שימוש של תהודה מגנטית הדמיה נתונים ביופסיה כדי להנחות הליכי דגימה עבור סרטן הערמונית ביאובאנקינג
10 באוקטובר 2019
שיטה זו כוללת ניצול של נתוני אבחון קליני עבור חולי סרטן הערמונית על מנת להנחות את הליכי הדגימה, כאשר רקמת biobanking בעקבות כריתת רדיקלים קיצוניים. זה מתגבר על בעיות עם שיטות שפורסמו בעבר סביב יעילות וזמינות של רקמות טריות עבור מגוון רחב יותר של יישומי במטה.
המשמעות של פרוטוקול זה על שיטות דגימת הערמונית הקודמות היא שזה נותן לנו ביטחון גבוה יותר של מיקוד רקמת גידול טרי למחקר. לכן, אנחנו יכולים לקחת את הרקמה הטרייה ישר בחזרה למעבדה ולהשתמש בו לתרבות או הדמיה כי יש לנו ביטחון גבוה של אילו דגימות הם גידול אשר שפירים. העצה העיקרית שלי כאשר לומדים את הטכניקה היא לעבוד עם הפתולוג המקומי שלך, כך אבחון רקמות סופי הדו"ח אינם בסכנה.
כדי למקד את מיקום הגידול, סקור את תמונות ה- MRI כדי למדוד את המיקום שמעל הגידול ולמצוא את הרצף שבו הגידול נראה ביותר במישור האקסיאלי. גלול בין התמונות האקסיאליות כדי לזהות את התמונה שבה הגידול הוא הגדול ביותר והדפס את התמונה לעיון. בתדמית הקורונה המתאימה, למדוד את המרחק מבסיס הערמונית למיקום ביתר שנבחר ולמדוד את מלוא אורך הערמונית מן העל לבסיס במילימטרים.
לאחר מכן להדפיס מדידות אלה ולסמן את המיקומים של הגידול לעיון. לאחר הדגימה נאסף, לעקר את מכסה המנוע לזרימה למינארית ומתקן חיתוך הערמונית עם 70% אתנול ולשקול את הערמונית בקנה מידה סטנדרטי בגרמים. ואז לצבוע את הצד הימני עם דיו כחול בצד שמאל של הדגימה עם דיו שחור מכסה את הקפסולה המלאה וריסקים הזרע עם דיו כדי לאפשר אפליה של השוליים הכירורגיים.
כדי לחתוך את הערמונית, מניחים את הרקמה עם הבסיס ואת apex מול קירות מנוגדים של המנגנון עם הצד האחורי למטה ואת הצד הקדמי למעלה. מניחים סיכות זהב סביב דגימת הרקמה דוחפים את הערמונית פנימה מעט במידת הצורך כדי להשיג התאמה נוחה ולמדוד את אורך הערמונית מהבסיס לשיא כדי להשוות מדידה זו לאורך הערמונית הנמדד על ידי MRI. אם הערמונית התכווצה, התאימו את תנוחת ההפחתה הצפויה באחוז המתאים של ההפחתה.
לאחר מכן, מדוד מהבסיס לפרוסה הרוחבית הרצויה ובחר את הסיכה הקרובה ביותר למדידה זו כדי לחתוך מסביב. לובש כפפות שרשרת כדי למנוע פציעה, מניחים את הלהבים של מכשיר הסכין משני צדי הסיכה שזוהתה ולהשתמש במרחב כדי לשמור על הלהבים חמישה מילימטרים זה מזה. כדי לרכוש את הפרוסה, השתמש במשיחות ארוכות כדי להזיז את הלהבים לאט אך בתקיפות כלפי מטה, קדימה ואחורה כדי לאשר על ידי תחושה שפרוסה מלאה הופרדה לפני פירוק המנגנון.
לאחר מכן להסיר את הקירות ואת הפינים ולהשתמש כפפות כדי להעביר בזהירות את הפרוסה על חתיכה סטרילית של הפקק. לאחר רכישת הדגימה, בדוק חזותית את הפרוסה הרוחבית לשם השוואה עם תמונת ה- MRI של ביתר-הבית. במקרים מסוימים, אזור הגידול עשוי להיראות חיוור יותר מהרקמה שמסביב.
יש לתפוך בעדינות את הפרוסה הרוח-רוחבית. הגידול עשוי להרגיש מוצק יותר מהרקמה שמסביב. באמצעות תמונת ה- MRI השרירית כמדריך, בחר אזור אחד או יותר לדגימה ולהשתמש בניקוב של שישה מילימטרים כדי לדחוף כלפי מטה את אזור הרקמות המעניין.
