כאן, אנו מתארים את פרוטוקולי האימות גנטי וכימי של c-פוס, Dusp1 כמטרה סמים בלוקמיה באמצעות העכבר גנטי, humanized במבחנה ויוו מודלים. בשיטה זו ניתן ליישם כל מטרה עבור אימות הגנטי ופיתוח טיפולית.
מאמר שיטה
כאן, אנו מתארים את פרוטוקולי האימות גנטי וכימי של c-פוס, Dusp1 כמטרה סמים בלוקמיה באמצעות העכבר גנטי, humanized במבחנה ויוו מודלים. בשיטה זו ניתן ליישם כל מטרה עבור אימות הגנטי ופיתוח טיפולית.
ההדגמה של מעכבי טירוזין קינאז (TKIs) בטיפול לוקמיה מיאלואידית כרונית (CML) יש בישרה עידן חדש ותרופות לסרטן. עם זאת, אוכלוסיה קטנה של תאים אינו מגיב לטיפול TKI, והתוצאה היא מחלה שיורית מינימלית (MRD); אפילו הכי חזק TKIs להיכשל כדי למגר תאים אלה. תאים אלה MRD לשמש מאגר לפתח עמידות לטיפול. למה TKI הטיפול אינו יעיל נגד MRD תאים לא ידוע. גורם הגדילה איתות הייתה שם בתמיכה ההישרדות של MRD תאים במהלך הטיפול TKI, אך הבנה מכניסטית לוקה בחסר. מחקרים שנעשו לאחרונה הראו c מוגברות-פוס ואת הביטוי Dusp1 כתוצאה מתכנסת oncogenic פקטורי גדילה איתות בתאים MRD לתווך TKI ההתנגדות. עיכוב גנטי וכימי של c-פוס, Dusp1 מעבד לוקמיה מיאלואידית כרונית רגישים להפליא TKIs ומרפא CML בשני המודלים העכבר humanized גנטי. זוהו הגנים האלה היעד באמצעות מיקרו-מערכים מרובים TKI רגיש ותאים עמידים. כאן, אנו מספקים שיטות אימות היעד באמצעות העכבר במבחנה ויוו מודלים. שיטות אלה ניתן בקלות ליישם כל מטרה עבור אימות הגנטי ופיתוח טיפולית.
פעילות קינאז טירוזין המכונן של BCR-ABL1 פיוז'ן אונקוגן גורמת CML, אשר מהווה הרציונל למקד את פעילות קינאז על ידי מעכבי מולקולה קטנה. ההצלחה של TKIs בטיפול בחולי CML מהפכה הקונספט של טיפול ממוקד1,2. לאחר מכן, טיפול אנטי-קינאז כתרופה דיוק פותחה עבור מספר ממאירויות אחרות, כולל גידולים מוצקים. עד כה, מעכבי קינאז יותר משלושים אושרו על ידי ה יונייטד המדינה-FDA לטיפול גידולים ממאירים שונים. בעוד TKI טיפול יעיל מאוד בדיכוי המחלה, זה לא מרפא. חוץ מזה, אוכלוסיה קטנה של תאים סרטניים נמשכת במהלך הטיפול:4,3,MRD5. אפילו חולים אשר הראו הפוגה מלאה נשארים עם MRD, אשר בסופו של דבר התוצאות ב- relapse אם לא באופן רציף מודחקים. לכן, מיגור של MRD תאים נדרש כדי להשיג היענות עמיד או ריפוי. לוקמיה מיאלואידית כרונית מייצג פרדיגמה ערך להגדרת המושג דיוק רפואה, מנגנונים של oncogenesis, הרפוי רציונלי מכוון מטרה, התקדמות המחלה תרופתיים. עם זאת, גם היום, מנגנון נהיגה מוות תאי TKI-induced בתאי סרטן אינה מובנת במלואה, ולא למה תאים MRD (המורכב של תאי גזע לוקמיה [LSCs]) עמידים ממהותם4,TKIs6. למרות זאת, התופעה של "תלות אונקוגן" כדי oncoprotein קינאז מוטציה הוא בהפרות יעילות TKI איפה עיכוב חריפה של יישוב אונקוגן מאת TKIs גורם מכת oncogenic שמוביל מסיבי proapoptotic תגובה או תרדמה בתא באופן תלוי-ההקשר6,7,8,9. עם זאת, בהתפשטות אונקוגן התלות מכניסטית לוקה בחסר. מחקרים שנעשו לאחרונה לסבך כי גורם הגדילה איתות abrogates אונקוגן התלות, כתוצאה מכך מקנה עמידות TKI טיפול10,11,12. לכן, כדי לזכות בתובנה המנגנון של אונקוגן התלות, ביצענו הגנום כולו ביטוי פרופיל של BCR-ABL1 מכורים ותאים nonaddicted (גדל עם גורמי גדילה), אשר גילה ש- c-פוס ו Dusp1 הם מתווכים קריטי של אונקוגן התמכרות13. המחיקה גנטי של c-פוס, Dusp1 תאים קטלניים BCR-ABL1-ולהבעת סינתטי, העכברים המשמשים את הניסוי לא לפתח לוקמיה. יתר על כן, עיכוב של c-פוס, DUSP1 על ידי מעכבי מולקולה קטנה נרפא BCR-ABL1-induced CML בעכברים. התוצאות מציגות רמות הביטוי של c-פוס, Dusp1 להגדיר את סף מוות של תאים סרטניים, כזה כי רמות נמוכות יותר להתייעץ סמים רגישות בעוד רמות גבוהות יותר לגרום התנגדות טיפול13.
