אנו מתארים פרוטוקול להפקת תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים מתוכנתים מחדש ומאופיינים ללא גורמים והמרה למצבים קליניים משוערים.
מאמר שיטה
אנו מתארים פרוטוקול להפקת תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים מתוכנתים מחדש ומאופיינים ללא גורמים והמרה למצבים קליניים משוערים.
תאי גזע אנושי pluripotent מושרה (hiPSCs) יכולים להיות שנוצרו עם מתודולוגיות תכנות מחדש מבוסס lentiviral. עם זאת, עקבות של גנים שעלולים להיות סרטניים שנותרו באזורים משועתקים של הגנום, להגביל את הפוטנציאל שלהם לשימוש ביישומים טיפוליים אדם 1. בנוסף, אנטיגנים שאינם בני אדם נגזרים מתכנות מחדש של תאי גזע או הבידול לנגזרים רלוונטיים טיפולי מונעים hiPSCs אלה מלשמש בהקשר קליני בבני אדם 2. בסרטון הזה, אנו מציגים הליך לתכנות מחדש וניתוח hiPSCs ללא גורם ללא transgenes אקסוגני. hiPSCs אלה לאחר מכן ניתן לנתח מומי ביטוי גנים באינטרון הספציפי המכיל את lentivirus. ניתוח זה יכול להיעשות באמצעות תגובת שרשרת של פולימראז רגישה כמותית (PCR), שבו יש יתרון על פני טכניקות רגישות פחות השתמש בעבר כדי לזהות הבדלי 3 ביטוי גנים. המרה מלאה לתרגול בכיתה קלינית טוב ייצור תנאים (GMP), מאפשר רלוונטי קלינית בבני אדם. הפרוטוקול שלנו מציע כי קריטריונים בטוחים נמל נוכחי ירחיבו וכוללים נגזרים מבוססי hiPSC ללא גורם מאופיינים ליישומים לטיפוליים אנושיים הנובע hiPSCs כיתה GMP, שאמורה לחסל את כל סיכון חיסוני בשל אנטיגנים שאינם בני אדם שסופקה על-מתודולוגיה אחרת. פרוטוקול זה הוא רחב החלים על תאי lentiviral לתכנות מחדש של כל סוג ומספק שיטה לשחזור להמרת תאים לתכנות מחדש לתנאי כיתה GMP.
תאים אנושיים בוגרים הוכחו כמסוגלים לעבור שיפוץ אפיגנטי ותכנות מחדש, כתוצאה מביטוי מבוסס לנטי-ויראלי של ארבעה גורמי שעתוק מרכזיים4,5. התקדמות חשובה בתחום התכנות מחדש הייתה השימוש בקלטת תאי גזע לנטיוויראלית אחת הניתנת לכריתה, שהכילה את כל ארבעת גורמי השעתוק המתכנתים מחדש שאפשרו יחס סטויכיומטרי מדויק של ביטוי חלבון6. בנוסף, כאשר הוא מומר בריבוי ספציפי של טווחי זיהום, STEMCCA יכול להוביל לאירועי אינטגרציה גנומיים בודדים בעיקר במהלך תהליך התכנות מחדש7. הכנסת גרסה ניתנת לכריתה, המשתמשת בטכנולוגיית Cre/loxP ואחריה כריתה של וקטור התכנות מחדש לאחר גזירת קו תאי הגזע, אפשרהלהפיק קווי תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים (hiPSC) ללא גורמים. בנוסף, על מנת לשפר את היישומים הטיפוליים של hiPSCs, היה צורך ליישם מתודולוגיה חדשנית, מהירה וניתנת ליישום להמרת קו תאים בדרגת תנאי ייצור נאותים (GMP), מתנאים המכילים קסנו לתנאים נטולי קסנו. כאן, אנו דנים במתודולוגיה רלוונטית המעריכה בצורה מדויקת יותר את הבדלי ביטוי הגנים המשולבים, במיוחד כאשר הם משולבים באינטרון, והמרת תאים בדרגה קלינית לתנאי GMP משוערים.
