במחקר זה פותחה שיטה המאפשרת העברה של הגדרות ניסוי ותבניות ניתוח בין שני ציטומטרים של זרימה בשתי מעבדות לאיתור לימפוציטים בילדים מחוסנים לדלקת המוח היפנית. שיטת התקינה לניסויי ציטומטר הזרימה תאפשר לבצע פרויקטים מחקריים ביעילות במספר מרכזים.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
במחקר זה פותחה שיטה המאפשרת העברה של הגדרות ניסוי ותבניות ניתוח בין שני ציטומטרים של זרימה בשתי מעבדות לאיתור לימפוציטים בילדים מחוסנים לדלקת המוח היפנית. שיטת התקינה לניסויי ציטומטר הזרימה תאפשר לבצע פרויקטים מחקריים ביעילות במספר מרכזים.
מספר גדל והולך של מעבדות צריכות לאסוף נתונים מציטומטרים מרובים של זרימה, במיוחד עבור פרויקטי מחקר המבוצעים על פני מרכזים מרובים. האתגרים בשימוש בשני ציטומטרים של זרימה במעבדות שונות כוללים היעדר חומרים סטנדרטיים, בעיות תאימות תוכנה, חוסר עקביות בהגדרת המכשירים ושימוש בתצורות שונות עבור ציטומטרים שונים של זרימה. כדי לבסס ניסוי ציטומטריית זרימה מתוקננת להשגת עקביות ויכולת השוואה של תוצאות ניסוי על פני מרכזים מרובים, הוקמה שיטת סטנדרטיזציה מהירה וישימה להעברת פרמטרים על פני ציטומטרים שונים של זרימה.
השיטות שפותחו במחקר זה אפשרו העברה של הגדרות ניסוי ותבניות ניתוח בין שני ציטומטרים של זרימה במעבדות שונות לאיתור לימפוציטים בילדים מחוסנים בדלקת המוח היפנית (JE). עוצמת פלואורסצנטיות עקבית התקבלה בין שני הציטומטרים באמצעות חרוזים סטנדרטיים פלואורסצנטיים כדי לקבוע את הגדרות הציטומטר. תוצאות דומות התקבלו בשתי מעבדות עם סוגים שונים של מכשירים. באמצעות שיטה זו, אנו יכולים לתקנן ניתוח להערכת תפקוד החיסון של ילדים שחוסנו ב- JE במעבדות שונות עם מכשירים שונים, להפחית את ההבדלים בנתונים ובתוצאות בין ציטוטמדי זרימה במספר מרכזים, ולספק גישה ישימה להסמכה הדדית של תוצאות מעבדה. שיטת הסטנדרטיזציה של ניסויי ציטומטר זרימה תבטיח ביצוע יעיל של פרויקטי מחקר על פני מרכזים מרובים.
הסטנדרטיזציה של ציטומטריית זרימה שימושית להשוואת תוצאות המתקבלות מציטומטרים שונים במעבדות ומרכזי מחקר שונים, ותורמת להכרה הדדית בתוצאות לשיפור יעילות העבודה. מספר גדל והולך של תרחישים דורשים סטנדרטיזציה. במהלך תהליך פיתוח התרופה, סטנדרטיזציה של ציטומטריית זרימה חשובה, שכן בדיקה מפותחת ומתוקפת תתמוך בכל תהליך פיתוח התרופה מניתוח פרה-קליני ועד לניתוח קליני. שיטות ציטומטריות זרימה מועברות לעתים קרובות בין תעשיית התרופות לבין מעבדות משתפות פעולה1. יתר על כן, חיוני לקבל נתונים דומים ממחקרים קליניים רב-מרכזיים. לדוגמה, זרימת עבודה של סטנדרטיזציה פותחה בפרויקט המחקר הקליני הרב-מרכזי למחלות אוטואימוניות מערכתיות כדי לקבל נתונים דומים מציטומטריית זרימה רב-צנטרית2.
הסטנדרטיזציה של שיטות ציטומטריית זרימה היא מאתגרת. האתגרים שנחווים במעבדות שונות מיוחסים למחסור בחומרים סטנדרטיים, בעיות תאימות תוכנה, חוסר עקביות בהתקנת מכשירים, ושימוש בתצורות שונות בין ציטומטרים שונים של זרימה ואסטרטגיות gating שונות בין המרכזים 3,4. לכן, חשוב לבצע ניתוח פער בין מעבדות. יש לבדוק גישה לדוגמה, מערכות איכות, כישורי כוח אדם ותצורת מכשירים כדי להבטיח עמידה בדרישות.
כיום, לילדים שחוסנו בחיסון נגד דלקת המוח היפנית (JE) יש שכיחות מופחתת משמעותית של JE5. ניטור תאי מערכת החיסון ההיקפיים בדם יכול לסייע בהבנת השינויים בחסינות הנרכשת בתיווך התא לאחר החיסון, ובקורלציה בין השינויים בתת-קבוצות לימפוציטים היקפיים בדם לבין השפעות החיסון. בשל היציבות המוגבלת של דגימות דם שלמות, הערכות של יעילות החיסון מבוצעות לעתים קרובות במספר מרכזים. לצורך ניתוח זה, הגדרנו תאי T נאיביים CD8+ או CD4+ כ- CD27+ CD45RA+, תאי T של זיכרון מרכזי (TCM) כ- CD27+ CD45RA-, תאי T של זיכרון אפקט (TEM) כ- CD27- CD45RA-, ותאי T של זיכרון אפקטור ממוין סופי (TEMRA) כ- CD27- CD45RA+. ניתן להפריד תאי CD19+ B לאוכלוסיות המבטאות CD27 לעומת IgD 6,7, תאי B נאיביים מבטאים CD27n תאי זיכרון B (mBCs) ניתנים לזיהוי על סמך ביטוי IgD6, ותאי T רגולטוריים (Tregs) ניתנים לזיהוי כ- CD4+CD25++CD127 נמוך 8. כדי לבסס ניסוי ציטומטריית זרימה מתוקננת להשגת עקביות ויכולת השוואה של תוצאות ניסוי במספר מרכזים, הוקמה שיטת סטנדרטיזציה מהירה וישימה כדי להקל על העברת פרוטוקולים על פני ציטומטרים שונים של זרימה לאיתור לימפוציטים בכל הדם של ילדים שחוסנו ב- JE. שישה ילדים בריאים (בני שנתיים) גויסו מבית החולים לילדים בבייג'ינג, האוניברסיטה הרפואית קפיטל. לאחר קבלת חיסון ראשוני וזריקת דחף בחיסון חי מוחלש JE SA14-14-2 פחות מ-6 חודשים קודם לכן, נאספו דגימות דם היקפיות מהמתנדבים. נתונים דומים מאוד התקבלו ממכשירים שונים בעקבות נהלים סטנדרטיים, אשר מועילים להערכות רב-מרכזיות.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחקר אושר על ידי ועדת האתיקה של בית החולים לילדים בבייג'ינג, האוניברסיטה הרפואית קפיטל (מספר אישור: 2020-k-85). הסכמה מדעת של נבדקים אנושיים בוטלה כדגימות שיוריות בלבד לאחר שנעשה שימוש בבדיקות קליניות במחקר זה. במחקר זה מעורבות שתי מעבדות. המעבדה המעבירה היא המקום שבו פותחה השיטה הסטנדרטית באמצעות ציטומטר זרימה אחד. הציטומטר במעבדה זו מכונה להלן ציטומטר A. מעבדת שיטות הבדיקה היא המעבדה המקבלת שיטות באמצעות ציטומטר זרימה אחר, והציטומטר במעבדה זו מכונה להלן ציטומטר ב'.
1. איסוף דגימות דם היקפיות והכנת תאים
2. הכנת חרוזי פיצוי והדברה מוכתמת אחת
3. שימוש בשמות תצורה זהים על הציטומטרים השונים בשתי מעבדות
4. ניסוי סטנדרטיזציה באמצעות ציטומטר A במעבדה המעבירה
5. העברת תבנית הניסוי לציטומטר B במעבדת שיטת הבדיקה
הערה: תבנית הניסוי כוללת הגדרות מכשיר, תבנית ניתוח ותבנית ערך היעד של עוצמת פלואורסצנטיות חציונית (MFI).
6. עקביות בין תוצאות הניסוי שהתקבלו על שני הציטומטרים
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
איור 1 מציג גליון עבודה כללי של תבנית ערך היעד עבור החרוזים הבהירים של CST. באמצעות התוויית FSC/SSC, משורטט שער מצולע לבחירת החרוזים הבהירים של CST. חלקות היסטוגרמה של 10 תעלות פלואורסצנטיות התקבלו עבור חרוזים בהירים CST: FITC, PE, BB700, PE-Cy7, APC, R718, APC-H7, BV421, V500 ו- BV605. ערך היעד עבור כל פרמטר מוצג על-ידי הצגת החציון בתוך שערי ההיסטוגרמה בטבלה 2. צילומי המסך של תבניות והגדרות פרמטרים בתוכנה של ציטומטר A וציטומטר B מוצגים באיור משלים S1.
<...הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
אימונופנוטיפ של תת-קבוצות לימפוציטים היקפיים בדם יכול לעזור להבין את השינויים בחסינות הנרכשת התאית-תיווכת לאחר החיסון בילדים. ביישומים קליניים, מתרחשים מצבים בלתי צפויים, כגון כשל בזיהוי דגימות בזמן או החלפת ציטומטר זרימה; לכן, יש צורך בשיטות סטנדרטיות מהירות המאפשרות מעבר בין ציטומטרים של זרימה במעבדות שונות 9,10,11. כאן, אנו מתארים שיטה סטנדרטית מהירה כדי להבטיח תוצאות עקביות בין מכשירים שונים. השיטה המתוקננת שימשה לניטור תאי ...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים כי אין ניגודי עניינים.
RW נתמך על ידי קרן מדעי הטבע של בייג'ינג, סין (מס '7222059), הקרן הלאומית למדעי הטבע של סין (מס '82002130), XZ נתמך על ידי קרן החדשנות CAMS למדעי הרפואה (מס '2019-I2M-5-026).
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| BD CompBeads אנטי עכבר Ig, κ/חלקיקי פיצוי בקרה שלילית סט BD | 552843 פיצוי | ||
| BD FACSCanto | BD FACSציטומטריית זרימת קנטו A במעבדה המעבירה | ||
| BD FACSDiva CS& חרוזי מחקר T | BD | 655051 | להגדיר את קו הבסיס של ציטומטר זרימה ולעקוב אחר ביצועי הציטומטר |
| BD Horizon BV421 עכבר אנטי אנושי CD127 | BD | 562436 נוגדן פלואורסצנטי | |
| BD Horizon BV605 עכבר אנטי אנושי CD27 | BD | 562656 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD Horizon V500 עכבר אנטי אנושי CD45 | BD | 560777 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD LSRפרטים | BD | LSRזרימה ציטומטריה | B במעבדת שיטת הבדיקה |
| BD OptiBuild BB700 עכבר אנטי אנושי CD19 | BD | 745907 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD OptiBuild R718 עכבר אנטי אנושי CD8 | BD | 751953 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD Pharmingen APC עכבר אנטי אנושי CD45RA | BD | 550855 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD Pharmingen APC-H7 עכבר אנטי אנושי CD3 | BD | 560176 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD Pharmingen FITC עכבר אנטי אנושי CD4 | BD | 566320 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD Pharmingen PE עכבר אנטי אנושי CD25 | BD | 555432 | נוגדן פלואורסצנטי |
| BD Pharmingen PE-Cy7 עכבר אנטי אנושי IgD | BD | 561314 | נוגדן פלואורסצנטי |
| מאגר מכתים מבריק בתוספת | BD | 566385 | מאגר מכתים |
| צנטריפוגה | Eppendorf | 5810 | צנטריפוגה תאים |
| BD Falcon | BD-35209715 | צינור צנטריפוגה 15 מ"ל | |
| CS& חרוזי T IVD | BD | 662414 | חרוזים סטנדרטיים להגדרת הגדרות ציטומטר בזרימה ציטומטרית |
| תמיסת לייזינג 10x תרכיז | BD | 349202 | תאי דם אדומים |
| מאגר פוספט (PBS) | Gibco | 10010-023 | PBS |
| מבחנה תחתונה עגולה | BD Falcon | 352235 5 מ"ל מבחנה |
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה