הפרוטוקול הנוכחי ממחיש את השימוש ברכיבים זמינים מסחרית ליצירת שיפוע תרמי יציב וליניארי. לאחר מכן ניתן להשתמש בשיפוע כזה כדי לקבוע את הגבול התרמי העליון של אורגניזמים פלנקטוניים, במיוחד זחלים חסרי חוליות.
מאמר שיטה
הפרוטוקול הנוכחי ממחיש את השימוש ברכיבים זמינים מסחרית ליצירת שיפוע תרמי יציב וליניארי. לאחר מכן ניתן להשתמש בשיפוע כזה כדי לקבוע את הגבול התרמי העליון של אורגניזמים פלנקטוניים, במיוחד זחלים חסרי חוליות.
מגבלות תרמיות ורוחב נעשה שימוש נרחב כדי לחזות את תפוצת המינים. ככל שהטמפרטורה העולמית ממשיכה לעלות, הבנת האופן שבו הגבול התרמי משתנה עם התאקלמות וכיצד הוא משתנה בין שלבי החיים והאוכלוסיות היא חיונית לקביעת פגיעותם של מינים להתחממות עתידית. לרוב האורגניזמים הימיים יש מחזורי חיים מורכבים הכוללים שלבים פלנקטוניים מוקדמים. בעוד שכימות הגבול התרמי של שלבי התפתחות מוקדמים קטנים אלה (עשרות עד מאות מיקרונים) מסייע בזיהוי צווארי בקבוק התפתחותיים, תהליך זה יכול להיות מאתגר בשל גודלם הקטן של אורגניזמי המטרה, דרישת שטח ספסל גדול ועלות ייצור ראשונית גבוהה. כאן מוצג מערך המיועד לנפחים קטנים (מ"ל עד עשרות מ"ל). מערך זה משלב רכיבים הזמינים באופן מסחרי ליצירת שיפוע תרמי יציב וליניארי. כמו כן מוצגים מפרטי הייצור של המערך, כמו גם נהלים להצגה וספירה של אנשים חיים לעומת מתים וחישוב טמפרטורה קטלנית.
סובלנות תרמית היא המפתח להישרדותם ולתפקודם של אורגניזמים 1,2. ככל שכדור הארץ ממשיך להתחמם עקב פליטות פחמן אנתרופוגניות, תשומת לב גוברת מוקדשת לקביעה וליישום של מגבלות תרמיות3. נקודות קצה שונות, כגון תמותה, אי התפתחות ואובדן ניידות, שימשו לקביעת גבולות תרמיים עליונים ותחתונים4. גבולות תרמיים אלה נחשבים לעתים קרובות פרוקסי עבור נישה תרמית של אורגניזם. מידע זה משמש בתורו לזיהוי מינים פגיעים יותר להתחממות כדור הארץ, כמו גם לחיזוי תפוצת מינים עתידיים ואינטראקציות המינים הנובעות מכך 3,5,6,7. עם זאת, קביעת גבולות תרמיים, במיוחד עבור אורגניזמים פלנקטוניים קטנים, יכולה להיות מאתגרת.
עבור אורגניזמים פלנקטוניים, במיוחד שלבי הזחלים של חסרי חוליות ימיים, ניתן לקבוע את הגבול התרמי באמצעות חשיפה כרונית. חשיפה כרונית מושגת על ידי גידול זחלים במספר טמפרטורות במשך ימים עד שבועות וקביעת הטמפרטורה שבה הזחלים שורדים ו/או קצב התפתחותי מפחיתים 8,9,10. עם זאת, גישה זו גוזלת זמן רב למדי ודורשת אינקובטורים גדולים וניסיון בגידול זחלים (ראה הפניה11 למבוא טוב לגידול זחלים חסרי חוליות ימיים).
לחלופין, ניתן להשתמש בחשיפה חריפה ללחץ תרמי כדי לקבוע גבולות תרמיים. לעתים קרובות, גישת קביעה זו כוללת הצבת בקבוקונים קטנים עם זחלים באמבטיות יבשות מבוקרות טמפרטורה 12,13,14, מינוף פונקציות שיפוע תרמי במחזורים תרמייםPCR 15,16, או הצבת בקבוקוני זכוכית / צינורות מיקרוצנטריפוגה לאורך שיפוע תרמי שנוצר על ידי חימום וקירור מיושמים בקצוות של בלוקי אלומיניום גדולים עם חורים שבהם הבקבוקונים מתאימים להתכרבל 17, 18,19. אמבטיות יבשות טיפוסיות מייצרות טמפרטורה אחת; לפיכך, יש להפעיל יחידות מרובות בו זמנית כדי להעריך את הביצועים בטווח טמפרטורות. מחזורים תרמיים מייצרים שיפוע אך מכילים רק נפח דגימה קטן (120 μL) ודורשים מניפולציות זהירות. בדומה למחזורים תרמיים, בלוקי אלומיניום גדולים יוצרים שיפועי טמפרטורה ליניאריים ויציבים. שתי הגישות יכולות להיות משולבות עם רגרסיה לוגיסטית או פרוביט כדי לחשב את הטמפרטורה הקטלנית עבור 50% אחוז מהאוכלוסייה (LT50)12,20,21. עם זאת, בלוקים אלומיניום בשימוש היו ~ 100 ס"מ אורך; גודל זה דורש שטח מעבדה גדול וגישה למכונות כרסום ממוחשבות מיוחדות לבקרה נומרית כדי לקדוח את החורים. יחד עם שימוש בשני אמבטיות מים ברמה מחקרית כדי לשמור על טמפרטורת היעד, העלות הכספית של הרכבת ההתקנה היא גבוהה.
