הרשמה ל-JoVE נדרשת לצפייה בתוכן זה. התחברו או התחילו בגרסת ניסיון בחינם.

מאמר שיטה

גישות משלימות לחקירת שטף מיטופגיה בתאי β הלבלב

2.5K צפיות

DOI:

10.3791/65789

15 בספטמבר 2023

במאמר זה

סיכום

פרוטוקול זה מתאר שתי שיטות לניתוח כמותי של מיטופגיה בתאי β של הלבלב: הראשונה, שילוב של צבעים ספציפיים למיטוכונדריה החדירים, ושנית, כתב מיטופגיה מקודד גנטית. שתי טכניקות אלה משלימות זו את זו וניתנות לפריסה על בסיס צרכים ספציפיים, ומאפשרות גמישות ודיוק בטיפול כמותי בבקרת איכות מיטוכונדריאלית.

תקציר

מיטופגיה היא מנגנון בקרת איכות הכרחי לשמירה על תפקוד מיטוכונדריאלי אופטימלי. מיטופגיה לא מתפקדת של תאי β גורמת לשחרור אינסולין לא מספיק. הערכות כמותיות מתקדמות של מיטופגיה דורשות לעתים קרובות שימוש במדווחים גנטיים. מודל העכבר mt-Keima, המבטא בדיקה ממוקדת pH רגישה למיטוכונדריה בעלת יחס עירור כפול לכימות מיטופגיה באמצעות ציטומטריית זרימה, עבר אופטימיזציה בתאי β. ניתן להשתמש ביחס בין פליטות אורכי גל mt-Keima חומציים לנייטרליים כדי לכמת מיטופגיה בצורה איתנה. עם זאת, שימוש בכתבי מיטופגיה גנטית יכול להיות מאתגר כאשר עובדים עם מודלים גנטיים מורכבים של עכברים או תאים קשים להעברה, כגון איים אנושיים ראשוניים. פרוטוקול זה מתאר שיטה חדשנית מבוססת צבע משלימה לכימות מיטופגיה של β תאים באיים ראשוניים באמצעות MtPhagy. MtPhagy הוא צבע רגיש ל-pH וחדיר לתאים שמצטבר במיטוכונדריה ומגביר את עוצמת הפלואורסצנטיות שלו כאשר מיטוכונדריה נמצאים בסביבות pH נמוכות, כמו ליזוזומים במהלך מיטופגיה. על ידי שילוב צבע MtPhagy עם Fluozin-3-AM, מחוון Zn2+ הבוחר עבור תאי β, וטטרמתילרודמין, אתיל אסטר (TMRE) להערכת פוטנציאל הממברנה המיטוכונדריאלית, ניתן לכמת שטף מיטופגיה באופן ספציפי בתאי β באמצעות ציטומטריית זרימה. שתי גישות אלה משלימות מאוד, ומאפשרות גמישות ודיוק בהערכת בקרת איכות מיטוכונדריאלית במודלים רבים של תאי β.

מבוא

תאי β בלבלב מייצרים ומפרישים אינסולין כדי לעמוד בדרישות המטבוליות, ותפקוד לקוי של תאי β אחראי להתפרצות היפרגליקמיה וסוכרת הן בסוכרת מסוג 1 והן בסוכרת מסוג 2. תאי β משלבים מטבוליזם של גלוקוז עם הפרשת אינסולין באמצעות אנרגיה מיטוכונדריאלית ופלט מטבולי, אשר תלויים בעתודה של מסה מיטוכונדריאלית תפקודית 1,2,3. כדי לשמור על תפקוד מיטבי של תאי β, תאי β מסתמכים על מנגנוני בקרת איכות מיטוכונדריה כדי להסיר מיטוכונדריה מיושנים או פגומים ולשמר את המסה המיטוכונדריאלית התפקודית4. אוטופגיה מיטוכונדריאלית סלקטיבית, הידועה גם בשם מיטופגיה, היא מרכיב מרכזי במסלול בקרת האיכות של המיטוכונדריה.