כדי לזהות את הגנים נהיגה התלות אונקוגן, ביצענו כמה הביטוי הגנום כולו פרופיל ניסויים בנוכחות גורם הגדילה של TKI (imatinib) באמצעות העכבר - והן תאים נגזר חולה CML (K562). נתונים אלה נותחו במקביל עם ערכות נתונים חולה CML המתקבל CD34+ hematopoietic תאי גזע לפני ואחרי הטיפול בעזרת imatinib. ניתוח זה חשף בשלושה גנים (גורם שעתוק [c-פוס], ירידה לפרטים כפול פוספטאז 1 [Dusp1], ולא של RNA-מחייב חלבון [Zfp36]) אשר הם בדרך כלל upregulated תאים עמידים TKI. כדי לאמת את המשמעות של גנים אלו משוחח עמידות לתרופות, אנחנו ביצעו ניתוח במבחנה , ויוו צעד אחר צעד. רמות ביטוי של גנים אלה שאושרו על-ידי qPCR בזמן אמת (RT-qPCR), סופג המערבי תאים עמידים לתרופות. יתר על כן, ביטוי cDNA של נוקאאוט מאת shRNA סיכות של c-פוס, Dusp1, Zfp36 גילה כי c מוגברות-פוס וביטויים Dusp1 הם מספיק והכרחי להיוועץ TKI ההתנגדות. לכן, אנו לבצע אימות ויוו באמצעות העכבר מודלים עם c-פוס Dusp1 בלבד. לשם אימות גנטי של c-פוס, Dusp1, אנו נוצר c-פוסחליל/חליל ROSACreERT-inducible עכברים (מותנה נוקאאוט)14 , חצה אותם עם Dusp1- / - (ישר נוקאאוט)15 כדי להפוך ROSACreERT2-c-פוסחליל/חליל Dusp1- / - העכברים הטרנסגניים-כפול. תאי מח עצם-derived c-Kit+ (מ- c-פוסחליל/חליל-, Dusp1- / --, ו- c-פוסחליל/חלילDusp1- / -) המבטאת BCR-ABL1 היו שנותחה במבחנה המושבה יוצרי assay יחידה (CFU), ו . ב ויוו על ידי השתלת מח עצם בעכברים אולם לקרינה, כדי לבדוק את הדרישה של c-פוס, Dusp1 לבד או יחד בפיתוח לוקמיה. באופן דומה, העכבות כימי של c-פוס DFC (difluorinated כורכומין)16 , Dusp1 על ידי BCI (benzylidene-3-(cyclohexylamino)-2,3-dihydro-1H-inden-1-one)17 נבדקו במבחנה, ויוו באמצעות BCR-ABL1-המבטאת עצם תאי מח-derived c-Kit+ מן העכבר (WT) פראי-סוג. כדי לאשר את הדרישה של c-פוס, Dusp1 בתאי גזע לוקמיה, אנחנו מנוצל דגם העכבר CML איפה BCR-ABL1 היה במיוחד שנגזרות בתאי גזע שלו דוקסיציקלין (ט-transactivator מבטא תחת מאתר תאי לוקמיה (SCL) הגן 3' משפר... תקנה)18,19. השתמשנו מח עצם לין–סרוק+c-Kit+ (LSK) תאים מחלון אלו עכברים ב וזמינותו השתלת ויוו. יתר על כן, הקמנו phopsho-p38 רמות, הביטוי של IL-6 כמו דינמי-טוהר הפרמה קופ סמנים ביולוגיים עבור Dusp1 וניגוד c-פוס, בהתאמה, ויוו. לבסוף, כדי להרחיב את המחקר עבור רלוונטיות האדם, נגזר החולה CD34+ תאים (המקביל בתאי c-Kit+ של עכברים) היו כלפיהן לטווח ארוך במבחנה. מתחילה תרבות תא מבחני (LTCIC) ומודל העכבר humanized ויוו של לוקמיה מיאלואידית כרונית20,21. העכברים immunodeficient הושתלו עם לוקמיה מיאלואידית כרונית CD34 + תאי, ולאחריו הטיפול בתרופה וניתוח של הישרדות cell לוקמיה אנושי.
