אנו מדגימים פרוטוקול שלב אחר שלב לחקר תפקוד גנים במקרופאגים שוכנים ברקמת הצפק in vivo, באמצעות וקטורים לנטי-ויראליים.
הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.
מאמר שיטה
אנו מדגימים פרוטוקול שלב אחר שלב לחקר תפקוד גנים במקרופאגים שוכנים ברקמת הצפק in vivo, באמצעות וקטורים לנטי-ויראליים.
למקרופאגים המתגוררים ברקמת הצפק יש תפקידים נרחבים בשמירה על הומאוסטזיס והם מעורבים בפתולוגיות בתוך רקמות מקומיות ושכנות. תפקידיהם מוכתבים על ידי רמזים מיקרו-סביבתיים; לכן, חיוני לחקור את התנהגותם בנישה פיזיולוגית in vivo . כיום, מתודולוגיות ספציפיות הממוקדות במקרופאגים פריטוניאליים משתמשות במודלים טרנסגניים של עכבר שלם. כאן מתואר פרוטוקול לאפנון יעיל in vivo של mRNA ומיני RNA קטנים (למשל, microRNA) במקרופאגים פריטוניאליים באמצעות חלקיקי לנטיוירוס. תכשירי לנטיוירוס נעשו בתאי HEK293T וטוהרו על שכבת סוכרוז אחת. אימות In vivo של יעילות לנטיוירוס לאחר הזרקה תוך צפקית גילה זיהום דומיננטי של מקרופאגים המוגבלים לרקמה מקומית. התמקדות במקרופאגים פריטוניאליים הייתה מוצלחת במהלך הומאוסטזיס ודלקת צפק הנגרמת על ידי תיוגליקולט. נדונות מגבלות הפרוטוקול, כולל דלקת ברמה נמוכה הנגרמת על ידי אספקה תוך צפקית של לנטיוירוס ומגבלות זמן לניסויים פוטנציאליים. בסך הכל, מחקר זה מציג פרוטוקול מהיר ונגיש להערכה מהירה של תפקוד גנים במקרופאגים פריטוניאליים in vivo.
מקרופאגים תושבי רקמות (Mφ) הם אוכלוסייה הטרוגנית של תאי חיסון פגוציטיים החשים ומגיבים לפתוגנים פולשים 1,2. בנוסף, הם ממלאים תפקיד חיוני בפיתוח רקמות, שיפוץ ושמירה על הומאוסטזיס 1,3. רקמות רבות Mφ נובעות מאבות שק החלמון במהלך האמבריוגנזה ומתמידות ברקמה לאורך כל החיים 4,5. הפנוטיפ והפונקציות של תאים אלה מוכתבים על ידי אינטראקציות שיתופיות והיררכיות של גורמי שעתוק ספציפיים והמיקרו-סביבה המקומית 6,7,8,9. הבנה הולכת וגוברת של תלות זו מגבירה את הצורך בשיטות יעילות in vivo למניפולציה גנטית של Mφ בתוך הנישה הרלוונטית מבחינה פיזיולוגית.
וקטורים לנטי-ויראליים הם כלי נפוץ למניפולציה של חומצות גרעין באוכלוסיות תאים ספציפיות in vivo 10,11,12, במיוחד בשל יכולתם להדביק תאים מתחלקים ולא מתחלקים ולהשתלב ביציבות בגנום המארח13,14. במהלך שני העשורים האחרונים, טכנולוגיית העברת lentivirus עברה אופטימיזציה, ומעטפות חלופיות ומקדמים סינתטיים נחקרו כדי להגדיל את מיקוד ספציפי לשושלת 8,15. בשל הטרופיזם הרחב של התא, גליקופרוטאין מעטפת וירוס סטומטיטיס שלפוחית הרחם (VSV-G)16,17 הפך למעטפת "תקן הזהב" המשמשת בטכנולוגיית lentivirus.
