Name: בדיקת LIVE/DEAD אופטימלית בשילוב עם ציטומטריית זרימה לכימות הישרדות לאחר מתח בתאי שמרים (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-08-29T14:50:00.000+00:00
Duration: 9 min 58 s
Description: למדו פרוטוקול LIVE/DEAD לכימות הישרדות תאי שמרים לאחר מתח חמצוני באמצעות ציטומטריית זרימה וצבעי SYTO 9 ו-PI. השיטה מספקת הערכה כמותית ואמינה של שלמות ממברנת התא.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Lourens-Hattingh, A., Viljoen, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+and+survival+of+a+probiotic+yeast+in+dairy+products%5BTitle%5D)+AND+%22Food+Res+Int%22%5BJournal%5D)">Growth and survival of a probiotic yeast in dairy products.</a> Food Res Int. 34 (9), 791-796 (2001).</li>
<li>Qiu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stress+tolerance+phenotype+of+industrial+yeast%3A+industrial+cases%2C+cellular+changes%2C+and+improvement+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Microbiol+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Stress tolerance phenotype of industrial yeast: industrial cases, cellular changes, and improvement strategies.</a> Appl Microbiol Biotechnol. 103 (16), 6449-6462 (2019).</li>
<li>Welsh, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Survival%2C+persistence%2C+and+isolation+of+the+emerging+multidrugresistant+pathogenic+yeast+Candida+auris+on+a+plastic+health+care+surface%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Survival, persistence, and isolation of the emerging multidrugresistant pathogenic yeast Candida auris on a plastic health care surface.</a> J Clin Microbiol. 55 (10), 2996-3005 (2017).</li>
<li>Millard, P. J., Roth, B. L., Thi, H. P., Yue, S. T., Haugland, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+the+FUN1+family+of+fluorescent+probes+for+vacuole+labeling+and+viability+testing+of+yeasts%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Development of the FUN1 family of fluorescent probes for vacuole labeling and viability testing of yeasts.</a> Appl Environ Microbiol. 63 (7), 2897-2905 (1997).</li>
<li>WlochSalamon, D. M., Bem, A. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Types+of+cell+death+and+methods+of+their+detection+in+yeast+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22J+Appl+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Types of cell death and methods of their detection in yeast Saccharomyces cerevisiae.</a> J Appl Microbiol. 114 (2), 287-298 (2013).</li>
<li>Boulos, L., Prévost, M., Barbeau, B., Coallier, J., Desjardins, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((LIVE%2FDEAD+BacLight%3A+Application+of+a+new+rapid+staining+method+for+direct+enumeration+of+viable+and+total+bacteria+in+drinking+water%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Microbiol.+Methods%22%5BJournal%5D)">LIVE/DEAD BacLight: Application of a new rapid staining method for direct enumeration of viable and total bacteria in drinking water.</a> J. Microbiol. Methods. 37 (1), 77-86 (1999).</li>
<li>Zhang, T., Fang, H. H. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+Saccharomyces+cerevisiae+viability+using+BacLight%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnol+Lett%22%5BJournal%5D)">Quantification of Saccharomyces cerevisiae viability using BacLight.</a> Biotechnol Lett. 26 (12), 989-992 (2004).</li>
<li>Stocks, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanism+and+use+of+the+commercially+available+viability+stain%2C+BacLight%5BTitle%5D)+AND+%22Cytometry+A%22%5BJournal%5D)">Mechanism and use of the commercially available viability stain, BacLight.</a> Cytometry A. 61A (2), 189-195 (2004).</li>
<li>Sun, S., Baryshnikova, A., Brandt, N., Gresham, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+interaction+profiles+of+regulatory+kinases+differ+between+environmental+conditions+and+cellular+states%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Syst+Biol%22%5BJournal%5D)">Genetic interaction profiles of regulatory kinases differ between environmental conditions and cellular states.</a> Mol Syst Biol. 16 (5), e9167(2020).</li>
<li>Li, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Allicin+shows+antifungal+efficacy+against+Cryptococcus+neoformans+by+blocking+the+fungal+cell+membrane%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Allicin shows antifungal efficacy against Cryptococcus neoformans by blocking the fungal cell membrane.</a> Front Microbiol. 13, 1012516(2022).</li>
<li>Jin, Y., Zhang, T., Samaranayake, Y., Fang, H. H. P., Yip, H. K., Samaranayake, L. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+use+of+new+probes+and+stains+for+improved+assessment+of+cell+viability+and+extracellular+polymeric+substances+in+Candida+albicans+biofilms%5BTitle%5D)+AND+%22Mycopathologia%22%5BJournal%5D)">The use of new probes and stains for improved assessment of cell viability and extracellular polymeric substances in Candida albicans biofilms.</a> Mycopathologia. 159 (3), 353-360 (2005).</li>