הערכות של מיטופגיה בתאים חיים מסתמכות לעתים קרובות על שינויים ב- pH המיטוכונדריאלי המתרחשים במהלך מיטופגיה. למיטוכונדריה יש pH בסיסי מעט, ומיטוכונדריה בריאים בדרך כלל שוכנים בציטוזול ניטרלי עם pH. במהלך מיטופגיה, מיטוכונדריה פגומים או לא מתפקדים משולבים באופן סלקטיבי באוטופגוזומים ובסופו של דבר מנוקים בתוך ליזוזומים חומציים5. מספר מודלים של עכברי כתב מיטופגיה טרנסגנית in vivo, כגון mt-Keima6, mitoQC7 ו-CMMR8, כמו גם בדיקות מיטופגיות טרנספקטיות, כגון פלסמיד Cox8-EGFP-mCherry9, משתמשים בשינוי pH זה כדי לספק הערכות כמותיות של מיטופגיה. השימוש בעכברים טרנסגניים המבטאים את ה-mt-Keima pH-sensitive dual-excitation ratiometric probe עבר אופטימיזציה להערכות מיטופגיות באיים ובתאים β באמצעות ציטומטריית זרימה10,11. ניתן להשתמש ביחס בין פליטות אורכי גל חומציים לנייטרליים mt-Keima (היחס בין עירור חומצי של 561 ננומטר לעירור נייטרלי של 480 ננומטר) כדי לכמת בצורה איתנה מיטופגיה 6,12.

פרוטוקול זה מתאר גישה אופטימלית להערכת שטף מיטופגיה באיים ראשוניים ובתאי β שבודדו מעכברים טרנסגניים mt-Keima 10,11. בעוד mt-Keima היא בדיקה רגישה מאוד, זה דורש או תוכניות רבייה מסובכות של בעלי חיים או transfection של תאים, אשר לעתים קרובות יכול להיות מאתגר כאשר עובדים בשילוב עם מודלים גנטיים אחרים או עם איים אנושיים ראשוניים. בנוסף, השימוש במספר לייזרים וגלאים פלואורסצנטיים לזיהוי אוכלוסיות תאים ניטרליים וחומציים יכול להגביל את השימוש הקומבינטורי של כתבים פלואורסצנטיים אחרים.

כדי להתגבר על אתגרים אלה, פרוטוקול זה מתאר גם שיטה משלימה, בעלת תעלה פלואורסצנטית יחידה, מבוססת צבע, לזיהוי חזק של מיטופגיה בתאי β מאיי עכבר מבודדים. גישה זו, המכונה שיטת MtPhagy, משתמשת בשילוב של שלושה צבעים חדירים לתאים כדי לבחור תאים β, לכמת את אוכלוסיות התאים שעוברות מיטופגיה באופן פעיל, ולהעריך את פוטנציאל הממברנה המיטוכונדריאלית (MMP או Δψm) בו זמנית.

הראשון מבין צבעים אלה הוא Fluozin-3-AM, מחוון Zn2+ חדיר לתאים עם Ex/Em 494/516 nm13. איי עכבר מהווים אוכלוסייה הטרוגנית של תאים נבדלים מבחינה תפקודית, כולל תאי α, β, δ ו- PP. תאי β מהווים כ-80% מהתאים בתוך איון העכבר וניתן להבדיל בינם לבין סוגי תאי איון אחרים בשל ריכוזם הגבוה Zn2+ בגרגרי אינסולין14,15, המאפשר זיהוי של תאי β כאוכלוסייההגבוהה של פלואוזין-3-AM. צבע MtPhagy, צבע רגיש ל- pH המשותק על המיטוכונדריה באמצעות קשר כימי ופולט פלואורסצנטיות חלשה, משמש גם בפרוטוקולזה 16. עם השראת מיטופגיה, מיטוכונדריה פגומה משולבת בליזוזום החומצי, וצבע MtPhagy מגביר את עוצמת הפלואורסצנטיות שלו בסביבת pH נמוכה (Ex/Em 561/570-700 ננומטר).

