שיטת שימור ארוכת טווח לזני דרוזופילה כחלופה להעברה תכופה של זבובים בוגרים לבקבוקוני מזון טריים רצויה מאוד. פרוטוקול זה מתאר שימור בהקפאה של תאי נבט קדמוניים של דרוזופילה והחייאת זנים באמצעות השתלתם בעוברים מארחים אגמטיים.
מאמר שיטה
* These authors contributed equally
שיטת שימור ארוכת טווח לזני דרוזופילה כחלופה להעברה תכופה של זבובים בוגרים לבקבוקוני מזון טריים רצויה מאוד. פרוטוקול זה מתאר שימור בהקפאה של תאי נבט קדמוניים של דרוזופילה והחייאת זנים באמצעות השתלתם בעוברים מארחים אגמטיים.
זני דרוזופילה חייבים להישמר על ידי העברה תכופה של זבובים בוגרים לבקבוקונים חדשים. זה טומן בחובו סכנה של הידרדרות מוטציות ושינויים פנוטיפיים. לכן פיתוח שיטה חלופית לשימור ארוך טווח ללא שינויים כאלה הוא הכרחי. למרות ניסיונות מוצלחים קודמים, שימור בהקפאה של עוברי דרוזופילה עדיין אינו שימושי מבחינה מעשית בגלל יכולת שחזור נמוכה. במאמר זה אנו מתארים פרוטוקול לשימור בהקפאה של תאי נבט קדמוניים (PGC) ולהחייאת זנים באמצעות השתלת PGCs משומרים בהקפאה בעוברים מארחים אגמטיים מסוג Drosophila melanogaster (D. melanogaster). PGCs חדירים מאוד לחומרים מגנים על הקפאה (CPAs), ושונות התפתחותית ומורפולוגית בין זנים היא פחות בעייתית מאשר בשימור בהקפאה של עוברים. בשיטה זו, PGCs נאספים מכ -30 עוברים תורמים, מועמסים לתוך מחט לאחר טיפול CPA, ולאחר מכן נשמרים בהקפאה בחנקן נוזלי. כדי לייצר גמטות שמקורן בתורם, ה-PGCs השמורים בהקפאה במחט מופשרים ולאחר מכן מופקדים בכ-15 עוברים מארחים אגמטיים. בפרוטוקול זה הושגה תדירות של לפחות 15% זבובים פוריים, ומספר הצאצאים לכל זוג פורה היה תמיד די והותר כדי להחיות את הזן המקורי (מספר הצאצאים הממוצע היה 77.2 ± 7.1), מה שמצביע על יכולתם של PGCs שמורים בהקפאה להפוך לתאי גזע של תאי גזע. המספר הממוצע של זבובים פוריים למחט היה 1.1 ±-0.2, ו-9 מתוך 26 מחטים הניבו שני צאצאים פוריים או יותר. נמצא כי 11 מחטים מספיקות כדי לייצר 6 צאצאים או יותר, שבהם נכללים ככל הנראה לפחות נקבה אחת וזכר אחד. הפונדקאי האגמטי מאפשר להחיות את הזן במהירות פשוט על ידי חציית זבובים נקביים וזכרים שזה עתה הופיעו. בנוסף, ל-PGCs יש פוטנציאל לשמש ביישומי הנדסה גנטית, כגון עריכת גנום.
