פרוטוקול זה מתאר עיסוי cloacal, טכניקה ידני פולשני עבור איסוף זרע מן הציפורים, והפקת DNA מן העופות הזרע באמצעות ערכת חילוץ מסחרי עם שינויים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מתאר עיסוי cloacal, טכניקה ידני פולשני עבור איסוף זרע מן הציפורים, והפקת DNA מן העופות הזרע באמצעות ערכת חילוץ מסחרי עם שינויים.
איסוף זרע עשויה להיות שימושית עבור מגוון רחב של יישומים כולל מחקרים שכללו איכות זרע, זרע טלומר dynamics, אפיגנטיקה. ציפורים נמצאים בשימוש נרחב הנבדקים במחקר ביולוגי והם אידיאליים עבור מחקרים שכללו דגימות זרע חוזרות ונשנות. עם זאת, מעט משאבים זמינים כעת עבור אלה המעוניינים ללמוד כיצד לאסוף לחלץ את ה-DNA של הזרע העופות. כאן נתאר עיסוי cloacal, טכניקה ידני עדין, לא פולשנית עבור איסוף זרע העופות. למרות טכניקה זו נוצר בספרות, זה יכול להיות קשה ללמוד מן התיאורים זמינים. כמו כן, אנו מספקים מידע עבור חילוץ דנ א בזרע העופות באמצעות ערכת חילוץ מסחרי עם שינויים. עיסוי cloacal יכול לשמש בקלות על ציפור זכר קטן-בינוני במצב הרבייה. בעקבות אוסף, הזרע שניתן להשתמש באופן מיידי עבור מבחני תנועתיות או קפוא להפקת DNA בעקבות הפרוטוקול כפי שיתואר בהמשך. פרוטוקול החילוץ זה היה מעודן לזרע העופות, נעשה בהצלחה על דגימות שנאסף מספר מינים ציפורי שיר מ (פאסר דומסטיקוס Spizella passerina, Haemorhous mexicanus, migratorius ציור ), אחד columbid (ליוויה יונה).
ציפורים הן נושאים אידיאלי עבור מחקרים שכללו איכות הזרע, תחרות1, זרע טלומר dynamics2, אפיגנטיקה3ונושאים דומים, הם נמצאים בשימוש נרחב המחקר הביולוגי, זרע ניתן בקלות לטעום באמצעות cloacal עיסוי. עיסוי cloacal היא טכניקה ידני עדין, לא פולשנית עבור איסוף זרע מן הציפורים-4,-5,-6. דוגמאות חוזרות ניתן להשיג בקלות, אין כלים מיוחדים נדרשים, עושה את זה פשוט לבצע בשדה או מעבדה. למרות עיסוי cloacal כבר בשימוש במשך עשרות שנים, קשה ללמוד לכתוב תיאורים זמינים. פרסום זה מיועד להפחית את הזמן ואת אי הוודאות מעורב לימוד עיסוי cloacal.
הזרע שנאסף ציפורים באמצעות עיסוי cloacal שניתן להשתמש מיד תנועתיות-הערכת-4,-7 או הזרעה מלאכותית8או קפוא לשימושים אחרים כגון הדמיה מתקדמות והפקת דנ א. דגימות זרע מציפורי שיר מ הם קטנים, אך מכיל זרע בצפיפות. ה-DNA מופק באמצעות ערכת חילוץ מסחרי עבור פשטות, עם שינויים כדי להתגבר על התכונות מגן מיוחדות של זרע9. לאחר החילוץ, טלומרים זרע ניתן למדוד באמצעות qPCR10.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה כרוך נושאים בעלי חוליות, אושרה על ידי טיפול בעלי חיים מוסדיים ועל שימוש הוועדה (IACUC) באוניברסיטת המדינה של צפון דקוטה.
1. זרע מהאוסף ציפור שיר באמצעות עיסוי cloacal
הערה: עיסוי Cloacal שיטת איסוף זרע יעיל על ציפורים reproductively פעילים בלבד, אך ניתן לבצע בהצלחה מחוץ לעונת הקינון במצבים המתאימים בשבי. פעילות הרבייה צריך להיקבע עבור היעד מינים לפני באמצעות עיסוי cloacal. ניתן להשתמש בטכניקה זו על ציפורי בר על לכידת או על ציפורים מוחזק בשבי.