בנוסף, טטרמתילרודמין, אתיל אסטר (TMRE), משמש להערכת MMP. TMRE הוא צבע בעל מטען חיובי חדיר לתאים (Ex/Em 552/575 nm) אשר נתפס על ידי מיטוכונדריה בריאה בשל המטען השלילי היחסי הנתמך על ידי פוטנציאל הממברנה שלהם17. מיטוכונדריה פגומה או לא בריאה מפזרת את פוטנציאל הממברנה שלהם, וכתוצאה מכך היכולת לבודד TMRE יורדת. באמצעות שימוש בצבעים אלה יחד, ניתן לזהות β תאים שעוברים מיטופגיה כאוכלוסייהנמוכה של פלואוזיןגבוה MtPhagyגבוהTMRE באמצעות ציטומטריית זרימה. מאחר שמיטופגיה היא תהליך דינמי ולא סטטי, פרוטוקול זה עבר אופטימיזציה להערכת שטף מיטופגיה באמצעות Valinomycin, K+-ionophore המשרה מיטופגיה לאחר פיזור MMP18. השוואה של מיטופגיה בנוכחות והיעדר valinomycin מאפשרת הערכה של שטף מיטופגיה בקבוצות מדגם שונות.

האופי מבוסס הצבע של הגישה הנוכחית מאפשר להסיק אותה על איים אנושיים וסוגי תאים קשים אחרים להעברה ולעקוף את הצורך בתוכניות גידול מסובכות של בעלי חיים, בניגוד לפרוטוקול mt-Keima. מטרת העל של פרוטוקול זה היא לכמת מיטופגיה בתאי β ברמת התא הבודד באמצעות שתי שיטות עצמאיות מבוססות ציטומטריית זרימה. יחד, פרוטוקול זה מתאר שתי שיטות חזקות ומשלימות המאפשרות דיוק וגמישות במחקר כמותי של בקרת איכות מיטוכונדריאלית.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

פרוטוקול

המחקרים בבעלי חיים המוצגים בפרוטוקול זה נבדקו ואושרו על ידי הוועדה המוסדית לטיפול ושימוש בבעלי חיים באוניברסיטת מישיגן. במחקר זה נעשה שימוש בעכברי C57BL/6J זכרים בני עשרים שבועות, שקיבלו דיאטת שומן רגילה של 15 שבועות (RFD) או דיאטה עתירת שומן (HFD).

1. הערכת מיטופגיה באמצעות גישת MtPhagy מבוססת צבע (שיטה 1)

