ניתוח LC-MS/MS של הפרופיל הפרוטאומי של גרגירי נוירומלנין שבודדו מרקמת מוח אנושית

0 צפיות • 3:47 דק׳ • April 28th, 2025

התחל עם פפטידים שמקורם בגרגירי נוירומלנין (NMGs) שבודדו מרקמת מוח אנושית לאחר המוות.

NMGs, הנמצאים בתאי עצב המייצרים דופמין, מכילים פיגמנט נוירומלנין, חלבונים ושומנים.

קח עמודת כרומטוגרפיה נוזלית בעלת ביצועים גבוהים (HPLC) המכילה פאזה נייחת מבוססת סיליקה המתפקדת עם ליגנדים הידרופוביים.

טען את הפפטידים על העמודה.

פפטידים הידרופוביים נקשרים חזק יותר לעמודה מאשר הידרופיליים.

העבר מאגר פליטה דרך העמודה.

פחות פפטידים הידרופוביים נפלטים ראשונים, בעוד שיותר הידרופוביים נפלטים מאוחר יותר.

הפפטידים המנופחים נכנסים למקור היינון האלקטרו-ספריי של ספקטרומטר המסה, שם הם מיוננים ליוני פפטיד טעונים.

הפפטידים המיוננים נכנסים לאחר מכן למנתח המסה, שם הם מופרדים על סמך יחסי המסה למטען שלהם.

יון פפטיד שנבחר מופנה לתא ההתנגשות ומפוצל ליונים קטנים יותר, שיחסי המסה למטען שלהם נמדדים שוב.

לבסוף, הנתונים מושווים למסד נתונים ייחוס כדי לזהות את החלבונים הקיימים בדגימת NMG.

לאחר ביצוע עיכול טריפטי, כמתואר בטקסט, הכינו את הדגימה לניתוח HPLC-MS על ידי המסת 200 עד 400 ננוגרם של פפטידים דגימה בנפח מוגדר של 0.1% TFA בכניסות בקבוקון זכוכית ספקטרומטרית מסה אינרטית. אם קביעת הריכוז אינה ישימה עקב כמות דגימה נמוכה, ודא טעינת דגימה זהה על ידי השוואת זרם היונים הכולל.

כדי להתחיל בניתוח נתונים גולמיים פרוטאומיים, לחץ על טען לטעינת ה

צפו בתמליל המלא וקבלו גישה לאלפי סרטונים מדעיים

התחברות

גלה סרטונים נוספים

כרומטוגרפיה נוזלית בעתמדה גבוהה