סינון שינויים גנומיים: שיטה לזיהוי מוטציות שנוצרו על ידי קריספר בדרוזופילה

0 views • 3:48 min • April 30th, 2023

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

- כאשר עוברים מוזרקים מתפתחים למבוגרים G0, לחצות את כל הזבובים בודדים למלאי איזון מתאים כדי להרחיב את הקווים הערוכים F1 CRISPR פוטנציאלי ולהיות מסוגל לעקוב אחר התורשה של השינוי הגנומי. לאחר מכן, הצליבו זכרים בודדים שנבחרו באופן אקראי בפורמולה 1 לנקבות מאוזנות מתאימות כדי שיוכלו להחזיר צאצאים אם זכר F1 חיובי למוטציה. לאחר הצלב, העבירו את זכר הפורמולה 1 לצינור להקרנה.

כדי לחלץ DNA גנומי, מעכו את הזבוב עם קצה פיפטה המכיל חיץ מיצוי. ברגע שהרקמה מתפרקת, מוציאים את הנוזל. מאגר המיצוי מכיל פרוטאינאז K, אנזים המעכל חלבונים בדגימה ומנוטרל בחום גבוה.

כעת, כשהדנ"א נגיש, עברו לבדיקת PCR. לדוגמה, השתמשו בפריימרים שנועדו להגביר אזור הכולל את הרצף החדש. רק בנוכחות השינוי יקשור הפריימר השני ומוצר PCR יוגבר. בדוגמה, נראה זבובים מגודלים ומוקרנים על ידי PCR להחדרת רצף טרנסאקטיבציה המחליף את האקסון הראשון של הגן חסר הענפים.

- כאשר עוברי nos-Cas9 שהוזרקו בעבר הן עם פלסמיד ביטוי הרנ"א המנחה והן עם התורם החלופי מתפתחים לבוגרים, זבובי G0 חוצים בנפרד לזבובים מאזנים מקו המתאים לאלל הממוקד. הרדימו את צאצאי F1 מכל צלב G0 על כרית פחמן דו חמצני ובחרו באופן אקראי 10 עד 20 זכרים תחת מיקרוסקופ סטריאו. חוצים בנפרד כל זכר שנבחר לנקבה מאזנת מקו המתאים לאלל הממוקד.

כאשר זחלי F2 בוקעים, בחר את האב F1 מכל צלב. לחלץ DNA גנומי על ידי מעיכת כל זבוב במשך 10 עד 15 שניות עם קצה פיפטה המכיל 50 מיקרוליטר של חיץ מעיכה מבלי לוותר על החיץ. לאחר מכן, מוציאים את החיץ הנותר לתוך הצינור ומערבבים היטב.

יש לדגור בחום של 37 מעלות צלזיוס למשך 20 עד 30 דקות. לאחר הדגירה, מניחים את הצינורות בבלוק חום של 95 מעלות צלזיוס למשך דקה עד שתיים כדי להשבית את הפרוטאינאז K. לאחר סיבוב במשך 5 דקות ב 10,000 פעמים g, לאחסן את ההכנה ב 4 מעלות צלזיוס לניתוח PCR נוסף.

בצע מסכים מבוססי PCR בשלושה שלבים באמצעות פריימרים קדימה 1 והפוך 1 כדי לסנן את קיומו של ההכנסה או ההחלפה. בצע PCR באמצעות פריימרים קדימה 2 והפוך 2 כדי לאמת את ההכנסה או ההחלפה משלושה אזורים ראשוניים. בצע PCR באמצעות פריימרים M13F והפוך 3 כדי לבדוק HDR קצוות.

- שמרו על קווי הזבוב עם ה-HDR המאושר וצרו מלאי איזון מדור ה-F2. החוצה לחצות את האיזון טס שוב כדי להסיר מוטציות לא מכוונות על כרומוזומים אחרים.

14:23

Recombineering הומולוגי רקומבינציה בבונה דרוזופילה

Related Videos

0 Views

08:25

באמצעות טכניקה ג'ל אלקטרופורזה פלורסנט PCR-נימי הגנוטיפ קריספר / Cas9 בתיווך נוק מוטאנטים בתוך פורמט תפוקה גבוהה

Related Videos

0 Views

11:27

ייצור יעיל והסתרות שנוצרו על-ידי זיהוי של CRISPR/Cas9 ג'ין, מערכת מודל רזבורה rerio

Related Videos

0 Views

05:48

התנהגות Assay עבור Mechanosensation של MARCM מבוסס משובט ב תסיסנית melanogaster

Related Videos

0 Views

08:37

מהירה עם צינור נתיישב עבור יצירת מוטציות נקודה גנומית ב- C. elegans באמצעות CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

Related Videos

0 Views

10:00

ב Vivo Forward המסך הגנטי כדי לזהות גנים נוירוגינים הרומן ב Drosophila ילה melanogaster

Related Videos

0 Views

06:22

שיטת הקרנה לזיהוי הטרוכרומטין-קידום תרופות באמצעות דרוזוהילה

Related Videos

0 Views

07:46

CRISPR/Cas9 עריכה של ג'ין C. elegans rbm-3.2 באמצעות סמן ההקרנה DPY-10 Co-CRISPR ומתחמי ריבונוקלאופרוטאין מורכבים.

Related Videos

0 Views

06:37

זיהוי מוטציות מיקרו-חדיר ונוקאאוט של CRISPR/Cas9 גנום ערוך Helicoverpa Armigera (Hübner)

Related Videos

0 Views

08:19

פרוטוקולים עבור CRISPR/Cas9 Mutagenesis של זבוב הפירות המזרחי Bactrocera dorsalis

Related Videos

0 Views

Last updated: 18 July 2026