תפקוד המיטוכונדריה - זרחן חמצוני ויצירת מיני חמצן תגובתי - הוא קריטי הן לבריאות והן למחלות. לפיכך, מדידת תפקוד המיטוכונדריה היא בסיסית במחקר ביו-רפואי. שרירי השלד הם מקור חזק למיטוכונדריה, במיוחד אצל בעלי חיים עם יכולת אירובית גבוהה מאוד, כגון סוסים, מה שהופך אותם לנושאים אידיאליים לחקר הפיזיולוגיה של המיטוכונדריה. מאמר זה מדגים את השימוש ברספירומטריה ברזולוציה גבוהה עם פלואורומטריה בו-זמנית, עם מיטוכונדריה של שרירי השלד שזה עתה נקטפו, כדי לכמת את היכולת לחמצן מצעים במצבים מיטוכונדריאליים שונים ולקבוע את היכולות היחסיות של אלמנטים שונים של נשימה מיטוכונדריאלית. טטרמתילרודאמין מתילאסטר משמש להדגמת ייצור פוטנציאל קרום מיטוכונדריאלי הנובע מחמצון המצע, כולל חישוב היעילות היחסית של המיטוכונדריה על ידי חישוב פוטנציאל הממברנה היחסי שנוצר ליחידת זרם חמצן בו-זמני. ההמרה של ADP ל-ATP גורמת לשינוי בריכוז המגנזיום בתא התגובה, עקב זיקות שונות של האדנילטים למגנזיום. לכן, מגנזיום ירוק יכול לשמש למדידת קצב סינתזת ATP, המאפשר חישוב נוסף של יעילות הזרחן החמצוני (היחס בין זרחן לחמצון [P/O]). לבסוף, השימוש ב- Amplex UltraRed, המייצר מוצר פלואורסצנטי (resorufin) בשילוב עם מי חמצן, מאפשר לכמת את ייצור מיני החמצן הריאקטיבי במהלך נשימה מיטוכונדריאלית, כמו גם את הקשר בין ייצור ROS לנשימה בו-זמנית. טכניקות אלה מאפשרות כימות חזק של הפיזיולוגיה המיטוכונדריאלית במגוון תנאים מדומים שונים, ובכך שופכות אור על תרומתו של מרכיב תאי קריטי זה לבריאות ולחולי כאחד.