בפרוטוקולזה 18, חלקיקים לנטי-ויראליים פסאודו-טייפ של VSV-G משמשים להדגמת העברה ממוקדת ויעילה של RNA קצר סיכת שיער (shRNA) ומיקרו-רנ"א (miR) לעכבר Mφ (pMφ) in vivo, במצב יציב19. ביטוי טרנסגנים הונע על ידי מקדם וירוס יצירת מוקד הטחול (SFFV). זיהום פרודוקטיבי של תאים הוגדר על ידי ביטוי של חלבון פלואורסצנטי ירוק משופר (GFP) שמקורו בלנטיוירוס. השימוש בגישה זו איפשר קריאה קלה לניסויי in vivo lentivirus כדי להגדיר את המינון האופטימלי ואת מסגרת הזמן של הניסוי. לבסוף, אתגר לנטיויראלי in vivo של עכברים במהלך דלקת הנגרמת על ידי תיוגליקולט חשף את הנטייה הטבעית לזיהום pMφ סלקטיבי.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כל עבודת בעלי החיים בוצעה בהתאם להנחיות המוסדיים ומשרד הפנים הבריטי.
הערה: כל מחקרי in vivo עם lentivirus צריכים להתבצע על פי הנחיות מקומיות ולאומיות לגבי שימוש אתי בבעלי חיים במחקר, כמו גם שמירה על כל התקנות הקשורות לשימוש בחומרים זיהומיים בקטגוריה II. כמו כן, יש לפקח על רווחת בעלי החיים בהתאם לתקנות המקומיות. בשלב זה של הפרוטוקול, יש לנקוט משנה זהירות בעבודה עם חלקיקים וחדים לנטי-ויראליים.
1. הכנת תאי HEK293T לטרנספקציה
הערה: בצע שלבים אלה תחת ארון בטיחות ביולוגי של תרבית רקמה סטרילית.
2. טרנספקציה של תאי HEK293T באמצעות מגיב טרנספקציה שומנים שאינם ליפוזומליים
3. אוסף של חלקיקים lentiviral
4. טיהור של lentivirus
5. טיטרציה של ייצור lentivirus בתאי Jurkat T
6. זיהום In vivo lentivirus של מקרופאגים פריטוניאליים תושבי רקמות
7. איסוף תאי צפק מעכבר נגוע בלנטיוירוס
אזהרה: עבור אוספים בטווח של 72 שעות לאחר הזרקת לנטיוירוס, פעל בהתאם לכללי הבטיחות הביולוגית המוסדיים בקטגוריה II. מצעים וכלוב החזקה שבו הוחזקו בעלי חיים נגועים ב-72 השעות הראשונות לאחר הזרקת הלנטיוירוס חייבים לעבור טיהור בהתאם לכללי הבטיחות הביולוגיים המוסדיים בקטגוריה II.
8. צביעה וניתוח של תאי הצפק
9. מיצוי תאים מאיברים
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
כאשר מתבצע באופן מלא ונכון, פרוטוקול זה מניב סך של 1.5 מ"ל של מלאי לנטיוירוס באיכות גבוהה לכל תכשיר יחיד, מספיק עבור שתים עשרה זריקות in vivo בנפח האופטימלי שנקבע במחקר זה18. ניתן להעריך את הצלחת הטרנספקציה בשלב מוקדם של הפרוטוקול. תאי HEK293T בריאים וקולפים צריכים להציג, אם הם קיימים בפלסמידים, אות סמן שניתן לזהות בקלות (למשל, GFP המשמש במחקר זה) לאחר 48 שעות לאחר התפשטות פלסמיד (איור 1A). העוצמה הנמוכה של האות, ניתוק יתר של תאים ומפגש נמוך בשלבים המוקדמים ש...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
מקרופאגים שוכני רקמות מבצעים מגוון תפקודים הומיאוסטטיים ודלקתיים ספציפיים לרקמה 1,2 המוכתבים על ידי הסביבה הפיזיולוגית שלהם 6,7,8,9. בפרוטוקול זה, שיטהיעילה 18 למניפולציה של מקרופאגים תושבי הצפק in vivo באמצעות חלקיקי לנטיוירוס הוצגה כדי לחקור את תפקוד המקרופאגים במיקרו-...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
למחברים אין מה לחשוף.