  1. הכנת איון עכבר וטיפול בו
    1. בצע תרבית איים וחשיפה לואלינומיצין לפי השלבים הבאים.
      1. בודדו איים מעכברי דיאטת שומן רגילה (RFD) או דיאטה עתירת שומן (HFD, 60 קק"ל% שומן19),בהתאם לשיטות 2,10 שתוארו קודם לכן.
      2. דגימות איון תרבית למשך הלילה בטמפרטורה של 37°C ב-RPMI בינוני בתוספת 100 יחידות/מ"ל אנטי-מיקוטי-אנטיביוטי, 50 יחידות/מ"ל פניצילין-סטרפטומיצין, 1 מ"מ נתרן פירובט, 10 מ"מ HEPES וסרום בקר עוברי 10% (FBS) (ראו טבלת חומרים). מדיום זה ייקרא "מדיום איון".
      3. בעזרת פיפטה, בוחרים 100 איים בכל מצב לצלחות פטרי בקוטר 6 ס"מ ב-2 מ"ל של איון בינוני.
        הערה: התנאים המשמשים לפרוטוקול זה: (1) בקרה לא מוכתמת: איי RFD לא מוכתמים; (2) בקרת DAPI בלבד: איי RFD מוכתמים ב- DAPI; (3) בקרת Fluozin-3-AM בלבד: איי RFD מוכתמים ב-Fluozin-3-AM; (4) בקרת MtPhagy בלבד: איי RFD מוכתמים ב-MtPhagy; (5) בקרת TMRE בלבד: איי RFD מוכתמים ב-TMRE; (6) RFD לא מטופל: איי RFD מוכתמים ב-MtPhagy, TMRE, Fluozin-3-AM ו-DAPI; (7) איי RFD שנחשפו לולינומיצין: איי RFD שנחשפו לוואלינומיצין ומוכתמים ב-MtPhagy, TMRE, Fluozin-3-AM ו-DAPI; (8) HFD לא מטופל: איי HFD מוכתמים ב-MtPhagy, TMRE, Fluozin-3-AM ו-DAPI; (9) איי HFD שנחשפו לולינומיצין: איי HFD שנחשפו לוואלינומיצין ומוכתמים ב-MtPhagy, TMRE, Fluozin-3-AM ו-DAPI.
      4. עבור תנאים (7) ו-(9) (ראה הערה לעיל) שנחשפו לוולינומיצין, הוסף 2 μL של 250 nΜ valinomycin ציר (ראה טבלת חומרים) לאיים בצלחת פטרי למשך 3 שעות כדי לגרום למיטופגיה.
    2. ביצוע דיסוציאציה של תא בודד.
      1. לאחר חשיפה של 3 שעות לוואלינומיצין, בחרו 100 איים מכל מצב לצינורות מיקרוצנטריפוגות נפרדים באמצעות פיפטה.
      2. סובבו איים במהירות של 350 x גרם למשך דקה אחת ב-10°C והשליכו את הסופרנאטנט באמצעות פיפטה.
      3. יש לשטוף דוגמיות 2x עם 1 מ"ל 1x מלח חוצץ פוספט (PBS), עם שלבי סחיטה (350 x גרם/דקה אחת, 10°C) בין כל כביסה. יש להשליך את הסופרנאטנט עם פיפטה לאחר כל כביסה.
      4. כדי לנתק איים לתאים בודדים, הוסף 500 μL של 0.05% טריפסין (מחומם מראש ל 37 ° C) לצינור מיקרוצנטריפוגה של דגימה אחת כדי למנוע עיכול יתר של איונים. פיפטה מעלה ומטה שוב ושוב עד שהאיים מפוזרים באופן גלוי.
      5. הוסף מיד 1 מ"ל של מדיום איון שחומם מראש כדי לנטרל טריפסין. חזור על טריפסיניזציה ונטרול עבור כל דגימה, אחד בכל פעם.
      6. דגימות ספין ב 500 x גרם במשך 5 דקות ב 10 ° C. מוציאים סופרנאטנט עם פיפטה, נזהרים לא להפריע לכדור.
        הערה: גלולה תהיה עדינה עבור דגימות שנחשפו valinomycin.
      7. יש לשטוף דוגמיות 2x עם RPMI בינוני, ללא פנול אדום, בתוספת 100 יחידות/מ"ל אנטי-אנטי-אנטיביוטי, 50 יחידות/מ"ל פניצילין-סטרפטומיצין, 1 מ"מ נתרן פירובט, 10 mM HEPES ו-10% אלבומין בסרום בקר (BSA). תווך זה ייקרא "תווך זרימת איון". כלול שלבי סחיטה (350 x גרם/דקה אחת, 10° צלזיוס) בין כל כביסה. יש להשליך את הסופרנאטנט עם פיפטה לאחר כל כביסה.
