JUMPn: יישום יעיל עבור אשכולות ביטוי משותף של חלבונים וניתוח רשת בפרוטאומיקה

2.9K צפיות

צוטט 13 פעמים

07:28 דק׳

19 באוקטובר 2021

10.3791/62796-v

19 באוקטובר 2021

2.9K צפיות

David Vanderwall¹ , Poudel Suresh¹^,² , Yingxue Fu² , Ji-Hoon Cho² , Timothy I. Shaw²^,³ , Ashutosh Mishra² , Anthony A. High² , Junmin Peng¹^,² , Yuxin Li¹^,²

¹Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology, St. Jude Children’s Research Hospital, ²Center for Proteomics and Metabolomics, St. Jude Children’s Research Hospital, ³Department of Computational Biology, St. Jude Children’s Research Hospital

אנו מציגים כלי לביולוגיה של מערכות JUMPn כדי לבצע ולהמחיש ניתוח רשת עבור נתוני פרוטאומיקה כמותית, עם פרוטוקול מפורט הכולל עיבוד נתונים מראש, אשכולות ביטוי משותף, העשרת מסלולים וניתוח רשת אינטראקציות חלבון-חלבון.