מחקר זה מומן, כולו או חלקו, על ידי פרס Wellcome Trust Investigator Award [107964/Z/15/Z]. P.R.T נתמך גם על ידי המכון הבריטי לחקר דמנציה. M.A.C נתמך על ידי מלגת גילוי המועצה למחקר ביוטכנולוגיה ומדעי הביולוגיה (BB/T009543/1). לצורך גישה פתוחה, המחבר החיל רישיון זכויות יוצרים ציבורי CC BY על כל גרסה של כתב היד המקובל על המחבר הנובעת מהגשה זו. L.C.D הוא מרצה באוניברסיטת סוונסי ועמית מחקר לשם כבוד באוניברסיטת קרדיף. עבודה זו נתמכת על ידי עבודה שבוצעה על ידי Ipseiz et al. 202018.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 0.05% טריפסין-EDTA (1x) (טריפסין 500 מ"ג/ליטר או 0.02 מ"מ) | Thermo Fisher Scientific | 25300054 | |
| 0.22 μ m מסנן Millex GP סטרילי | Merck | SLGS033SS | |
| 0.45 μ m מסנן סטרילי millex GP | Merck | SLHP033RS | |
| 0.5 מ"ל מזרק אינסולין U-100 עם מחט, 0.33 מ"מ x 12.7 מ"מ (29 גרם) | BD | 324892 | |
| 1 ליטר Sharps מיכל | N | /A N/A | |
| 2.4G2 נוגדן (TruStain FcX נגד עכבר CD16/32) | Biolegend | 101320 | |
| 40 μ m מסננת | תרמו פישר סיינטיפיק | 22363547 | |
| מדיום AimV (דרגת מחקר), תוסף AlbuMax | תרמו פישר מדעי | 31035025 | |
| חסימת מאגר מוכן | בבית | ||
| מבשלה תיוגליקולט בינוני | סיגמא-אולדריץ' | B2551 | 4% תמיסת מלאי שהוכנה במים, אוטוקלאב ונשמר קפוא. |
| CD11b | Biolegend | 101222 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD11b | BD | 550993 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD11c | Biolegend | 117317 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD11c | Biolegend | 117333 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD19 | BD | 560375 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD19 | Biolegend | 152410 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD226 | Biolegend | 128808 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD3e | BD | 560527 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD3e | Biolegend | 152313 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD4 | Biolegend | 100412 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD73 | eBioscience | 16-0731-82 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| CD8a | eBioscience | 48-0081-82 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| בקבוק תרבית תאים (T175 fask, 175 cm2, 550 מ"ל) | גריינר ביו וואן | 658175 | |
| צינורות צנטריפוגה, צינורות תחתונים חרוטיים 25 מ"מ x 89 מ"מ | בקמן קולטר | 358126 | |
| צנטריפוגות | בקמן | צנטריפוגה וצנטריפוגה TC | |
| קולגנאז מסוג IV | סיגמא-אולדריץ' | C5138 | |
| צינורות צנטריפוגה חרוטיים (15 מ"ל ו-50 מ"ל) | גריינר ביו וואן | 11512303 & 11849650 | |
| Cryotubes | Greiner Bio One | 123277 | או Cryotubes |
| DMEM בינוני (1x) + 4.5 גרם/ליטר D-גלוקוז, 400 ומיקרו; M L-glutamine | Thermo Fisher Scientific | 41965-062 | |
| Dnase I | Sigma-Aldrich | 11284932001 | |
| מגיב טרנספקציה אפקטן | Qiagen | 301425 | |
| F4/80 | Biolegend | 123123 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| F4/80 | Biolegend | 123133 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| F4/80 | Biolegend | 123147 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| FceR1 | eBioscience | 48-5898-80 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| סרום עגל עוברי (FCS) | Thermo Fisher Scientific | 10270-106 | מושבת בחום למשך 30 דקות בטמפרטורה של 56 מעלות; C וסטרילי מסוננים דרך 0.22 μ m מסנן |
| זרימה ציטומטר | תרמו פישר מדעי | Attune NxT | |
| Flow Cytometry (FACS) | מאגר מוכן בבית | ||
| מיקרוסקופ תרבית רקמות פלואורסצנטיות | Thermo Fisher Scientific | EVOS FL | |
| מלקחיים | N/A | N/A | העדפת משתמש |
| תמיסת המלח המאוזנת של האנק (HBSS) | Gibco, Life Technologies | 14175-053 | |
| קו | תאים HEK293T | גדל לפחות שבוע לפני הטרנספקציה. | |
| אנטיגן ליבה נטול HIV-1 | בקמן קולטר | 6604667 | |
| Hyaluronidase | Sigma-Aldrich | H3506 | |
| פילינג כירורגי Hydrex, כלורהקסידינג גלוקונאט 4% w/v ניקוי עור | Ecolab | 3037170 | |
| I-A/I-E | Biolegend | 107625 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| ICAM1 | Becton Dickinson | 554970 | עיין בטבלה 1 עבור |
| תאי Jurkat T | שגדל לפחות שבוע לפני השימוש. | ||
| ערכת כתמי תאים מתים ללא מיקופלזמה חי/מת כמעט IR ניתנת לתיקון | Thermo Fisher Scientific | L34975 | |
| Ly6G | Biolegend | 127615 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| עכברים | כאן השתמשו בנקבות C57BL/6, בגילאי 8-12 שבועות (נהרות צ'ארלס), אלא אם צוין אחרת | ||
| פיפטות מיקרו-נימיות (טווח נפח 0.5-1,000 μ L) | פישר סיינטיפיק & Starlab | 11963466 & 11943466 & 11973466 & S1111-3700 | |
| NK1.1 | Biolegend | 108724 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| Paraformaldehyde | Sigma-Aldrich | P6148-500G | מוכן ל-2% w/v ב-PBS |
| pCMV-Δ אריזת R8.91 פלסמיד | Zuffrey, R., et al. 1997 | מקודד חלבון Gag-Pol HIV המונע על ידי מקדם ציטומגלווירוס. עמידות לאמפיצילין. | |
| פניצילין/סטרפטומיצין (100x, 10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| צלחת פטרי | Greiner Bio One | 664160 | |
| pHR'SIN-cPPT-SEW פלסמיד | Rosas, M. et al. 2014 | שונה למחקרי ביטוי shRNA ו-miR. מקודד סמן EGFP במורד הזרם מקדם SFFV ובמעלה הזרם של משפר נגיף ההפטיב של וודצ'אק. עמידות לאמפיצילין. | |
| pMD2.G פלסמיד | Naldini, L. et al. 1996 | מקודד מעטפת g-glycoprotein של נגיף סטומטיס שלפוחית (VSV-G). עמידות לאמפיצילין. | |
| חולדה IgG1, κ בקרת איזוטיפ | Becton Dickinson | 550617 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| סרום חולדה | Sigma-Aldrich | R9759-10ML | |
| מאגר ליזה ACK בדם אדום | שהוכן בבית | ||
| RPMI 1640 בינוני (1x) + 400 uM L-גלוטמין | Thermo Fisher Scientific | 21875-091 | |
| Saponin | Sigma-Aldrich | S4521 | |
| SiglecF | BD | 562681 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| טבליות נתרן היפוכלוריט (אקונומיקה, 2,000 ppm) | Guest Medical | H8818 | |
| צלחת תרבית תאים סטרילית 24 בארות | Greiner Bio One | 662160 | |
| Sterile Dulbecco's PBS (DPBS) (1x) Mg++ ו-Ca2+ - ללא | Thermo Fisher Scientific | 14190144 | |
| סטרילי EDTA | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
| צינורות העברה חד פעמיים סטריליים VWR (23.0 מ"ל, 30 ס"מ) | VWR | 612-4515 | |
| סוכרוז | תרמו פישר | 15503022 | |
| מספריים כירורגיים | N/A | N/A | העדפת משתמש |
| מזרקים (50 מ"ל ו-1 0 מ"ל) | Fisher Scientific | 10084450 & 768160 | |
| Tim4 | Biolegend | 130007 | עיין בטבלה 1 לדילול וריכוז |
| צלחת תרבית תאים 96 בארות U-bottom | Greiner Bio One | 650180 |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.