תאי β בלבלב מייצרים ומפרישים אינסולין כדי לעמוד בדרישות המטבוליות, ותפקוד לקוי של תאי β אחראי להתפרצות היפרגליקמיה וסוכרת הן בסוכרת מסוג 1 והן בסוכרת מסוג 2. תאי β משלבים מטבוליזם של גלוקוז עם הפרשת אינסולין באמצעות אנרגיה מיטוכונדריאלית ופלט מטבולי, אשר תלויים בעתודה של מסה מיטוכונדריאלית תפקודית 1,2,3. כדי לשמור על תפקוד מיטבי של תאי β, תאי β מסתמכים על מנגנוני בקרת איכות מיטוכונדריה כדי להסיר מיטוכונדריה מיושנים או פגומים ולשמר את המסה המיטוכונדריאלית התפקודית4. אוטופגיה מיטוכונדריאלית סלקטיבית, הידועה גם בשם מיטופגיה, היא מרכיב מרכזי במסלול בקרת האיכות של המיטוכונדריה.
הערכות של מיטופגיה בתאים חיים מסתמכות לעתים קרובות על שינויים ב- pH המיטוכונדריאלי המתרחשים במהלך מיטופגיה. למיטוכונדריה יש pH בסיסי מעט, ומיטוכונדריה בריאים בדרך כלל שוכנים בציטוזול ניטרלי עם pH. במהלך מיטופגיה, מיטוכונדריה פגומים או לא מתפקדים משולבים באופן סלקטיבי באוטופגוזומים ובסופו של דבר מנוקים בתוך ליזוזומים חומציים5. מספר מודלים של עכברי כתב מיטופגיה טרנסגנית in vivo, כגון mt-Keima6, mitoQC7 ו-CMMR8, כמו גם בדיקות מיטופגיות טרנספקטיות, כגון פלסמיד Cox8-EGFP-mCherry9, משתמשים בשינוי pH זה כדי לספק הערכות כמותיות של מיטופגיה. השימוש בעכברים טרנסגניים המבטאים את ה-mt-Keima pH-sensitive dual-excitation ratiometric probe עבר אופטימיזציה להערכות מיטופגיות באיים ובתאים β באמצעות ציטומטריית זרימה10,11. ניתן להשתמש ביחס בין פליטות אורכי גל חומציים לנייטרליים mt-Keima (היחס בין עירור חומצי של 561 ננומטר לעירור נייטרלי של 480 ננומטר) כדי לכמת בצורה איתנה מיטופגיה 6,12.
פרוטוקול זה מתאר גישה אופטימלית להערכת שטף מיטופגיה באיים ראשוניים ובתאי β שבודדו מעכברים טרנסגניים mt-Keima 10,11. בעוד mt-Keima היא בדיקה רגישה מאוד, זה דורש או תוכניות רבייה מסובכות של בעלי חיים או transfection של תאים, אשר לעתים קרובות יכול להיות מאתגר כאשר עובדים בשילוב עם מודלים גנטיים אחרים או עם איים אנושיים ראשוניים. בנוסף, השימוש במספר לייזרים וגלאים פלואורסצנטיים לזיהוי אוכלוסיות תאים ניטרליים וחומציים יכול להגביל את השימוש הקומבינטורי של כתבים פלואורסצנטיים אחרים.
כדי להתגבר על אתגרים אלה, פרוטוקול זה מתאר גם שיטה משלימה, בעלת תעלה פלואורסצנטית יחידה, מבוססת צבע, לזיהוי חזק של מיטופגיה בתאי β מאיי עכבר מבודדים. גישה זו, המכונה שיטת MtPhagy, משתמשת בשילוב של שלושה צבעים חדירים לתאים כדי לבחור תאים β, לכמת את אוכלוסיות התאים שעוברות מיטופגיה באופן פעיל, ולהעריך את פוטנציאל הממברנה המיטוכונדריאלית (MMP או Δψm) בו זמנית.
הראשון מבין צבעים אלה הוא Fluozin-3-AM, מחוון Zn2+ חדיר לתאים עם Ex/Em 494/516 nm13. איי עכבר מהווים אוכלוסייה הטרוגנית של תאים נבדלים מבחינה תפקודית, כולל תאי α, β, δ ו- PP. תאי β מהווים כ-80% מהתאים בתוך איון העכבר וניתן להבדיל בינם לבין סוגי תאי איון אחרים בשל ריכוזם הגבוה Zn2+ בגרגרי אינסולין14,15, המאפשר זיהוי של תאי β כאוכלוסייההגבוהה של פלואוזין-3-AM. צבע MtPhagy, צבע רגיש ל- pH המשותק על המיטוכונדריה באמצעות קשר כימי ופולט פלואורסצנטיות חלשה, משמש גם בפרוטוקולזה 16. עם השראת מיטופגיה, מיטוכונדריה פגומה משולבת בליזוזום החומצי, וצבע MtPhagy מגביר את עוצמת הפלואורסצנטיות שלו בסביבת pH נמוכה (Ex/Em 561/570-700 ננומטר).
בנוסף, טטרמתילרודמין, אתיל אסטר (TMRE), משמש להערכת MMP. TMRE הוא צבע בעל מטען חיובי חדיר לתאים (Ex/Em 552/575 nm) אשר נתפס על ידי מיטוכונדריה בריאה בשל המטען השלילי היחסי הנתמך על ידי פוטנציאל הממברנה שלהם17. מיטוכונדריה פגומה או לא בריאה מפזרת את פוטנציאל הממברנה שלהם, וכתוצאה מכך היכולת לבודד TMRE יורדת. באמצעות שימוש בצבעים אלה יחד, ניתן לזהות β תאים שעוברים מיטופגיה כאוכלוסייהנמוכה של פלואוזיןגבוה MtPhagyגבוהTMRE באמצעות ציטומטריית זרימה. מאחר שמיטופגיה היא תהליך דינמי ולא סטטי, פרוטוקול זה עבר אופטימיזציה להערכת שטף מיטופגיה באמצעות Valinomycin, K+-ionophore המשרה מיטופגיה לאחר פיזור MMP18. השוואה של מיטופגיה בנוכחות והיעדר valinomycin מאפשרת הערכה של שטף מיטופגיה בקבוצות מדגם שונות.
האופי מבוסס הצבע של הגישה הנוכחית מאפשר להסיק אותה על איים אנושיים וסוגי תאים קשים אחרים להעברה ולעקוף את הצורך בתוכניות גידול מסובכות של בעלי חיים, בניגוד לפרוטוקול mt-Keima. מטרת העל של פרוטוקול זה היא לכמת מיטופגיה בתאי β ברמת התא הבודד באמצעות שתי שיטות עצמאיות מבוססות ציטומטריית זרימה. יחד, פרוטוקול זה מתאר שתי שיטות חזקות ומשלימות המאפשרות דיוק וגמישות במחקר כמותי של בקרת איכות מיטוכונדריאלית.