מחקר קודם השתמש רק בניתוח שעתוק מיקרו-מערך חסר רגישות יחסית כדי לנתח הבדלי ביטוי גנים בגנים משולבים לאחר התמרת STEMCCA3,9. כאן, אנו מציגים את המתודולוגיה של ניתוח תגובת שרשרת פולימראז כמותית רגישה (PCR), כדי לבחון עוד יותר את הבדלי ביטוי הגנים המשולבים. חשוב לציין, הקריטריונים הנוכחיים של נמל מבטחים משליכים hiPSCs שיש להם גנים עם אינטגרציות ויראליות, ובכך מגבילים את הישימות של תאים אלהלטיפולים תאיים אנושיים במורד הזרם. אנו מציעים כי הסטטוס קוו עשוי להשתנות עם שימוש ב-hiPSCs מתוכנתים מחדש באופן אינטרוני המאופיינים במלואם ונטולי טרנסגנים. בנוסף, אנו מציגים פרוטוקול המרת תאים חזק בדרגת GMP שניתן ליישם בקלות על מגוון סוגי תאים שונים, אשר נגזרו במקור בתנאים המכילים קסנו10. זה מספק הזדמנויות משמעותיות לפיתוח ניסויים עתידיים בתכנות מחדש של תאים, הדורשים תנאים ברמה קלינית כדי לשמור על רלוונטיות טיפולית אנושית.
מתודולוגיות אלו מספקות בסיס שעליו ניתן להרחיב את קריטריוני נמל המבטחים הנוכחיים כך שיכללו קווי hiPSC מתוכנתים מחדש של STEMCCA השומרים על פרופיל ביטוי גנים תקין לאחר כריתת STEMCCA מהאינטרון המשולב. כמו כן, המרה מלאה לתנאים ברמה קלינית, ללא אנטיגנים של בעלי חיים שאינם אנושיים, תעזור לשלב סוגי תאים רבים נוספים, שבעבר תוכנתו מחדש ואופיינו רק בתנאים המכילים קסנו. מתודולוגיות אלה יחד, מהוות קרקע משכנעת עבור מנהל המזון והתרופות האמריקני (FDA) לשקול להרחיב את האישור המוגבל שלהם מטיפולים מבוססי תאי גזע עובריים אנושיים (ESC) לטיפולים מבוססי hiPSC11.
לאחרונה פירטנו את הנגזרת של קו hiPSC נטול פקטורים שאופיין במלואו והוסב למצבים קליניים משוערים10. כאן, אנו מפרטים את הפרוטוקול לגזירת hiPSC על ידי שימוש ב-STEMCCA lentivirus. תאי גזע אלה עוברים תהליך כריתה ואחריו אפיון ביטוי גנים. לבסוף, ה-hiPSCs מומרים לתנאים בדרגת GMP על ידי מתודולוגיית המרה איטית.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: שיטה זו שימשה במחקר דיווח נוראים et al 10..
1. תכנות מחדש אדם הבוגר Dermal Fibroblasts עם STEMCCA
2. וקטור אינטגרציה ניתוח אתר וSTEMCCA כריתה
3. Quantitation של הבדלי ביטוי גנים על ידי שימוש בכמותי PCR מהקדם וhiPSCs נכרת-ההודעה
4. המרה לתנאי כיתה GMP
5. hiPSCs נכרת-ההודעה אפיון כיתה GMP
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אנו מציגים פרוטוקול להפקת hiPSCs ללא גורם כיתה קלינית על ידי שימוש בגישת תכנות מחדש מבוססת lentiviral STEMCCA. איור 1 א מציג תמונה מייצגת של שלושה קווים שונים hiPSC-נכרת מראש, לאחר תכנות מחדש עם גישת STEMCCA על שכבת MEFs. היתרון העיקרי של גישת תכנות מחדש STEMCCA טמון בהצלחת תכנות מחדש העקבית מושגת על ידי מדענים רבים, בקבוצות מחקר שונות ובמקומות. איור 1 מציג את הג'ל שעתוק-PCR ההפוך פוסט-כריתה, מראה subclone אחד מסוים (2.3) שהוא חופשי לחלוטין מlenti...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אנו מתארים שיטה של הפקת hiPSCs ללא גורם והופך אותם מבחינה קלינית רלוונטי על ידי המרת תאים אלה לתנאי כיתה GMP להתמיינות תאים במורד הזרם בתרופות אנושיות בעתיד. למרות שפרוטוקול זה הוא החלים רחב למגוון של סוגי תאים, בחרנו לתכנת מחדש fibroblasts עורי האנושי, בשל הקלות של חילוץ מהמטופל ותחולתם לתרופות אנושיות מותאמות אישית. ברגע שמגבלות תקנה ככל בידול מלא לנגזרי תא רלוונטיים מבחינה קלינית הוא 14 מודאגים, ההמרה הוצגה לתנאי כיתה GMP תהיה עוד יותר רלוונטית למגוון של סוגי תאים ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ג'יימס א. ביירן (JAB) ואגוסטין וגה-קרספו מקבלים מימון מחקר מ-Fibrocell Science, Inc. JAB הוא יועץ מדעי ל-Fibrocell Science, Inc. לאף מחבר אחר אין אינטרסים מתחרים לחשוף.