    3. תאי צביעה עם MtPhagy, TMRE, Fluozin-3-AM ו-DAPI כדי להתכונן לציטומטריית זרימה.
      1. להשהות דגימות איון ב 500 μL של תווך זרימת איון.
      2. הוסף 0.25 μL של מלאי MtPhagy של 100 מיקרומטר (ראה טבלת חומרים) לצינורות המקבלים צבע MtPhagy (תנאים 4, 6, 7, 8 ו- 9, הערה לשלב 1.1.1).
      3. הוסף 0.25 μL של 100 μM TMRE (ראה טבלת חומרים) לצינורות המקבלים צבע TMRE (תנאים 5, 6, 7, 8 ו- 9).
      4. יש להוסיף 0.25 μL של 1 mM Fluozin-3-AM (ראה טבלת חומרים) לצינורות המקבלים צבע Fluozin-3-AM (תנאים 3, 6, 7, 8 ו-9).
      5. צינורות מערבולת במהירות נמוכה במשך 5 שניות לערבב.
      6. יש לעטוף צינורות מיקרוצנטריפוגות ברדיד אלומיניום כדי להגן מפני אור ולדגור בטמפרטורה של 37°C למשך 30 דקות. באמצע הדגירה, מערבולות צינורות במהירות נמוכה עבור 5-10 שניות כדי לערבב.
      7. לאחר הדגירה, דגימות צנטריפוגות ב 350 x גרם במשך דקה אחת ב 10 ° C. יש להשליך סופרנאטנט באמצעות פיפטה.
      8. דגימות השעיה בתווך זרימה של 500 μL איון. הוסף 0.2 מיקרוגרם/מ"ל DAPI (ראה טבלת חומרים) לתנאים 2, 6, 7, 8 ו- 9.
      9. דגימות ספין ב 350 x גרם במשך 1 דקות ב 10 ° C. יש להשליך סופרנאטנט באמצעות פיפטה ולהשהות מחדש ב-500 מיקרוליטר של תווך זרימת איון.
      10. מניחים דוגמאות על קרח.
  2. ציטומטריית זרימה
    1. הפעל את המכשיר (ראה טבלת חומרים).
      הערה: כל ציטומטר זרימה עם המסננים המתאימים יפעל. במחקר זה נעשה שימוש במסננים הבאים: (1) VL1 עבור DAPI: עירור/פליטה - 405 ננומטר/440 ננומטר (50 ננומטר); (2) BL1 עבור Fluozin-3-AM: עירור/פליטה - 488 ננומטר/530 ננומטר (30 ננומטר); (3) BL2 לצבע MtPhagy: עירור/פליטה - 488 ננומטר/590 ננומטר (40 ננומטר); (4) YL1 עבור TMRE: עירור/פליטה - 561 ננומטר/585 ננומטר (16 ננומטר).
    2. התאם את המתחים עבור פיזור קדימה (FSC) ופיזור צדדי (SSC) כדי להבטיח שאוכלוסיות התאים נמצאות במרכז חלקת הפיזור. עבור פרוטוקול זה, המתחים ששימשו היו 120 V עבור FSC ו- 260 V עבור SSC כדי להבטיח שהתאים נופלים באופן שווה בתוך FSC-A לעומת . תרשים SSC-A (איור 1A).
    3. כדי לא לכלול תאים שאינם בודדים, הוסף שער מלבני ב- FSC-H לעומת . FSC-W ואחריו SSC-H לעומת . SSC-W (איור 1B,C).
    4. התאם מתחים ופיצוי עבור DAPI לסינון עבור תאי β חיים. קבעו שערי פלואורסצנטיות עבור כל פלואורופור שנעשה בו שימוש בהתבסס על דגימת RFD לא מוכתמת (איורים 1D-F).
      הערה: מתחים המשמשים עבור כל ערוץ: (1) VL1: 320-360 V; (2) BL1: 300-340 V; (3) BL2: 260-300 V; (4) YL1: 300-340 V.
    5. לאחר הקמת השערים, אספו 10,000 אירועים לכל מדגם.
      הערה: תוך שימוש בגישת ה-gating הזו, רמות מיטופגיה בתנאי בסיס ובהשראת ולינומיצין הוערכו גם באיי RFD וגם באיי HFD (איור 2).
    6. שמור נתונים כקבצי FCS לניתוח.