בפרויקט זה, אנו מפתחים שיטות זיהוי המטרה והאימותים באמצעות כלים גנטיים והן כימית, שימוש במודלים פרה שונה. שיטות אלה ניתן להחיל בהצלחה כדי לאמת את מטרות נוספות לפתח שיטות כימיות לפיתוח טיפולית.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כל הניסויים בוצעו בהתאם לקווים המנחים של טיפול בעלי חיים מוסדיים ושל שימוש הוועדה (IACUC) ב חולים רפואי במרכז (CCHMC סינסינטי ילדים). דגימות אנושי (מוניטור רגיל וזה מ לוקמיה מיאלואידית כרונית (p210-BCR-ABL +) לוקמיה) התקבלו באמצעות פרוטוקולים שאושרו על-ידי ועדה מוסדית (מוסדיים המנהלים: Federalwide אבטחת #00002988 לילדים בסינסינטי מרכז רפואי בית חולים), הסכמה הודיע התורם CCHMC, באוניברסיטת סינסינטי.
1. בזמן אמת qPCR ניתוח
2. המערבי סופג
הערה: כל תא תמציות הוכנו על-ידי הוספת µL 250 1 x פירוק מאגר כפי שמתואר Kesarwani et al.13 שיושלם עם מעכב פרוטאז קוקטיילים וחדר פוספטאז מעכב 2 קוקטיילים.
3. הדור של עכברים נוקאאוט
4. בידוד תאי c-Kit+ של מח העצם
5. התמרה חושית
6. המושבה יוצרי UnitAssays
7. השתלת ואת וזמינותו התמותה
8. העכברים הטרנסגניים מודל של לוקמיה BCR-ABL1
9. בהערכת Vivo BCI ופעילות DFC
10. לטווח ארוך. מתחילה תרבות Assay תא
הערה: וזמינותו LTCIC בוצעה כפי שתואר לעיל25.
11. humanized דגם העכבר באמצעות CML CD34 תאים+
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
התמכרות אונקוגן היה מעורב יעילות טיפולית של TKIs. עם זאת, מנגנוני נהיגה התלות אונקוגן אינם מובנים. אנו לבצע ניתוחים ביטוי ג'ין לא משוחד מרובים כדי לזהות את הרכיב הגנטי מעורב מנצח ההתמכרות. ניתוחים אלה חשף קולטנים את upregulation של שלושה גנים ג-פוס, Dusp1, Zfp36, בתאי סרטן אשר אינם תלויים איתות oncogenic להישרדות ומהוות, לפיכך, רגישות לטיפול TKI. Downregulation של c-פוס, Dusp1 על ידי נוקאאוט בתיווך shRNA מספיקה לשחזר את הסמים רגישות בשן אחרת TKI עמידים תאים.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
עבור חלק הארי של תאים סרטניים, התגובה הטיפולית TKI מתווך על ידי מצור של אותות טירוזין-קינאז-oncoprotein אשר הגידול הוא מכור. עם זאת, יחסית מעט מאוד ידוע על איך מיעוט של תאים סרטניים לתרום MRD לברוח אונקוגן התלות וטיפול4. מחקרים שנעשו לאחרונה חשף כי גורם הגדילה איתות שמתווכת תרופתיים לוקמיה והן גידולים מוצק איברים. הדבר מצביע על מנגנונים מולקולריים שונים עשויה ביסוד מהותי להתנגדות10,11,12. כדי להבין את המנ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים אין לחשוף.
