כאן, אנו מכוונים באופן סלקטיבי לנוגדנים כנגד חבר ספציפי במשפחת חלבונים שהשתמרה מאוד על ידי חיסון בעלי חיים עם האזורים השונים ביותר שלהם ולאחר מכן הסרת נוגדנים תגובתיים צולבים על ידי ספיחה מוקדמת.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
כאן, אנו מכוונים באופן סלקטיבי לנוגדנים כנגד חבר ספציפי במשפחת חלבונים שהשתמרה מאוד על ידי חיסון בעלי חיים עם האזורים השונים ביותר שלהם ולאחר מכן הסרת נוגדנים תגובתיים צולבים על ידי ספיחה מוקדמת.
תת-משפחת הקולטנים הגרעיניים 4 (NR4A) מורכבת מ-3 חלבונים קשורים החולקים תחום קשירת DNA (DBD) ותחום קשירת ליגנד (LBD). חלבון 1 הקשור לקולטן הגרעיני (Nurr1 או NR4A2) ממלא תפקיד מפתח בתחזוקת המערכת הדופמינרגית. הפרעות בתפקוד הדופמין הקשורות לגן Nurr1 כוללות בין היתר מחלת פרקינסון, סכיזופרניה ומאניה דיפרסיה. יתר על כן, עדויות עדכניות מצביעות על כך ש-Nurr1 מתבטא גם באזורים אחרים במוח כמו ההיפוקמפוס וממלא תפקידים קריטיים ללמידה וזיכרון. שאר בני המשפחה הם גורם גדילה עצבי IB (Nur77 או NR4A1) וקולטן יתום 1 שמקורו בנוירונים (NOR1 או NR4A3). כדי לעזור לחקור את התפקידים התפקודיים המדויקים של Nurr1 בהפרעות תפקוד עצביות דופמינרגיות ואחרות הקשורות לאזור המוח, היה צורך בנוגדנים נטולי תגובתיות צולבת כנגד Nur77 ו-NOR1. מכיוון שהחלבונים שונים יותר ב-LBD שלהם מאשר בתחומי קשירת ה-DNA שלהם, חיסון עם LBD מטוהר אמור להניב נוגדנים ספציפיים ל-Nurr1 עם תגובתיות מינימלית כנגד Nur77 ו/או NOR1. למרות שנוגדנים נגד Nurr1 נוצרו בהצלחה, אלה הראו תגובתיות חיסונית משמעותית כנגד שאר בני המשפחה. כרומטוגרפיה של זיקה על פני חלבון A משותק ואחריה ספיחה מוקדמת כנגד LBDs Nur77 ו-NOR1 משותקים הניבה נוגדנים ספציפיים ל-Nurr1 ללא תגובתיות צולבת. כאן, אנו מכוונים באופן סלקטיבי לנוגדנים כנגד חבר ספציפי במשפחת חלבונים שהשתמרה מאוד על ידי חיסון בעלי חיים עם האזורים השונים ביותר שלהם ולאחר מכן הסרת נוגדנים צולבים על ידי ספיחה מוקדמת. מטרת הפרוטוקול היא להגביר את הספציפיות של נוגדנים רב-שבטיים באמצעות ספיחה מוקדמת כנגד אנטיגנים צולבים.
גורם שעתוק Nurr1 וhomologs שלה (Nur77 וNor1) שייכים ל4A קולט הגרעיני תת משפחה (NR4A) 1. הם גם קולטנים יתום כי ligands אנדוגני אינו מזוהים עדיין. Nurr1 היה משובט ראשון בשנת 1992 ולמרות שידוע שבאו לידי ביטוי במוח 2, תפקידה החיוני לפיתוח ותחזוקה של נוירונים דופמין המוח התיכון התגלה על ידי מחקרי עכבר נוקאאוט 3. בנוסף, התפקיד החשוב שלה לצורך התחזוקה של נוירונים דופמין המוח התיכון הודגם לאחרונה על ידי מחקר בנוקאאוט מותנה 4. בשל מחקרים האלגנטיים אלה מראים התפקידים הקריטיים של Nurr1 לנוירונים דופמין המוח התיכון, מחקרים רבים שלאחר מכן התמקדו במידה רבה בנוירונים דופאמין והפרעה ניוונית של מערכת עצבים הקשורים לדופמין המוח התיכון, מחלת פרקינסון (PD) 5.
