מודלים בעלי חיים חיוניים לפיתוח תרופות טרום-קלינית בכל שלב של התהליך מזיהוי של CPPs הרומן, לימודי biodistribution פצה, מנגנון התמרה, בסופו של דבר בדיקה ליעילות של המטען המועבר באמצעות הרומן הזה CPPs כמו וקטורים. ישנן שיטות רבות המשמשות בשימוש נפוץ כדי להעריך biodistribution פצה כגון היסטולוגיה, הדמיה גרעינית התרופה (הזהיר ו PET), ו vivo אופטי הדמיה12. שיטות הדמיה גרעינית יכול להיות מסורבל בשל הזמינות מוגבלת של בעלי חיים קטנים ומערכות לחיות מחמד, כמו גם את היכולת לייצר radiolabel-מחוות הסמים, אשר דורשים את המומחיות של רדיוכימאי. לעומת זאת, תוויות פלורסנט הם הרבה יותר פשוט והוא יכול להיות חסכוני לעבוד עם. הפרוטוקול המתואר במאמר זה מאפשר ניתוח מהיר של ביוהפצה באמצעות שיטות מרובות. Vivo Ex הדמיה האיבר האופטי האיברים מאפשר השוואה מיידית של זריחה על פני רקמות שונות וקבוצות טיפול והוא יכול לזהות ספיגת איברים וזמן כדי ספיגת שיא באיבר העניין באופן כמותי למחצה. היסטולוגיה רקמות כמותי דורש עיבוד נרחב יותר לטיפול, סעיף, תמונה, ולנתח רקמות, אבל זה מספק יותר נתונים על רמת מיקרוסקופיים והוא טכניקה סטנדרטית הנוכחי. כדאי לציין כי השוואה ישירה, כמותית על פני שתי טכניקות אינו אפשרי, משום שניתן לראות את האוטופלואורסצנטית עם כל טכניקה עבור איברים שונים ואורכי גל עירור משתנה באופן משמעותי.
חלק חשוב בפרוטוקול זה הוא בחירת fluorophore ימינה כדי תווית מועמד CPPs עבור ניסויים. בעיה פוטנציאלית אחת היא החפיפה של ספקטרום, אשר יכול להיות בעייתי כאשר fluorophores מרובים נחוצים. המדיה הפלואורסצנטית DAPI הרכבה ו-Cy 5.5 אין ספקטרום חופפים. עם זאת, עבור יישומים מסוימים שבו fluorophores מרובים נחוצים, הסיכון של חפיפה ספקטרלי צריך להיחשב בזהירות. בהתאם למערכת הנמצאת בשימוש, בחירת fluorophore עשויה להיות מוגבלת. לכן, הידע על יכולות המערכת הוא המפתח. פלורסנט מערכות אופטיות מנוצל הטוב ביותר עם fluorophores הרבה אדום או קרוב אינפרא אדום בשל ספיגת רקמות גבוהות של אורכי גל קצרים13. Fluorophores בטווח של חלבון פלורסנט ירוק משופר יש מגבלה גדולה, כי יש האיבר משמעותי מאוד autoפלואורסצנטי לראות את הגל שלה עירור, במיוחד במוח רקמת הכבד. בהתאם לתנאים של ניסוי, fluorophores כמה הם הטובים ביותר להימנע. כמה מסיסים במים fluorophores אורגני יש אינטראקציה חזקה עם bilayers השומנים, אשר יכול לגרום תוצאות חיוביות שווא. מכאן, נקיטת צעדים כדי לקבוע אם fluorophore יש זיקה חזקה לרקמת העניין הוא רצוי14. גורם נוסף לשקול הוא בחירת השיטה המתאימה של הקונפפור, אשר יכול להיות פרמטר חשוב המשפיע על התוצאות. ניתן לתייג את cpps באמצעות קשר כלשהו בין n-הטרמינוס של הפפטיד לבין קבוצת קרבוקסילי של הצבע כגון cy 5.5-בי. הטיפול צריך להילקח, כי מנגנון התמרה של רוב CPPs אינו מובן בפרוטרוט והקוניוגציה בקצה אחד עשויים להשפיע על מנגנון ספיגת יותר כך מאשר בקצה השני. אפשרות נוספת עבור תיוג CPPs היא דרך biotinylating N-טרמינוס עבור בניינים כדי fluorescently בתווית. באמצעות אסטרטגיה זו יש את הנוחות של מתן אפשרות שונים פלורסנט streptavidin השערים להיות מנוצל. עם זאת, מגבלה אפשרית של אסטרטגיה זו היא שקומפלקס ביוטין-streptavidin הוא מבנה גדול, שעלול להפריע להתמרה.
פלורסנט מערכות דימות אופטי הם אסטרטגיה יעילה ליצירת השוואה של זריחה על פני איברים שונים וטיפולים ביעילות אך אינם מסוגלים לייצר מידה כמותית של ריכוזים מוחלטים ברקמה. זאת בשל השפעות פיזור אור בתוך הרקמה, אשר מורכב עוד יותר על ידי מגוון טבעי בגדלים וצפיפויות רקמות, והבדלים ב vascularity עם פיזור משתנה של זריחה. הרקמה האוטומטית של רקמות יכול להיות גורם גם, בשל התרחשות טבעית מקורות ביוכימיים כגון קולגן, או מקורות תזונתיים כמו כלורופיל במזון13.
היסטולוגיה היא השיטה הנפוצה ביותר למדידת biodistribution והוא עלול לשמש כדי למדוד במדויק ולהשוות ספיגה בין רקמות שונות לאורך זמן. בעיות פיזור אור נמנעים באמצעות שיטה זו מכיוון שכל הרקמות מנות לעובי זהה15. היתרון העיקרי של שיטה זו הוא היכולת לכלול מדבקות פלורסנט נוספות החותמות עבור אימונוהיסטוכימיה. למרות התוספת של fluorophore אחר יכול להפוך הדמיה מאתגרת יותר, השימוש בתוויות פלורסנט יכול להיות שימושי עבור לוקליזציה של CPP לתאי תאיים מסוימים, כמו lysosomes או המיטו,. ניתן להשתמש בנוגדן לניסוי מיקרוסקופ ממוקד כדי לקבוע אם המועמד העומד בפני מבנה CPP משתמש במבנה של עניין, שיכול להראות את הפוטנציאל של CPP כסוכן משלוחים. מגבלה אחת של שיטה זו היא כי הכנת שקופיות מדגימות איברים יכול לגזול זמן רב, עבודה אינטנסיבית, ונטייה לטעות אנוש12,15. כאשר שקופיות הדמיה, הטיפול צריך להילקח לא תמונה באותו מיקום יותר מדי זמן כדי למנוע הלבנת. Photobleaching לבנת חלק יהיה בלתי נמנע, בהתאם לרגישות של fluorophore. הטיפול צריך להילקח בכל שלב של פרוטוקול זה כדי להגן על דגימות מאור הסביבה ולאחסן אותם כראוי16. מומלץ לאחסן את השקופיות ב -4 ° c, מוגנות באור, להדמיה עתידית.
קיימות מגוון שיטות זמינות למדידת ההתפלגות הביומלית של מועמד CPP המחייב ציוד מיוחד והוא יכול להפיק תוצאות דומות, למרות שהם עשויים לדרוש תיוג מורכב יותר של CPP. הפרוטוקול המתואר במאמר זה משתמש בשתי שיטות תואמות כדי לייצר ביעילות נתוני הפצה ביולוגיים בהקשר של מערכת חיים, תוך מתן אפשרות לרכישת מידע מעמיק יותר אודות פפטיד הפנמה בתוך תאים מאותה דוגמית, ובכך לחתוך את מספר בעלי החיים הדרושים למחקר על ידי חצי. שיטות אלה שימשו להפקת הנתונים הנ ל, אשר מדגימים כי שתי השיטות יכולות להיות מנוצל באופן רציף באותה חיה, ואת איכות הנתונים שנוצרו על ידי כל אחד. התוצאות שלנו מדגישות גם את חוסר היכולת לתאם ישירות את התוצאות בין שתי הטכניקות באופן כמותי.