בדיקת אי: שיטה בעלת תפוקה גבוהה להערכת התנהגות לוקומוטורית של דרוזופילה

0 צפיות4:21 דק' • April 30th, 2023

- בדיקת האי מורכבת ממשטח לבן מוגבה בתוך מגש של מי סבון, מכוסה בקופסה שקופה עם צד אחד פתוח. מצלמה על גבי הקופסה מקליטה תמונות עיליות של הרציף, ואורות ממוקמים כדי להבטיח תאורה אחידה של האזור.

כדי להעמיס את הזבובים על הזירה, הקש בקבוקון על משטח שטוח כדי להביא את כל הזבובים לתחתית. ברצף מהיר, הסר את תקע הבקבוקון, הפוך את הבקבוקון והקש על הקצה הפתוח של הבקבוקון על הפלטפורמה כדי להפיל את כל הזבובים בו זמנית. נחיתה על הרציף מעוררת תגובת בריחה. זבובים עם ניידות טיפוסית יכולים לפנות את הרציף תוך מספר שניות, בניגוד לזבובים עם פגמים מוטוריים.

הנבדקים מרותקים לקופסה, ואלה שנוחתים על מי הסבון שוקעים במהירות מכיוון שהסבון מפחית את מתח הפנים של המים. כדי להעריך התנהגות מוטורית מתנאים שונים, ספור את הזבובים הנותרים על הרציף לאחר פרק זמן מוגדר.

בפרוטוקול דוגמה זה, נראה התקנה של בדיקת האי תואמת לניתוח תמונה חצי אוטומטי.

- ראשית, הכינו מינימום של שלושה בקבוקונים לכל תנאי ניסוי כהעתקים ביולוגיים. כל בקבוקון צריך להכיל כ -15 זבובים מאותו מין וגיל דומה. חשוב לציין, לזבובים חייבות להיות כנפיים שלמות.

צור את התיקיות לאחסון הניסויים. צור אותם במבנה ספרייה המוגדר על-ידי התנאים והעותקים המשוכפלים. אם, לדוגמה, לניסוי יש שני גנוטיפים עם חמישה עותקים משוכפלים כל אחד, צור תיקייה ראשית עם תאריך הניסוי, ובתוך תיקיה זו, צור תת-תיקייה אחת לכל גנוטיפ. לאחר מכן, בתוך תיקיות הגנוטיפ, צור תיקיות משנה עבור כל שכפול.

לאחר מכן, הגדר את מנגנון הבדיקה. מוסיפים מים קרים עם כמות קטנה של סבון למגש האמבטיה וממקמים את המצע באמצע האמבטיה, אם עדיין לא קבוע באמבטיה. מכסים את המגש והפלטפורמה בקופסה שקופה.

כדי להאיר את הרציף, מקם מנורה קרירה, כגון נורות LED רגילות של 12 וולט, מעליה. כמו כן, מקם מצלמת אינטרנט המחוברת למחשב ישירות מעל הפלטפורמה.

במחשב, פתח את תוכנת הקלטת התמונות. ממערכת התפריטים, בחר את מצלמת האינטרנט המתאימה כהתקן הלכידה. מקם זבוב מת על האי כדי להתאים את הגדרות הווידאו. כוונן את הבהירות, הניגודיות והצבע בתוכנה כך שהזבוב המת ייראה שחור על רקע לבן.

לאחר מכן, התאם את הגדרת הסרט בהילוך מהיר כדי לשמור את הסרטים כקבצי AVI. לאחר מכן, דפדף לספרייה שבה יש לשמור את הנתונים והגדר את שם הסרט. שמור שינויים אלה.

לדחיסת נתוני התמונה, בחר את קוד Intel IYUV. הגדר את מהירות ההקלטה לפריים אחד כל 0.1 שניות והתאם את קצב ההפעלה המתאים ל -10 תמונות לשנייה.

לבסוף, עבור אל ההגדרה מתקדם ובחר צור תמונת BNP עבור כל מסגרת שנתפסה. לאחר מכן, דפדף לאותה ספרייה שבחרת לארח את קבצי ה- AVI ולחץ אישור.

לפני שמתחילים, ודאו שהאי ריק ונקי. לאחר מכן, התחל את ההקלטה בממשק התמונה בהילוך מהיר של תוכנת הקלטת התמונות.

קח בקבוקון המכיל זבובים והקש עליו פעמיים או שלוש כדי להפיל את כל הזבובים לתחתית. לאחר מכן, הסר במהירות את התקע מהבקבוקון והקש במרץ על הזבובים על הרציף. כולם צריכים להכות את הפלטפורמה בערך באותו זמן.

תנו לזבובים עד 30 שניות לעזוב את הרציף. לאחר מכן, עצור את ההקלטה. במידת הצורך, הסר ידנית את כל הזבובים שנותרו מהפלטפורמה.

לפני שתמשיך לניסוי הבא, הקפד להגדיר מחדש את הספרייה שבה תאוחסן קבוצת הנתונים הבאה.