שיטת microdilution מרק קל וישימה לסינון תרכובות פטריות ותמציות.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
שיטת microdilution מרק קל וישימה לסינון תרכובות פטריות ותמציות.
זיהומים פטרייתיים הפכו מצב רפואי חשוב בעשרות השנים האחרונות, אך מספר תרופות נגד פטריות זמין הוא מוגבל. בתרחיש זה, החיפוש אחר תרופות נגד פטריות חדשות הכרחי. פרוטוקול דיווח על פרטי שיטה פפטידים מסך עבור מאפייניהם נגד פטריות. הוא מבוסס על ציר microdilution רגישות הבדיקה מן ההנחיות קלינית ומכון תקנים מעבדה (CLSI) M27-A3 עם שינויים שיתאימו למחקר של פפטידים מיקרוביאלית כמו תבחיני חדשים פוטנציאליים. פרוטוקול זה מתאר assay פונקציונלי כדי להעריך את הפעילות של תרכובות נגד פטריות, ניתן לשנות בקלות כדי להתאים כל סוג מסוים של מולקולות תחת חקירה. מאז מבחני מבוצעות ב- 96-ובכן צלחות באמצעות אמצעי אחסון קטן, הקרנה בקנה מידה גדול וניתן להשלים את כמות קצרה של זמן, במיוחד אם יבוצע באווירה אוטומציה. הליך זה מדגים איך פרוטוקול קליני מתוקנן, הניתנים לשינוי יכול לעזור המרדף ספסל-עבודה של מולקולות חדשות כדי לשפר את הטיפול של מחלות פטרייתיות.
זיהומים פטרייתיים הפכו הדאגה הרפואית חשובה במהלך העשורים האחרונים, נתקל גדל במידה ניכרת בעיקר בשל עלייה במספר של יחידים immunocompromised כגון אלה עוברת טיפול בסרטן, אלה החיים עם HIV/איידס או מושתלים איברים1,2. עם זאת, מערך מוגבל מאוד של תרופות נגד פטריות זמין, הגדלת מספר דיווחים על ההתנגדות פטרייתי להם לתרום הבעיות העיקריות לגבי הרפוי של mycoses מערכתית3.
מקור פוטנציאלי של תרכובות חדשות פטריות הם פפטידים מיקרוביאלית (אמפר), קטן פפטידים cationic המיוצר על ידי אורגניזמים רבים כחלק שלהם תגובה חיסונית מולדת זיהום4. למרות זאת, שיטת ההקרנה כדי לבדוק את המשחות נגד פתוגנים ופטריות אינה אחידה. הליכים שונים שימשו כדי להעריך את הפעילות פטרת של אמפר, לפעמים על אותו מודל מיקרואורגניזם5,6,7. הבדלים אלה וחוסר פרט פרוטוקולים מסוימים לסבך השוואות בין הפארמצבטית תרכובות ואת הסלים.
דרך אחת כדי לתקנן את הבדיקות למועמדים סמים חדשים היא לעקוב אחר הנחיות המשמש להגדרת הרגישות פטריות בהגדרות קליני, כגון קלינית והנחיות M27 מכון תקנים מעבדה (CLSI)-A3. עם זאת, בדיקות רגישות פטריות אלה מגבילות מדי, לא עשה שיקול וריאציה בחילוף החומרים על פני מינים, כפי שהם הוקמו רק עבור כמה סוכנים בחר. לדוגמה, הם לא לוקחים בחשבון את צרכי חילוף החומרים שאינם התססת שמרים.
פרוטוקול זה מאפשר את ההערכה של פעילות של תרכובות פטריות פוטנציאליים והוא מיושם כאן לחיפוש פטריות פפטידים. הוא מבוסס על ציר microdilution רגישות הבדיקה מן ההנחיות CLSI M27-A3 עם שינויים לייעל את ההקרנה של תרכובות חדשות8,9. שינויים אלה מאפשרים השימוש כמויות קטנות של המתחם, וריאציות של טמפרטורה או inoculum הראשונית, מדיה שונים לצמיחה pre-test אופטימלית, תוך המתקנות את התוצאות עם השימוש של הפניה תבחיני כפקדים. שיטה זו, עם השימוש של תרבות רב טוב צלחות, מאפשר למסך במהירות ובאמינות מספר רב של תרכובות.
עקב הגמישות שלה, פרוטוקול זה יכול לשמש עם מחלקות שונות הכימי של תרכובות ונגד מיקרואורגניזמים אחרים, עם כמה עיבודים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. פתרונות ומדיה
2. תנאי הגידול Inoculum פטרייתי
3. פפטידים (סוכן לא ידוע)
4. התייחסות תבחיני (פקדי חיובי)
5. פטריות Assay
הערה: במבחנה מבחני פטריות מבוצעות בהתבסס על ציר microdilution רגישות הבדיקה מן ההנחיות קלינית ומכון תקנים מעבדה (CLSI) M27-A3 עם מספר שינויים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המיקרופון מוגדר הריכוז הנמוך ביותר במתחם מיקרוביאלית כי לחלוטין מעכב צמיחה פטרייתי גלוי בסוף תקופת הדגירה. מאחר המטרה של פרוטוקול זה יש שיטה מהירה תבחיני פוטנציאליים מסך, כל טוב עם הדומה הבארות ריק ברור מדיה נחשבת תוצאה חיובית, ואילו בכל טוב עם עכירות מקביל הבארות שליטה שלילי/צמיחה נחשב שלילי. עם זאת, אם יש אינטרס לדעת אם כח נתון הוא fungistatic או אנטי-פטרייתית, המדיה מן הבארות חיובי יכול גם להיות מצופה על גבי אגר דקסטרוז Sabouraud או נבדק על ידי עוד מבחן הכדאיות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בדיקות Microdilution יכול לנתח את הפעילות נגד פטריות פוטנציאלי של מטרה מורכבים באמצעות כמויות קטנות של המתחם, באותו זמן לבחון אותה בטווח ריכוזים. בהתאם לכך, פרוטוקול זה מומלץ כשלב ראשון סינון עבור פוטנציאל תרכובות חדשות נגד פטריות. פרוטוקול המובאת כאן מבוססת על פרוטוקול M27-A3, תוכנן בתחילה כדי לסייע בבחירה של טיפול נגד פטריות במרפאות, וניתן להתאים מגוון של תרכובות חדשות נגד פטריות. בסך הכל, פרוטוקול זה יכול להתמקד התכונות physicochemical של התמצית או מורכבים. לדוגמה, מועמד פוטנציאלי ב וזמינותו שקרית להופעתו לא יעיל כי מ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים אין לחשוף.
אנו מודים שכמיות-ברזיל, CNPq-ברזיל, FAP/DF עבור תמיכה כספית. אנחנו אסירי תודה ד ר הוגו קוסטה פאיס עבור תיקון כתב היד.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| <חזק>מדיה וריאגנטים | |||
| RPMI 1640 בינוני עם L-גלוטמין, ללא נתרן ביקרבונט | Thermo Fisher | 31800-022 | |
| 3-(N-morpholino) חומצה פרופאן סולפונית (MOPS) (o que a gente usa tem um só dio, completa o nome dele please) | Sigma-Aldrich | השתמש כדי לחצץ 2X RPMI בינוני | |
| נתרן כלורי (NaCl) | Dinâ נציץ | 1528-1 | 137 מ"מ למי מלח חוצץ פוספט (PBS) |
| אשלגן כלורי (KCl) | J.T.Baker | 3040-01 | 2.7 מ"מ למי מלח חוצץ פוספט (PBS) |
| נתרן פוספט דו-בסיסי (Na2HPO4) | סיגמא-אולדריץ' | V000129 | 10 מ"מ למי מלח חוצץ פוספט (PBS) |
| אשלגן דימימן פוספט פוספט (KH2PO4) | סיגמא-אולדריץ' | 60230 | 2 מ"מ למי מלח חוצץ פוספט (PBS) |
| BD Difco Sabouraud מרק דקסטרוז | BD | 238230 | |
| BD Difco Sabouraud דקסטרוז אגר | BD | 210950 | |
| גליצרול | סיגמא-אולדריץ' | V000123 | 35% עבור (soluç &אטילדה; o de estoque? Criopreservaç &אטילדה; o?) |
| סטריליים | Para diluiç &אטילדה; o das drogas na diluiç &אטילדה; o seriada | ||
| <תרופות חזקות>אנטי פטרייתיות | |||
| אמפוטריצין B | סיגמא-אולדריץ' | A2942 | |
| פלוקונזול | סיגמא-אולדריץ' | F8929 | |
| Caspofungin | Sigma-Aldrich | PHR1160 | |
| <חזק>פלסטיק חרוטי חזק> | |||
| 50 מ"ל | Sarstedt | 62.547.254 | |
| צלחת פטרי | J.Prolab | 0304-5 | |
| 96 צלחת | באר קורנינג | 3595 | |
| מאגר תמיסה סטרילית | KASVI | K30-208 | השתמש כדי לזרוק את הפתרונות באמצעות הציוד הרב-ערוצי פיפט |
| <חזק>ציוד וחומרים אחרים | |||
| מיקרוסקופ אופטי | ניקון | E200MV | |
| צנטריפוגה | תרמו פישר | MegaFuge 16R | |
| חממה | Ethik Technology | 403-3D | מוגדר ל 37° C |
| שייקר | ניו ברונסוויק סיינטיפיק | אקסלה E25 | מוגדר ל-37° C, 200 סל"ד |
| תא ספירת תאים, נויבאואר | BOECO גרמניה BOE | 13 | |
| פיפטה רב ערוצית | HTL | 5123 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה