Name: הקהילות מיקרוביאלית בטבע מעבדה - ראיון (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00.000+00:00
Duration: 29 min 13 s
Description: חקור את הקהילות המיקרוביאליות בטבע מעבדה באמצעות מטגנומיקה וגנומיקה סביבתית. למד כיצד מיקרואורגניזמים משפיעים על הסביבה ומבינים את הדינמיקה הגנומית של אוכלוסיות מיקרוביאליות טבעיות.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

למחברים אין ניגודי עניינים להצהיר עליהם.

הקהילות מיקרוביאלית בטבע מעבדה - ראיון

Microbial Communities in Nature and Laboratory - Interview

שמי אד דלונג, ואני פרופסור במכון הטכנולוגי של מסצ'וסטס (MIT). למעשה, יש לי מינוי כפול בהנדסה אזרחית וסביבתית ובהנדסה ביולוגית, מה שעשוי להיראות כשילוב לא שגרתי כיוון שאני פועל בשני תחומים שונים. אחד ההיבטים של המחקר שלנו עוסק בסביבה ובמיקרואורגניזמים באופן ספציפי – כיצד הם משפיעים על הסביבה וכיצד הסביבה משפיעה עליהם; זהו החלק האזרחי והסביבתי של התוכנית שלנו.הדבר השני שאנו חוקרים קשור יותר להנדסה ביולוגית. מה גורם למיקרובים לפעול? כיצד הם בנויים?כיצד החלקים השונים המרכיבים מיקרוב, מיקרובים או קהילות מיקרוביאליות פועלים יחד בסינרגיה? כך שסוג הברית הזה בין שני התחומים עובד באופן די טוב. הרקע הספציפי שלי הוא במיקרוביולוגיה כללית, בשילוב עם מעט אוקיינוגרפיה.קיבלתי את התואר הראשון שלי בבקטריולוגיה ב-uc Davis, ואת הדוקטורט שלי קיבלתי ב-Scripps Institute of Oceanography. הדוקטורט שלי הוא למעשה בביולוגיה ימית, אם תאמינו לכך.והנה אני כאן ב-MIT. איך זה קרה? תחום המיקרוביולוגיה השתנה במהירות רבה.ואחת ההשפעות, מההשפעות הגדולות, על מה שאנו מבינים כיום על מיקרובים הייתה התקדמות טכנולוגית בתחום הגנומיקה. בדרך כלל, כאשר בוחנים מיקרובים תחת מיקרוסקופ, קשה מאוד לזהותם. קיימים צורות וגדלים שונים, אך הם אינם באמת מספקים מידע רב על זהות האורגניזם או על הפעילות שלו.וכך בדרך כלל, מיקרוביולוגים היו מוגבלים

microbial-communities-in-nature-and-laboratory-interview

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

ג'ארד לידבטר מסביר מדוע הקהילה טרמיטים חיידקים במעיים היא מערכת מצוינת ללמוד את יחסי הגומלין המורכבים בין חיידקים. הקשר הסימביוטי הקיים בין חרקים המארח lignocellulose-משפיל החיידקים במעיים הוא הסביר, כמו גם שימושים תעשייתיים של חיידקים אלו ביומסה במפעל משפיל להפקת דלק ביולוגי.

חקירת הקהילה חיידקים במעי האחורי הטרמיטים - ראיון

ביולוגיה של הקהילות מיקרוביאלית - ראיון

חפירה של שורשי צמחים מן השדה, כמו גם עיבוד של דגימות לתוך endosphere, rhizosphere ואדמה מתוארים בפירוט, כולל הפקת דנ א ושיטות ניתוח הנתונים. נייר זה נועד לאפשר מעבדות אחרות שימוש בטכניקות אלה לצורך המחקר של קרקע, endosphere, rhizosphere microbiomes.

בידוד וניתוח של הקהילות מיקרוביאלית בקרקע, Rhizosphere ושורשים בניסויים עשב רב שנתי

בשל האטימות של האדמה, לא ניתן לדמיין בקלות אינטראקציות בין המיקרובים המרכיבים אותה עם רזולוציה תאית. כאן מוצגים שני כלים מיקרופלואידיים, המציעים הזדמנויות חדשות לחקר אינטראקציות פטרייתיות-מיקרוביאליות. המכשירים הם רב-תכליתיים ופשוטים לשימוש, ומאפשרים שליטה מרחבית-טמפורלית גבוהה והדמיה ברזולוציה גבוהה ברמה התאית.

כלים מיקרופלואידיים לחקר אינטראקציות פטרייתיות-מיקרוביאליות ברמה התאית

מיקרוקוסמוסים של קומפוסט מביאים את המגוון המיקרוביאלי שנמצא בטבע למעבדה כדי להקל על מחקר המיקרוביום ב-Caenorhabditis elegans. מובאים כאן פרוטוקולים להקמת ניסויי מיקרוקוסמוס, כאשר הניסויים מדגימים את היכולת לווסת את המגוון המיקרוביאלי הסביבתי כדי לחקור את הקשרים בין המגוון המיקרוביאלי הסביבתי לבין הרכב המיקרוביום של מעי התולעים.

מיקרוקוסמוסים של קומפוסט כסביבות טבעיות מגוונות מיקרוביאלית לחקר המיקרוביום ב-Caenorhabditis elegans

אנו מציעים פרוטוקול מיקרוסקופ אלקטרונים סורק אופטימלי להדמיית דגימות הטרוגניות ועדינות ביותר המכילות ביומסה צמחית ופטרייתית, יחד עם מיקרוביוטה וביופילם. פרוטוקול זה מאפשר לתאר את הממדים המרחביים של ארגון המיקרוביוטה.

מיקרוביוטה של גני נמלים אטיין: הדמיה של נוף מיקרוביאלי על ידי סריקת מיקרוסקופ אלקטרונים

כריסטופר CW יוז מתארת ​​את השירות של מערכת התרבות שלו ללימוד אנגיוגנזה במבחנה. הוא מסביר את החשיבות של fibroblasts כי להפריש ביקורתית, בלתי מזוהה עדיין, גורם מסיס המאפשרים לתאי האנדותל כדי ליצור כלי בתרבות כי הסניף, טופס לומן ראויה, לעבור anastamosis.

כריסטופר יוז: במודל חוץ גופית לחקר אנגיוגנזה (ראיון)

מחקרים Chemotaxis חיידקית שימוש מיקרופלואידיקה - ראיון

בראיון זה, ד"ר לינדקוויסט מתאר יחסים בין קיפול חלבונים, מחלות Prion וכן הפרעות ניווניות. הבעיה של קיפול החלבון הוא הליבה של הביולוגיה המודרנית. בנוסף לפונקציות ביוכימיים המסורתיים שלהם, חלבונים יכולים לתווך העברת מידע ביולוגי ולכן יכול להיחשב חומר גנטי. פונקציה זו שהתגלתה לאחרונה של חלבונים יש השלכות חשובות על מחקרים של הפרעות אדם. ד"ר לינדקוויסט מתאר גם גישות הניסוי הנוכחי כדי לחקור את המנגנון של מחלות ניווניות מבוסס על מחקרים גנטיים באורגניזמים המודל.

ראיון: קיפול חלבונים ולימודי של מחלות ניווניות

ב רבים בעבר במערכות חוץ גופית תרבות - בעיקר בתרבויות monolayer - סבלו לעתים קרובות החיסרון כי תאים ראשוניים הבדיל היה קצר יחסית אורך חיים ו-de הבדיל במהלך התרבות. כתוצאה מכך, את רוב הפונקציות איבר ספציפי שלהם אבדו במהירות. לפיכך, על מנת לשחזר תנאים טובים יותר עבור תאים אלה במבחנה, שינויים והתאמות שנעשו בתרבויות monolayer קונבנציונאלי.

ראיון: bioreactors ועלו-Modified-3D פיגומים למחקר בתאי גזע

חקור את הקהילות המיקרוביאליות בטבע מעבדה באמצעות מטגנומיקה וגנומיקה סביבתית. למד כיצד מיקרואורגניזמים משפיעים על הסביבה ומבינים את הדינמיקה הגנומית של אוכלוסיות מיקרוביאליות טבעיות.

הקהילות מיקרוביאלית בטבע מעבדה - ראיון

גלה סרטונים נוספים