2. הערכת מיטופגיה באמצעות כתב mt-Keima מקודד גנטית (שיטה 2)

  1. הכנת אי עכבר ודיסוציאציה של תא בודד
    1. בצע תרבית איים וחשיפה לואלינומיצין לפי השלבים הבאים.
      1. בודדו איים בלבלב מעכברי בר (WT) ועכברי mt-Keima/+ (mt-Keima)6. בשיטה זו נעשה שימוש בעכברי WT זכרים בני 20 שבועות או עכברי RFD מוזנים mt-Keima/+.
      2. דגימות איון תרבית לילה ב 37 °C (77 °F) בתווך איון.
      3. בעזרת פיפטה, בוחרים 100 איים בכל מצב לתוך צלחות פטרי בקוטר 6 ס"מ עם 2 מ"ל של איון בינוני.
        הערה: התנאים המשמשים לפרוטוקול זה: (1) בקרה לא מוכתמת: איי WT לא מוכתמים; (2) בקרת DAPI בלבד: איי WT מוכתמים ב- DAPI; (3) בקרת פלוזין-3-AM בלבד: איי WT מוכתמים בפלוזין-3-AM; (4) בקרת mt-Keima בלבד: איים mt-Keima/+ לא מוכתמים; (5) לא מטופלים: mt-Keima/+ איים מוכתמים בפלוזין-3-AM ו-DAPI; (6) Valinomycin: mt-Keima/+ איים שנחשפו לוולינומיצין ומוכתמים בפלוזין-3-AM ו-DAPI.
      4. עבור מצב (6) עם חשיפה valinomycin, להוסיף 2 μL של 250 ננומטר valinomycin ציר לאיים בצלחת פטרי במשך 3 שעות כדי לגרום mitophagy.
    2. ביצוע דיסוציאציה של תא בודד.
      1. בצע שלבי דיסוציאציה של תא בודד, כמתואר בשלב 1.1.2.
    3. תאי צביעה עם Fluozin-3-AM ו-DAPI.
      1. להשהות דגימות איון ב 500 μL של תווך זרימת איון.
      2. הוסף 0.25 μL של 1 mM Fluozin-3-AM לצינורות המקבלים צבע Fluozin-3-AM (תנאים 3, 5 ו- 6).
      3. לדגור על תאים בטמפרטורה של 37°C ולהמשיך לטיפול DAPI, כמתואר בשלבים 1.1.3.5-1.3.10.
  2. ציטומטריית זרימה
    1. הפעל את המכשיר. כל ציטומטר זרימה עם המסננים המתאימים יעבוד.
      הערה: במחקר זה נעשה שימוש במסננים הבאים: (1) VL1 עבור DAPI: עירור/פליטה - 405 ננומטר/440 ננומטר (50 ננומטר); (2) BL1 עבור Fluozin-3-AM: עירור/פליטה - 488 ננומטר/530 ננומטר (30 ננומטר); (3) VL3 עבור mt-Keima נייטרלי: עירור/פליטה - 405 ננומטר/603 ננומטר (48 ננומטר); (4) YL2 עבור חומצת mt-Keima: עירור/פליטה - 561 ננומטר/620 ננומטר (15 ננומטר).
    2. כוונן מתחי FSC ו-SSC ולא כלל תאים שאינם בודדים כמתואר בשלבים 1.2.2-1.2.3 (איורים 3A-C).
    3. התאימו את המתחים והפיצוי עבור DAPI, Fluozin-3-AM ו-mt-Keima באמצעות בקרות לא מוכתמות וחיוביות בודדות (תנאים 1-4) כדי להבטיח שניתן יהיה להבחין בין אוכלוסיות תאים חיוביים פלואורסצנטיים לבין תאים לא מוכתמים. לאחר החלת פיצוי מתאים על כל ערוץ, הגדירו שער שלילי DAPI ושערים חיוביים של Fluozin-3-AM כדי לסנן תאי β חיים (איורים 3D-E).
    4. הגדירו סכמת גטינג משולשת באמצעות הדגימה החיובית mt-Keima (תנאי 4) כדי לזהות אוכלוסיות תאים חומציים וניטרליים (איור 3F).
      הערה: מתחים המשמשים בדרך כלל עבור כל ערוץ: (1) VL1: 320-340 V; (2) BL2: 260-280 V; (3) VL3: 280-300 V; (4) YL2: 280-300 V.
    5. לאחר הקמת השערים, אספו 10,000 אירועים לכל מדגם. סכמות Gating עבור תנאים 5 ו-6 מודגמות באיור 3A-G.
    6. שמור נתונים כקבצי FCS לניתוח.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

תוצאות

הערכת מיטופגיה באמצעות גישת MtPhagy מבוססת צבע
גישה מבוססת צבע זו הותאמה לניתוח שטף מיטופגיה בתוך תאי β עכבר ראשוניים ללא צורך בכתב גנטי, תוך שימוש בפלוזין-3-AM, TMRE ו- MtPhagy וכן DAPI כדי להוציא תאים מתים. על ידי זיווג צבעים אלה עם valinomycin כדי לגרום mitophagy, פרוטוקול זה מתאר שיטה מבוססת צבע למדוד באופן סלקטיבי שטף mitophagy בעכבר ראשוני β תאים18. עבור הנתונים המוצגים בשיטת MtPhagy זו, הן מיטופגיה בסיסית והן מיטופגיה הנגרמת על ידי ולינומיצין נותחו באיים שבודדו מדיאטה רג...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

דיון

פרוטוקול זה תיאר שתי שיטות משלימות לכימות שטף מיטופגיה באיים עכבריים ראשוניים מנותקים. בשיטת mt-Keima כומתה עלייה במיטופגיה כיחס מוגבר של תאים חומציים (561 ננומטר)/ניטרליים (405 ננומטר), ואילו בשיטת MtPhagy כומתה שטף מיטופגיה מוגבר כגידול באוכלוסייתהתאים הגבוהה MtPhagyHighTMRE. שיטות אלה מאפשרות הערכות מהירות, כמותיות וספציפיות לתאים β של שטף המיטופגיה.

שתי השיטות הן גישות פשוטות. עם זאת, שלבים מסוימים בפרוטוקול זה חיוניים להשגת תוצאות איכותיות וניתנות לשחזור. ...

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

גילויים

SAS קיבלה מימון מענקים מחברת Ono Pharmaceutical Co., Ltd. והיא יועצת עבור Novo Nordisk.

תודות

א.ל-ד. מאשר תמיכה מה-NIH (T32-AI007413 ו-T32-AG000114). SAS מודה על תמיכתם של JDRF (COE-2019-861), NIH (R01 DK135268, R01 DK108921, R01 DK135032, R01 DK136547, U01 DK127747), המחלקה לענייני חיילים משוחררים (I01 BX004444), משפחת ברהם ומשפחת אנתוני.

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

חומרים

רשימת החומרים שנעשה בהם שימוש במאמר זה
שםחברהמספר קטלוגהערות
טכנולוגיות חיים אנטיביוטיות-אנטי-מיקוטיות15240-062
Attune NxT זרימה ציטומטר תרמופישרמדעיA24858
דימתיל סולפוקסידסיגמא-אולדריץ'317275
חומצות שומן ללא חומצות שומן הלם חום אבקת BSA EquitechBAH66
סרום בקר עובריג'מיני ביו900-108
פלואוזין-3AM תרמופישר סיינטיפיק F24195100 μ g אבקת Fluozin-3AM משוחזרת ב-51 μ L DMSO ו-51 μ L פלורוניק F-127 יגיע למלאי של 1 מילימטר.
גיבקו  RPMI 1640 בינוניפישר סיינטיפיק11-875-093
HEPES (1M)Life Technologies15630-080
MtPhagy dyeDojindoMT02-105 μ גרם אבקת MtPhagy משוחזרת עם 50 μ L DMSO כדי להגיע ל-100 μ מניות M. 
צבע MtPhagyDojindoMT02-10
פניצילין-סטרפטומיצין (100x)Life Technologies15140-122תמיסה 1x המשמשת בפרוקוטול על ידי דילול 1:10 ב-ddH2O
תמיסת מלח חוצצת פוספט, 10xFisher ScientificBP399-20תמיסה 1x המשמשת בפרוקוטול על ידי דילול 1:10 ב-ddH2O
נתרן פירובט (100x)Life טכנולוגיות11360-0705 μ גרם אבקת MtPhagy משוחזרת עם 50 μ L DMSO כדי להגיע ל-100 μ מניות M. 
TMRE [טטרמתילרודמין, אתיל אסטר, פרכלורט]AnaspecAS-88061TMRE משוחזרת ב-DMSO כדי להגיע ל-100 μ מלאי M.
טריפסין-EDTA (0.05%), פנול אדוםThermofisher Scientific25300054
ValinomycinSigmaV0627אבקת Valinomycin הורכבה מחדש ב-DMSO כדי להגיע למלאי של 250 ננומטר.
אבקת