איור 1 : גריפ עבור עיסוי cloacal. הציפור מאובטח בקלילות ביד הדומיננטית עם הצד הגחון שלו נוגע את דקל ובראש מאובטח על ידי אצבע הזרת. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.

איור 2 : אצבע המיקום ואת בליטה cloacal. אוורט קלואקה על ידי הפעלת לחץ קל עד הסוף מעולה (א). ב זכר ציפורי שיר reproductively פעיל, ברור בליטה cloacal המשרד (B). אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
2. הפקת דנ א בזרע ציפור
הערה: פרוטוקול זה נבדק עם מספר ערכות חילוץ מסחרי של DNA, אך עברו רק מוצלח בעת שימוש ב- DNA אחד ערכת12. צעדים שעברו שינויים בפרוטוקול ערכת מסומנים באמצעות *.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
עיסוי cloacal, ה-DNA חילוץ באמצעות שהפרוטוקול המתואר בוצע מספר מינים ציפורי שיר מ, אחד columbid (טבלה 1). הנוכחות של זרע זרע הדגימות שנאספו על ידי עיסוי cloacal אושר על-ידי הצגת כמות קטנה של הדגימות מדולל תחת מיקרוסקופ מתחם בהגדלה X 400 (איור 3). לאחר חילוץ DNA דגימות זרע שנאספו מן הבית דרורים באמצעות פרוטוקול המתואר כאן, שמונה דגימות היו פועלים בג'ל עם סולם הדנ א (שלוש דוגמאות ניתן לראות באיור4). להקות שונות ללא...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אנו מתארים שיטה פשוטה ואמינה איסוף זרע מעופות קטנים ובינוניים במצב פעיל reproductively, חילוץ DNA של הזרע העופות.
פרוטוקול מיצוי DNA זרע מתואר שינוי ערכה של פשטות, אבל היה מעודן לשימוש על זרע העופות. הזרע הם עמידים בפני פירוק על ידי מיצוי סטנדרטי כימיקלים9,13, דגימות זרע שנאסף passerines קטן למדי (בדרך כלל כמה microliters). גורמים אלה מציגים אתגרים הם בהצלחה להתגבר על-ידי שימוש של הריכוז המתאים של DTT המקננת ב 65 º C. באמצעות שיטה זו, ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים כי יש להם אינטרסים כלכליים אין מתחרים.
אנו מודים חוזה Noguera לקבלת סיוע מוקדם עם עיסוי cloacal, ותמיכה ג'פרי Kittilson עבור המעבדה. עבודה זו נתמכה על ידי פרס ND EPSCoR FAR0022429 כדי BJH. עלויות הפרסום בנדיבות נתמכו על ידי NDSU במחלקה למדעי הביולוגיה.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| צינורות נימיים מיקרוהמטוקריט | פישרברנד | 22-362566 | ניתן להשתמש בכל ספק. צינורות קטנים יותר עשויים להיות יעילים יותר לאיסוף דגימות זרע קטנות, כגון מעופות עוברים קטנים מאוד כמו דרור סתת. |
| צינורות מיקרוצנטריפוגה | כל | ||
| 1x PBS | כל משמש | לאחסון דגימות זרע לפני מיצוי DNA. | |
| DL-Dithiothreitol | Sigma-Aldrich | D0632 | |
| Tris base | Sigma-Aldrich | 10708976001 | ניתן להשתמש בכל ספק. |
| EDTA | סיגמא-אולדריץ' | 1233508 | ניתן להשתמש בכל ספק. |
| NaCl | Sigma-Aldrich | 793566 | ניתן להשתמש בכל ספק. |
| SDS | Sigma-Aldrich | 1614363 | ניתן להשתמש בכל ספק. |
| ערכת מיקרו QIAamp DNA | Qiagen | 56304 | Qiagen QIAamp ערכת מיקרו DNA מומלצת במיוחד. פרוטוקול מיצוי DNA זה נוסה עם ערכות מסחריות אחרות אך ללא הצלחה רבה. הסיבות לכך אינן ידועות לנו. |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.