יש לציין, Nurr1 מתבטא לא רק בתאי עצב דופמין המוח התיכון (מד"א), אלא גם בdiאזורים במוח פסוק 2, מה שמרמז שאולי יש לו תפקידים פונקציונליים בתחומים רבים שאינו התובע, אשר נתמך במידה רבה על ידי יותר מחקרים שנעשה לאחרונה הראו כי Nurr1 משחק תפקידים חשובים בתפקודי מוח שונים. לדוגמאות, זה הוצג פעילויות התרמה-זיכרון שכגון למידה, או משימות היפוקמפוס תלוי אחרות לגרום לעד-רגולציה של ביטוי Nurr1 ב6,7 היפוקמפוס. בנוסף, להפיל את ביטוי Nurr1 בהיפוקמפוס היה מספיק כדי לפגוע בזיכרון לטווח ארוך ו / או פלסטיות הסינפטית 8-11, חזק המצביע על כך Nurr1 משחק תפקידים מגוונים באזורי מוח רבים. לכן, כדי להבין את ביטוי תאים מסוג ספציפי וsubcellular של Nurr1 נוסף, רצוי להשתמש נוגדני Nurr1 ספציפי, שאינו מפגינים כל תגובה צולבת לhomologs Nur77 או Nor1. מאמר זה מתאר פרוטוקול מראש ספיחה לייצר נוגדני Nurr1 ספציפי ונתונים נוספים מראים הנוכחיים הספציפי שלו.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: ניתן למצוא ההרכב של כל הפתרונות שהובאו להלן בטבלת חומרים / ציוד.
1. חלבון טור נוגדן טיהור
2. צימוד של החלבונים LBD לAminoLink צימוד שרף
3. אתרי חסימה נותרה
4. טיהור של נוגדנים ספציפיים Nurr1
ניתוח של מזוקקים אנטי-Nurr1 נוגדנים מבוסס ELISA 5.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
השוואה של חלבון נוגדני Nurr1 ספציפי עמודה מטוהרת עם חלבון נוגדנים נגד Nurr1 מטוהרים ואחרי המעבר בNur77 LBD וNor1 LBD עמודות מוצגים באיור 1. כפי שניתן לראות, מטוהר נוגדן Nurr1 חלבון הציגה חזק מחייבת לNurr1 LBD. עם זאת, הוא גם הוכיח משמעותי מחייב Nur77 LBD וNor1 LBD. כאשר נוגדני Nurr1-מטוהר חלבון היו מטוהרים נוסף נגד Nur77 LBD וNor1 LBD, הזיקה הסופית מטוהרת נוגדני Nurr1 הציגו ספציפיים מחייבים Nurr1 LBD עם גילוי מחייב לNur77 LBD או Nor1 LBD, הוכחה כי התגובה הצולבת של...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ההצלחה של פרוטוקול זה מסתמכת על הזמינות של חלבונים טהורים לאפיון הנוגדנים שהועלו נגד חבר ספציפי של משפחת החלבון של עניין. אין צורך לטהר את הנוגדנים באמצעות חלבון / G עד שברור נקבע כי יש reactivities הצולב משמעותי על ידי ELISA ומערבי סופג.
כאמור בטקסט, חשוב להימנע מהשעיית החלבון (ים) להיות בין-צמוד לטור במאגר המכיל אמין כמו טריס או גליצין. יתר על כן ריכוז החלבון האופטימלי המשמש לcross-linking צריך להיקבע באופן אמפ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
יש המחברים אין לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי מענקי NIH (NS070577 ו-NS084869).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| תחום קשירת ליגנד מטוהר מפתרון אחסון עמודות Nurr1, Nor 1 ו-Nur77 | |||
| AminoLink צימוד שרף וערכה | Thermo Scientific | 44890 | |
| חלבון עמוד ספין | Thermo Scientific | 89978 | |
| Dulbecco's Phosphate-Buffered | Saline Corning | 21-031-CV | |
| 96 באר צלחות תחתונות, אוגן גבוה, 330 μ l | Thermo Scientific | 3455 | |
| 10% סרום עיזים רגיל | KPL | 50-675-69 | |
| תרכיז מדלל / חוסם חלב | KPL | 50-82-01 | |
| IgG Elution Buffer | Thermo Scientific | 21004 | |
| ערכת בדיקת חלבון מיקרו BCA | Thermo Scientific | 23235 | |
| צנון סוסים Peroxidase מצומד עז נגד ארנב IgG (H+L) | Thermo Scientific | 31460 | |
| Ni-NTA שרף | Thermo Scientific | 88221 | |
| 3, 3', 5, 5' Tetramethylbenzydine | Thermo Scientific | 34028 | |
| 2N H2SO4 | Macron Fine Chemicals | H381 05 | |
| חלבון A IgG מאגר מחייב | Thermo Scientific | 21001 | |
| IgG Elution Buffer | Thermo Scientific | 21004 | |
| תמיסת | עמודה פוספט חוצץ מי מלח המכילים 0.02% נתרן אזיד | ||
| ספקטרה/פור 7 צינורות דיאליזה מטופלים מראש | ספקטרום מעבדות | 132128 | |
| 10 מ"ל עמודות חד פעמיות | Thermo Scientific | 29924 | |
| AminoLink מאגר | 0.1M נתרן פוספט, 0.05% NaN3, pH 7.0 | ||
| מאגר | 1M Tris. HCI, 0.05% NaN3, pH | ||
| תמיסת | 7.4 1M NaCl, 0.05% NaN3 | ||
| ELISA חוסם חוצץ | 1% סרום סוס רגיל (NHS), 1% סרום עיזים רגיל (NGS) בתמיסת | ||
| 1X KPL PBS pH 7.4 המכיל 0.02% נתרן אזיד | |||
| מיקרופיפטות: 10 μ l; 20 μ l; 200 μ l; 1000 μ l |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.