תחזוקת זני דרוזופילה על ידי העברת זבובים בוגרים לבקבוקוני מזון חדשים גורמת בהכרח להצטברות מוטציות ושינויים אפיגנטיים לאורך זמן. פיתוח שיטה חלופית לתחזוקה ארוכת טווח של זני דרוזופילה ללא שינויים כאלה הוא הכרחי, במיוחד עבור זני ייחוס שבהם יש לשמור על כל הגנום. מספר ניסיונות מוצלחים לשמר בהקפאה עוברים או שחלות דרוזופילה תוארו 1,2,3. למרבה הצער, הם עדיין לא בשימוש מעשי בגלל יכולת שחזור נמוכה. ואכן, לעוברים בשלב מוקדם יש שיעור הישרדות נמוך לאחר שימור בהקפאה בגלל תכולת החלמון הגבוהה שלהם, המעכבת חדירה ודיפוזיה של חומר מגן קריוגני (CPA) 2,3. חדירות CPA מוגבלת מאוד גם על ידי שכבות השעווה של עוברים בשלב מאוחר. קשה וגוזל זמן למצוא פרק זמן ספציפי שבו לעוברים יש שיעור הישרדות גבוה ושכבת שעווה דקה יותר. לאחרונה, Zhan et al.4 שיפרו שיטות לחדירת עוברים, העמסת CPA וויטריפיקציה והצליחו להקפיא עוברים מזנים מרובים. עם זאת, השיטות אינן קלות ליישום מכיוון שהכדאיות של עוברים לאחר חדירה נוטה להיות גרועה. לכן, שיפור נוסף ופיתוח של גישות חלופיות עדיין נדרשים. שיטות הכוללות שימור בהקפאה של תאי נבט קדמוניים (PGC) הן גישה חלופית לתחזוקה ארוכת טווח של זני דרוזופילה.
השתלת PGC (המכונה גם תאי קוטב) שימשה ליצירת כימרות נבט, במיוחד נקבות, כדי לחקור תהליכים כגון השפעות אימהיות של מוטציות קטלניות זיגוטיות וקביעת מין של תאי נבט 5,6,7,8,9,10,11,12 . PGCs הם הרבה יותר קטנים מאשר עוברים והם צפויים להיות חדירים מאוד עבור רוב cryoprotectants. יתר על כן, השונות ההתפתחותית והמורפולוגית בין הזנים בעייתית פחות, ופונדקאי אגמטי מאפשר שחזור מהיר של גנומים שלמים. לאחרונה פיתחנו שיטה חדשה לשימור קריוגניPGC 13, המונעת את השינויים הגנטיים והאפיגנטיים הבלתי נמנעים בזני דרוזופילה. כאן אנו מציגים את הפרוטוקול המפורט.
שיטת שימור קריוגנית זו דורשת מומחיות ספציפית בטיפול ובמכשור PGC. בעוד שגישה שלב אחר שלב עשויה להיות פתרון יעיל עבור אלה שאינם מכירים אותה, היא עשויה להיות לא מתאימה למעבדות קטנות בשל דרישות המכשור. פרוטוקול PGC זה לשימור קריוגני יכול להיות מותאם בקלות רבה יותר לשימוש עם מיני דרוזופילה שונים ומיני חרקים שונים מאשר פרוטוקולי שימור הקפאה של עוברים בגלל הבדלים התפתחותיים ומורפולוגיים קטנים יותר. PGCs יכולים לשמש גם ביישומי הנדסה גנטית, כגון עריכת גנום 14,15,16. לסיכום, ניתן להשתמש בשיטה זו במרכזי מלאי ובמעבדות אחרות כדי לשמור על זני זבובים וזני חרקים אחרים לפרקי זמן ממושכים ללא שינויים.
1. הכנת ציוד
2. איסוף ושימור בהקפאה של PGCs
3. הפשרה והשתלה של PGCs
4. דגירה על עוברים ושיקום זני תורם
היעילות של השתלת PGC בהקפאה דווחה על ידי Asaoka et al.13 והיא ניתנת בטבלה 2 להשתלת PGCs בהקפאה למשך יום אחד או יותר בחנקן נוזלי. שיעור הבקיעה היה 168/208 עוברים מושתלים (80.8%), ושיעור הבקיעה מהעובר לבוגר היה 87/208 (41.8%). שכיחות הזבובים הפוריים הייתה 28/87 (32.2%). תדירות זו לא הייתה שונה בין PGCs שמורים בהקפאה במשך 8 עד 30 יום לבין אלה שנשמרים בהקפאה במשך 31-150 ימים (20/57 לעומת 8/30, G' = 0.63, p >0.1, d.f. = 1). המספר הממוצע של צאצאים לזוג היה 77.2 ± 7.1 (n = 18, 28-122), מה שמצביע על היכולת של PGCs שמורים בהקפאה להפוך לתאי גזע של תאי גזע נבט. מתוך 26 המחטים, 10 לא הפיקו צאצאים פוריים, 7 מחטים ייצרו צאצא פורה אחד, 7 מחטים ייצרו 2 צאצאים פוריים ו-2 מחטים ייצרו 3 או 4 צאצאים פוריים. המספר הממוצע של זבובים פוריים למחט היה 1.1 ± 0.2. בהתבסס על נתונים אלה, בביטחון של 95%, 11 מחטים מספיקות כדי לייצר 6 צאצאים או יותר, שבהם לפחות נקבה אחת וזכר אחד נכללים ככל הנראה.
בניסויים לעיל השתמשנו בעוברים המבטאים mRNA של ovo-A ב-PGCs (nanos>ovo-A, OvoA_OE עוברים) כפונדקאי אגמטי. מתוך 669 נקבות F1 ו-720 זכרי F1 שהופקו מזוגות ננו>אובו-A מושתלים, לא היה מנוס שמקורו ב-PGCs המארחים. מספר מוטנטים של אוסקר (osk) הם גם אגמטייםרגישים לטמפרטורה 20,21. מכיוון שמוטנט אוסק עם כדאיות הומוזיגוטית גבוהה והפנוטיפ האגמטי אינו זמין עוד, יצרנו מחדש את מוטנט ה-osk[8] missense20 על ידי עריכת גנום בסיוע CRISPR/Cas9. זבובים אלה היו אגמטיים לחלוטין (0 בורחים מתוך 230 נקבות ו -192 זכרים) ב -25 מעלות צלזיוס, אך כמה בורחים הגיחו ב -23 מעלות צלזיוס (1 מתוך 248 נקבות ו -1 מתוך 290 זכרים). ננו>אובו-A מומלצים אפוא כעוברים מארחים אגמטיים. מניות UASp-ovo-A ו- nanos-Gal4 13 יהיו זמינות בקרוב ממרכז המניות KYOTO Drosophila.

איור 1: ציוד נדרש. (A) מערכת מיקרומניפולטור לאיסוף תאים והשתלתם. i) מיקרוסקופ הפוך, ii) מיקרומניפולטור מכני, iii) מזרק, iv) מחזיק נימי, v) סטופקוק תלת-כיווני, vi) מכשיר אדים, vii) מיקרוסקופ סטריאו. (ב) מזרק. (C) סטופקוק תלת-כיווני וצינורות סיליקון מחברים מזרק ומחזיק נימי. (D) מחט ומחזיק נימים מחוברים למיקרומניפולטור. (E) גביע לאיסוף עוברים עם צלחת לאיסוף עוברים (קוטר 6 ס"מ, גובה 7.7 ס"מ). (F) מסננת רשת מנירוסטה. (ז) מכל המשמש כתא לח עם מגלשת זכוכית. כדי לשמור על לחות, הניחו נייר רטוב על התחתית וסגרו את המכסה. (ח) מחזיק מחט עם מחט להקפאה. (I) מתלה אחסון להקפאה וקופסה עם מחטים. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: מגלשת זכוכית מאוסף PGC ומחט לשימור קריוגני. (A) שקופית זכוכית מאוסף תאי נבט קדמוניים (PGC) המצופה בדבק. עוברים דכוריוניים מיושרים בשתי שורות ומכוונים כאשר הקדמי שלהם ימינה (הצד שיש לטפל בו) והצד הגחוני למעלה. מסגרת בריכת עוברים מוצמדת, שתי טיפות של תמיסת חומרים מגנים על הקפאה (CPA) מופקדות, והבריכה מלאה בשמן סיליקון. (B) מחט צריכה להכיל כמות קטנה ככל האפשר של חלמון ומזהמים אחרים. PGCs נדחקים בין שתי שכבות של שמן סיליקון כאשר הם נשמרים בהקפאה בחנקן נוזלי. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 3: יצירת המחט. שיטת ליטוש חוד תלת שלבית ליצירת מחט בגודל חור מתאים וקצה חד. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: סכימת איסוף עוברים. לאחר שני אוספים מקדימים, אנו בדרך כלל אוספים שלוש או ארבע פעמים ביום. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 5: יישור עובר מארח. יישור העוברים המארחים על שקופית זכוכית. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 6: סקירה כללית של שיטת PGC cryopreservation. סקירה כללית של כל השלבים שבוצעו לביצוע שימור בהקפאה של תאי נבט קדמוניים (PGC). אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
