Name: הייצור של ג elegans Transgenes דרך Recombineering עם GalK לבחירה מרקר (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2011-01-11T23:58:00.000+00:00
Duration: 12 min 3 s
Description: למד לייצר טרנסגנים ב-Caenorhabditis elegans באמצעות רקומבינרינג עם GalK כסמן בחירה. שיטה זו שומרת על רכיבי רגולציה מקוריים ומאפשרת שינויים גנטיים מדויקים במחקר פונקציונלי.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

המחברים מבקשים להודות לינדסי נאש לקבלת עזרה בפיתוח הטכניקה. עבודה זו מומנה על ידי NIH כדי להעניק AG028977 אלף, פיילוט מענק מאוניברסיטת פיטסבורג OAIC (AG024827), וקרנות זרע מאוניברסיטת פיטסבורג.

<ol><li>Mello, C., Fire, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+transformation%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">DNA transformation.</a> Methods Cell Biol. 48, 451-482 (1995).</li>
<li>Zhang, Y., Nash, L., Fisher, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simplified%2C+robust%2C+and+streamlined+procedure+for+the+production+of+C.+elegans+transgenes+via+recombineering%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">A simplified, robust, and streamlined procedure for the production of C. elegans transgenes via recombineering.</a> BMC Dev Biol. 8, 119-119 (2008).</li>
<li>Antebi, A., Yeh, W. H., Tait, D., Hedgecock, E. M., Riddle, D. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((daf-12+encodes+a+nuclear+receptor+that+regulates+the+dauer+diapause+and+developmental+age+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+and+Development%22%5BJournal%5D)">daf-12 encodes a nuclear receptor that regulates the dauer diapause and developmental age in C. elegans.</a> Genes and Development. 14, 1512-1527 (2000).</li>
<li>Snow, M. I., Larsen, P. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structure+and+expression+of+daf-12%3A+a+nuclear+hormone+receptor+with+three+isoforms+that+are+involved+in+development+and+aging+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim.+Biophys.+Acta%22%5BJournal%5D)">Structure and expression of daf-12: a nuclear hormone receptor with three isoforms that are involved in development and aging in Caenorhabditis elegans.</a> Biochim. Biophys. Acta. 1494, 104-116 (2000).</li>
<li>Fisher, A. L., Page, K. E., Lithgow, G. J., Nash, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Caenorhabditis+elegans+K10C2.4+Gene+Encodes+a+Member+of+the+Fumarylacetoacetate+Hydrolase+Family.+A+CAENORHABDITIS+ELEGANS+MODEL+OF+TYPE+I+TYROSINEMIA%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol.Chem%22%5BJournal%5D)">The Caenorhabditis elegans K10C2.4 Gene Encodes a Member of the Fumarylacetoacetate Hydrolase Family. A CAENORHABDITIS ELEGANS MODEL OF TYPE I TYROSINEMIA.</a> J Biol.Chem. 283, 9127-9135 (2008).</li>
<li>Wightman, B., Ha, I., Ruvkun, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Posttranscriptional+regulation+of+the+heterochronic+gene+lin-14+by+lin-4+mediates+temporal+pattern+formation+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Posttranscriptional regulation of the heterochronic gene lin-14 by lin-4 mediates temporal pattern formation in C. elegans.</a> Cell. 75, 855-862 (1993).</li>
<li>Lehrbach, N. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((LIN-28+and+the+poly%28U%29+polymerase+PUP-2+regulate+let-7+microRNA+processing+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Struct+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">LIN-28 and the poly(U) polymerase PUP-2 regulate let-7 microRNA processing in Caenorhabditis elegans.</a> Nat Struct Mol Biol. 16, 1016-1020 (2009).</li>
<li>Tursun, B., Cochella, L., Carrera, I., Hobert, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+toolkit+and+robust+pipeline+for+the+generation+of+fosmid-based+reporter+genes+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">A toolkit and robust pipeline for the generation of fosmid-based reporter genes in C. elegans.</a> PLoS One. 4, e4625-e4625 (2009).</li>
<li>Bamps, S., Hope, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Large-scale+gene+expression+pattern+analysis%2C+in+situ%2C+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Brief.+Funct.+Genomic.+Proteomic%22%5BJournal%5D)">Large-scale gene expression pattern analysis, in situ, in Caenorhabditis elegans.</a> Brief. Funct. Genomic. Proteomic. , (2008).</li>
<li>Dolphin, C. T., Hope, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+reporter+fusion+genes+generated+by+seamless+modification+of+large+genomic+DNA+clones%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans reporter fusion genes generated by seamless modification of large genomic DNA clones.</a> Nucleic Acids Res. 34, e72-e72 (2006).</li>
<li>Sarov, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+recombineering+pipeline+for+functional+genomics+applied+to+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Methods%22%5BJournal%5D)">A recombineering pipeline for functional genomics applied to Caenorhabditis elegans.</a> Nat. Methods. 3, 839-844 (2006).</li>
<li>Yang, X. W., Model, P., Heintz, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Homologous+recombination+based+modification+in+Escherichia+coli+and+germline+transmission+in+transgenic+mice+of+a+bacterial+artificial+chromosome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Homologous recombination based modification in Escherichia coli and germline transmission in transgenic mice of a bacterial artificial chromosome.</a> Nat Biotechnol. 15, 859-865 (1997).</li>
<li>Court, D. L., Sawitzke, J. A., Thomason, L. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+engineering+using+homologous+recombination%5BTitle%5D)+AND+%22Annu.Rev.Genet%22%5BJournal%5D)">Genetic engineering using homologous recombination.</a> Annu.Rev.Genet. 36, 361-388 (2002).</li>
<li>Westenberg, M., Bamps, S., Soedling, H., Hope, I. A., Dolphin, C. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Escherichia+coli+MW005%3A+lambda+Red-mediated+recombineering+and+copy-number+induction+of+oriV-equipped+constructs+in+a+single+host%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Escherichia coli MW005: lambda Red-mediated recombineering and copy-number induction of oriV-equipped constructs in a single host.</a> BMC Biotechnol. 10, 27-27 (2010).</li>
<li>Warming, S., Costantino, N., Court, D. L., Jenkins, N. A., Copeland, N. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simple+and+highly+efficient+BAC+recombineering+using+galK+selection%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">Simple and highly efficient BAC recombineering using galK selection.</a> Nucleic Acids Res. 33, e36-e36 (2005).</li>
<li>Penfold, R. J., Pemberton, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+improved+suicide+vector+for+construction+of+chromosomal+insertion+mutations+in+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Gene%22%5BJournal%5D)">An improved suicide vector for construction of chromosomal insertion mutations in bacteria.</a> Gene. 118, 145-146 (1992).</li>
<li>Praitis, V., Casey, E., Collar, D., Austin, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Creation+of+low-copy+integrated+transgenic+lines+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Creation of low-copy integrated transgenic lines in Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 157, 1217-1226 (2001).</li>
<li>Puig, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+tandem+affinity+purification+%28TAP%29+method%3A+a+general+procedure+of+protein+complex+purification%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">The tandem affinity purification (TAP) method: a general procedure of protein complex purification.</a> Methods. 24, 218-229 (2001).</li>
<li>Rigaut, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+generic+protein+purification+method+for+protein+complex+characterization+and+proteome+exploration%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.Biotechnol%22%5BJournal%5D)">A generic protein purification method for protein complex characterization and proteome exploration.</a> Nat.Biotechnol. 17, 1030-1032 (1999).</li>
<li>Achilleos, A., Wehman, A. M., Nance, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PAR-3+mediates+the+initial+clustering+and+apical+localization+of+junction+and+polarity+proteins+during+C.+elegans+intestinal+epithelial+cell+polarization%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">PAR-3 mediates the initial clustering and apical localization of junction and polarity proteins during C. elegans intestinal epithelial cell polarization.</a> Development. 137, 1833-1842 (2010).</li>
<li>Maduro, M., Pilgrim, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+and+cloning+of+unc-119%2C+a+gene+expressed+in+the+Caenorhabditis+elegans+nervous+system%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Identification and cloning of unc-119, a gene expressed in the Caenorhabditis elegans nervous system.</a> Genetics. 141, 977-988 (1995).</li>
</ol>

אין ניגודי אינטרסים הכריז.

הדור של transgenes מ fosmids מציעה את היתרון של שמירה על כל מרכיבי מקדם הילידים, וריאנטים אחוי, ו 3 &#39;UTR אלמנטים רגולטוריים. זה יכול להוביל להקמת transgene שהוא מהורהר יותר של דפוס הביטוי הילידים, או בנייה של transgene פונקציונלי כאשר גישות אחרות להיכשל 5. Transgenes וכתוצאה מכך יכול לשאת מגוון של תגים epitope כולל GFP או תג TAP. בניית transgenes מעורבים שלושה שלבים אשר מבוצעים הכל ב SW106 15<...

<table><tbody><tr><td>ערכת FosmidMAX</td><td>Epicentre Biotechnologies</td><td>FMAX046</td><td></td></tr><tr><td>GoTaq</td><td>Promega Corp.</td><td>M7122</td><td></td></tr><tr><td>מצע MOPS</td><td>TEKnova, Inc.</td><td>M2120</td><td></td></tr><tr><td>תמיסת פוטסיום פוספאט 0.132 M</td><td>TEKnova, Inc.</td><td>M2102</td><td></td></tr><tr><td>D-galactose</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G0750</td><td></td></tr><tr><td>2-דאוקסיגלקטוז</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D4407</td><td></td></tr><tr><td>ביוטין</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B4639</td><td></td></tr><tr><td>לוצין</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>L8000</td><td></td></tr><tr><td>NH&lt;sub&gt;4&lt;/sub&gt;Cl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A9434</td><td></td></tr><tr><td>Phusion DNA polymerase</td><td>New England Biolabs</td><td>F-530S</td><td></td></tr><tr><td>בסיס אגר מקונקי (MacConkey agar base)</td><td>BD Biosciences</td><td>281810</td><td></td></tr><tr><td>ערבינוז</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A3131</td><td></td></tr><tr><td>כלורמפניקול</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>C1919</td><td></td></tr><tr><td>נתרן פוספט דו-בסיסי</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5136</td><td></td></tr><tr><td>אשלגן פוספט מונובסיס</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P5655</td><td></td></tr><tr><td>נתרן כלוריד</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5886</td><td></td></tr><tr><td>גליצרול</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G2025</td><td></td></tr><tr><td>בקטו-אגר (Bacto Agar)</td><td>BD Biosciences</td><td>214010</td><td></td></tr></tbody></table>

הייצור של ג elegans transgenes דרך recombineering עם galk לבחירה מרקר

The Production of C. elegans Transgenes via Recombineering with the galK Selectable Marker

יצירה של חיות טרנסגניות הוא מנוצל באופן נרחב ב C. elegans המחקר כולל שימוש חלבונים GFP היתוך ללמוד את הרגולציה דפוס הביטוי של גנים של עניין או דור של טיהור זיקה טנדם (TAP) מתויג גרסאות של גנים ספציפיים על מנת להקל הטיהור שלהם. בדרך כלל transgenes נוצרות על ידי הנחת יחצן במעלה הזרם של גן ה-GFP הכתב או cDNA של עניין, ואת זה לעתים קרובות מייצר דפוס הביטוי נציג. אולם, אלמנטים קריטיים של ויסות הגנים, כגון אלמנטים לשלוט באזור מתורגמים של 3 או מקדמי חלופיים, יכול לפספס על ידי גישה זו. יתר על כן רק גרסה אחת אחוי ניתן ללמוד בדרך כלל על ידי אמצעי זה. לעומת זאת, השימוש של תולעת ה-DNA הגנומי נישא על ידי שיבוטים fosmid DNA סביר כוללת את רוב אם לא כל הגורמים המעורבים בוויסות גנים in vivo, אשר מאפשרת יכולת טובה יותר כדי ללכוד את דפוס הביטוי העיתוי אמיתי. כדי להקל על הדור של transgenes באמצעות DNA fosmid, אנו מתארים E. coli מבוסס הליך recombineering להכניס GFP, ברז, תג, או רצפי עניין אחרים לתוך מקום בגן. ההליך עושה שימוש הגן galK כסמן הבחירה הן הצעדים מבחר חיוביים ושליליים recombineering שתוצאתה השגת השינוי הרצוי עם יעילות גבוהה. יתר על כן, פלסמידים המכילים את הגן galK מוקף נשק הומולוגיה ל-GFP נפוצים TAP גנים היתוך זמינים אשר להפחית את העלות של oligos בשיעור של 50% בעת יצירת ה-GFP חלבון TAP או היתוך. פלסמידים אלה משתמשים מוצא שכפול R6K אשר מונע את הצורך לטיהור PCR נרחב של המוצר. לבסוף, אנו גם להפגין טכניקה לשלב את הסמן UNC-119 על לשדרת fosmid המאפשר fosmid להיות מוזרק ישירות לתוך תולעים או מופצצים כדי ליצור חיות טרנסגניות. וידאו זה מדגים את ההליכים הכרוכים יצירת transgene דרך recombineering באמצעות שיטה זו.

היכולת לייצר עבור transgenes<em&gt; Caenorhabditis elegans</em&gt; באמצעות הדנ&quot;א הגנומי נישא על ידי fosmids הוא אטרקטיבי במיוחד כמו כל האלמנטים הרגולציה יליד נשמרות. המתואר הוא הליך פשוט חזקים לייצור transgenes דרך recombineering עם<em&gt; GalK</em&gt; סמן לבחירה.

הייצור של ג elegans Transgenes דרך Recombineering עם GalK לבחירה מרקר

יצירת בעלי חיים טרנסגניים נמצאת בשימוש נרחב במחקרי *C. elegans*, כולל שימוש בחלבוני היתוך GFP כדי לחקור את הוויסות ו...

המטרה הכללית של הניסוי הבא היא להפיק טרנסגנים באמצעות DNA גנומי של תולעת הנשא בספריית השבטים SMID. השימוש ב-DNA גנומי משמר את כל אלמנטי הבקרה הטבעיים, כגון מחזקים (enhancers) באזורי ה-3' UTR. דבר זה מושג על ידי העברת ה-FO smid למאבקי E. coli מזן SW 1 0 6 כדי לנצל את מנגנון הרקומבינציה המושרה lambda red.בשלב שני, הגן GAL K מוחדר למיקום הרצוי ב-FO smid, המסמן את האתר שבו ימוקם ה-GFP או תג ה-tap. לאחר מכן, הגן Gade מוחלף על ידי GFP או tap TAC באמצעות רקומבינציה הומולוגית, ולאחריה ברירה שלילית באמצעות דאוקסי-גלקטוז על מנת ליצור את הגן המשונה. התוצאות מראות כי ניתן ליצור טרנסגנים אלה במהירות ובהצלחה, בהתבסס על אימות ההחדרה באמצעות colony PCR.שלום, שמי Love Ship. אני עובד במעבדה של Fisher באוניברסיטת פיטסבורג. היום אדגים את הטכניקה ליצירת טרנסגן של C elegant.מדוע לבצע רקומבינציה עם GK כסמן לבחירה. היתרון המרכזי של טכניקה זו על פני שיטות קיימות ליצירת Cogan Transgenes הוא שבטכניקה זו אנו משתמשים ב-DNA הגנומי של הגן המבוקש, ובכך אנו מסוגלים לכסות את כל האלמנטים הקריטיים של ויסות הגנים, כגון אלמנטים בקרי באזור ה-three prime UTR, תמלילי שחבור חלופיים, מקדמים חלופיים ומגברים מרוחקים, שעלולים להישמט בגישות סטנדרטיות המבוססות על שיクלו닝 קונבנציונלי. אז בואו נתחיל.הזמינו את שיבט ה-FO smid עבור הג

the-production-c-elegans-transgenes-via-recombineering-with-galk

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

וידאו זה מדגים את הטכניקה של microinjection לתוך בלוטת המין של C. elegans כדי ליצור חיות טרנסגניות.

הדור של Stable טראנסגנטי C. elegans שימוש Microinjection

תולעים טראנסגנטי משמשים בדרך...

דור טראנסגנטי ג elegans על ידי שינוי Biolistic

אנו מתארים שיטה רגיש לזהות הרגולטורים postembryonic של ביטוי חלבונים לוקליזציה...

RNAi הקרנת לזהות פנוטיפים Postembryonic ב ג elegans</em

(גני גן או epistasis) מסכים שיטתיים, בקנה מידה גדול סינטטיים גנטיים אינטראקציה יכולים לשמש כדי לחקור יתירות ומסלול-הצטלבות גנטית. כאן, אנו מתארים טכנולוגית תפוקה גבוהה כמותית סינטתית גנטית מערך הקרנה, כינת eSGA שפתחנו להבהרת יחסי epistatic ולחקור רשתות אינטראקציה גנטיות...

מיפוי רשתות פונקציונליות חיידקיים ומסלולים ב<em&gt; חיידקי Escherichia</em&gt; באמצעות מערכים גנטיים סינטטיים

פרוטוקול זה מתאר הליך מהיר וצריכת חומר נמוך לשילוב של מערכים חוץ-כרומוזומליים טרנסגניים בגנום Caenorhabditis elegans באמצעות קרינה אולטרה סגולה (UV). יתר על כן, פרוטוקול זה מתאים במיוחד לקווים טרנסגניים המשדרים מערכים חוץ-כרומוזומליים בקצב גבוה.

פרוטוקול מהיר לשילוב מערכים חוץ-כרומוזומליים עם קצב העברה גבוה לגנום C. elegans

חלבונים בדרך כלל מכילים מספר תחומים שיכולים להפעיל פונקציות סלולריות שונות. ג'ין לדפוק-outs (KO) לא מחשיב מגוון תפקודי זו. כאן, אנו מדווחים חילופי קלטת בתיווך רקומבינציה (RMCE) גישת מבנה-תפקוד מבוסס בתאי גזע עוברי KO המאפשרת דיסקציה המולקולרי של תחומים או הגירסות פונקציונליים השונים של חלבון.

מחקרי מבנה-תפקוד תאי גזע עוברי עכבר שימוש recombinase בתיווך Exchange קסטה

כאן, אנו מציגים שיטה להנדס את הגנום של C. elegans שימוש CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins ותבניות תיקון התלויים הומולוגיה.

מהירה עם צינור נתיישב עבור יצירת מוטציות נקודה גנומית ב- C. elegans באמצעות CRISPR/Cas9 Ribonucleoproteins

מתוארים כאן היא שיטה ממוקדת, מרפבלי גנים מחיקה בקלמידיה trachomatis באמצעות קלטת מallelic exchange מוטזיס מוטציות, flaem.

מרקרבלי ג'ין מחיקה על-ידי קסטה מAllelic Exchange מוטגנזה בקלמידיה

תהליך הזרקה מיקרו-CRISPR/Cas9 לתיוג פלואורסצנטי אנדוגני בקו הנבט Caenorhabditis elegans לקבלת קווי הדחיפה הומוזיגוטיים לניתוח מיקום חלבונים בחיים.

תיוג פלואורסצנטי אנדוגני בתיווך CRISPR/Cas9 של גנים ספציפיים לקו הנבט ב-Caenorhabditis elegans

יישום electrophysiology כדי סינפסות נגיש מספק מדד לכימות הפעילות הסינפטית, שימושי בניתוח מוטנטים הסינפטי. מאמר זה מתאר שיטה לנתיחה נהג לחשוף את בצמתים neuromuscular (NMJ)...

הביתור, הקלטה מ צומת C. elegans Neuromuscular

למד לייצר טרנסגנים ב-Caenorhabditis elegans באמצעות רקומבינרינג עם GalK כסמן בחירה. שיטה זו שומרת על רכיבי רגולציה מקוריים ומאפשרת שינויים גנטיים מדויקים במחקר פונקציונלי.

הייצור של ג elegans Transgenes דרך Recombineering עם GalK לבחירה מרקר

גלה סרטונים נוספים