לכן, עבודה זו שואפת לפתח אמצעי חלופי ליצירת שיפוע טמפרטורה יציב וליניארי עם חלקים זמינים מסחרית. מוצר כזה חייב להיות בעל טביעת רגל קטנה ואמור להיות מסוגל לשמש בקלות לניסויים בחשיפה ללחץ תרמי חריף עבור אורגניזמים פלנקטוניים. פרוטוקול זה פותח עם זואופלנקטון שגודלו <1 מ"מ כאורגניזמים מטרה, ולכן הוא הותאם לשימוש בצינור מיקרוצנטריפוגה של 1.5 או 2 מ"ל. אורגניזמים מחקריים גדולים יותר ידרשו מכולות גדולות יותר מצינורות המיקרוצנטריפוגה של 1.5 מ"ל המשמשים וחורים מוגדלים בגושי האלומיניום.
בנוסף להפיכת מנגנון הניסוי לנגיש יותר, עבודה זו נועדה לפשט את צינור עיבוד הנתונים. בעוד שתוכנה סטטיסטית מסחרית מספקת שגרות לחישוב LT50 באמצעות רגרסיה לוגיסטית או פרוביט, עלות הרישוי אינה טריוויאלית. לכן, סקריפט קל לשימוש המסתמך על תוכנית הסטטיסטיקה בקוד פתוח R22 יהפוך את ניתוח הנתונים לנגיש יותר.
פרוטוקול זה מראה כיצד ניתן לייצר גוש חום קומפקטי עם חלקים זמינים מסחרית וליישם אותו על חשיפת זואופלנקטון (זחלי דנדרסטר אקסצנטריקוס של דולר החול) ללחץ חום חריף כדי לקבוע את הגבול התרמי העליון שלהם.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
1. ייצור בלוק החום
2. קביעת הגדרות שיפוע תרמי
3. חשיפה תרמית וספירת מתים: מתים
הערה: ניתן להשמיט את שלב 2 לאחר קביעת ההגדרות הרצויות עבור שיפוע הטמפרטורה.
4. חישוב LT50
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מטרת פרוטוקול זה היא לקבוע את הגבול התרמי העליון של זואופלנקטון. לשם כך, יש צורך בשיפוע תרמי יציב וליניארי. ההגדרה המוצעת הצליחה ליצור שיפוע תרמי שנע בין 14 °C ל-40 °C על-ידי הגדרת טמפרטורת אמבט המים ל-8°C והמחמם ל-39°C (איור 2A). ניתן לצמצם ולהזיז את שיפוע הטמפרטורה על-ידי שינוי ערכי נקודות הקצה. שיפוע תרמי עם טווח צר יותר (19 °C (19 °F) עד 37 °C (77 °F) נוצר גם על ידי הגדרת התנור ל 37 °C (76 °F) ואת אמבט המים ל 15 °C (65 °F). הטמפרטורה בבלוק מתייצבת תוך 45 דקות עד שעה מההתקנה (
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מספק גישה נגישה וניתנת להתאמה אישית כדי לקבוע את הגבולות התרמיים של אורגניזמים פלנקטון קטנים באמצעות חשיפה תרמית חריפה. העיצוב בן 10 הגומות ונקודות הקצה הגמישות לטמפרטורה, הנשלטות על ידי אמבט המים בקצה התחתון והמחמם בקצה העליון, מאפשרים לקבוע LT50 בדייקנות. באמצעות גישה זו, ניתן היה לזהות הבדל בגבול התרמי שהוא <1 מעלות צלזיוס (איור 3). גישה זו מספקת קביעה מהירה של גבולות תרמיים (בשעות) עבור מגוון מינים, והערכים שהתקבלו יושמו על מודלים של התפלגות מינים מרובים
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין ניגוד עניינים להצהיר.