| לחות בחדר | |||
| < 30% | ~ 30% | > 30% | |
| יישור עוברים מארחים (~ 20 דקות) | יש להשתמש במכשיר אדים למשך 2 - 10 דקות | יש להשתמש במכשיר אדים לסירוגין למשך דקה אחת | אין להשתמש במכשיר אדים |
| הפשרת PGCs מתורם | לא ישים | לא ישים | לא ישים |
| PGCs יבשים באוויר | השמט שלב זה | השמט שלב זה | 5 דקות |
| מרחו שמן סיליקון | לא ישים | לא ישים | לא ישים |
| PGCs להשתלה | לא ישים | לא ישים | לא ישים |
| כל השלבים האלה צריכים להיות finshed בתוך 50 דקות. | |||
טבלה 1: ייבוש עוברים במהלך יישור העוברים והפשרת PGC.
| זן התורם | תקופת שימור בהקפאה | מספר עוברים מושתלים (A) | מספר הזחלים שבקעו (B) (בקיעה, ב/א) | מספר המבוגרים הסגורים (C) (כדאיות ביצה לבוגר, C/A) | מספר הבוגרים הפוריים (D) (תדירות הזבובים הפוריים, D/C) |
| M17 | 8 - 30 ימים | 134 | 108 (80.6%) | 57 (42.5%) | 20 (35.1%) |
| M17 | 31 - 150 ימים | 74 | 60 (81.1%) | 30 (40.5%) | 8 (26.7%) |
| M17: yw; TM6B, P{Dfd-GMR-nvYFP}4, Sb[1] Tb[1] ca[1]/ Pri[1] | |||||
טבלה 2: יעילות השתלת PGC בהקפאה. טבלה זו השתנתה מ- 13. כל הנתונים הם ממארחים אגמטיים.
גורם קריטי להצלחה בשימור הקפאה והחייאת PGC הוא שימוש בעוברים טובים. יש להשתמש בנקבות צעירות (למשל, בנות 3 עד 5 ימים) לאיסוף עוברים. הן העובר התורם והן העובר המארח מוערכים על ידי בדיקה מיקרוסקופית, ורק אלה בשלב הבלסטודרם (שלב 5) משמשים12. עבור איסוף PGC, אנו בדרך כלל מיישרים כ -40 עוברים תורמים בתקופה של 20 דקות ואוספים PGC מכ -30 עוברים בשלב מוקדם 5; לא נעשה שימוש בעוברים ישנים ופגומים. לאחר שימור בהקפאה והפשרה, PGCs צריכים לשמור על צורתם; PGCs נקרעים בשימור לא מוצלח. עוברים מארחים צריכים להיות גם בשלב 5 ויש להם לחץ פנימי מתון; העוברים צריכים לחזור לאט לאט לצורתם המקורית לאחר דרבון עדין. עוברים מיובשים מדי ולא יבשים מספיק לא יתפתחו באופן נורמלי לאחר ההשתלה. מכיוון שהשתלה הטרוסקסואלית של PGCs אינה מצליחה לייצר גמטות בדרוזופילה 5,10, השתלת PGCs מעוברים מרובים מתורמים לעוברים מארחים היא בעלת סיכוי גבוה יותר להניב מבוגרים פוריים. לשם כך, אנו בדרך כלל אוספים PGCs מכ -30 עוברים לכל מחט.