מקורות

  1. Kaufman, B. A., Li, C., Soleimanpour, S. A. Mitochondrial regulation of β-cell function: maintaining the momentum for insulin release. Molecular Aspects of Medicine. 42, 91-104 (2015).
  2. Soleimanpour, S. A., et al. The diabetes susceptibility gene Clec16a regulates mitophagy. Cell. 157 (7), 1577-1590 (2014).
  3. Pearson, G., et al. Clec16a, Nrdp1, and USP8 form a ubiquitin-dependent tripartite complex that regulates β-cell mitophagy. Diabetes. 67 (2), 265-277 (2018).
  4. Hattori, N., Saiki, S., Imai, Y. Regulation by mitophagy. International Journal of Biochemistry and Cell Biology. 53, 147-150 (2014).
  5. Berezhnov, A. V., et al. Intracellular pH modulates autophagy and mitophagy. Journal of Biological Chemistry. 291 (16), 8701-8708 (2016).
  6. Sun, N., et al. Measuring in vivo mitophagy. Molecular Cell. 60 (4), 685-696 (2015).
  7. McWilliams, T. G., et al. mito-QC illuminates mitophagy and mitochondrial architecture in vivo. Journal of Cell Biology. 214 (3), 333-345 (2016).
  8. Aoyagi, K., et al. A new beta cell-specific mitophagy reporter mouse shows that metabolic stress leads to accumulation of dysfunctional mitochondria despite increased mitophagy. Diabetologia. 66 (1), 147-162 (2023).
  9. Ma, X., Ding, W. X. A fluorescence imaging based-assay to monitor mitophagy in cultured hepatocytes and mouse liver. Liver Research. 5 (1), 16-20 (2021).
  10. Sidarala, V., et al. Mitophagy protects β cells from inflammatory damage in diabetes. JCI Insight. 5 (24), 141138(2020).
  11. Gingerich, M. A., et al. An intrinsically disordered protein region encoded by the human disease gene CLEC16A regulates mitophagy. Autophagy. 19 (2), 525-543 (2023).
  12. Sun, N., Malide, D., Liu, J., Rovira, I. I., Combs, C. A., Finkel, T. A fluorescence-based imaging method to measure in vitro and in vivo mitophagy using mt-Keima. Nature Protocols. 12 (8), 1576-1587 (2017).
  13. Zhao, J., Bertoglio, B. A., Gee, K. R., Kay, A. R. The zinc indicator FluoZin-3 is not perturbed significantly by physiological levels of calcium or magnesium. Cell Calcium. 44 (4), 422-426 (2008).
  14. Da Silva Xavier, G. The Cells of the Islets of Langerhans. Journal of Clinical Medicine. 7 (3), 54(2018).
  15. Thapa, B., et al. Imaging β-cell function using a zinc-responsive MRI contrast agent may identify first responder islets. Frontiers in Endocrinology. 12, 809867(2022).
  16. Iwashita, H., et al. Live cell imaging of mitochondrial autophagy with a novel fluorescent small molecule. ACS Chemical Biology. 12 (10), 2546-2551 (2017).
  17. Crowley, L. C., Christensen, M. E., Waterhouse, N. J. Measuring mitochondrial transmembrane potential by TMRE staining. Cold Spring Harbor Protocols. 2016 (12), 087361(2016).
  18. Klein, B., Wörndl, K., Lütz-Meindl, U., Kerschbaum, H. H. Perturbation of intracellular K(+) homeostasis with valinomycin promotes cell death by mitochondrial swelling and autophagic processes. Apoptosis. 16 (11), 1101-1117 (2011).
  19. Ji, Y., et al. Toll-like receptors TLR2 and TLR4 block the replication of pancreatic β cells in diet-induced obesity. Nature Immunology. 20 (6), 677-686 (2019).
  20. Sauvat, A., et al. Quantification of cellular viability by automated microscopy and flow cytometry. Oncotarget. 6 (11), 9467-9475 (2015).
  21. Liu, Y. T., et al. Mt-Keima detects PINK1-PRKN mitophagy in vivo with greater sensitivity than mito-QC. Autophagy. 17 (11), 3753-3762 (2021).
  22. Mauro-Lizcano, M., et al. New method to assess mitophagy flux by flow cytometry. Autophagy. 11 (5), 833-843 (2015).

הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.

הדפסות חוזרות והרשאות

תגיות

Mt KeimaMtPhagyFluozin 3 AM