-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

HE

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

he_IL

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
שימוש בספריות ראייה ממוחשבת לייעול כימות הגרעינים
שימוש בספריות ראייה ממוחשבת לייעול כימות הגרעינים
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Using Computer Vision Libraries to Streamline Nuclei Quantification

שימוש בספריות ראייה ממוחשבת לייעול כימות הגרעינים

Full Text
678 Views
06:25 min
June 6, 2025

DOI: 10.3791/67945-v

Danielle E. Levitt1, Alexandra L. Khartabil1, Rylea E. Hall1, Matthew R. DiLeo1, Connor J. Mills1, Ashley K. Williams1, Casey R. Appell2, Ronald G. Budnar, Jr.1, Hui-Ying Luk2

1Metabolic Health & Muscle Physiology Laboratory, Department of Kinesiology and Sport Management,Texas Tech University, 2Applied Exercise Physiology Laboratory, Department of Kinesiology and Sport Management,Texas Tech University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a method for automating the quantification of nuclei in images, which aids in normalizing metabolic data in skeletal muscle research. The automated program, validated across varying cell densities, addresses challenges inherent to manual counting, such as bias and variability.

Key Study Components

Research Area

  • Cell biology
  • Metabolic health
  • Heat therapy effects on muscle

Background

  • Manual quantification of nuclei is time-consuming and biased.
  • Automated methods can improve accuracy and efficiency.
  • Understanding the effects of heat therapy on muscle adaptations is crucial for metabolic health.

Methods Used

  • Automated nuclei counting using an open-source program
  • Cell line models for skeletal muscle research
  • Image processing and analysis

Main Results

  • The automated program showed excellent reliability with an intra-class correlation coefficient of 0.993.
  • Quantification accuracy was high across varying cell densities.
  • Problems with clustering nuclei and artifacts were identified for further improvement.

Conclusions

  • The study demonstrates an objective approach to nuclei quantification that enhances experimental normalization.
  • This method is relevant for advancing research in metabolic health and muscle adaptations.

Frequently Asked Questions

What is the significance of nuclei quantification in this study?
Nuclei quantification is essential for normalizing metabolic data in skeletal muscle research.
How does the automated program compare to manual counting?
The automated program significantly reduces observer bias and variability, showing high reliability against manual counts.
What challenges does manual nuclei counting present?
Manual counting is prone to biases and inconsistencies, making it less reliable than automated methods.
What improvements can be made to the automated method?
Further enhancements can focus on better handling of clustered nuclei and image artifacts.
Is the program user-friendly for those with limited technical skills?
Yes, the program is designed to be accessible for scientists with varying levels of coding experience.
What was the primary validation for the automated program?
The program was validated with high intra-class correlation coefficients across all tested cell densities.
How does this research relate to metabolic health?
It aims to uncover mechanisms of heat therapy in improving muscle and mitochondrial health, particularly in pre-diabetic individuals.

מאמר זה מתאר שיטות צעד-אחר-צעד לאוטומציה של כימות גרעינים מבוססי תמונה באמצעות תוכנית הפעלה בקוד פתוח המאומתת על פני מגוון צפיפויות תאים. תוכנית זו מספקת אלטרנטיבה המטפלת בחסמים הקשורים לעלות, נגישות למשתמשים בעלי כישורים טכנולוגיים מוגבלים ואימות ספציפי ליישום שעלול להגביל את התועלת של טכנולוגיות קיימות.

פיתחנו שיטה זו כדי לנרמל נתונים מטבוליים ממודלים תאיים כדי לסייע בזיהוי מנגנונים, להדגיש הסתגלות שרירי השלד הנגרמת על ידי טיפול בחום, ובסופו של דבר, לשפר את הבריאות המטבולית בקרב אנשים עם טרום סוכרת.

עלינו לספור גרעינים לצורך נורמליזציה ניסויית. כימות ידני של גרעינים מציב אתגרים כולל הטיית הצופה, זמן ושונות בהתמודדות עם דגימות או תנאים שונים.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

ביולוגיה גיליון 220

Related Videos

זרימת עבודה עבור גבוהה תוכן, כימות תא יחידה של פלורסנט סמנים מUniversal מיקרוסקופים נתונים, הנתמכים על ידי תוכנות קוד פתוחות

09:57

זרימת עבודה עבור גבוהה תוכן, כימות תא יחידה של פלורסנט סמנים מUniversal מיקרוסקופים נתונים, הנתמכים על ידי תוכנות קוד פתוחות

Related Videos

13.6K Views

כימות של ביטוי חלבון ו Co-לוקליזציה שימוש חיסונית-histochemical Multiplexed מכתים והדמיה Multispectral

08:40

כימות של ביטוי חלבון ו Co-לוקליזציה שימוש חיסונית-histochemical Multiplexed מכתים והדמיה Multispectral

Related Videos

13.4K Views

ניצול הדמיה בשידור חי על המסלול גרעינים במהלך התמיינות Myoblast, פיוז'ן

09:03

ניצול הדמיה בשידור חי על המסלול גרעינים במהלך התמיינות Myoblast, פיוז'ן

Related Videos

8.7K Views

מיפוי הארגון המרחבי של תאי היונקים באמצעות מיקרודפוסים והדמיה כמותית

09:56

מיפוי הארגון המרחבי של תאי היונקים באמצעות מיקרודפוסים והדמיה כמותית

Related Videos

7K Views

מנתח מבנה משנה: זרימת עבודה ידידותית למשתמש לחקר מהיר וניתוח מדויק של גופים סלולריים בתמונות מיקרוסקופ פלואורסצנטית

14:28

מנתח מבנה משנה: זרימת עבודה ידידותית למשתמש לחקר מהיר וניתוח מדויק של גופים סלולריים בתמונות מיקרוסקופ פלואורסצנטית

Related Videos

8.4K Views

בידול וניתוח התבגרות של תאי גזע עצביים עובריים ומבוגרים שמקורם בתאי גזע עצביים

09:36

בידול וניתוח התבגרות של תאי גזע עצביים עובריים ומבוגרים שמקורם בתאי גזע עצביים

Related Videos

3.3K Views

הדמיה וניתוח אוטומטיים לכימות של מקרופינומיסומים המסומנים בפלואורסצנטות

11:01

הדמיה וניתוח אוטומטיים לכימות של מקרופינומיסומים המסומנים בפלואורסצנטות

Related Videos

3.4K Views

צינור רב-תכליתי לניתוח שינויים דינמיים בגופים גרעיניים במגוון סוגי תאים

06:33

צינור רב-תכליתי לניתוח שינויים דינמיים בגופים גרעיניים במגוון סוגי תאים

Related Videos

917 Views

SCAnED - מאקרו פילוח עור בקוד פתוח לזיהוי אוטומטי למחצה של תאים וגרעינים בתאי עור האפידרמיס והעור

06:34

SCAnED - מאקרו פילוח עור בקוד פתוח לזיהוי אוטומטי למחצה של תאים וגרעינים בתאי עור האפידרמיס והעור

Related Videos

591 Views

ניתוח נתוני מיקרוסקופיה רב-ממדית באמצעות Cell-ACDC

06:17

ניתוח נתוני מיקרוסקופיה רב-ממדית באמצעות Cell-ACDC

Related Videos

558 Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code