כהגנה קריואקטיבית, ניסינו אתילן גליקול, דימתיל סולפוקסיד וגליצרול יחד עם סוכרוז בריכוזים שונים. קבענו EBR המכיל 20% אתילן גליקול ו 1 M סוכרוז להיותהטוב ביותר 13; עם זאת, השימוש במגני קריופרוטקציה שונים עשוי לשפר את שימור PGC22.
שיטת שימור הקפאה זו דורשת מיומנויות מיוחדות בטיפול ב-PGC, ויש צורך בכ-6 שבועות של הכשרה כדי לאסוף ולהשתיל PGC בנוחות. כדי להעריך ולשפר מיומנות, ניתן לחלק זאת לשישה שלבי אימון: 1) יישור עוברים על מגלשת זכוכית, 2) שליטה במניפולטור, 3) השתלת PGCs מעובר לעובר אחר ללא הקפאה, 4) השתלת PGCs מ-10 עוברים או יותר ל-5 עד 10 עוברים, 5) השתלת PGCs לאחר החלת CPA, ו-6) השתלת PGCs לאחר הפשרת הקפאה. כל שלב עשוי להימשך שבוע. המטרות קצרות הטווח בשלב 3 הן שיעור בקיעה של 40%, כדאיות עובר לבוגר של 10%-20%, ותדירות של זבובים פוריים של 20%.
שימור קריוגני PGC דורש מכשור יקר וכוח אדם מיומן. לכן, שיטה זו לא יכולה להיות מאומצת על ידי מעבדות רבות. עם זאת, לשיטת PGC הנוכחית יש מספר היבטים חשובים. ראשית, PGCs קטנים בהרבה מעוברים והם חדירים מאוד להקפאה. לעומת זאת, חדירות ההגנה הקפאית מוגבלת מאוד על ידי שכבות השעווה של עוברי דרוזופילה, שהיא הבעיה החמורה ביותר בשימור עוברים בהקפאה. ואכן, מחקרים קודמים עשו מאמצים רבים למצוא חלון זמן שבו לעוברים יש שיעור הישרדות גבוה ושכבת שעווה דקה יותר. השני עוסק בשונות התפתחותית ומורפולוגית בין זנים. PGCs נאספים מעוברים בשלב מוקדם -5 (2 שעות 30 דקות-3 שעות 20 דקות לאחר הטלת ביצית), בעוד ששימור בהקפאה של עוברים מתבצע בשלב 16 עוברים (14-22 שעות לאחר הטלת ביציות). העוברים הם, אם כן, מבוגרים בהרבה ומראים שונות זן גדולה בהרבה בחלון הזמן האופטימלי לשימור בהקפאה בהשוואה לשימור בהקפאה PGC. ואכן, התדירות של פונדקאים המייצרים צאצאים שמקורם בתורם לא השתנתה בין חמישה זנים שנחקרו על ידי Asaoka et al.13, אם כי המארחים לא היו אגמטיים. יתר על כן, ל-PGCs יש פוטנציאל לשמש ביישומי הנדסה גנטית, כגון עריכת גנום 14,15,16.
למחברים אין ניגודי עניינים להצהיר.