עבודה זו נתמכת על ידי קרן המחקר הפקולטית של מכללת סוורת'מור [KC] ומלגת רוברט ריינולדס ולוסינדה לואיס '70 מחקר קיץ עבור BJ.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 0.45 ומיקרו; מסנן ממברנה m | VWR | 74300-042 | |
| ½ ” יריעת אקריליק | McMaster-Carr | 8560K266 | משמש לבניית מארז מרוכס עם בידוד מספיק. |
| מזרק 1 מ"ל | VWR | 76290-420 | |
| 2 ערוצים 7 סוגי צמד תרמי Datalogger | Omega Engineering | HH506A | ניתן להחליף בכל מדחום שיתאים לצינור מיקרוצנטריפוגה |
| פיפטה אוטומטית | רנין | ||
| מחמם רצועה בורג ומהדק הר עם 430 נדן נירוסטה, 120V AC, 1-1/2 אינץ' רחב, 100W | McMaster-Carr | 3619K32 | |
| Crystal Sea Bioassay Mix | Pentair | CM2B | השתמש לייצור מי ים מלאכותיים |
| Denraster excentricus | M-Rep | דולר חול מ קליפורניה | |
| מיקרוסקופ ניתוח | ניקון | SMZ645 | |
| DIYhz בלוק קירור מים מאלומיניום, מערכת גוף קירור מים נוזלית למחשב מחשב מעבד גרפי רדיאטור גוף קירור ראש אנדותרמי כסף (40 מ"מ x 120 מ"מ x 12 מ"מ | אמזון | מתחבר לאמבט מים ומשמש לקירור קצה אחד של הבלוק. | |
| קל למכונה MIC6 גיליון אלומיניום יצוק בעובי 2 אינץ' 8 אינץ' x 8 אינץ' | McMaster-Carr | 86825K953 | מעובד במכונה ל-2 אינץ' x 6 אינץ' x 8 אינץ' עם 60 חורים במרווחים שווים (קוטר 11 מ"מ, עומק 42 מ"מ) עם שני חורי תוספת שנקדחו בצד אחד לבדיקות תרמוסטט. |
| בידוד צינורות קצף פוליאתילן גמיש חסכוני | McMaster-Carr | 4530K121 | מכסה את צינורות הפלסטיק בין הצ'ילר לבלוק כדי להפחית את אובדן החום. ניתן להשמיט אם טווח הטמפרטורות קרוב לטמפרטורת החדר |
| EVERSECU 72w 110-240v אקווריום מים צ'ילר בקר טמפרטורת מחמם/קריר יותר עבור מיכל שרימפס דגים מיכל שונית אלמוגים ימית מתחת ל-20 ליטר/30 ליטר אקווריום צ'ילר | אמזון | ניתן להשתמש במקום אמבט המים בדרגת מעבדה | |
| דוגמה עם דולר חול זחל | |||
| GENNEL 100 גרם כסף סיליקון משחת גריז תרכובת מוליכה תרמית עבור GPU CPU IC LED תנורי קירור | אמזון | משפר את המוליכות התרמית בין הבלוק לגופי החימום והקירור. | |
| בקר טמפרטורת תרמוסטט זוחלים WiFi של Inkbird עם 2 בדיקות ו-2 שקעים, תרמוסטט מחצלת חום IPT-2CH זוחלים (מקסימום 250 וואט לשקע) | אמזון | מנטר קצוות חמים וקרים. שומר על קצה חם בטווח | |
| Lauda Ecoline Silver מקורר אוויר | מקורר אוויר סירקולטורים VWR | 89202-386 | ניתן להחליף במקרר אקווריום |
| צינורות מיקרוצנטריפוגה | VWR | 76019-014 | אם משתמשים בבעלי חיים גדולים יותר, בקבוקוני סריקה (VWR 66022-004) הם אלטרנטיבה טובה |
| פילטר רשת Nitex | תוצרת | משומשת דבק חם לחיבור רשת Nitex לצינורות PVC 1/2 אינץ' | |
| פיפטה פסטר | VWR | 14673-010 | |
| אשלגן כלורי (0.35 מ') | Millpore-Sigma | P3911-500G | |
| R. | פרויקט R לחישוב | ||
| מחט מזרק | VWR | 89219-346 | בהתאם לגודל אורגניזם היעד ניתן להשתמש ב-Gague 14 ו-16 |
| Tygon Tubing | McMaster-Carr | 5233K65 | התאם כך שיתאים לצ'ילר ולבלוק המשמש |
| Zoo Med Repti Temp Rheostat | Chewy.com | מדורג ל-150 וואט ומחווט מחדש כדי להזין ישירות לגוף החימום. משמש לשליטה בקצב תפוקת החום |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה