פרוטוקול זה מתאר את בידוד סיבי שריר יחיד שלמים מהסולאוס החמצוני ואת הקמת תרביות מיובלסט מטוהרות מאוד שמקורן בסיבים אלו. ההליך האופטימלי מניב באופן אמין כ-300–500 סיבי מיו שלמים לכל עכבר, ומאפשר ניתוחים מולקולריים ותאים במורד הזרם.
מאמר שיטה
פרוטוקול זה מתאר את בידוד סיבי שריר יחיד שלמים מהסולאוס החמצוני ואת הקמת תרביות מיובלסט מטוהרות מאוד שמקורן בסיבים אלו. ההליך האופטימלי מניב באופן אמין כ-300–500 סיבי מיו שלמים לכל עכבר, ומאפשר ניתוחים מולקולריים ותאים במורד הזרם.
שריר השלד מורכב מסיבי שריר רב-גרעיניים ששלמותם ותפקודם חיוניים לתנועה ולבריאות כללית. בהפרעות נוירומוסקולריות, קבוצות שרירים עלולות להיות מושפעות באופן שונה בין סוגי מחלות ושלבים שונים, ולכן חשוב לבודד סיבים בודדים ברי קיימא משרירים מייצגים לצורך מחקרים מכניים. מטרת הפרוטוקול היא לספק שיטה אמינה לבידוד תפוקה גבוהה של מיוסיבים בודדים שלמים משריר הסוליאוס של העכברים (SOL), שקשה להתנתק בשל אורך הסיבים ושבריריותו. על ידי אופטימיזציה של ריכוז הקולגנאז וזמן העיכול, הפרוטוקול מפחית אובדן סיבים ושומר על הקיימות במהלך דיסוציאציה. תהליך העבודה האופטימלי מפחית משמעותית את ההיצמדות השארית של רקמות לסיבים מבודדים, ובכך מגביל את העברת תאים שאינם סיבים ומפחית זיהום בין תאים. טכניקה זו מתאימה לניתוח סיב יחיד וכן לבידוד תאי לוויין ולהרחבה בתנאים עם זיהום מינימלי. באמצעות זרימת עבודה אופטימלית זו, אנו מקבלים באופן שגרתי ~300–500 סיבים בודדים שמקורם ב-SOL, שניתן לסמן אותם ביעילות גבוהה ולספק אוכלוסיית תאי לוויין איכותיים עם זיהום מינימלי של פיברובלסטים. באמצעות ניתוחים השוואתיים עם שריר Extensor Digitorum Longus (EDL) אנו מדגישים את הערך של גישה מותאמת וספציפית לשריר להערכת טיפולים במחלות נוירומוסקולריות, המאפשרת לבדוק התערבויות תרופתיות מועמדות בתוך חלונות ניסוי קטנים וניתנים לכיוונון.
שריר השלד הוא הרקמה השכיחה ביותר בגוף האדם, ומהווה כ-40–50% ממסת הגוף הכוללת1. שריר השלד משמש כמאגר אנרגיה בצורת גליקוגן. במהלך חשיפה לקור, הוא מספק חום דרך תרמוגנזה, וחשוב מכך גם מספק תנועה. שריר השלד מורכב מסיבי מיו רב-גרעיניים פוסט-מיטוטיים. כדי לשמר את הבשלה ותיקון השריר, נוצרים מיונוקליאים חדשים על ידי תא הגזע הקבוע של שריר השלד שלנו, תא הלוויין (SC). SCs נמצאים בשולי סיבי השריר השלדיים לאחר הלידה 2,3,4. SCs מזוהים על ידי גורם השעתוק Pax7, המובע הן במצב שקט והן במצב מופעל 3,5. בעת פציעה או גירוי היפרטרופי, SCs מפעילים ומווסתים את ה-MyoD, נכנסים לתוכנית המיוגנית, מתרבים, ולבסוף מתאחדים עם סיבי שריר קיימים או חדשים כדי לשקם את תפקוד השריר 6,7,8. SCs הם הטרוגניים ביכולת הגבעול שלהם, במקור העוברי (סומיטי לעומת לא סומיטי), בשלב הגדילה לאחר הלידה (צעיר מול זקן), ובהרכב השריר (סיבים מהירים מול איטיים)9,10,11.
בהתאם לאזור בגוף, שריר השלד מותאם לדרישות האנרגטיות והתפקודיות של אותו אזור. ההטרוגניות הזו בסיבי השריר אפשרית בשל ההתכווצות והיכולת החמצונית שלהם. למעשה, סיבי שריר מורכבים מסיבי חמצון איטיים (המכונים סוג I ו-IIa) וסיבים גליקוליטיים מתכווצים במהירות (נקראים IIx, במכרסמים IIb)12,13. פסיפס יפה ופונקציונלי זה של סוגי סיבים מאפשר לנו לנוע בחופשיות בחיי היומיום שלנו. לדוגמה, שרירי יציבה כמו הסוליאוס (SOL) ועמוד השדרה הזקוף נמצאים במצב של הפעלה כרונית ברמה נמוכה, ולכן מכילים אחוז גבוה של סיבי שריר מסוג I ו-IIa איטיים. לעומת זאת, שרירים קצרים אך מהירים, כמו השרירים המאריך של השרירים הארוכים (EDL), מורכבים בעיקר מסיבי גליקוליטיקה מסוג IIx ו-IIb. עם זאת, הרכב הסיבים אינו קבוע; במקום זאת, סיבי שריר הם מבנים דינמיים המסוגלים לעבור ממהיר לאיטי ולהפך, בהתאם לדרישות הפונקציונליות המוטלות עליהם. ההבדל בכיווץ סוג הסיבים אפשרי בשל תכולת חלבון המיוזין. זהו החלבון העיקרי בשריר השלד, המורכב מאיזופורמים של שרשראות מיוזין קלות וכבדות12,14.
בתוך סרקומר (היחידה התפקודית הקטנה ביותר בשריר שמייצרת כוח), ראשי המיוזין והאקטין מתקשרים ליצירת מבנה הידוע כגשר צולל. באמצעות הידרוליזה של ATP, משתחררת אנרגיה על ידי מחזור האינטראקציות בין המיוזין לאקטין15,16. שרשרת המיאוסין הכבדה (MyHC) היא הסמן המתאים ביותר לזיהוי סוגי סיבים 12,13. בהתאם לאיזופורם של MyHC המובטא, קצב ההתכווצות של השריר ישתנה. כפי שצוין, סיבי סוג I הם סיבים חמצניים איטיים, בניגוד לסיבים מסוג II. קבוצות שרירים דומיננטיות מסוג I מכילות שפע גבוה יותר של אנזימים חמצוניים, עשירות יותר במיטוכונדריה, ויש להן רשת נימים צפופה שמחליפה את השריר17,18 (תחשבו על רץ מרתון). סיבים מסוג I מקודדים על ידי הגן MYH7 13,19. סיבים מסוג II מהירים לעייפות, מכילים אחוז גבוה של אנזימים גליקוליטיים, ויש להם מהירות קיצור מרבית גבוהה יותר, מה שהופך אותם לאידיאליים לפרצי כוח או תנועה קצרים (כמו פאוור לייטר). סיבים מסוג II עבור סוגי IIa, IIx ו-IIb (במכרסמים) מקודדים על ידי הגנים MYH2, MYH1 ו-MYH4, בהתאמה20,21. כמובן, כל פגיעה פתופיזיולוגית שמשפיעה על שלמות השריר תשנה את הרכב הסיבים ותוביל להשפעות מזיקות על תפקוד השריר, מה שעלול להוריד את איכות החיים. למעשה, דיסטרופיות שריריות רבות מתחילות בתא הלוויין (אופתיות תאי לוויין) או בסיבי השריר (נוירונים מוטוריים או רקמת שריר), ועלולות לגרום לשינוי בהרכב סוג הסיבים 22,23,24,25. לדוגמה, פגיעות חוט שדרה, מחקרים במנוחה במיטה וטיסות חלל (מיקרו-כבידה) מראים כי חוסר פעילות ממושכת יכול לגרום לשרירי היציבה לעבור מפנוטיפ איטי למהיר של סיבים 26,27,28,29,30. לעומת זאת, בדיסטרופיה שרירית של דושן, הן במודלים אנושיים והן בעכבר (mdx), סיבים גליקוליטיים מהירים מושפעים במידה רבה יותר ובחומרה רבה יותר מאשר סיבים איטייםיותר 31,32,33,34. באופן דומה, בדיסטרופיה שרירית פאסיוסקפלו-הומרלית (FSHD), נצפה מעבר מהיר לאיטי של עווית עם שיעור גבוה יותר של סיבי סוג I יחד עם ייצור כוח נמוך יותר בסיבי סוג II 24,35,36.
עדיין לא ברור מדוע סוגים מסוימים של סיבי שריר מושפעים סלקטיבית או נחסכים במחלות שונות. העובדה שדפוסים אלו אינם אקראיים מדגישה את החשיבות של ניתוח המנגנונים הבסיסיים, עבורם בידוד סיב יחיד הפך לטכניקה חזקה ונפוצה. למעשה, מאז שהוצג לראשונה באמצע שנות ה-80 על ידי בישוף37, הכלי החיוני הזה עבר שיפור והתאמה מתמשכת, מה שמאפשר חקירה מדויקת יותר של ביולוגיית השרירים 38,39,40. חשוב לציין כי בידוד סיב יחיד שומר על ה-SC קרוב ככל האפשר לנישה הפיזיולוגית שלהם, ומאפשר בדיקה מספקת של פעילותם המולקולרית. למרות שניתן להוציא קבוצות שרירים כמו אלו של כופף הדיגיטורום ברביס (FDB) ו-EDL בקלות יחסית 41,42,43, שריר ה-SOL נשאר אחד השרירים הקשים ביותר להשגת אוכלוסייה עשירה של סיבים שלמים. הסיבה לכך היא הקשיחות שלו, אורך הסיבים הארוך והרגישות לנזק. כדי להתמודד עם זה, טכניקה אופטימלית במחקר הנוכחי שמניבה באופן יציב אוכלוסיית סיבים איכותית וברת קיימא משריר SOL הידוע לשמצה שקשה לבודד. בשילוב עם בידוד סיבי EDL, גישה זו מאפשרת תרבית של סיבים ותאים נגזרים (תאי לוויין, מיובלסטים ומיוטיובים) מקבוצות שריר שונות. חשוב לציין, פלטפורמה זו מאפשרת חקירה שיטתית של הגורמים המולקולריים שעשויים לתרום באופן שונה לפתולוגיות שרירים מגוונות ומספקת אמצעי עוצמתי לבדיקת התערבויות תרופתיות באופן שיכול לחשוף תגובות ספציפיות לסוג השריר ולבסוף לתמוך בפיתוח טיפולים יעילים למחלות שריר שלד.
כל בעלי החיים שוחזקו במתקן הטיפול בבעלי חיים של אוניברסיטת טוקיו מטרופוליטן (מספרי היתרים: A4-4, A5-9, A6-7, A7-018). כל בעלי החיים נשמרו בתנאים מסוימים ללא פתוגנים (SPF). טיפול בבעלי חיים ונהלים ניסיוניים שנקטו במחקר זה עמדו בקפדנות בהנחיות ועדת הבטיחות והאתיקה של אוניברסיטת טוקיו מטרופוליטן.
1. הכנת ריאגנטים
2. ניתוח שרירי הסוליאוס
3. עיכול שרירי הסוליאוס
4. בידוד סיבים בודדים תחת מיקרוסקופ סטריאומיקרוסקופ
5. הקמת תרביות מיובלסט מטוהרות מאוד מסיבי סולאוס
הטכניקה שלנו מראה כי סיבים מבודדים של שרירי הסוליאוס (SOL) ושריר האצבעה הארוכה (EDL) יכולים להיות מסומנים ביעילות נגד Pax7 (איור 3B). הסיבים המבודדים הללו יכולים להישמר במדיום תרבית צפה (המורכב מ-DMEM + GlutaMAX עם 10% סרום סוסים, 1% AB, 0.5% CEE) למשך 3 ימים, ולאחר מכן תווית חיסון (איור 3B). לא מומלץ לשמור על סיבים צפים ליותר מ-4 ימים. בתנאי הסיבים הצפים המתוארים, המיוסיבים נוטים להצטבר לאחר תקופה זו, מה שפוגע בניתוח האימונוליבלינג שלאחר מכן.
הטכניקה המוצגת יכולה לשמש גם לאימונובליטינג על פני תוכנית המיוגנית (איור 3C). למעשה, מיובלסטים שמקורם ב-SOL ו-EDL צופים ללוחות של 24 בארות בנקודת מפגש של כ-70%. התאים נשמרו בתווך גדילה במשך יום אחד (מיובלסטים) או הושרדו להתמיינות במשך יומיים או ארבעה ימים (מיוטובובים מוקדמים ומיוטובים מומיינים, בהתאמה). חמישה מיקרוגרם חלבון הועמסו לניתוח אימונובליטינג.
ביטוי MyHC I התבטא כמעט באופן ספציפי בסיבי שריר שמקורם ב-SOL, עם ביטוי מינימלי במיוטבובסים וזניח במיובלסטים (איור 3C). MyHC II התבטא הן בסיבי שריר SOL והן ב-EDL. ביטוי זה משקף את ה-SOL, המורכב בעיקר מסוגים I ו-IIa, בעוד שה-EDL מורכב בעיקר מסיבי IIx ו-IIb. המיובלסטים לא ביטאו את MyHC II, אך ביטויו גדל בהדרגה במהלך התמיינות. החלבונים הקשורים לחמצון PGC-1α ו-COXIV הראו ביטוי גבוה צפוי בסיבים שמקורם ב-SOL. כמו כן, זוהה ביטוי גבוה יותר של GLUT4 בסיבי SOL מבודדים בהשוואה לסיבי EDL. בעיה שעלולים להתמודד איתה ביולוגים של שרירי שלד היא שחלבוני בית נפוצים ואמצעי בקרת עומס, כגון α-טובולין, β-אקטין, GAPDH וצבעי חלבון כולל Ponceau S, אינם נשארים יציבים בין מיובלסטים, מיוטיובסים וסיבי שריר מבודדים, כאשר כל אחד מהם מציג שונות ייחודית. עוצמת האות של α-טובולין ו-β-אקטין הייתה הגבוהה ביותר במיוטובובלס, בעוד שצביעת Ponceau S הייתה חלשה יחסית במיובלסטים. לעומת זאת, GAPDH הראה ביטוי חזק יותר בסיבי שריר EDL. עם זאת, בהתאם למטרת הניסוי, אחד מחלבוני הניקיון הללו עשוי עדיין להיות רלוונטי, וניתן לחקור גורמי נרמול חלופיים כמו חלבון הלם חום 70 (HSP70).

איור 1. ניתוח שריר סולאוס. (א) ציוד הנדרש לפירוק. 1: מספריים מיקרו, 2: מלקחיים דקים, 3: מספריים לניתוח, ו-4: סיכות חתך. (B) גיד PLA נחתך מחבילות גידים של GAS ו-SOL (חץ צהוב). גיד ה-PLA הדיסטלי (החץ הלבן) הורם באמצעות מלקחיים. (ג) פין חיתוך הוכנס למרווח שבין הגיד הפרוקסימלי של ה-SOL (חץ אדום) ל-GAS (חץ ירוק). (D) SOL הופרדה מ-GAS באמצעות פין חיתול. (E) חבילות גיד GAS ו-SOL נחתכו בצד ה-GAS. (F) גיד הפרוקסימלי של SOL נחתך לאחר מכן במספריים מיקרו. (ז) הוסרו חבילות גיד דיסטליות נוספות. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.

איור 2. בידוד סיבי סולאוס. (א) ציוד הנדרש לבידוד. 1: פיפטות צרות ו-2: פיפטות פסטר רחבות קינה. (ב) סטריאומיקרוסקופ המשמש לבידוד. (ג) סולאוס מעוכל בקולגנאז הועבר ל-DMEM עם 1% AB. (D) סיבי סולאוס שהתנתקו מהשריר לאחר 10 השטיפות הראשונות. (ה) סיבים בודדים שהועברו לצלחת השנייה. (F) תמונה המציגה סיבים נקיים שהוסרו מפסולת וסיבים מצומצמים. (G) סיבים בודדים נטולי פסולת שהועברו לצלחת השלישית. (H) סיבים בודדים שלמים גלויים בבירור. פס קנה מידה = 10 מ"מ. אנא לחצו כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של הדמות הזו.

איור 3. הרחבת תרבית תאים וניתוח דגימות שמקורן ב-EDL וב-SOL. (א) לאחר 6 ימים לאחר הבידוד, דגימות המדיום שהתרבו מראות תרבית מיובלסט טהורה שהושגה מסיבי סולאוס מבודדים. פס קנה מידה = 100 מיקרון. (B) סיבים בודדים שמקורם ב-SOL ו-EDL, מיד או 3 ימים לאחר הבידוד, מראים תאי לוויין מסומנים ל-Pax7 (ירוק). היעדר MyoD (אדום) מאשר שתאי לוויין עדיין לא התחייבו להפעלה מיוגנית. הסיבים צוברו בצבע DAPI (כחול). התאים נצפו לאחר מכן באמצעות מיקרוסקופ פלואורסצנטי. פס סקאלה = 20 מיקרומטר. (C) 5 מיקרוגרם חלבון שימש לאימונובלוטינג של מיובלסטים, מיוטבובסים ודגימות שמקורן במיוסיבר. לוחות אימונובלוטינג מראים ביטוי של MyHC I, MyHC II, PGC-1α, COX IV, GLUT4, α-tubulin, β-actin ו-GAPDH שימשו כמטרות לניהול בית/נרמול. צבע Ponceau S שימש כבקרה מלאה על טעינת חלבון. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה מוגדלת של הדמות הזו.
המפתח הראשון לבידוד מספר רב של סיבי שריר מהסולאוס (SOL) הוא שמירה על שלמות המבנה של השריר במהלך הדיסקציה. אם האפימיזיום של ה-SOL נקרע או אם השריר נמשך בעוצמה, במיוחד לאורך הציר האורכי שלו, במהלך הדיסקציה, תפוקת הבידוד תיפגע קשות. שגיאות החיתוך הללו בדרך כלל קלות לזיהוי לאחר מכן. למעשה, לאחר עיכול הקולגנאז, השריר מתכווץ באופן אחיד ויוצר גוש לבן ודחוס. בתנאים כאלה, רק מספר קטן מאוד של סיבים ברי קיימא יכולים להתנתק.
הגורם המכריע השני לבידוד סולאוס מוצלח הוא יעילות עיכול הקולגנאז מסוג I. כאשר הקולגנאז פועל בצורה מיטבית, ניתן להשיג כ-100–200 סיבי סולאוס בעשרת סשנים הראשונים. לעומת זאת, כאשר העיכול לא אופטימלי, אפילו לאחר 20 השטיפות הראשונות, פחות מ-50 סיבים עשויים להשתחרר. כדי להשיג תפוקת סיבים גבוהה יותר, נדרשים שטיפה נמרצת יותר ומחזורי שטיפה נוספים. עם זאת, מכיוון שסיבי SOL שבריריים במיוחד, לעיתים קרובות זה גורם להתכווצצות הסיבים במהלך השטיפה.
להקמת תרבות מיובלסט ראשונית טהורה שמקורה ב-SOL, עיכול הקולגנאז שוב משחק תפקיד מרכזי. כאשר העיכול יעיל, פחות סיבים נשארים מחוברים לרקמה שנותרה והעברת הסיבים לתוך מדיום התרבית גורמת לזיהום מינימלי בפיברובלסטים. לעומת זאת, כאשר ה-SOL מעוכל בצורה לקויה, סיבים מנותקים נשארים מחוברים לרקמה שאריתית, ויזהמו את תרבית המיובלסט בפיברובלסטים. חוקרים צריכים לחפש את הסימנים הטיפוסיים לזיהום פיברובלסטים בדגימות התאים הזרועים; אלה כוללים גודל תא גדול בהרבה ובליטות ציטוסקלטליות נרחבות, בהשוואה לתאי לוויין קטנים בהרבה בצורת ציר בצלחות מצופות מטריג'ל דבוקות. אם תתרחש זיהום, חוקרים עשויים לחשוף תאים לשלבים מוקדמים לציפוי כפי שמתואר במקום אחר45. לזמן קצר, ה-SC מגדלים במשך 3 ימים לאחר הבידוד, ואז מעובדים בטריפסין ומצפים מראש לזמן קצר על כלים מצופים קולגן. במהלך 15–30 דקות של דגירה, הפיברובלסטים נדבקים בעוד הפיברובלסטים נשארים תלויים ומועברים לפלטות טריות מצופות מטריג'ל.
כפי שצוין לעיל ובהתאם לניסינו, סיבי SOL ארוכים ושבריריים יותר מסיבי ה-extensor digitorum longus (EDL) ו-flexor digitorum brevis (FDB). זה מקשה על העברת סיבים באמצעות פיפטות פסטר. חשוב לשאוב סיבים לאורך ציר האורך שלהם במקום למשוך אותם מהמרכז; אחרת, הסיבים מתקפלים ומתכווצים תחת המתח. מלבד הגורמים המכריעים שקובעים ישירות אם בידוד הסיבים יצליח, כמה שלבים טכניים נוספים חיוניים לשיפור תפוקת סיבי הסוליאוס. אחד מהם הוא לצפות את כל הפיפטים, הכלים וצינורות האיסוף של פסטר ב-5% BSA. דבר זה מונע מסיבי שריר שהתנתקו טריים להידבק למשטחים, ובכך מונע קיפול סיבים והתכווצות לאחר מכן. מומלץ להכין פיפטות פסטר חדשות מחוטאות בחום ומצופות BSA בכל פעם שמבודדות דגימות שריר. חלופה לכך היא שחוקרים יכלו להכין סט של פיפטות פסטר לשימוש ארוך טווח. אם כן, יש לחטא בחום בכל פעם ולצפות מחדש ב-BSA לפני השימוש.
הפרוטוקול הקונבנציונלי לבידוד סיבי שריר בודד היה מותאם בעיקר לשרירים גליקוליטיים כגון FDB ו-EDL37. עם זאת, שרירים חמצניים, כמו ה-SOL, מובחנים מבחינה מבנית. ניתוחים טרנסקריפטומיים הראו כי ביטוי גנים הקשור למטריקס חוץ-תאית (ECM) שונה בין SOL ל-EDL46, כולל גנים כמו דיסטרופין, חלבון קישור ציטוסקלטלי של שריר השלד44. כתוצאה מכך, התנאי הסטנדרטי לעיכול שריר EDL עם קולגנאז של 0.2% (2 מ"ג/מ"ל) למשך 60–90 דקות אינו אופטימלי לשרירי SOL, מה שמוביל לחבילות סיבים דחוסות או סיבים מצומצמים לאחר העיכול. במחקר זה, אופטימיזציה של מספר שלבים מרכזיים כדי להתאים את הפרוטוקול לשרירי SOL חמצניים. על ידי התאמת ריכוז הקולגנאז מסוג I ל-0.5% (5 מ"ג/מ"ל), הארכת תקופת הדגירה ל-130 דקות, והפחתת העומס המכני במהלך השטיפה, ניתן להשיג באופן עקבי 300–500 סיבים שלמים מעכבר אחד. בהשוואה ל-EDL, מספר הסיבים והתפוקה של דגימות SOL נשארים נמוכים יותר (ה-EDL יכול להניב > 500 סיבים); עם זאת, מספר הסיבים, וחשוב מכך, האיכות הגבוהה של הסיבים שמקורם ב-SOL הם עמידים ומתאימים ליישומים במעלה הזרם כמו אימונובלוטינג ואימונובלוטינג. למרות שתוצאות האימונובלוטינג שלנו כללו דגימות סיב בודד מאוחדות, הטכניקה המוצגת בדוח זה מסוגלת לחלץ סיבים בודדים שלמים באופן אמין, מה שהופך אותם למתאימים ליישומים בהמשך כמו אימונובלוטינג, פרוטאומיקה וריצוף RNA47 ברזולוציה של סיב יחיד. חוקרים בתחום יכולים להשתמש בטכניקה זו כדי לחקור הבדלים מטבוליים וכיווצים בין סיבי שריר חמצניים לגליקוליטיים.
בסך הכול, פרוטוקול זה מספק שיטה ניתנת לשחזור ונגישה לבידוד סיבים חמצניים שלמים מהשריר הסוליאוס, ומרחיב את ערכת הכלים הזמינה לחקר פיזיולוגיה ומנגנונים מולקולריים ספציפיים לסוג סיבי שריר.
למחברים אין ניגודי עניינים להצהיר עליהם.
מחקר זה נתמך על ידי הקמת מלגות אוניברסיטאיות ליצירת חדשנות מדעית-טכנולוגית (JST, מענק מס' JPMJFS2139 ל-T.H.) ומענקים מהחברה היפנית לקידום המדע (KAKENHI 23H00457 הוענק ל-N.L.F., 20J12849 ל-Y.Mi., 24K222254 ל-Y. Ma). מחקר זה נתמך גם על ידי מענק מחקר מתקדם של ממשלת טוקיו מטרופולין [R2-2] ל-Y.Ma., ל-N.L.F., וקרן המחקר האסטרטגי של TMU למחקר חדשני [R3] ל-N.L.F. תודה ליאסורו פורואיצ'י על עצותיו ותגובותיו המועילות.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| Accutase | Innovative Cell Technologies | AT104 | |
| Basic fibroblast growth factor | Peprotech | 450-33 | |
| Bovine serum albumin | Sigma | A9418 | |
| Butorphanol tartrate | Meiji Yakuka Co., Ltd | 711-12 | שם מוצר: Vetorphale Injection |
| Chicken Embryo Extract | US Biological | C3999 | |
| Collagenase type I | Worthington | M9B2717 | |
| DAPI | Sigma-Aldrich | D9542 | |
| Fetal bovine serum | Gibco | 10437-028 | |
| Glucose-free DMEM | Gibco | A14430-01 | |
| GlutaMAX | Gibco | 10569 | |
| High-glucose DMEM+GlutaMAX | Gibco | 10569-010 | |
| Horse serum | Life technology | 16050-130 | |
| Low-protein binding filter | Millipore | SLGVR33RB | |
| Matrigel | Corning | 354230 | |
| Medetomidine hydrochloride | Kyoritsu Seiyaku Co., Ltd | 8816 | שם מוצר: Dorbene Injection |
| Midazolam | Maruishi Pharmaceutical Co., Ltd | 4987211762100 | שם מוצר: Dormicum Injection |
| Penicillin-streptomycin-amphotericin B suspension | Wako | 161-23181 | |
| Ponceau S stain solution | Sigma-Aldrich | 24-3875-5 | |
| Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Gibco | 25200056 | |
| Equipment | |||
| Centrifuge tubes (25 mL) | IWAKI | 2362-025 | |
| Fluorescence microscope | Keyence | BZ-X810 | |
| Pasteur pipettes | IWAKI | 5 3/4 IK-PAS-5P | |
| Stereomicroscope | Leica | M165C | |
| Sterilin dishes (100-mm) | Thermo Scientific | 3020-100 | מוזכר כצלחת פטרי במאמר |
| Anbitodies לסימון אימונולוגי | |||
| Goat anti-mouse (H+L), Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A-32723 | 1:400 |
| Goat anti-rabbit (H+L), Alexa Fluor 594 | Thermo Fisher Scientific | A-11012 | 1:400 |
| Mouse Anti-Myosin Heavy Chain | R&D Systems | MAB4470 | 1:400 |
| Mouse Anti-Pax7 | DSHB | AB-528428 | 1:100 |
| Rabbit Anti-MyoD | Santa Cruz Biotechnology | sc-760 | 1:100 |
| Anbitodies לאימונובלוטינג | |||
| HRP-conjugated Anti-mouse IgG | Cytiva | NA931 | 1:1000/ חומצה פרוקסידאז סוסיות |
| HRP-conjugated Anti-Rabbit IgG | Cytiva | NA934 | 1:1000/ חומצה פרוקסידאז סוסיות |
| Mouse Anti-MyHC I | Sigma | M8421 | 1:1000/ Myosin Heavy Chain I |
| Mouse Anti-MyHC II | Sigma | M4276 | 1:1000/ Myosin Heavy Chain II |
| Mouse Anti-PGC-1α | Santa Cruz Biotechnology | sc-517380 | 1:1000/ Pparg coactivator 1 alpha |
| Mouse Anti-α-tubulin | Cell Signaling Technology | #3873 | 1:1000/ Alpha tubulin |
| Rabbit Anti-COXIV | Cell Signaling Technology | #4850 | 1:1000/ Cytochrome c oxidase IV |
| Rabbit Anti-GAPDH | Cell Signaling Technology | #2218 | 1:10000/ Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase |
| Rabbit Anti-GLUT4 | Cell Signaling Technology | #2213 | 1:1000/ Glucose Transporter 4 |
| Rabbit Anti-β-actin | Proteintech | 20536-1-AP | 1:2000/ Nonmuscle Beta-actin |