אנו מודים למרכז המניות KYOTO Drosophila על זני הזבובים. אנו מודים גם לגב' וונדה מיאטה על עריכת כתב היד בשפה האנגלית ולד"ר ג'רמי אלן מאדנז (https://jp.edanz.com/ac) על עריכת טיוטה של כתב יד זה. עבודה זו נתמכה על ידי מענקים (JP16km0210072, JP17km0210146, JP18km0210146) מהסוכנות היפנית למחקר ופיתוח רפואי (AMED) ל- T.T.-S.-K., מענקים (JP16km0210073, JP17km0210147, JP18km0210145) מ- AMED ל- S.K., מענק (JP20km0210172) מ- AMED ל- T.T.-S.-K. ו-S.K., מענק סיוע למחקר מדעי (C) (JP19K06780) מהאגודה היפנית לקידום המדע (JSPS) ל-T.T.-S.-K., ומענק סיוע למחקר מדעי בתחומים חדשניים (JP18H05552) מ-JSPS ל-S.K.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| חומצה אצטית | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 017-00256 | לאיסוף עוברים |
| אבקת אגר | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 010-08725 | לאיסוף עוברים |
| סידן כלורי | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 038-24985 | לתמיסת EBR |
| מכשיר סאטר | נימי | B100-75-10-PT | זכוכית בורוסיליקט; OD: 1.0 מ"מ, תעודת זהות: 0.75 מ"מ, אורך: 10 ס"מ, 225 יחידות |
| מחזיק נימי | Eppendorf | 5196 081.005 | מחזיק נימי 4; למיקרומניפולציה |
| תערובת חומצה כרומית | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 037-05415 | לשטיפת מחטים |
| תמיסת | 1x EBR המכילה 20% אתילן גליקול ו-1M סוכרוז | ||
| סרט דו צדדי | 3M | סקוטש w-12 | לחילוץ דבק |
| Ephrussi – תמיסת רינגר חרוזים (EBR) | 130 מ"מ NaCl, 5 מ"מ KCl, 2 מ"מ CaCl2, ו-10 מ"מ Hepes ב-pH 6.9 | ||
| אתנול (99.5) | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 057-00451 | לאיסוף עוברים |
| אתילן גליקול | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 054-00983 | לתמיסת CPA |
| Falcon 50 מ"מ x 9 מ"מ צלחת פטרי בקטריולוגית | Corning Inc. | 351006 | לאיסוף עוברים |
| מלקחיים | Vigor | Type5 Titan | לטיפול בעוברים |
| מיץ ענבים | Asahi Soft Drinks Co., LTD. | Welch's Grape 100 | לאוסף עוברים |
| אגר מיץ ענבים | 50% מיץ ענבים, 2% אגר, 1% אתנול, 1% חומצה אצטית | ||
| Heptane | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 084-08105 | למיצוי |
| דבק מכשיר אדים | APIX INTERNATIONAL CO., LTD. | FSWD2201-WH | להכנת עוברים |
| מיקרוסקופ הפוך | Leica Microsystems GmbH | Leica DM IL LED | למיקרומניפולציה |
| מזרק זכוכית Luer-lock | טוקיו Garasu Kikai ושות', בע"מ | 0550 14 71 08 | מצפים בוכנה בשמן סיליקון (FL-100-450CS); למיקרומניפולציה |
| מיקרומניפולטור מכני | Leica Microsystems GmbH | למיקרומניפולציה | |
| זכוכית מיקרו שקופיות | Matsunami Glass Ind., Ltd. | S-2441 | ליישור עוברים |
| מיקרו-מטחנה | NARISHIGE Group | הזמנה מותאמת אישית | EG-401-S משולבת EG-401 ו-MF2 (עם עדשת עיניים MF2-LE15); להכנת מחט |
| מצלמת מיקרוסקופ | Leica Microsystems GmbH | Leica MC170 HD | למיקרומניפולציה |
| מחזיק מחט | Merck KGaA | Eppendorf TransferTip (ES) | לשימור בהקפאה |
| אשלגן כלורי | נקלאי טסקה, בע"מ | 28514-75 | עבור חולץ תמיסת EBR |
| NARISHIGE Group | PN-31 | להכנת מחט; רמת החימום מוגדרת ל-85.0-98.4, רמת המגנט הראשית ל-57.8 ורמת המשנה של המגנט ל-45.0. | |
| סרט דבק PVC לבידוד חשמלי | Nitto Denko Corporation | J2515 | למסגרת בריכת עוברים |
| שמן סיליקון | Shin-Etsu Chemical, Co, Ltd. | FL-100-450CS | לטיפול בעוברים |
| נתרן כלורי | Nacalai Tesque, Inc. | 31320-05 | לתמיסת EBR |
| תמיסת נתרן היפוכלוריט | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 197-02206 | לא מדולל ומוכן טרי; לעובר מפר |
| סוכרוז | Nacalai Tesque, Inc. | 30404-45 | עבור פתרון CPA |