<li>Bojsen, R., Regenberg, B., Folkesson, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Saccharomyces+cerevisiae+biofilm+tolerance+towards+systemic+antifungals+depends+on+growth+phase%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Saccharomyces cerevisiae biofilm tolerance towards systemic antifungals depends on growth phase.</a> BMC Microbiol. 14, 305(2014).</li>
<li>Ryan, L. K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Activity+of+potent+and+selective+host+defense+peptide+mimetics+in+mouse+models+of+oral+candidiasis%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">Activity of potent and selective host defense peptide mimetics in mouse models of oral candidiasis.</a> Antimicrob Agents Chemother. 58 (7), 3820-3827 (2014).</li>
<li>Chudzik, B., Koselski, M., Czuryło, A., Trębacz, K., Gagoś, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+new+look+at+the+antibiotic+amphotericin+B+effect+on+Candida+albicans+plasma+membrane+permeability+and+cell+viability+functions%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.+Biophys.+J.+%28EBJ%29%22%5BJournal%5D)">A new look at the antibiotic amphotericin B effect on Candida albicans plasma membrane permeability and cell viability functions.</a> Eur. Biophys. J. (EBJ). 44 (1-2), 77-90 (2015).</li>
<li>Roscetto, E., Contursi, P., Vollaro, A., Fusco, S., Notomista, E., Catania, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antifungal+and+antibiofilm+activity+of+the+first+cryptic+antimicrobial+peptide+from+an+archaeal+protein+against+Candida+spp.+clinical+isolates%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Antifungal and antibiofilm activity of the first cryptic antimicrobial peptide from an archaeal protein against Candida spp. clinical isolates.</a> Sci Rep. 8 (1), 17570(2018).</li>
<li>Tang, H., Liang, J., He, B. Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+LIVE%2FDEAD+assay+using+flow+cytometry+to+quantify+poststress+and+antifungaltreatment+survival+in+diverse+yeasts%5BTitle%5D)+AND+%22BioRiv%22%5BJournal%5D)">An optimized LIVE/DEAD assay using flow cytometry to quantify poststress and antifungaltreatment survival in diverse yeasts.</a> BioRiv. , (2025).</li>
<li>Stiefel, P., SchmidtEmrich, S., ManiuraWeber, K., Ren, Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Critical+aspects+of+using+bacterial+cell+viability+assays+with+the+fluorophores+SYTO9+and+propidium+iodide%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Critical aspects of using bacterial cell viability assays with the fluorophores SYTO9 and propidium iodide.</a> BMC Microbiol. 15 (1), 36(2015).</li>
<li>Rego, A., Ribeiro, A., CôrteReal, M., Chaves, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monitoring+yeast+regulated+cell+death%3A+Trespassing+the+point+of+no+return+to+loss+of+plasma+membrane+integrity%5BTitle%5D)+AND+%22Apoptosis%22%5BJournal%5D)">Monitoring yeast regulated cell death: Trespassing the point of no return to loss of plasma membrane integrity.</a> Apoptosis. 27 (9), 778-786 (2022).</li>
<li>CarmonaGutierrez, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Guidelines+and+recommendations+on+yeast+cell+death+nomenclature%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Cell%22%5BJournal%5D)">Guidelines and recommendations on yeast cell death nomenclature.</a> Microbial Cell. 5 (1), 4-31 (2018).</li>
<li>Miller, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+colony+size+to+measure+fitness+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Using colony size to measure fitness in Saccharomyces cerevisiae.</a> PLoS One. 17 (10), e0271709(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>לוח באר בעומק 96 בארות</td><td>תרמו פישר</td><td>278606</td><td>NUNC 96</td></tr><tr><td>Attune NxT זרימת ציטומטר עם קורא לוחות</td><td>תרמו פישר A24858</td><td>A24858</td><td>אוטוסמפלר (A42901)</td></tr><tr><td>Candida glabrata</td><td></td><td></td><td>CG99, זן מעבדה שמקורו בבידוד קליני (Cormack & פאלקו, 1999)</td></tr><tr><td>ערכת FungaLight Yeast LIVE/DEAD</td><td>תרמו פישר A24858</td><td>L34952</td><td>מכיל SYTO 9 (3.34 מ"מ) ויודיד פרופידיום (20 מ"מ). שני הרכיבים הללו ניתנים גם לרכישה נפרדת מספקים שונים.</td></tr><tr><td>מי חמצן</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>H1009</td><td></td></tr><tr><td>מיקרוסקופ Leica Confocal SP8</td><td>לייקה</td><td>TCS SP8 X</td><td></td></tr><tr><td>כלוריד נתרן</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>S9888</td><td>משמש לייצור תמיסה עיקרה של 0.85% NaCl</td></tr><tr><td>בסיס חנקן שמרים ללא חומצות אמינו</td><td>סיגמא אולדריץ'</td><td>Y0626</td><td>שימש לייצור מדיה מלאה סינתטית עם תערובת גלוקוז וחומצות אמינו של 2%</td></tr></tbody></table>

בדיקת live/dead אופטימלית בשילוב עם ציטומטריית זרימה לכימות הישרדות לאחר מתח בתאי שמרים

An Optimized LIVE/DEAD Assay Coupled with Flow Cytometry for Quantifying Post-Stress Survival in Yeast Cells

בדיקת LIVE/DEAD אופטימלית בשילוב עם ציטומטריית זרימה לכימות הישרדות לאחר מתח בתאי שמרים

Quantifying survival is a common and critical task in yeast research. LIVE/DEAD stains based on plasma membrane integrity provide a rapid and ...

an-optimized-livedead-assay-coupled-with-flow-cytometry-for

Research

JoVE Journal

Biology

ביולוגיה

כמותי תא חי פלואורסצנטי, מיקרוסקופ ניתוח של שמרים ביקוע

מקור: צ'פמן, I. J., et al., אופטימיזציה של בדיקה מולקולרית לקביעת תמותת תאים באורגניזם פוטוסינתטי (Microcystis aeruginosa) באמצעות ציטומטריית זרימה. J. Vis. Exp. (2016)סרטון זה מדגים את השיטה להבחנה בין תאי Microcystis aeruginosa חיים ומתים על ידי שילוב של תיוג בדיקה פלואורסצנטית עם ניתוח ציטומטרי זרימה של אוטו-פלואורסצנציה של פיקוציאנין ואות בדיקה.

ניתוח כדאיות של Microcystis aeruginosa באמצעות ציטומטריית זרימה

מאמר זה מתאר את השימוש בחלבון היתוך לוציפראז-GFP גחלילית...

מבחני יחד לrefolding החלבון בניטור<em&gt; Cerevisiae Saccharomyces</em

שתי שיטות משלימות המבוססות על הזרימה cytometry ומיקרוסקופיה מוצגות המאפשרות כימות, ברמת התא הבודד, של הדינמיקה של ביטוי גנים הנגרמת על ידי ההפעלה של מסלול MAPK בשמרים.

כימות זמניות של ביטוי MAPK מושרה בתאי שמרים יחיד

אוכלוסיות חיידקים מכילות ההטרוגניות תא משמעותית, אשר יכול להכתיב התנהגות כוללת. ניתוח בדיקה מולקולרי באמצעות cytometry זרימה יכול לקבוע מדינות פיסיולוגיות של תאים, עם זאת היישום שלה משתנה בין מינים. מחקר זה מספק פרוטוקול לקבוע תמותת תאים בתוך אוכלוסיית cyanobacterium במדויק, בלי להמעיט או הקלטת תוצאות חיוביות שגויות.

מולקולרי הבדיקה אופטימיזציה לקביעת תמותת תא באורגניזם פוטוסינתזה (<em&gt; Aeruginosa Microcystis</em&gt;) שימוש cytometry הזרימה

חקר חילוף החומרים הופך רלוונטי יותר ויותר למחקר אימונולוגי. כאן, אנו מציגים שיטה אופטימלית למדידת גליקוליזה ונשימה מיטוכונדריאלית בטחול עכברים, ולימפוציטים T ו-B.

פרוטוקול אופטימיזציה כדי לנתח הגליקוליזה מיטוכונדריאלי הנשימה לימפוציטים

חלבון צבירת מעורר הסלולר סטרס חמצוני. פרוטוקול זה מתאר שיטה לניטור את המדינות amyloidogenic חלבונים תאיים סטרס חמצוני המשויכים אליהן, באמצעות cytometry זרימה. הגישה משמש כדי ללמוד על אופן הפעולה של גרסאות מסיסים ונוטה צבירת של פפטיד עמילואיד-β.

הערכת ההשפעה של חלבון צבירה על סטרס חמצוני הסלולר ב שמרים

מאמר זה מתאר זרימה מבוססת-סריג cy, מבוסס הפרוטוקול כדי לכמת הרכבה עצמית חלבון בשני S. cerevisiae ס ו HEK293T תאים.

גילוי ואפיון הרכבה עצמית של חלבון בVivo על-ידי הזרמת הקיטומטל

פנוטיפים של צמיחת שמרים נמדדים במדויק באמצעות הדמיה מקבילה מאוד של תאים משותקים הגדלים למיקרוקולוניות. במקביל, ניתן לעקוב אחר עמידות ללחץ, ביטוי חלבון ולוקליזציה של חלבונים, וליצור ערכות נתונים משולבות כדי לחקור כיצד הבדלים סביבתיים וגנטיים, כמו גם הטרוגניות של ביטוי גנים בקרב תאים איסוגניים, מווסתים את הצמיחה.

הדמיה חיה בעלת תפוקה גבוהה של מיקרוקולוניות למדידת הטרוגניות בצמיחה ובביטוי גנים

כאן, אנו מציגים פרוטוקול לשימוש במצעים המוצגים על פני השטח של שמרים לבדיקות שינוי אנזימטיות. הפלטפורמה הודגמה באמצעות ניתוח פעילות הדפוספורילציה של טירוזין פוספטאז SHP-2 כנגד אחד המצעים שלו כבדיקת שינוי אנזימטי מייצגת.

שינוי אנזימטי והערכת ציטומטריית זרימה של חלבונים המוצגים על פני השטח של שמרים

למדו פרוטוקול LIVE/DEAD לכימות הישרדות תאי שמרים לאחר מתח חמצוני באמצעות ציטומטריית זרימה וצבעי SYTO 9 ו-PI. השיטה מספקת הערכה כמותית ואמינה של שלמות ממברנת התא.

בדיקת LIVE/DEAD אופטימלית בשילוב עם ציטומטריית זרימה לכימות הישרדות לאחר מתח בתאי שמרים

גלה סרטונים נוספים