המחברים מודים ל ג ש דיילי למתן התאים BaF3 ועל ה-וואי ובונה רייה ט עבור MSCV-BCR-ABL-Ires-YFP. המחברים מודים ל מ קרול למתן דגימות החולה מן המשבר הפיצוץ לוקמיה מיאלואידית כרונית. מחקר זה נתמך על ידי מענקים כדי M.A. מ- NCI (1RO1CA155091), לוקמיה Research Foundation, קרן V ומ NHLBI (R21HL114074-01).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| <חזק>חומרים ביולוגיים | |||
| RPMI | Cellgro (קורנינג) | 15-040-CV | |
| DMEM | Cellgro (קורנינג) | 15-013-CV | |
| IMDM | Cellgro (קורנינג) | 15-016-CVR | |
| RetroNectin רקומביננטי שבר פיברונקטין אנושי | Takara | T100B | |
| MethoCult GF M3434 (מתיל צלולוז לעכבר) | תאי גזע | 3434 | |
| MethoCult H4434 קלאסי (מתיל צלולוז ל-CFU אנושי) | תאי גזע | 4434 | |
| 4-הידרוקסיטאמוקסיפן | סיגמא | H6278 | |
| עכברים רקומביננטיים SCF | Prospec | CYT-275 | |
| עכברים רקומביננטיים Flt3-Ligand | Prospec | CYT-340 | |
| רקומביננטי עכברים IL-6 | Prospec | CYT-350 | |
| עכברים רקומביננטיים IL-7 | Peprotech | 217-17 | |
| DFC | LKT Laboratories Inc. | D3420 | |
| BCI | Chemzon Scientific | NZ-06-195 | |
| מעבדת | LC | I-5508 | |
| כורכומין | סיגמא | 458-37-7 | |
| NDGA | Sigma | 500-38-9 | |
| Penn/Strep | Cellgro (corning) | 30-002-CI | |
| FBS | אטלנטה ביולוגי | S11150 | |
| טריפסין EDTA 1x | Cellgro (קורנינג) | 25-052-CI | |
| 1x PBS | Cellgro (קורנינג) | 21-040-CV | |
| L-גלוטמין | Cellgro (קורנינג) | 25-005-CL | 5 מ"ג/מ"ל מלאי במים |
| Puromycin | Gibco (טכנולוגיות חיים) | A11138-03 | |
| HEPES | Sigma | H7006 | |
| Na2HPO4.7H2O | Sigma | S9390 | |
| פרוטאמין סולפט | Sigma | P3369 | 5 מ"ג/מ"ל מלאי במים |
| תמיסת טריפאן כחול (0.4%) | Sigma | T8154 | |
| DMSO | Cellgro (קורנינג) | 25-950-CQC | |
| WST-1 | Roche | 11644807001 | |
| 0.45 μ מסנן דיסק אקרו M | PALL | 2016-10 | |
| 70 μ m תאי ניילון Stariner | Becton Dickinson | 352350 | |
| FICOL (Histopaque 1083) (פוליסוכרוז) | Simga | 1083 | |
| PBS | Corning | 21040CV | |
| LS Columns | Miltenyi | 130-042-401 | |
| קוקטייל מעכב פרוטאז | Roche | קו-RO | |
| קוקטייל מעכב פוספטאז 2 | סיגמא | P5762 | |
| Nitrocullulose Membrane | Bio-Rad | 1620115 | |
| SuperSignal West Dura Extended Duration Substrate ( chemiluminiscence substrate) | Thermo Scientific | 34075 | |
| CD5 | eBioscience | 13-0051-82 | |
| CD11b | eBioscience | 13-0112-75 | |
| CD45R (B220) | BD biosciences | 553092 | |
| CD45.1-FITC | eBioscience | 11-0453-85 | |
| CD45.2-PE | eBioscience | 12-0454-83 | |
| hCD45-FITC | BD Biosciences | 555482 | |
| Anti-Biotin-FITC | Miltenyi | 130-090-857 | |
| אנטי-7-4 | eBioscience | MA5-16539 | |
| Anti-Gr-1 (Ly-6G/c) | eBioscience | 13-5931-82 | |
| Anti-Ter-119 | eBioscience | 13-5921-75 | |
| Ly-6 A/E (Sca1) PE Cy7 | BD | ||
| 558612 נגמ"ש CD117 | BD | ||
| BD Pharm Lyse | BD | ||
| BD Cytofix/Cytoperm (תמיסת קיבוע וחדירה) | BD | ||
| BD סלסול/וושינגטון (תמיסת חדירה ושטיפה לזרימת פוספו) | BD | ||
| פוספו p38 | טכנולוגיות איתות תאים | 4511S | |
| סה"כ p38 | טכנולוגיות איתות תאים | 9212 | |
| בקרת IgG עכבר | BD | ||