סובב את אגרוף הרקמה במקום ומטה כנגד הפקק כדי להבטיח הפרדה מלאה באמצעות אזמל חד כדי להפריד את דגימת הביופסיה מהדגימה לפי הצורך. כאשר המדגם נרכש, להסיר את האגרוף ולהשתמש בוכנה כדי להוציא את המדגם לתוך המיכל המתאים לניתוח במורד הזרם הבאים. ואז דיו החורים שבהם האגרופים נלקחו באדום ושים לב למיקום של כל אגרוף יחד עם המשקל של הערמונית וכל תצפיות על צבע רקמות ומוצקות.
הצמד את כמוסת הערמונית ל הפקק כדי למנוע bilging במהלך הקיבעון. להטביע את הערמונית ואת הפקק לתוך תיקון להבטיח את המדגם שקוע לחלוטין. בניתוח מייצג זה, מתוך 92 המקרים הראשונים שנדגמו כפי שהודגם, 64% מהדגימות הכילו לפחות 40% גידול והוגשו לפרויקט 100,000 הגנומים ללא מיקרו-דיסקציה.
הדנ"א חולץ והיה מספיק תשואה ואיכות בכל המקרים ותת-קבוצה ראשונית של 59 דגימות אלה פורסמה להשוואה לשיטת דגימה מוקדמת יותר. בעקבות הליך זה, ניתן להשתמש בדגימות הגידול הטריות להדמיה חיה או לתרבות המאפשרת לנו לבדוק סמנים ביולוגיים חדשים, תרופות, ולגלות עוד על ביולוגיה של הגידול. עכשיו שאנחנו משתמשים בשיטה זו באופן שגרתי, הצלחתי לקדם פרויקט באמצעות רקמה זו לתרבות אקס ויוו להסתכל על שילובים חדשים של טיפולים פרה-קליניים לסרטן הערמונית.
סקירה כללית
פרוטוקול זה משפר את יעילות דגימת רקמות מסרטן ערמונית על ידי שימוש בנתונים דיאגנוסטיים קליניים להכוונת תהליך הדגימה. הוא מאפשר איסוף של רקמת גידול טרייה, שניתן להשתמש בה ישירות למגוון יישומים המשכיים.
מרכיבי מפתח של המחקר
תחום המדע
- אונקולוגיה
- פתולוגיה
- ביובנקאות
רקע
- שיטות קודמות לדגימה של רקמת ערמונית היו חסרות יעילות ואמינות.
- רקמה טרייה היא קריטית למחקר ולניתוח מדויקים.
- שימוש בדימות MRI משפר את התמיגור של מיקומי הגידול.
- שיתוף פעולה עם פתולוגים הוא חיוני לאבחנה מדויקת.
מטרת המחקר
- לשיפור דיוק דגימת רקמת הגידול בחולי סרטן הערמונית.
- להקל על השימוש ברקמה טרייה עבור יישומים מחקריים.
- לביסוס פרוטוקול מהימן למאגר ביולוגי (biobanking) של רקמת ערמונית.
שיטות שנעשה בהן שימוש
- בחינת תמונות MRI לאיתור מדויק של גידולים.
- מדידה וסימון של מיקומי הגידולים בדגימות ערמונית.
- שימוש במכשיר פריסה להוצאת חיתוכים רוחביים של הערמונית.
- דגימה של אזורי הגידול באמצעות מחץ רקמה (tissue punch) לצורך ניתוח המשכי.
תוצאות עיקריות
- 64% מהדגימות הכילו לפחות 40% רקמת גידול.
- ה-DNA שהופק מהדגימות היה בעל תפוקה ואיכות מספקות.
- דגימות גידול טריות שימשו בהצלחה לדימיון חי (live imaging) ולתרבית.
- השוואות ראשוניות עם שיטות דגימה מוקדמות יותר הראו תוצאות משופרות.
מסקנות
- הפרוטוקול משפר באופן משמעותי את מהימנות דגימת רקמת הערמונית.
- ניתן להשתמש ביעילות ברקמה טרייה למחקר על סרטן הערמונית.
- שיתוף פעולה עם פתולוגים הוא חיוני ליישום מוצלח.
שאלות נפוצות
רלוונטיות תעשייתית למנהלים
דגימה ממוקדת של רקמת ערמונית באמצעות נתוני MRI וביופסיה נותנת מענה לצורך קריטי בזיהוי גידולים ברמת ביטחון גבוהה בתהליכי ביו-בנקאיים. גישה זו משפרת את הביטחון החזוי עבור יישומים המשכיים, ומאפשרת מחקר תרגומי ופיתוח מודלים פרה-קליניים אמינים יותר. על ידי הגדלת הפרופורציה של דגימות עשירות בגידול, השיטה תומכת בקבלת החלטות מוצקה לגבי תיקי פיתוח ובקידום מותאם סיכונים במחקר ופיתוח בתחום האונקולוגיה.
יישומים אסטרטגיים במחקר ופיתוח בביופארמה
גילוי מוקדם ותיקוף מטרה
- מאפשר בחינה מדויקת של הביולוגיה של הגידול באמצעות בידוד של אזורים עם תכולת גידול גבוהה.
- משפר את התיקוף התפקודי של המטרה על ידי הבטחת הרלוונטיות של הדגימה ומזעור זיהום מרקמות שפירות.
- תומך בביטחון ניבוי במחקרים מכניסטיים ובמחקרי סמנים ביולוגיים באמצעות בחירת רקמה מדויקת.
סריקה ופיתוח בדיקות
- מסייע בהכנת דגימות גידולים שעברו תיקוף עבור בדיקות גנומיקה, פרוטאומיקה והיסטולוגיה.
- משפר את השחזוריות והסטנדרטיזציה של הבדיקה על ידי הפחתת השונות בדגימה.
- מאפשר הערכה מהימנה של תרכובות בפלטפורמות של תרביות ex vivo והדמיה של רקמות חיות.
מחקר תרגומי ופרה-קליני
- מתאימה את תוצרי הביובנק (biobanking) למערכות הרלוונטיות למחלה לצורך גילוי ביומרקרים תרגומיים.
- מספק רצף מרגע השגת הרקמה ועד לתיקוף פרה-קליני על ידי תמיכה ביישומים של רקמה טרייה.
- מפחית סיכונים במחקרים פרה-קליניים על ידי הבטחת תכולת הגידול ואיכות הדגימה עבור בדיקות תפקודיות.
שילוב תהליכי עבודה ומסלולי עיבוד
שיטת דגימה זו, המונחית על ידי MRI וביופסיה, משולבת בממשק שבין השגת רקמות לבין אנליזה מולקולרית המשכה, ובכך היא מגשרת בין שלב הגילוי המוקדם למחקר תרגומי ופרה-קליני.
- ביולוגיה של הגילוי: תומכת בבדיקת היפותזות ובבירור מסלולים ביולוגיים באמצעות אספקת דגימות עשירות בגידולים.
- סריקה: מספקת רקמה המוכנה לבדיקה, עם הדירות גבוהה ותוכן גידולי כמותי.
- אנליטיקה: מאפשרת מדידה חסונה של נקודות סיום מולקולריות ותאיות למחקרים השוואתיים.
- מחקר תרגומי: מקשרת בין ביו-בנקאות למחקרי סמנים ביולוגיים ותגובה לתרופות באמצעות שימוש ברקמה טרייה הרלוונטית למחלה.
- שימוש חוזר ארגוני: קובעת פרוטוקול סטנדרטי וניתן להרחבה לשימוש חוזר בתוכניות מחקר בתחום האונקולוגיה.
השפעה תפעולית וארגונית
- ערך מדעי: מגביר את הביטחון החזוי ומפחית עמימות מכניסטית במחקרי רקמות.
- ערך תפעולי: סטנדרטיזציה של הדגימה, שיפור השחזוריות ותמיכה בפעולות ביו-בנקים הניתנות להרחבה.
- ערך אסטרטגי: מאפשר קבלת החלטות מושכלת של go/no-go ומפחית סיכון ביולוגי בשלבים מאוחרים בתיקי פרויקטים של אונקולוגיה.
- השפעה על תיק הפרויקטים: תומך בתיעדוף מותאם סיכונים וקידום נכסים טרנסלציונליים ופרה-קליניים.
שיקולי יישום
- דורש מומחיות בפירוש MRI ושיתוף פעולה הדוק עם צוותי פתולוגיה.
- נדרש גישה למכשירי חיתוך ייעודיים ותשתיות ביו-בנק סטריליות.
- דורש סטנדרטיזציה קפדנית בין הצוותים כדי לשמור על שלמות אבחנתית.
- עשוי לדרוש התאמה לגדלי פרוסטה שונים או למיקומים שונים של הגידול.
- תלוי באיכות הדימות ובנתוני הביופסיה לצורך מיקוד אופטימלי.