ברצוננו להודות לפטריק סי לי, סיריל ראמאת'ל ו-Saravanan Karumbayaram (SK) על עזרתם בביצוע ניסויי הגזירה והאפיון של iPSC; אהרון קופר על ביצוע ניסויי האנליזה של iPSC; ויטוריו סבסטיאנו ורנה א. רייחו פרה על ניהול מאמצי התכנות הראשוניים; SK, וויליאם א. לאורי, ג'רום א. זאק ודונלד ב. קון על הנחיית הקמת מתקני ה-GMP של UCLA המאפשרים המרה ואפיון של iPSCs ברמה קלינית; גוסטבו מוסטוסלבסקי על שסיפק לנו את וקטור התכנות מחדש הפוליציסטרוני של STEMCCA. עבודה זו מבוססת על שיתוף פעולה מחקרי עם Fibrocell Science ויוזמת החקירות הקליניות לנגזרות שהושגו בעור (CIDMOD) ליצירת טיפולים תאיים מותאמים אישית בטוחים. עבודה זו נתמכה על ידי מימון ממרכז אלי ואדית ברוד לרפואה רגנרטיבית וחקר תאי גזע ב-UCLA, קרן משפחת פלפס, Fibrocell Science, Inc., ופרס המלומדים של UCLA CTSI ל-JAB.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| <חזק>מדיה וריאגנטים | |||
| DMEM/F12 (מדיה בסיסית) | Invitrogen (קרלסבד, קליפורניה, ארה"ב) | 11330057 | |
| סרום בקר עוברי | Invitrogen | 16000044 | |
| חומצות אמינו לא חיוניות מינימליות (MEM) (NEAA), 100x | Invitrogen | 11140050 | |
| Glutamax, 100x | Invitrogen | 35050-061 | |
| PenStrep, פניצילין-סטרפטומיצין, 100x | Invitrogen | 15140-122 | הפשרה ב-4 מעלות; C, aliquot ואחסון ב & מינוס; 20 מעלות; החלפת |
| סרום נוקאאוט | C Invitrogen | 10828028 | הפשרה ב-4 מעלות; C, aliquot ואחסון ב & מינוס; 20 מעלות; C |
| Trypsin/EDTA, 0.5% | Invitrogen | 15400-054 | לדלל את המלאי ל-0.05% ב-1x PBS |
| גורם גדילה פיברובלסטים בסיסי | GlobalStem (רוקוויל, מרילנד, ארה"ב) | GSR-2001 | להקים מחדש ל-10 ומיקרו; מלאי גרם/מ"ל באלבומין סרום בקר 0.1% מומס ב-1x PBS ומאחסנים ב-& מינוס; 80 מעלות; C |
| β-mercaptoethanol | Millipore (בילריקה, מסצ'וסטס, ארה"ב) | ES-007-E | |
| Matrigel (מטריצת ממברנת הבסיס) | BD Biosciences (סן חוזה, קליפורניה, ארה"ב) | 356231 | לדלל את בקבוקון המטריגל עם 10 מ"ל של DMEM/F12 בזמן שהוא על קרח לדילול של 1:2. Aliquot ואחסון ב & מינוס; 20 מעלות צלזיוס. |
| CELLstart (מצע סינטטי) | Invitrogen | A1014201 | |
| Stemmolecule Y27632 | Stemgent (קיימברידג', מסצ'וסטס, ארה"ב) | 04-0012-02 | |
| Puromycin | Invitrogen | A1113802 | |
| LightCycler 480 Probes Master | Roche (באזל, שוויץ)4707494001 | ||
| ProFreeze-CDM בינוני/קפוא בינוני | לונזה (באזל, שוויץ) | 12-769E | |
| דימתיל סולפוקסיד | סיגמא-אולדריץ' (סנט לואיס, מיזורי, ארה"ב) | D8418 | |
| PBS | Invitrogen | 14190-250 | |