| קמח אלכסה 488 מצומד | Invitrogen | A-11034 | |
| סידן כלוריד | Invitrogen | K278001 | |
| 2x HBS | Invitrogen | K278002 | |
| EDTA | Ambion | AM9261 | |
| BSA | Sigma | A7906 | |
| צינורות נימי דם | Fisher | 22-260-950 | |
| צינור איסוף דם | Giene Bio-One | 450480 | |
| יילוד עגל סרום | אטלנטה ביולוגי | S11295 | |
| Erythropoiein | Amgen | 5513-267-10 | |
| SCF אנושי | Prospec | CYT-255 | |
| אנושי IL-3 | Prospec | CYT-210 | |
| G-SCF | Prospec | CYT-220 | |
| GM-CSF | Prospec | CYT-221 | |
| MyeloCult (מדיה לבדיקת LTCIC) | Stem Cell Technologies | 5100 | |
| הידרוקורטיזון נתרן המיסוקסינט | טכנולוגיות תאי גזע | 7904 | |
| MEM אלפא | Gibco | 12561-056 | |
| 1/2 סמ"ק Lo-Dose u-100 מזרק אינסולין 28 G1/2 | Becton Dickinson | 329461 | |
| Mortor pestle | Coor tek | 60316 ו- 60317 | |
| איזופלורן (איזותזיה TM) | באטלר שיין | 29405 | |
| SOC | ניו אינגלנד Biolabs | B90920s | |
| Ampicillin | Sigma | A0166 | 100 מ"ג/מ"ל מלאי במים |
| בקטו אגר (אגר) | Difco | 214050 | |
| מרק נהדר | בקטון דיקינסון | 243820 | |
| אגרוז | Genemate | E-3119-500 | |
| דוקסיציקלין צ'או | TestDiet.com | 52662 | RMH1500 שונה, ניתן לחיטוי 5LK8 עם 0.0625% דוקסיציקלין |
| טמוקסיפן | סיגמא | T5648 | |
| יודוניטרוטרזוליום כלוריד | Sigma | I10406 | |
| <ערכות חזקות>ערכות | |||
| Dneasy ערכת דם ורקמות | Qiagen | 69506 | |
| GoTaq Green (טאק פולימראז עם צבע מטען ירוק) | Promega | M1722 | |
| miRNeasy Mini Kit (ערכת בידוד RNA) | DNA של Qiagen | 217084 | |
| (טיפול ב-DNA עבור RT PCR) | אמביון, Life Technologies | AM1906 | |
| Superscript III סינתזת גדיל ראשון (טרנסקריפטאז הפוך לסינתזת cDNA) | Invitrogen | 18080051-SYBR | |
| Green (תערובת פולימראז טאק עם צבע אינטרצ'לציה ירוק ל-qPCR) | ערכת MicroBead | 1725270-CD117 | |
| Miltenyi | 130-091-224 | ||
| תרבית אנושית לטווח ארוך יוזמת בדיקת תאים | Stemp Cell Technologies | ||
| Instruments | |||
| NAPCO series 8000 WJ CO2 incubator | Thermo scientific | ||
| Swing Bucket rotor cetrifuge 5810R | Eppendorf | ||
| TC-10 מונה תאים אוטומטי | Bio-RAD | ||
| C-1000 Thermal Cycler | Bio-RAD | ||
| Mastercycler Real Plex 2 | Eppendorf | ||
| ChemiDoc Imaging System (מערכת הדמיה לג'לים וכתמים מערביים) | Bio-RAD | 17001401 | |
| Hemavet (מונה בולד) | Drew-Scientific | ||
| LSR II (FACS analyzer) | BD | ||
| פורטסה I (מנתח FACS) | BD | ||
| FACSAriaII (סדרן FACS) | BD | ||
| מעמד מגנט | Miltenyi | ||
| Irradiator | J.L. Shepherd and Associates, San Fernando CA | Mark I דגם 68A | מקור Cs 137 |
| <חזק>עכברים | |||
| ROSACreERT2 | מעבדת | ||
| Scl-tTA | ד"ר קלאודיה הוטנר' s lab | ||
| BoyJ | מתקן ליבת עכבר ב-CCHMC | ||
| C57Bl/6 | של מעבדת | ||
| ב-CCHMC | |||
| ROSACreERT2/c-Fosfl/fl Dusp1-/- | תוצרת הבית | ||
| ROSACreERT2/c-Fosfl/fl | תוצרת הבית | ||
| Cells | |||
| BaF3 | מתנה מג'ורג' דיילי, בית הספר לרפואה של הרווארד, בוסטון | ||
| WEHI | מתנה מג'ורג' דיילי, בית הספר לרפואה של הרווארד, בוסטון | ||
| CML-CD34+ ותאי CD34+ רגילים | בית החולים האוניברסיטאי, אוניברסיטת סינסינטי |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה