השלבים העיקריים של השיטה המתוארים כדי לקבל השעיה של תא יחיד של לויקוציטים ברחם מסוכמים באיור 3. באיור 2B מוצגת אסטרטגיית הגטינג הבסיסית של FACS המשמשת לזיהוי שלוש קבוצות משנה של g1 ILCs בעכברים מסוג B6: uILC1 (CD49a+Eomes-), trNK (CD49a+Eomes+) ותאי cNK (CD49a-Eomes+). ניתוח נוסף של אוכלוסיות אלה יכול להתבצע כדי לחקור סמנים משטחיים תאיים שונים של g1 ILCs. כדוגמה, ניתן להעריך את הביטוי המשותף של קולטני IFN-ɣ ו-MHC עצמי בתאי uILC1, trNK ו-cNK לאחר גירוי עם נוגדן נגד NK1.1 (איור 7).
בהתאם לשאלת המחקר, ניתן להתאים הן את הפרוטוקול (איור 3) והן את לוח הנוגדנים. חשוב לציין, מומלץ להשתמש בנוגדנים נגד NK1.1 ואנטי-NKp46 בלוח FACS אחד עבור g1 ILC גטינג (איור 2B ושולחן 1). יש לציין כי g1 ILCs המתקבלים מדם, טחול או כבד יש ביטוי גבוה יותר של NKp46 על פני השטח שלהם מאשר המקבילה הרחם (איור 8). כתמי משטח עבור NK1.1 מעניקים הפרדה טובה יותר ומאפשרים ג'י-אי-סי רחם 1 להיות מגודרים בקלות (איור 8). בעוד NKp46 מתבטא רק על ידי כל זני העכבר, האנטיגן NKR-P1C המוכר על ידי נוגדן נגד NK1.1 PK136 מתבטא רק על ידי כמה זני עכבר, כולל C57BL/6 (כלומר, B6), FVB/ N, ו- NZB, אך לא ב- AKR, BALB / c, CBA / J, C3H, DBA / 1, DBA / 2, NOD, SJL, או 129. בנוסף, אם החוקר מתכוון לחקור קולטני תאי NK חיוניים כגון קולטני MHC Ly49, חשוב להיות מודעים לשינויים אליליים בזני עכבר מעבדה, אשר מסכמים את השונות הגבוהה של קולטנים דמויי אימונוגלובולין דמויי רוצח אנושי (KIR). יתר על כן, אם התאים להיות מגורה עם NK1.1 לבדיקה פונקציונלית, כפי שתואר קים, S. et al.20, זה עשוי להיות רצוי להכתים את התאים עם אנטי NKp46 ולא אנטי NK1.1, כמו אנטיגן NKR-P1C עשוי להיות תפוס על ידי אנטי NK1.1 crosslinking או ירידה קולטן עשוי לעקוב אחר הגירוי. תפוסת הקולטן או הירידה עלולות לעכב את הכתמים עם אותו נוגדן המשמש להמרצתו.
בעיה נפוצה עם דיסוציאציה רקמות אנזימטיות היא שינוי של אפיטופים פני השטח על תאים על ידי אנזימים המשמשים למדיום עיכול. לדוגמה, כתמים עבור MHC CD94:NKG2A קולטן הוא עני אם ליבראז TM משמש. עם זאת, עיכול עם ליבראז DH משמר זיהוי NKG2A על ידי שיבוט נוגדנים 16A11 (איור 9). מומלץ לבדוק את ההשפעה של אנזימים על כל epitopes בלוח FACS של אחד. לשם כך, השתמש בהשעיית טחול העכבר המתקבל על ידי דיסוציאציה מכנית (העברת הטחול כולו דרך מסננת 70 מיקרומטר). לאחר מכן המדגם מחולק לשני חלקים או יותר ואחריו דגירה עם מדיום עם או בלי אנזימים.
כאמור, תאים שמקורם בדם נמצאים בדגימות מנותקות מרקמות. במידת הצורך, ניתן להחריג מזהמי דם בשיטת כתמים תוך-וסקולרית כפי שפותחה במעבדת Masopust21. איור 10 מדגים כי כ-6.5% מה-G1 ILCs הנמצאים בדגימות רקמת הרחם ביום ההיריון 8.5 הם שמקורם בדם. נוגדנים נגד CD45 המשמשים להכתמה תוך-וסקולרית יכולים להיות מצומדים עם פלואורוכרום המשמש לערוץ אשפה; זה לא יכלול מזהמי דם ללא שימוש בערוץ פלואורסצנטיות נוסף. הבעיות הנפוצות ביותר והפתרונות שלהן מוצגים בטבלה 2.

איור 1: חתך רוחב של רחם עכבר. (A) חתך חתך של רחם העכבר (לא בהריון) המציין מגוון לויקוציטים אימהיים המאכלסים את הרחם. (ב) חתך רחם העכבר (יום ההיריון 8.5). (ג) חתך רחם עכבר (יום ההיריון 13.5). (ד) השוואה בין היווצרות של עכבר לעומת שליה אנושית משלב הפיצוץ ואילך. תמונות שנוצרו באמצעות BioRender.com. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: תת-אוכלוסין של הרחם g1 ILC1. (A) אחוזים של cNK הרחם, ILC1, ו trNK בעכברים במהלך החיים המוקדמים וההריון. W - שבועות, יום ההיריון. גרף שונה מפיליפוביץ', א. ואח' 4. (B) אסטרטגיית גטינג לניתוח תת-קבוצות ILC של קבוצת הרחם 1 לפי ציטומטריית זרימה. לימפוציטים היו מבודדים מרקמות הרחם ביום ההיריון 10.5. עיכול רקמות בוצע באמצעות מדיום עיכול המכיל ליבראז TM. התאים היו מגודרים על סמך יכולתם לפזר אור. זוגות לא נכללו באמצעות התוויית FSC-A לעומת FSC-H, ורק CD45+CD3-CD19- תאים בני קיימא נותחו עוד יותר. בתוך CD45+CD3-CD19- תאים קיימא, הקבוצה 1 שער ILC זוהה כתאי NK1.1+ NKp46+ . בתוך קבוצה 1 ILCs, ניתן לזהות שלוש תת-קבוצות: CD49a-Eomes + תאי NK קונבנציונליים (cNK), CD49a + Eomes + תאי NK תושב רקמות (trNK), ו- CD49a + Eomes - uILC1. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: מדריך חזותי לשלבים העיקריים של הפרוטוקול. (1) לנתח את הרחם ההריוני ללא שומן mesometrial. (2) הסר את העוברים; להחזיר את הרחם לצינור 5 מ"ל ולטחון את הרקמה. המשך עם שלב העיכול האנזים: להוסיף 3 מ"ל של תערובת עיכול אנזימטית חמה לכל מדגם. לדגור על צינורות 5 מ"ל במשך 30 דקות ב 37 °C (5 °F) עם תסיסה. (3) (i) לאחר העיכול, לשטוף הכל מתוך 5 mL צינורות לתוך צינורות 15 מ"ל באמצעות 10 מ"ל של קר כקרח 5 mM EDTA PBS פתרון. (ii) צינורות צנטריפוגה 15 מ"ל המכילים רקמות מעוכלות במשך 10 דקות ב 400 x גרם. (iii) להשליך את סופר-נט; העיף בעדינות את הכדור והגדיל אותו מחדש ב-10 מ"ל של תמיסת PBS חמה (37 °C) 5 מ"מ EDTA. (4) דגימות דגירה בצינורות 15 מ"ל ב 37 °C עם תסיסה, במשך 15 דקות. (4) באמצעות הבוכנה של מזרק סטרילי 1 מ"ל, לכפות את הרקמה מעוכלת באמצעות מסננת 70 מיקרומטר על צינור 50 מ"ל מתויג כראוי, ספין במשך 10 דקות ב 400 x g. (5) לאחר הסיבוב, המשך עם אחת מהאפשרויות A (המיוצגת כאן בדיאגרמות) או B. אפשרות A: להשליך את supernatant מצינור 50 מ"ל, באמצעות ילד pipet, resuspend כל גלולה ב 8 מ"ל של 40% (v / v) פרקול איזוטוני ב- PBS. (6) (i) אפשרות A המשיכה: באמצעות ילד pipet במהירות איטית, בזהירות לכסות את הכדור resuspended בתמיסה 40% פרקול על פתרון 5 מ"ל של 80% פרקול. פיפטה לאט וברצף; החזק את צינור 15 מ"ל בזווית של 45°. (ii) מבלי להפריע שכבת העל, צנטריפוגה צינורות 15 מ"ל ב 850 x g במשך 20 דקות בטמפרטורת החדר, עם תאוצה בינונית הפסקה איטית. (7) לאחר הסיבוב, תוך ניסיון למצוץ כמות מינימלית של פתרון פרקול (עד 4-5 מ"ל בסך הכל), לאסוף בזהירות את הטבעת של לויקוציטים. (8) בצע שלבי תמותה של תאי דם אדומים. (9) ספירת תאים באמצעות כחול טריפן ותא נויבואר. (10) העבר 1-2 מיליון תאים לבאר לתוך צלחת עגולה 96-באר. (11) המשך עם צבע קיימא וכתמים נוגדנים. (12) לבסוף, להעביר את הדגימות לתוך צינורות FACS מסומנים. שמור את הצינורות על קרח או במקרר עד לעיבוד עם ניתוח FACS בתוך 24 שעות. תמונות שנוצרו באמצעות BioRender.com. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: תקע הנרתיק (A) והיעדרו (B) אצל נקבות C57BL/6 ב- 0.5 יום לאחר ההזדווגות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.

איור 5: ניתוח לחילוץ הרחם מעכבר בהריון. (A) הסכר מוצמד למחטים על לוח רך כדי לנגב את הגוף עם 70% אתנול. שני חותכים אנכיים נעשים, כפי שצוין על ידי הקווים המנוקדים הכחולים. (B) העור מורם כדי לחשוף איברים פנימיים. לולאות המעי נעות בעדינות כדי לדמיין את הרחם. (C) הרחם נדגם על ידי חיתוך בשלוש נקודות: ליד השחלות ובצוויר הרחם, כפי שצוין על ידי שני הקווים המנוקדים הכחולים והחץ הכחול, בהתאמה. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: הכנת השעיה של תא יחיד. (א) הסרה מכנית של עוברים מאתר ההשתלה שלהם. (B) שכבת-על הדרגתית של פרקול; השכבה העליונה מכילה את המתלים של תא בודד ב-40% של פרקול ואת השכבה התחתונה 80% של פרקול. (C) היווצרות טבעת לימפוציט לאחר צנטריפוגה של שיפוע פרקול. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 7: ניתוח FACS מייצג של בדיקות פונקציונליות עם קבוצה 1 ILCs. זיהוי IFN-ɣ ו- CD107a במשטח בקבוצה 1 ILCs המבטאים קולטני NK עבור קולטני MHC עצמיים (Ly49C, Ly49I ו- NKG2A) בהשוואה לאלה שלא, לאחר הצלבת NK1.1 עם נוגדנים הקשורים לצלחת. התאים היו מבודדים מרקמות הרחם ביום ההיריון 9.5. עיכול רקמות בוצע באמצעות מדיום עיכול המכיל ליבראז DH. מוצגים הערכים הגולמיים של כל ארבעת הרבעים (פינות) כמו גם האחוז היחסי של המגיבים בקרב תאים המבטאים קולטנים עבור עצמם ומגיבים שאין להם קולטנים עצמיים (מספרים מודגשים). אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 8: לימפוציטים מכתימים טחול ורחם בנוגדנים נגד NKp46 ואנטי-NK1.1. (א) השעיות תאים שהתקבלו מטחול העכבר ורחם (B) ביום ההיריון 10.5 הופרדו לשניים; חלק אחד היה מוכתם עם NKp46-APC (אדום) והשני עם NK1.1-APC (כחול). שים לב כי הכתמת NKp46 של לימפוציטים ברחם אינה מפרידה בין NKp46+ ו- NKp46 - תאים בצורה מסודרת כמו לימפוציטים בטחול. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 9: ירידה של NKG2A MFI (שיבוט נוגדנים: 16A11) על ידי דגירה עם מדיום עיכול. השעיית תא של טחול עכבר C56BL/6 חולקה לשלושה חלקים. חלק אחד היה דגירה במדיום העיכול של ליבראז DH (HBSS המכיל 0.13 WU / mL ליבראז DH ו 30 מיקרוגרם / מ"ל של DNAse), וחלק אחר היה דגירה עם מדיום העיכול של ליבראז TM (HBSS המכיל 0.52 WU / mL ליבראז TM ו 30 מיקרוגרם / מ"ל של DNAse). החלק השלישי טופל ב- HBSS מסודר במשך 30 דקות בשעה 37 מעלות צלזיוס. ביטוי של סמן NKG2A על g1 ILCs הוערך על ידי ציטומטריית זרימה. גרף שנלקח מ-שריב נ. התפקיד של עיכוב תאי NK הרחם בהריון (תזה); מפקח: קולוצ'י פ, 2020. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.

איור 10: כתמים תוך-וינטליים בנוגדנים נגד CD45 להדרה של G1 ILCs שמקורם בדם. עכבר סכר C57BL/6 ביום ההיריון 8.5 היה ליקוט 3 דקות לאחר הזרקה תוך ורידי עם 3 מיקרוגרם של CD45-AF647. הרחם, הדם השלם והתימוס נקצרו ועובדו לניתוח FACS. ציר ה- X מציג את האות מכתמים תוך ורידי עם CD45-AF647, וציר ה- Y מדגים אות מ- CD45-BUV395 מוכתם במבחנה . אחוזי אוכלוסין מתת-אוכלוסין מוצגים ברביעים. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של איור זה.
| נוגדן / צבע | שיבוט | פלואורוכרום | לייזר |
| 1 (ערוץ Dump) | זומבי סגול תיקון קיימא צבע | | | ויולט |
| CD19 | 1D3 | BV421 |
| CD3 | 145-2C11 | BV421 |
| 2 | CD45 | 30-F11 | FITC | כחול |
| 3 | NK1.1 | PK136 | BV605 | ויולט |
| 4 | NKp46 | 29A1.4 | נגמ"ש | אדום |
| 5 | CD49a | ח31/8 | BUV395 | סגול |
| 6 | EOMES | Dan11mag | PE | ירוק |
טבלה 1: דוגמה של פאנל FACS עבור cytometer 5 לייזרים קונבנציונאלי.
| בעיה | סיבה אפשרית | הצעה |
| טבעת התא אינה גלויה בממשק של שני פתרונות פרקול | שכבות גרועות של פתרון פרקול או ערבוב שתי שכבות במהלך טיפול בדגימות | יש להקפיד במיוחד לא לשבור את כרית 80% פרקול במהלך כיסוי. שימו לב במהלך טיפול לדוגמה: אל תפריעו לממשק פרקול |
| מספר נמוך של לויקוציטים (למשל, בעת שימוש ברחם שאינו בהריון) | ניתן לראות את הממשק גם כאשר מספר התא בממשק נמוך מאוד. גם אם הטבעת אינה נראית לעין, לאסוף נוזל בין 40% ל 80% פתרונות percoll, כמו עדיין ייתכן שיש מספיק תאים לעיבוד נוסף |
| תמה RBC לא שלמה | התאים לא הוצבו מחדש כראוי במאגר התבודדות | תאי פיפטה למעלה ולמטה כדי לשבור את הגושים ותאים resuspend מלא במאגר ליסינג |
| תמיסת ליסינג קרה | יש לתעד את פתרון ההסתה לטמפרטורת החדר לפני השימוש |
| להאריך את זמן הדגירה עם פתרון lysing עד 15 דקות |
| ניתן לחזור על שלב תמה של RBC |
| תפוקת תאים נמוכה | עיכול אנזימטי גרוע | בדוק אם אנזימים אינם מעודכנים ואוחסנו על פי המדריכים שלהם |
| אובדן תאים במהלך שלבי כביסה | בדוק את גלולה התא לאחר כל שלב כביסה: גלולה אטומה בתחתית הבאר לאחר ספין. שימוש בתחתית V במקום לוחות תחתית U, צנטריפוגה רוטור סווינג, זמן צנטריפוגה ארוך יותר עשוי להפחית את אובדן התא |
| דגימת רקמה מכילה מספר נמוך של לימפוציטים (למשל, בעת שימוש ברחם שאינו בהריון) | מאגר כמה רחם כדי להשיג מספיק אירועים לניתוח. שקול להשתמש באפשרות ב' של הפרוטוקול לבידוד תאים |
| שונות גבוהה של מספרי לויקוציטים מוחלטים המתקבלים מעכברים מאותה קבוצה | איסוף לא עקבי של תאים בממשק של פתרונות פרקול של 40% ו-80% | הקפד לאסוף שבר תא שלם בממשק פרקול. שקול להשתמש באפשרות ב' של הפרוטוקול לבידוד תאים |
| לא מסוגל לזהות אוכלוסין לימפוציטים צפויים / סמנים או MFI נמוך במיוחד עבור כמה סמני פני השטח של התא | עיכול אנזימטי משפיע על ביטוי פני השטח של כמה אפיטופים או השפלתם | מטב את העיכול אנזימטי על ידי שינוי: אנזים (למשל לסוג אחר של ליבראז או קולגנאז) ו/או אורך הדגירה ו/או ריכוז האנזים |
| רעש רקע גבוה בציטומטר הזרימה | שיעור גבוה של פסולת תאים או זיהום RBC | התאם פרמטר סף FSC. שקול להשתמש באפשרות א' של הפרוטוקול לבידוד תאים |
טבלה 2: מדריך לפתרון בעיות.