RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
he_IL
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
פרוטוקול זה מתאר את השימוש בחיישנים ביולוגיים מבוססי BRET למדידה בזמן אמת של הפעלת חלבון G בתאי HEK293 חיים על גירוי ליגנד קולטן מצומד לחלבון G. כאן, קולטן β2-אדרנרגי וקולטן קנבינואיד מסוג 1 משמשים כדוגמאות להדגמת היעילות של חיישנים עבור מספר תת-סוגים של חלבון G ועל פני GPCRs שונים.
קולטנים מצומדים לחלבון G (GPCRs) מהווים את המשפחה הגדולה ביותר של קולטנים טרנסממברניים, הממלאים תפקיד מכריע באיתות תאי על ידי התמרת גירויים חוץ-תאיים לתגובות תוך-תאיות. הפעלת GPCR מובילה לשינויים קונפורמטיביים המאפשרים אינטראקציות עם חלבוני G הטרוטרימריים. עם ההפעלה, יחידת המשנה Gα עוברת חילופי GDP-GTP, מתנתקת מדימר Gβγ ומפעילה מפלי איתות במורד הזרם. כדי לחקור הפעלת חלבון G בתיווך GPCR, חיישנים ביולוגיים מבוססי העברת אנרגיה בתהודה ביולוגית (BRET) היא גישה רגישה ביותר ולא פולשנית. חיישני הפעילות הטריציסטרונית מבוססי חלבון G (חיישנים ביולוגיים G-CASE), שפותחו על ידי Schihada et al., מזהים דיסוציאציה של הטרוטרימר כפרוקסי להפעלה ומאפשרים ניטור בזמן אמת של פעילות GPCR באמצעות טרנספקציה של פלסמיד יחיד, תוך התגברות על המגבלות של גישות טרנספקציה משותפת. מבחני BRET מציעים מספר יתרונות על פני טכניקות מבוססות פלואורסצנטיות, כגון רעשי רקע נמוכים יותר, הפחתת פוטוהלבנה ורגישות משופרת. בפרוטוקול זה, נעשה שימוש בחיישנים הביולוגיים G-CASE מבוססי BRET בתאים חיים ובצלחות של 96 בארות. באופן ספציפי, אנו מעריכים את הפעילות של הקולטן β2-אדרנרגי (β2-AR) והקולטן הקנבינואיד מסוג 1 (CB1R) במונחים של הפעלת חלבון G. באמצעות תאים מסוג פרא HEK 293T שהועברו באופן חולף עם β2-AR ותאי HEK293T המבטאים ביציבות CB1R, החוסן של חיישנים ביולוגיים Gs ו-Gi3 G-CASE מאושר. פרוטוקול זה תומך בתועלת של גישה זו למחקרים פרמקולוגיים ובדיקת GPCR בתפוקה גבוהה כדי להבין טוב יותר את יכולתם של ליגנדים להפעיל מסלולים ספציפיים, למשל, באמצעות איתות מוטה ובכך להקל על גילוי תרכובות טיפוליות חדשות.
קולטנים מצומדים לחלבון G (GPCRs) מייצגים את משפחת העל הגדולה ביותר של קולטנים טרנסממברניים, האחראים על התמרת גירויים חוץ-תאיים למפלי איתות תוך-תאיים וכתוצאה מכך תגובות ביולוגיות ספציפיות. הם מטרות פרמקולוגיות מרכזיות, כאשר כ-30% מהתרופות המשווקות פועלות על GPCRs1. קשירת ליגנד GPCR גורמת לשינויים קונפורמטיביים בקולטן, מה שמקל על אינטראקציות עם חלבוני G הטרוטרימריים ו/או GPCR קינאזות (GRKs) ו-β-עצרים, ובכך יוזמת איתות במורד הזרם או הפנמת קולטן2.
חלבוני G הטרוטרימריים משמשים כמתמרים התוך-תאיים העיקריים של איתות GPCR ומורכבים משלוש יחידות משנה: Gα, Gβ ו-Gγ. הטרוטרימרים אלה מסווגים לארבע משפחות - Gi/o, Gs, Gq ו- G12/13 - בהתבסס על תת-הסוג Gα , שכל אחד מהם מפעיל מסלולי איתות נפרדים: תת-סוג Gi/o מעכב אדנילט ציקלאז בעוד Gs מגרה אותו, Gq מפעיל פוספוליפאז C-β, ו-G12/13 מווסת GTPases ממשפחת Rho.
