 1:100
Alexa Fluor 568 Donkey Anti-Rabbit IgGAntibody Life TechnologiesA10042  דילול מומלץ 1:200.
Alexa Fluor 647 Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) AntibodyLife TechnologiesA31573  דילול מומלץ 1:200.
Alexa Fluor 568 חמור נוגדן IgG (H+L) נוגדן IgG נוגדן IgGטכנולוגיות חייםA11057  דילול מומלץ 1:200.
Alexa Fluor 647 חמור נגד עיזים IgG (H+L) טכנולוגיות חיים נוגדניםA21447  דילול מומלץ 1:200.
תוספים ופקודות מאקרו
ImageJ  http://imagej.nih.gov/ij/index.html. 
ImageJ תוסףhttp://www.embl.de/eamnet/html/body_kymograph.html.
Life 11668027 תרבית תאים Roper Scientific ספציפיות ספציפיות קימוגרף

מקורות

  1. Goldstein, A. Y. N., Wang, X., Schwarz, T. L. Axonal transport and the delivery of pre-synaptic components. Curr. Opin. Neurobiol. 18, 495-503 (2008).
  2. Hirokawa, N. Kinesin and dynein superfamily proteins and the mechanism of organelle transport. Science.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

תגיות