| 100 BP DNA סולם | Invitrogen | 15628019 | |
| כתם ג'ל DNA בטוח SYBR 10,000x | Invitrogen | S33102 | |
| Agarose | Bio-Rad Laboratories, Inc. (הרקולס, קליפורניה, ארה"ב) | 161-3101 | |
| ג'לטין, מעור חזיר | Sigma-Aldrich | G1890-100G | הכינו מלאי ב-0.2% ב-PBS, חיטוי ואחסנו בטמפרטורת החדר. |
| mTeSR1 | StemCell Technologies (ונקובר, קולומביה הבריטית, קנדה) | 5850 | שלב תוספת פי 5 עם המדיום הבסיסי, הוצא ואחסן ב-4 מעלות; C עד שבועיים. |
| Stemedia NutriStem XF/FF תרבית בינונית | 05-100-1A | הפשרה ב-4 מעלות; C O/N, אליקוט ואחסון ב-4 מעלות; C עד שבועיים. | |
| פרימוצין | InvivoGen (סן דייגו, קליפורניה, ארה"ב) | ant-pm-1 | |
| Accutase (מגיב דיסוציאציה) | Invitrogen | A1110501 | |
| חמור נגד עוף IgG AlexaFluor 488 | Jackson ImmunoResearch (ווסט גרוב, פנסילבניה, ארה"ב) | 703-546-155 | |
| חומר פוליברן/טרנספקציה | Millipore | TR-1003-G | |
| <חזק>פלסטיק | |||
| צלחות חזקות >12 בארות | VWR (ווסט צ'סטר, פנסילבניה, ארה"ב) | 29442-038 | |
| צלחות 6 בארות | VWR | 29442-042 | |
| צלחות 10 ס"מ | סיגמא-אולדריץ' | Z688819 | |
| מחט 18 מד | פישר סיינטיפיק (פיטסבורג, פנסילבניה, ארה"ב) | 148265D | |
| מחט 21 מד | פישר סיינטיפיק | 14-829-10D | |
| <חזק>ציוד | |||
| BD LSRII זרימה ציטומטר | KSystem מאת ניקון (טוקיו, יפן) | ||
| BD FACSDiva גרסה 6.1.3 תוכנה | BD Biosciences | ||
| ערכות | |||
| PureLink גנומי DNA מיני ערכת | Invitrogen | K182000 | |
| KAPA HiFi Hotstart ReadyMix PCR Kit | KAPA Biosystems (ווילמינגטון, MA, ארה"ב) | KK2601 | |
| ערכת בידוד RNA טהור גבוה | Roche | 11828665001 | |
| Transcriptor First Strand cDNA Synthesis | Kit Roche | 4379012001 | |
| Sialix anti-Neu5Gc Basic Pack Kit | Sialix (ניוטון, MA, ארה"ב) | Basic Pack | |
| media | |||
| Combined media 1 | StemCell Technologies ו Stemgent | מורכב מחלקים שווים mTeSR1 ו-Nutristem | |
| Combined Media 2 | StemCell Technologies ו-Stemgent | מורכב מחלקים שווים TeSR2 ו-Nutristem | |
| HUF Media | Dulbecco' s שונה Eagle' s medium/F12 [DMEM/F12] בתוספת 10% סרום בקר עוברי, 1x חומצות אמינו לא חיוניות, 1x גלוטמקס ו-1x Primocin | ||
| Human Pluripotent Cell | DMEM/F12 בתוספת 20% תחליף סרום נוק-אאוט, 1x גלוטמקס, 1x חומצות אמינו לא חיוניות, 1x פרימוצין, 1x ובטא;-מרקפטואתנול, ו-10 ננוגרם/מ"ל גורם גדילה פיברובלסטים בסיסי. | ||
| DMEM/F12, Dulbecco' s שונה Eagle' s בינוני/F12; PBS, מי מלח עם חוצץ פוספט. |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה