$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
קח קטע מוח עבה קבוע מעכבר נגוע בנגיף הכלבת.
הנגיף מדביק נוירונים ומשתכפל, וכתוצאה מכך חלבונים נגיפיים נמצאים בתוך התאים.
טפל בחומר ניקוי כדי לחלחל את ממברנות התאים ובתמיסה חוסמת כדי להסוות אתרי קשירה לא ספציפיים.
דגירה עם נוגדנים ראשוניים המכוונים לחלבונים הנגיפיים, ואחריהם נוגדנים משניים מצומדים פלואורופור הנקשרים לנוגדנים הראשוניים.
טפל בצבע קושר חומצות גרעין פלואורסצנטיות כדי לסמן את הגרעין.
יש לייבש את הרקמה בהגברת ריכוזי האלכוהול, ולאחר מכן למרוח תמיסת ניקוי כדי להגביר את שקיפות הרקמות להדמיה.
התקן את החלק בתא הדמיה, מלא אותו בתמיסת הניקוי ואטום אותו.
באמצעות מיקרוסקופ סריקת לייזר קונפוקלי, צלם את הרקמה בנפרד באמצעות תוויות הפלורסנט, ולאחר מכן מזג אותן ליצירת תמונה דו מימדית.
רכוש תמונות במישורי מוקד שונים על פני הרקמה ושלב אותן ליצירת ייצוג תלת מימדי להערכת התקדמות הזיהום.
לצביעה חיסונית של חלקי רקמת המוח, יש לשטוף את הדגימות פעמיים למשך שעה אחת ב-4 מיליליטר של 0.2% טריטון X-100 ב-PBS, ולאחר מכן חדירה למשך יומיים ב-37 מעלות צלזיוס, ב-4 מיליליטר של 0.2% טריטון X-100, 20% דימתיל-סולפוקסיד ו-0.3 גליצין מולרי ב-PBS. חסום כל קישור לא ספציפי עם 4 מיליליטר של 0.2% טריטון X-100, 10% דימתיל-סולפוקסיד ו-6% סרום רגיל ב-PBS למשך יומיים ב-37 מעלות צלזיוס.
בתום הדגירה החוסמת, סמנו את הדגימות ב-2 מיליליטר של תמיסת נוגדנים ראשונית למשך חמישה ימים בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס, ורענן את תמיסת הנוגדנים לאחר יומיים וחצי. לאחר מכן, שטפו את הדגימות למשך יום אחד ב -4 מיליליטר של 0.2% טווין 20 ו -10 מיקרוגרם למיליליטר הפרין ב- PBS, החליפו את מאגר הכביסה לפחות ארבע עד חמש פעמים במהלך היום והשאירו את הכביסה הסופית למשך הלילה.
למחרת, דגרו את הדגימות ב-2 מיליליטר של תמיסת נוגדנים משנית למשך חמישה ימים בטמפרטורה של 37 מעלות צלזיוס. לאחר מכן, שטפו את הדגימות ב-4 מיליליטר של 0.2% טווין טרי 20 ו-10 מיקרוגרם למיליליטר הפרין ב-PBS כפי שהודגם.
לצביעה גרעינית של הדגימות, דגרו את הדגימות ב -4 מיליליטר של כתם חומצת הגרעין TO-PRO-3 למשך 5 שעות, מוגן מפני אור. בתום הדגירה יש לשטוף את הדגימות ב-0.2% בין 20 ל-10 מיקרוגרם למיליליטר הפרין ב-PBS כפי שהודגם, ולאחר מכן התייבשות בסדרת טרט-בוטנול עולה למשך שעתיים לכל טבילה.
לאחר הטבילה של 90%, העבירו את הדגימות לתמיסת טרט-בוטנול של 96% למשך הלילה. למחרת בבוקר, יש לייבש את הדגימות עוד יותר ב-100% טרט-בוטנול למשך שעתיים לפני ניקוי חלקי הרקמה ב-BABB-D15 טרי שהוכן למשך שעתיים עד 6 שעות עד שהן שקופות אופטית. לאחר מכן ניתן לאחסן את הדגימות ב-BABB-D15, מוגנות מפני אור עד להרכבתן והדמיה.
להרכבה לדוגמה, השתמש במדפסת תלת מימד כדי להדפיס תא הדמיה ומכסה. התקן כיסוי בקוטר 30 מילימטרים על תא ההדמיה עם גומי סיליקון מגפר בטמפרטורת החדר רכיב אחד. באופן דומה, התקן כיסוי של 22 מילימטרים על המכסה. השתמש בצמר גפן רטוב במים כדי להסיר את עודפי גומי הסיליקון בשתי הטבעות לפני שתאפשר לגומי להתרפא למשך הלילה.
למחרת, הנח דגימה בתא ההדמיה והוסף נפח קטן של BABB-D15 לתא לפני הכנסת המכסה. בעזרת מחט היפודרמית, מלאו את התא ב-BABB-D15 דרך הכניסה וחברו את הכניסה לפני איטום תא ההדמיה בגומי סיליקון.
כדי להגדיר את רכישת התמונה, בחר את קווי הלייזר המתאימים לפלואורופורים המשמשים והתאם את טווחי הזיהוי של כל גלאי כדי למנוע חפיפת אותות בין ערוצים. לאחר מכן הגדר את פרמטרי הרכישה, הגדר את הגבול העליון והתחתון של הערימה ורכוש את אוסף התמונות.
ליצירת הקרנות תלת-ממדיות של אוסף התמונות, פתחו את קובצי התמונה בפיג'י ובחרו בכלי תמונה, צבע, ערוצים, עוד ופיצול ערוצים כדי לפצל את התמונות הממוזגות לערוצים נפרדים. לתיקון הלבנה של התמונות בכל ערוץ, בחרו 'תמונה', 'התאמה', 'תיקון אקונומיקה' ובחרו 'יחס בין 'פשוט'. השתמשו במחוונים להתאמת הבהירות והניגוד של כל אחד מהערוצים, ובחרו 'תמונה', 'צבע' ו'מיזוג ערוצים'. סמן את האפשרות צור קומפוזיציה.
המירו את התמונה לתבנית RGB ובחרו 'תמונה', 'אוספים' ו'פרויקט תלת-ממד' ליצירת הקרנה תלת-ממדית. בחרו בנקודה הבהירה ביותר כשיטת ההקרנה וקבעו את ריווח הפרוסות כך שיתאים לגודל צעד Z של אוסף התמונות שנרכש. לקבלת איכות מרבית, הגדר את מרווח זווית הסיבוב ל- 1 והפעל אינטרפולציה. שנה את סף הסיבוב הכולל, סף השקיפות והאטימות לפי הצורך. לאחר מכן שמור את ההקרנה התלת-ממדית כשניהם. תבניות קובץ TIFF ו-.AVI.