הפעלת GPCR מובילה לסידור מחדש של הקונפורמציה שלהם, מה שמאפשר מעורבות מהירה של חלבון G בתוך קינטיקה תת-שנייה. תהליך זה גורם לשינויים קונפורמטיביים של חלבון G, ומקדם חילופי תמ"ג-GTP ביחידת המשנה Gα. קשירת GTP משנה עוד יותר את קונפורמציה של תת-יחידה Gα, וכתוצאה מכך להתנתק מהדימר Gβγ, ומאפשר התפשטות אותות. חלבוני G הם אפוא חיוניים בוויסות הספציפיות והדינמיקה הזמנית של תגובות תאיות על ידי ויסות חלבוני אפקטור מגוונים כגון אדנילט ציקלאז או תעלות יונים 3,4,5.
פרוטוקול זה מתאר את מדידת ההפעלה או ההשבתה של חלבון G באמצעות חיישנים ביולוגיים מבוססי העברת אנרגיה בתהודה ביולוגית (BRET) על גירוי ליגנד GPCR בתאים חיים. בהשראת עבודה חלוצית על חיישנים ביולוגיים של חלבון G 6,7,8,9, מערכת G-CASE (חיישני פעילות תלת-ציסטרוניים של חלבון G), שהוצגה על ידי Schihada et al.10, מבוססת על BRET בין תת-יחידות Gα ו-Gβγ מסומנות ומציעה גישה יעילה הדורשת טרנספקציה אחת בלבד של פלסמיד. תכונה זו משפרת את הרגישות ומפחיתה אתגרים הקשורים לטרנספקציה משותפת של פלסמידים מרובים המקודדים לשלוש יחידות המשנה (Gα, Gβ ו-Gγ) של חלבון G ההטרוטרימרי. חיישנים אלה הפכו לזמינים לקבוצות מחקר אקדמיות באופן מסחרי (ראה טבלת חומרים).
BRET מציע יתרונות משמעותיים על פני העברת אנרגיה תהודה (FRET) של Förster. ב-BRET, העברת אנרגיה מתרחשת בין תורם ביולומינסנט למקבל פלואורסצנטי ללא צורך במקורות אור חיצוניים. ביולומינסנציה פנימית זו מפחיתה בעיות הקשורות ל-FRET, כגון אוטופלואורסצנציה ופיזור אור, וכתוצאה מכך אות רקע נמוך יותר ורגישות משופרת לבדיקה 6,7,11.
היעדר עירור חיצוני זה ב-BRET ממזער את ההשפעות הפוטו-הלבנה והפוטוטוקסיות, מה שמוביל לאותות רקע נמוכים יותר בהשוואה ל-FRET. כתוצאה מכך, מבחני BRET מציגים לרוב רגישות מוגברת, המאפשרת מדידה של הפעלת חלבון G של GPCRs פעילים מבחינה מכוננת. הרגישות המוגברת של מבחני BRET מקלה על זיהוי אינטראקציות ביולוגיות עדינות, דבר בעל ערך במיוחד במחקרים פרמקולוגיים שבהם מדידה מדויקת של פעילות הקולטן היא קריטית.
ניתן לתרגם את החיישנים הביולוגיים הללו להקרנה בתפוקה גבוהה בצלחות של 96 בארות או 384 בארות, כפי שהודגם לאחרונה על ידי סקוט-דניס ואחרים, שם פותחה שיטה המשתמשת בחיישנים ביולוגיים אלה בבדיקת 384 בארות מבוססת ממברנה לניתוח הפעילות של קולטני קנבינואידים CB1R ו-CB2R12. מאמר זה מתאר את השימוש בחיישנים ביולוגיים אלה בצלחות של 96 בארות בתאים חיים על ידי מדידת הפעילות של β2-AR כאב טיפוס GPCR מסוג A, הקושר את חלבון Gs ואת ה-CB1R השייך ל-GPCRs מסוג A ומפעיל את חלבון משפחת Gi/o . השימוש בשני חיישנים ביולוגיים G-CASE מאומת: Gs ו-Gi3 בתאי HEK 293T עם ה-GPCR באופן חולף (עם β2-AR) או מבוטא ביציבות (עם ה-CB1R).
חשוב לציין כי ניתן לבצע ניסוי זה בקווי תאים שונים, מה שמדגים את הרבגוניות והחוסן של טכניקה זו בהקשרים תאיים שונים. זה מבטיח שניתן ליישם את השיטה על מודלים ניסיוניים מגוונים, מה שהופך אותה לכלי רב ערך לחקר איתות GPCR במסגרות פיזיולוגיות ופרמקולוגיות שונות. איור 1 ממחיש את העיקרון של חיישני פעילות חלבון G מבוססי BRET.

איור 1: העיקרון של חיישני פעילות חלבון G מבוססי BRET. חיישני חלבון G מורכבים משלוש יחידות משנה: Gα, Gβ מקורי ו-Gγ. תת-היחידה Gα מאוחה ל-NanoLuciferase הקטן והבהיר (Nluc), בעוד שתת-היחידה Gγ מסומנת באופן N-terminally עם נוגה מעגלית (cpVenus173). הגנים המקודדים את יחידות המשנה של חלבון G המהונדסות הללו משולבים לפלסמיד יחיד. קשירת ליגנד ל-GPCRs גורמת לשינויים קונפורמטיביים של GPCR, מקדמת גיוס חלבון G ודיסוציאציה לאחר מכן ואחריה הידרוליזה של GTP. דיסוציאציה זו משבשת את העברת האנרגיה בין השותפים, וכתוצאה מכך ירידה באות ה-BRET. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
הריאגנטים והציוד המשמשים במחקר זה מפורטים בטבלת החומרים.
1. זריעת צלחת באר (יום 1)
הערה: עקוב אחר כל פרוטוקולי תרבית התאים במכסה זרימה למינרי סטרילי כדי לשמור על תנאים סטריליים. לוחות באר לבנים עם תחתית שטוחה שקופה משמשים למעקב אחר צמיחת התאים וכדאיותם. השתמש בצלחת הבאר הלבנה המלאה כדי להימנע משימוש במדבקה בשלב 3.2.1.
2. טרנספקציה של פלסמיד (יום 2)
הערה: ניתן לבצע טרנספקציה של תאים ביום הראשון על תאים תלויים לפני הציפוי, במהלך שלב 1.2.7 ורכישת נתונים ביום 3.
3. רכישת נתונים (יום 3)
4. ניתוח נתונים
הערה: אסוף את הנתונים של כל קריאה בקבצי גיליון נתונים נפרדים.




איור 2: שלבים עיקריים לביצוע בדיקת BRET. סקירה כללית של שלושת השלבים הניסיוניים העיקריים המתוארים בפרוטוקול זה (זריעת תאים, טרנספקציה של תאים ורכישת אותות BRET) ומדריך מפורט לרכישת נתונים. מערך ניסוי: ביום הראשון, התאים נזרעים בצלחת לבנה מצופה מראש של 96 בארות עם תחתית שטוחה ושקופה בצפיפות של 30,000 תאים לבאר. ביום השני, התאים עוברים טרנספטציה עם חיישן חלבון G שנבחר יחד עם הפלסמידים GPCR או pcDNA3.1 שנחקרו. לאחר 24 שעות דגירה, פעילות חיישן חלבון G נמדדת באמצעות קריאות ביולומינסנציה ופלואורסצנטיות עם הוספת ליגנד. רכישת נתונים: לאחר שטיפת HBSS של התאים, 80 מיקרוליטר של HBSS מתווספים לבארות, ופליטת הקרינה cpVenus173 נמדדת בין 500 ננומטר ל-600 ננומטר באמצעות מונוכרומטור 535/30 ננומטר (1). לאחר מכן, ביולומינסנציה של Nluc נמדדת בין 400 ננומטר ל-600 ננומטר באמצעות מונוכרומטור של 450/40 ננומטר, הן לפני (2) והן אחרי (3) הוספת פורימזין. לבסוף, אות ה-BRET לפעילות חלבון G המושרה על ידי ליגנד נמדד באמצעות מונוכרומטורים של 450/40 ננומטר ו-535/30 ננומטר, בהתאמה, במשך 3 דקות (3 מחזורים של 60 שניות עם מרווח מדידה של 0.30 שניות) (4) ו-16 דקות (16 מחזורים של 60 שניות עם מרווח מדידה של 0.30 שניות) (5). אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
סכימה כללית של הגדרת הניסוי וביצועו מפורטת באיור 2. ההפעלה של חלבונים ממשפחת Gs או Gi/o לאחר הפעלת ליגנד של שני GPCRs הוערכה באמצעות החיישנים הביולוגיים G-CASE. ראשית, נחקרה משפחה אב-טיפוסית A GPCR, ה-β2-AR עבר טרנספטציה זמנית בתאי HEK 293T. כאשר אגוניסט (כלומר, איזופרוטרנול) הוחל על תאי HEK wt המבטאים את β2-AR יחד עם חיישן החלבון Gs(short)-CASE, נצפתה ירידה תלוית ריכוז באות ה-BRET, מה שמעיד על הפעלה של חלבון Gs (איור 3B). ערכי ΔBRET ירדו עם ריכוז הליגנד עד שהושגה רוויה, עם רמה שנצפתה כ-5 דקות לאחר גירוי הליגנד. לעומת זאת, תאי HEK wt שהועברו עם הפלסמיד הריק pcDNA3.1 וחיישן החלבון Gs(short)-CASE הראו תגובה הפוכה אך נמוכה ולא משמעותית לגירוי איזופרוטרנול (איור 3B). בפרוטוקול זה משורטטים ערכים המתקבלים לאחר 15 דקות של גירוי ליגנד. כדי להבטיח עקביות בתוצאות ועצמאות מבחירת הזמן, יש לבדוק נקודות זמן אחרות, כדי להבטיח שהושג שיווי משקל. בנוסף, כדי להשוות תוצאות על פני ניסויים שונים, יש להתאים את בחירת הזמן על סמך קינטיקה ההפעלה של כל ניסוי.
כדי ליצור את עקומות המינון-תגובה הסיגמואידיות המוצגות באיור 3C, ערכי ה-ΔBRET שנמדדו ב-15 דקות לאחר הגירוי (כאשר הרמה מתייצבת) תווו כנגד ריכוזי הליגנדים השונים. ה-EC50 הנצפה (9.4 ננומטר ±-2.1 ננומטר) נמצא בערכי הטווח של ה-Kd הידוע של הקולטן עבור איזופרוטרנול (13 ננומטר ±-6 ננומטר)13,14 (איור 3C,D). תוצאות אלו מדגימות את היעילות של חיישני G-CASE בהערכת הפעלת חלבון G עם תגובה נצפית הקשורה במיוחד לנוכחות β2-AR.

איור 3: הערכת חיישן חלבון Gs בתאי משקל HEK. קריאות ΔBRET קינטיות עם הוספת איזופרוטרנול האגוניסט לתאי HEK wt שהועברו עם חיישן חלבון Gs ו-β2-AR (A) או pcDNA3.1 (B). (C) עקומות מינון-תגובה המתקבלות על ידי התאמת ערכי ΔBRET (%) לאחר גירוי ליגנד של 15 דקות בריכוזי ליגנד משתנים. (D) השוואת ערכים מקסימליים של ΔBRET בין תאי הבקרה pcDNA3.1 ו-β2-AR שעברו גירוי עם איזופרוטרנול. ההבדל הסטטיסטי למצב pcDNA3.1 נבדק באמצעות מבחן מאן-וויטני לא פרמטרי (**p < 0.01). הנתונים מראים ± SEM ממוצע של שלושה ניסויים עצמאיים שבוצעו בשכפול. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
שנית, החיישנים הביולוגיים נבדקו בתאי HEK CB1, קו תאים HEK 293T המבטא ביציבות את ה-CB1R. תאים אלה הועברו באופן חולף עם חיישן החלבון Gi3-CASE. גירוי עם אגוניסט CB1R WIN-55,212-2 גרם לאות ΔBRET תלוי ריכוז, המצביע על הפעלה של מסלול Gi3 (איור 4A). לעומת זאת, תאי HEK wt שהועברו עם חיישן החלבון Gi3-CASE ועוררו באותם תנאים לא הראו תגובה כלשהי, מה שאישר את הספציפיות של הפעלת CB1R (איור 4B). הרמה הושגה כ-5 דקות לאחר הפעלת הליגנד. עקומת המינון-תגובה המתאימה הדגישה את תגובת ה-ΔBRET תלוית הריכוז הנגרמת על ידי גירוי WIN-55,212-2 בתאי HEK-CB1, בעוד שלא נצפתה תגובה כזו בתאי HEK wt (איור 4C). ה-EC50 הנצפה (112 ננומטר ±-25 ננומטר) נמצא בערכי הטווח של ה-EC50 הידוע של הקולטן עבור WIN-55,212-2 (354 ננומטר ±-62 ננומטר)15 (איור 4C, D). לבסוף, השוואה של ערכי ΔBRET שהתקבלה 15 דקות לאחר גירוי אגוניסטי עם 10 מיקרומטר של WIN-55,212-2 בתאי HEK CB1, ותאי HEK wt ממחישה את ההפעלה התלויה ב-CB1R של מסלול האיתות Gi3 (איור 4D).

איור 4: הערכת חיישן חלבון Gi3 בתאי HEK CB1. קריאות ΔBRET קינטיות עם הוספת האגוניסט WIN-55,212-2 לתאי HEK CB1 (A) או HEK wt (B). עקומות מינון-תגובה המתקבלות על ידי התאמת ערכי ΔBRET (%) לאחר 15 דקות של גירוי ליגנד כנגד ריכוז הליגנד (C). השוואת ערכים מקסימליים של ΔBRET בין תאי הבקרה HEK wt ו-HEK CB1 מגורים עם WIN-55.212-2 (D). ההבדל הסטטיסטי למצב HEK wt נבדק באמצעות מבחן מאן-וויטני לא פרמטרי (****p < 0.0001). הנתונים מראים ± SEM ממוצע של חמישה ניסויים עצמאיים שבוצעו בכפולות. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
למחברים אין מה לחשוף.
פרוטוקול זה מתאר את השימוש בחיישנים ביולוגיים מבוססי BRET למדידה בזמן אמת של הפעלת חלבון G בתאי HEK293 חיים על גירוי ליגנד קולטן מצומד לחלבון G. כאן, קולטן β2-אדרנרגי וקולטן קנבינואיד מסוג 1 משמשים כדוגמאות להדגמת היעילות של חיישנים עבור מספר תת-סוגים של חלבון G ועל פני GPCRs שונים.
תאי HEK-CB1 היו מתנה נדיבה מ- M. Guzman (אוניברסיטת קומפלוטנס, מדריד, ספרד), ופלסמיד קולטן β2-אדרנרגי היה מתנה נדיבה מ- D. Perrais (IINS, המכון הבינתחומי למדעי המוח, בורדו, צרפת). Gi3-CASE ו-Gs(short)-CASE היו מתנה מגונאר שולט (Addgene plasmid # 168122; Addgene פלסמיד # 168124). חלק מהאיורים נוצרו באמצעות BioRender.com. עבודה זו נתמכת על ידי משרד המחקר הצרפתי ובמימון סוכנות המחקר הלאומית הצרפתית (ANR), PolyFADO (ANR-21-CE44-0019), AlzCaBan (ANR-24-CE44-4647) ו-SCHIZOLIP (ANR-22-CE44-0034).
| לוח גידול מתקדם עם 96 בארות, לבן עם תחתית שטוחה שקופה, עם מכסה, ביו-אחד של גריינר | דאצ'ר | 655983 | |
| סרט לבן של BrightMax ClearLine | דאצ'ר | 760245 | |
| ClarioSTAR LVF | BMG Labtech | ||
| דימתיל סולפוקסיד (DMSO) | סיגמא | D4540 | |
| DPBS מותאם, ללא כלוריד סידן ומגנזיום כלוריד, נוזלי, מסונן סטרילי, מתאים לתאים | Sigma | D8537 | |
| דולבקו' s Modified Eagle' s medium (DMEM) GlutaMAX | סיגמא | D0822 | חם ב-37 ומעלות גבוה; אמבט מים C לפני השימוש |
| סרום בקר עוברי (FBS) | Sigma | F9665 | |
| Galphai3-Nluc-Gbeta1-Ggamma2-Venus | אדג'ין | 168122 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ מתנה מגונאר שולטה |
| Galphas (איזופורם קצר)-Nluc-Gbeta3-Ggamma1-Venus | אדג'ין | 168124 | https://www.addgene.org/Gunnar_Schulte/ מתנה מגונאר שולטה |
| HEK-293T עם ביטוי יציב של CB1R (HEK CB1) | מתנה נדיבה ממר גוזמן (אוניברסיטת קומפלוטנסה, מדריד, ספרד) | ||
| HEK-293T מסוג פראי (משקל HEK) | |||
| איזופרוטרנול | סיגמא | I6504 | ממוסס ב-H20 ונשמור ב-– 20 ודרגה C |
| ליפופקטמין 2000 | Invitrogen | 11668019 | |
| תוסף Opti-MEM I מופחת בסרום מדיום GlutaMAX | פישר | 11564506 | |
| pcDNA3 דגל בטא-2-אדרנרגי-רצפטור תג FLAG C-ter | מתנה נדיבה של ד. פרייס (IINS, בורדו) | ||
| pcDNA3.1-(ריק)-TAG | אדג'ין | 138209 | |
| פניצילין/סטרפטומיצין | Sigma | P4333 | |
| תמיסת פולי-אל-ליזין (PLL) | סיגמא | RNBL7086 | |
| Trypsin-EDTA | Sigma | T3924 | |
| ניצחון-55,212-2 | קיימן כימיקלים | 10009023 | ממיס ב-DMSO ונשמור ב-– 20 ודרגה C |