פרוטוקול זה מתאר את השימוש elutriation צנטריפוגלי כדי להפריד בין תאים לוקמיה לימפובלסטית חריפה העיקרי לשלבים שונים של מחזור התא.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
פרוטוקול זה מתאר את השימוש elutriation צנטריפוגלי כדי להפריד בין תאים לוקמיה לימפובלסטית חריפה העיקרי לשלבים שונים של מחזור התא.
היכולת לסנכרן את התאים כבר מרכזי לקידום ההבנה שלנו של מחזור התא רגולציה. טכניקות נפוצות המועסקים כוללים קיפוח סרום; כימיקלים אשר לעצור תאים בכל שלבי מחזור התא שונים; או השימוש mitotic לנער-off המנצלת שדבקו מופחת. אולם, כל אלה יש חסרונות. לדוגמה, סרום הרעבה עובד היטב עבור תאים נורמליים, אבל פחות טוב של תאים סרטניים עם מחזור התא פרוץ המחסומים בשל אובדן משתיק קול ההפעלה או גידול אונקוגן. באופן דומה, אוכלוסיות תאים טיפול כימי יכול הנמל נזק שיכרון ולהראות שינויים הקשורות במתח. טכניקה אשר עוקף בעיות אלה הוא counterflow elutriation צנטריפוגליות (להרדים), שבו תאים נחשפים שני הכוחות המנוגדים, כוח צנטריפוגלי, מהירות נוזלים, כשהתוצאה היא ההפרדה של תאים על בסיס גודל וצפיפות. מאז תאים לקדם באמצעות המחזור בדרך כלל להגדיל, להרדים יכול לשמש כדי להפריד בין תאים לשלבים שונים של מחזור התא. כאן אנו מיישמים את הטכניקה הזו לתאים העיקרי לוקמיה לימפובלסטית חריפה. בתנאים אופטימליים, אוכלוסיה בעיקרו של דבר טהור של תאים בשלב G1 ואת אוכלוסיה מועשר של תאים בשלבים G2/M ניתן להשיג תשואה מעולה. אוכלוסיות תאים אלה מתאימים באופן אידיאלי עבור לימוד תלויי-מחזור התא מנגנוני הפעולה של תרופות נגד סרטן, יישומים אחרים. אנחנו גם להראות כיצד שינויים הליך סטנדרטי יכול לגרום בביצועים שיוצרת ולדון את המגבלות של הטכניקה. המתודולוגיה מפורט שהוצג צריך לאפשר יישום וחקירה של הטכניקה סוגים אחרים של תאים.
תאים בתרבית בדרך כלל לגדול באופן אסינכרוני, תאים בודדים נמצאים בשלבים שונים של מחזור התא. אורגניזמים מסוימים ייתקלו מחזורי תאים סינכרונית באופן טבעי או ניתן לסנכרן באמצעות ספציפית לגירויים פיזיולוגיים. לדוגמה, גרעינים בתוך plasmodia ענק התבנית רפש Physarum polycephalum לחלק אופנה מאוד סינכרונית1, וכן תאים של האצות הירוק שניתן לסנכרן Desmodesmus quadricauda , לסירוגין כהה תקופות2. בעוד אורגניזמים כגון מציעים תכונות ניסויית ייחודית, הם מודל כראוי המורכבות של תאי יונקים. היכולת לסנכרן באופן מלאכותי בתרבית של תאים אוכלוסיות כבר מרכזי לקידום ההבנה שלנו של מחזור התא רגולציה, הבסיס המולקולרי של מחזור התא מחסומים. שיטות נפוצות כוללות מניעת סרום, בלוק כימי, שחרור, או ניצול מאפיינים פיזיים3,4. נסיגה של סרום גורם לעתים קרובות תאים להזין תרדמה ולאחר התוספת מחדש של סרום מקדם החזרה מחזור התא לתוך שלב G15. מעכבי כימי כוללות סוכני כגון עודף תימידין הידרוקסיוראה החוסמות תאים על הגבול G1/S, או מעכבי microtubule אשר בדרך כלל לעצור התאים ב-3,שלב4מ'. גישות לנצל תכונות פיזיות כוללות mitotic לנער את אשר יכול לשמש כדי להעשיר תאים mitotic מכיוון שהן פחות חסיד מאשר לאטמוספרה תאים6. אולם, כל הטכניקות הללו יש החסרונות פוטנציאל. לדוגמה, לא כל סוגי תאים לשמור על הכדאיות העדר של סרום או הנוכחות של מעכבי כימי, וכן את התשואה של התאים לאחר mitotic לנער-לא מוגבל ללא סינכרון מוקדמת עם מעכבי mitotic.
למעט בתחילת מחזורי תאים עובריים, שבו תאים בהדרגה להקטנת גודל כפי הם מחלקים7, רוב התאים לקדם באמצעות המחזור עוברים שלבי גידול ולהיות גדול יותר. מאפיין זה הוא לנצל את הטכניקה של counterflow צנטריפוגלי elutriation (להרדים), אשר יכול לשמש כדי להפריד בין תאים שונות בגודל, ומכאן במחזור התא שלב8,9. במהלך. להרדים, התאים נמצאים תחת ההשפעה של שני כוחות מנוגדים: כוח צנטריפוגלי, אשר כוננים התאים מחוץ לציר הסיבוב, והמהירות נוזל (counterflow), אשר מניע את התאים לכיוון לציר הסיבוב (איור 1). תאים במחסנית elutriation להגיע למשרת שיווי משקל שבו כוחות אלה הם שווים. גורמי מפתח מכתיב את מיקום שיווי משקל הם התא קוטר וצפיפות. כמו הזרם גדל קצב של הפתרון מאגר כוח גרירה counterflow עולה הדיסקה, נוצר שיווי משקל חדש, גרימת שינוי בעמדה של תאים בתוך החדר. כל התאים יוזזו לכיוון היציאה קאמרית, וכתוצאה מכך הקטנים עוזב את החדר קודם, ואילו התאים גדול יותר להישאר בתוך החדר עד שער counterflow הוא גדל מספיק כדי לקדם את היציאה שלהם. ניתן לאסוף תאי בריחה תא elutriation עם עליות רצופות קצב counterflow בחלקים ספציפיים ומכיל כל השבר תאים ברצף הולך וגובר גדלים. במקום ניצוח elutriation עם עליות מצטבר counterflow קצב, ירידות רציפים כוח צנטריפוגלי על ידי הפחתת מהירות צנטריפוגה תוכלו להשיג את אותה תוצאה. התהליך של elutriation דורש אופטימיזציה בהתאם סוג התא, מאגר elutriation המועסקים מנגנון ספציפי משמש. הקצב של שיקוע של תאים בתנאים אלה מתואר על ידי חוק סטוקס מיטב: SV = [d2(ρp- ρמ') / 18η] .ω2r, איפה SV = מהירות שיקוע; d = קוטר של החלקיק; Ρp = צפיפות של החלקיק; Ρm = צפיפות של המאגר; Η = צמיגות של המאגר; Ω = מהירות זוויתית של הרוטור; ו- r = רדיאלי המיקום של החלקיק. לפיכך, SV הוא יחסי התא קוטר וצפיפות, מאז קוטר הוא בחזקת השני, תורם יותר משמעותית מאשר צפיפות אשר הוא בדרך כלל קבוע דרך מחזור התא.
יתרון חשוב של להרדים הוא תאים לא נתון את התנאים הקשים של טיפול כימי או מחסור תזונתי, ניתן לשחזר בעיקרו בשלוות נפש מעולה כממוצע. דרישה הוא בתאים עוברים עלייה משמעותית בקוטר לפחות 30%, כפי שהם חוצים את מחזור התא. החיסרון העיקרי הוא העלות של צנטריפוגה מיוחדים, רוטור, אביזרים. למרות זאת, היכולת להכין תאים מועשר בשלבים מסוימים מחזור התא על-ידי. להרדים במידה רבה הנחתה את מחזור התא במחקר האורגניזמים שמרים בתרבית של תאים9,10. יתר על כן, ההתקדמות מתרחבים שימושים הפרדת תאים מן בריא לעומת רקמה סרטנית, ההפרדה של סוגי תאים שונים בתערובות הטרוגניות ולאחר לייצור של סוגי תאים ספציפיים חיסוני9.
האינטרס העיקרי שלנו כבר בהבנת מנגנון הפעולה של microtubule מיקוד סוכנים (MTAs) כגון וינקה אלקלואידים, taxanes. תרופות אלו נחשבו לפעול באופן בלעדי מיטוזה, חסימת צירים microtubule פונקציה11,12, אך לאחרונה העדויות שהם גם עשויים למקד לאטמוספרה microtubules13,14. לאחרונה דיווחנו כי ראשי לוקמיה לימפובלסטית חריפה (ALL) תאים עוברים מוות בכל שלב G1 או ב- M שלב כאשר שטופלו vincristine ו MTAs אחרים באופן תלוי-מחזור התא15. היכולת להפריד בין כל התאים לשלבים שונים מחזור התא על ידי להרדים היה אינסטרומנטלי להגיע מסקנה זו. במאמר זה, אנו מתארים את הפרטים הטכניים, מציעים טיפים מעשיים עבור היישום של. להרדים הכנת ראשי כל התאים בשלבים שונים של מחזור התא.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
הערה: פרוטוקול זה הותאם עבור ראשי B-כל התאים אשר נע בקוטר של 8 מיקרומטר (שלב G1) 13 מיקרומטר (שלבים G2/M). לפיכך, מהירויות צנטריפוגה ספציפיים, משאבת זרימה המחירים לא ייתכן החלים על תאים בעלי גודל שונה טווחים. ובכל זאת, הפרמטרים elutriation המתאים יכול להיות מוערך באמצעות המשוואה קצב שקיעת. תאים מתורבתים במדיום מוגדר ללא סרום כפי שמתואר 16 ב צפיפות מיטבית של 1-3 x 10 6 תאים למ"ל. פרט לאוסף של שברים מתנהל ב 4 ° C באמצעות צינורות מקורר קרח, נערכים כל השלבים בטמפרטורת החדר, לצנטריפוגה להגדיר ב- 20 ° C עם מקסימום של 24 מעלות צלזיוס
1. הכנה של מאגר Elutriation וחומרים
2. הרכבה של מערכת Elutriation
3. הטרמה של מערכת Elutriation
4. הכנת המדגם תא
5. הקדמה של דגימות התאים לתוך המערכת Elutriation ואת אוסף של שברים
6. שטיפה של מערכת Elutriation
7. ניתוח של שברים ואוסף של G1 או בריכות G2/M.
הערה: כדי להדגים את היעילות של elutriation, ניתוח שבר כל ספירת תאים, תא בקוטר של תוכן ה-DNA, בריכות נוצרים תאים בשלבים G1 או G2/M עבור ניתוחים immunoblot, כפי שמתואר נציג תוצאות. סעיף פרוטוקול זה יתאר כיצד ליצור בשלוליות להכין אותם לשימוש ניסיוני.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
ראשית כל התאים (3-4 x 108) היו נתון elutriation צנטריפוגלי ונאספים שני שברים שטיפת ושברים הראשי עשרים, כמפורט בפרוטוקול. טבלה 1 מציגה את הנתונים נציג איפה המספר הכולל של תאים כל שבר, כמו גם את מהירות הרוטור המתאימים מוצגים. בסך הכל התשואה היה בדרך כלל מעל 80%. מדידה של התא קוטר בחלקים בודדים אישר את קוטר תא גדל עם קידום elutriation (איור 2). תוצאות אלו מייצגים ממוצעים של שני האישושים עצמאית ומשקפים רמה גבוהה של נתונים הפארמצבטית. שברים הבא היו נתונ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
תארנו שיטה להשגת ראשי כל התאים בשלבים שונים של מחזור התא באמצעות להרדים. בתנאים אופטימליים אוכלוסיה בעיקרו של דבר טהור של תאים בשלב G1 ואת אוכלוסיה מועשר של תאים בשלבים G2/M יכול בקלות להשיג תשואה מעולה, התאים מועשרים מאוד בשלב זה גם ניתן להשיג אם רצונך בכך. התוצאות המובאות כאן התקבלו באמצעות ראשי אחד שכל תרבות (ליתר דיוק, כל-5) ותוצאות במהותה זהה הושגו עם תרבות עצמאית, כל-215. בנוסף, כל שאר ראשי בכל התרבויות בדק את תאריך יש טווחים צפיפות דומה במהלך צמיחה אסינכרוני, צפויה לבצע באופן דומה כאשר נתון...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
יעקב לוי Kothari נמצאת כרגע המחלקה של התא וביולוגיה מולקולרית בבית החולים סנט ג'וד לילדים מחקר.
עבודה זו נתמכה על ידי NIH CA109821 (כדי TCC). אנו מודים Beckman Coulter בנדיבות תקציבים כדי לכסות את עלויות הפרסום, לקבלת סיוע טכני בארצות ותפעול של מערכת elutriation. אנו מודים ד ר פרד Falkenburg למתן הראשית הראשונית בכל התרבויות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| תמיסת מלח מאוזנת של הנקס | לונזה | 10-508Q | בקבוק 1 ליטר |
| סרום בקר עוברי פלוס | Atlas Biologicals | FP-0500-A | בקבוק 500 מ"ל |
| 2-napthol-6,8-חומצה דיסולפונית מלח דיפוטסיום | Acros Organics | 212-672-4 | 100 גרם אבקה |
| 50 מ"ל צינורות קונציאליים | Denville Scientifics | C1062-P | 500/מארז |
| PES ממברנה 0.22 ומיקרו; m יחידת סינון | Millipore | SLGP033RB | 250/חבילה |
| Avanti J-26S XPI עם Elut. ללא IVD - 50/60 הרץ, 200/208/240V | בקמן קולטר | B14544 | תואמת למערכת אלוטריאציה |
| JE 5.0 ערכת רוטור | בקמן קולטר | 356900 | ערכת רוטור הכוללת את הרוטור, מפתח משושה ידית T, מכלול השחרור המהיר (ללא תא הפליטה), כבל העיגון ותא מכלול ה-strobe |
| , סטנדרטי, 4 מ"ל, "A" | Beckman Coulter | 356943 | תא אלוטריאציה סטנדרטי |
| Masterflex L/S ראש משאבת עומס קל | Cole-Parmer | EW-07518-10 | |
| Masterflex L/S כונן במהירות משתנה | Cole-Parmer | EW-07528-10 | |
| Masterflex BioPharm צינורות משאבת סיליקון מרפא פלטינה, L/S 16 | Cole-Parmer | EW-96420-16 | |
| 25 G x 1.5 מחט Precision Glide | BD | 305127 | סטריליות, מחטים חד פעמיות |
| 10 מ"ל Luer-Lok מזרק | BD | 309604 | מזרקים סטריליים לשימוש חד פעמי |
| Vi-Cell XR | בקמן קולטר | 383556 | |
| PI/RNase מאגר צביעה | BD Pharmingen | 550825 | propidium iodide/RNase מאגר צביעה |
| ציקלין B1 (GNS1) עכבר חד-שבטי נוגדן IgG | סנטה קרוז ביוטכנולוגיה | sc-245 | |
| cyclin D1 (DCS-6) נוגדן IgG חד-שבטי | עכבר סנטה Cruz Biotechnology | sc-20044 | |
| P-Rb (S807/811) (D20B12) XPR ארנב נוגדן חד שבטי | טכנולוגיית איתות תאים | 8516s | |
| GAPDH (14C10) נוגדן חד שבטי ארנב | טכנולוגיית איתות תאים | 2118s עיזים | |
| נגד עכבר IgG (H+L)-HRP מצומד | BioRad | 170-6516 | |
| עיזים נגד ארנב IgG (H+L)-HRP מצומד | BioRad | 170-6515 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.