Name: הדמיה סופר-רזולוציה ספקטרוסקופית של מולקולות DNA באמצעות ניגוד פנימי (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-03-06T13:25:00.000+00:00
Duration: 9 min 19 s
Description: למד הדמיה סופר-רזולוציה ספקטרוסקופית של מולקולות DNA באמצעות ניגוד פנימי ללא תיוג חיצוני. השיטה מאפשרת ניתוח ספקטרלי ומיפוי מולקולרי תוך שימור תכונות DNA המקוריות.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Ellis, R. J., Minton, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Join+the+crowd%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Join the crowd.</a> Nature. 425 (6953), 27-28 (2003).</li>
<li>Hell, S. W., Wichmann, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breaking+the+diffraction+resolution+limit+by+stimulated+emission%3A+stimulated+emission-depletion+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">Breaking the diffraction resolution limit by stimulated emission: stimulated emission-depletion fluorescence microscopy.</a> Opt Lett. 19 (11), 780(1994).</li>
<li>Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-diffraction-limit+imaging+by+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+%28STORM%29%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM).</a> Nat Methods. 3 (10), 793-796 (2006).</li>
<li>Betzig, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+intracellular+fluorescent+proteins+at+nanometer+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Imaging intracellular fluorescent proteins at nanometer resolution.</a> Science. 313 (5793), 1642-1645 (2006).</li>
<li>Gustafsson, M. G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonlinear+structured-illumination+microscopy%3A+wide-field+fluorescence+imaging+with+theoretically+unlimited+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Nonlinear structured-illumination microscopy: wide-field fluorescence imaging with theoretically unlimited resolution.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (37), 13081-13086 (2005).</li>
<li>Hell, S. W., Kroug, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ground-state-depletion+fluorescence+microscopy%3A+a+concept+for+breaking+the+diffraction+resolution+limit%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Phys+B%22%5BJournal%5D)">Ground-state-depletion fluorescence microscopy: a concept for breaking the diffraction resolution limit.</a> Appl Phys B. 60 (5), 495-497 (1995).</li>
<li>Fölling, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+nanoscopy+by+ground-state+depletion+and+single-molecule+return%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Fluorescence nanoscopy by ground-state depletion and single-molecule return.</a> Nat Methods. 5 (11), 943-945 (2008).</li>
<li>Ricci, M., Manzo, C., García-Parajo, M. F., Lakadamyali, M., Cosma, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromatin+fibers+are+formed+by+heterogeneous+groups+of+nucleosomes+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Chromatin fibers are formed by heterogeneous groups of nucleosomes in vivo.</a> Cell. 160 (6), 1145-1158 (2015).</li>
<li>Bintu, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Super-resolution+chromatin+tracing+reveals+domains+and+cooperative+interactions+in+single+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Super-resolution chromatin tracing reveals domains and cooperative interactions in single cells.</a> Science. 362 (6413), eaau1783(2018).</li>
<li>Matsuda, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Condensed+mitotic+chromosome+structure+at+nanometer+resolution+using+PALM+and+EGFP-histones%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Condensed mitotic chromosome structure at nanometer resolution using PALM and EGFP-histones.</a> PLoS One. 5 (9), e12768(2010).</li>
<li>Bohn, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Localization+microscopy+reveals+expression-dependent+parameters+of+chromatin+nanostructure%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Localization microscopy reveals expression-dependent parameters of chromatin nanostructure.</a> Biophys J. 99 (5), 1358-1367 (2010).</li>
<li>Acosta, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-color+single-molecule+localization+microscopy+in+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22Light+Sci+Appl%22%5BJournal%5D)">Three-color single-molecule localization microscopy in chromatin.</a> Light Sci Appl. 14, 7(2025).</li>
<li>Almassalha, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+imaging+of+the+native%2C+living+cellular+nanoarchitecture+using+partial-wave+spectroscopic+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Label-free imaging of the native, living cellular nanoarchitecture using partial-wave spectroscopic microscopy.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (42), E6372-E6381 (2016).</li>
<li>Beerman, T. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+analogs+of+the+DNA+minor+groove+binder+Hoechst+33258+on+topoisomerase+II+and+I+mediated+activities%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Effects of analogs of the DNA minor groove binder Hoechst 33258 on topoisomerase II and I mediated activities.</a> Biochim Biophys Acta. 1131 (1), 53-61 (1992).</li>
<li>Cadet, J., Anselmino, C., Douki, T., Voituriez, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+trends+in+photobiology%5BTitle%5D)+AND+%22J+Photochem+Photobiol+B%22%5BJournal%5D)">New trends in photobiology.</a> J Photochem Photobiol B. 15 (4), 277-298 (1992).</li>
<li>Dong, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superresolution+intrinsic+fluorescence+imaging+of+chromatin+utilizing+native%2C+unmodified+nucleic+acids+for+contrast%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Superresolution intrinsic fluorescence imaging of chromatin utilizing native, unmodified nucleic acids for contrast.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 113 (35), 9716-9721 (2016).</li>
<li>Vayá, I., Gustavsson, T., Miannay, F., Douki, T., Markovitsi, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+of+natural+DNA%3A+from+the+femtosecond+to+the+nanosecond+time+scales%5BTitle%5D)+AND+%22J+Am+Chem+Soc%22%5BJournal%5D)">Fluorescence of natural DNA: from the femtosecond to the nanosecond time scales.</a> J Am Chem Soc. 132 (34), 11834-11835 (2010).</li>
<li>Anders, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+fluorescence+at+room+temperature+excited+by+means+of+a+dye+laser%5BTitle%5D)+AND+%22Chem+Phys+Lett%22%5BJournal%5D)">DNA fluorescence at room temperature excited by means of a dye laser.</a> Chem Phys Lett. 81 (2), 270-272 (1981).</li>
<li>Plessow, R., Brockhinke, A., Eimer, W., Kohse-Höinghaus, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intrinsic+time-+and+wavelength-resolved+fluorescence+of+oligonucleotides%3A+a+systematic+investigation+using+a+novel+picosecond+laser+approach%5BTitle%5D)+AND+%22J+Phys+Chem+B%22%5BJournal%5D)">Intrinsic time- and wavelength-resolved fluorescence of oligonucleotides: a systematic investigation using a novel picosecond laser approach.</a> J Phys Chem B. 104 (15), 3695-3704 (2000).</li>
<li>Takaya, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((UV+excitation+of+single+DNA+and+RNA+strands+produces+high+yields+of+exciplex+states+between+two+stacked+bases%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">UV excitation of single DNA and RNA strands produces high yields of exciplex states between two stacked bases.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (30), 10285-10290 (2008).</li>
<li>Bancaud, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+fractal+model+for+nuclear+organization%3A+current+evidence+and+biological+implications%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Res%22%5BJournal%5D)">A fractal model for nuclear organization: current evidence and biological implications.</a> Nucleic Acids Res. 40 (18), 8783-8792 (2012).</li>
<li>Daban, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+concentration+of+DNA+in+condensed+chromatin%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">High concentration of DNA in condensed chromatin.</a> Biochem Cell Biol. 81 (3), 91-99 (2003).</li>
<li>Bohrmann, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Concentration+evaluation+of+chromatin+in+unstained+resin-embedded+sections+by+means+of+low-dose+ratio-contrast+imaging+in+STEM%5BTitle%5D)+AND+%22Ultramicroscopy%22%5BJournal%5D)">Concentration evaluation of chromatin in unstained resin-embedded sections by means of low-dose ratio-contrast imaging in STEM.</a> Ultramicroscopy. 49 (1-4), 235-251 (1993).</li>
<li>Dong, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stochastic+fluorescence+switching+of+nucleic+acids+under+visible+light+illumination%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Express%22%5BJournal%5D)">Stochastic fluorescence switching of nucleic acids under visible light illumination.</a> Opt Express. 25 (7), 7929-7944 (2017).</li>
<li>Gong, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+spectroscopic+intrinsic-contrast+photon-localization+optical+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+SPIE%22%5BJournal%5D)">DNA spectroscopic intrinsic-contrast photon-localization optical nanoscopy.</a> Proc SPIE. 13326, 133260F(2025).</li>
<li>Wang, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Label-free+DNA+spectroscopic+photon-localization+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Optica+Biophotonic+Congress%22%5BJournal%5D)">Label-free DNA spectroscopic photon-localization nanoscopy.</a> Optica Biophotonic Congress. , (2025).</li>
<li>Eshein, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-10-nm+imaging+of+nucleic+acids+using+spectroscopic+intrinsic-contrast+photon-localization+optical+nanoscopy+%28SICLON%29%5BTitle%5D)+AND+%22Opt+Lett%22%5BJournal%5D)">Sub-10-nm imaging of nucleic acids using spectroscopic intrinsic-contrast photon-localization optical nanoscopy (SICLON).</a> Opt Lett. 43 (23), 5817-5820 (2018).</li>
<li>Song, K. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monolithic+dual-wedge+prism-based+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nanophotonics%22%5BJournal%5D)">Monolithic dual-wedge prism-based spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> Nanophotonics. 11 (8), 1527-1535 (2022).</li>
<li>Song, K. H., Sun, C., Zhang, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Design+strategy+for+a+dual-wedge+prism+imaging+spectrometer+in+spectroscopic+nanoscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Rev+Sci+Instrum%22%5BJournal%5D)">Design strategy for a dual-wedge prism imaging spectrometer in spectroscopic nanoscopy.</a> Rev Sci Instrum. 94 (2), 023702(2023).</li>
<li>Yeo, W. H., Sun, C., Zhang, H. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Physically+informed+Monte+Carlo+simulation+of+dual-wedge+prism-based+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biomed+Opt%22%5BJournal%5D)">Physically informed Monte Carlo simulation of dual-wedge prism-based spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> J Biomed Opt. 29 (S1), S11501(2023).</li>
<li>Davis, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RainbowSTORM%3A+an+open-source+ImageJ+plug-in+for+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy+%28sSMLM%29+data+analysis+and+image+reconstruction%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">RainbowSTORM: an open-source ImageJ plug-in for spectroscopic single-molecule localization microscopy (sSMLM) data analysis and image reconstruction.</a> Bioinformatics. 36 (19), 4972-4974 (2020).</li>
<li>Davis, J. L., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDavis%2C+JL+%22RainbowSTORM+v2+%28MATLAB+app%29%22">RainbowSTORM v2 (MATLAB app)</a>. , https://github.com/FOIL-NU/sSMLM-protocol (2020).</li>
<li>Brenner, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Implementation+and+calibration+of+spectroscopic+single-molecule+localization+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Methods%22%5BJournal%5D)">Implementation and calibration of spectroscopic single-molecule localization microscopy.</a> BMC Methods. 2 (1), 2(2025).</li>
<li>sSMLM for DNA intrinsic fluorescence (Python scripts). , Backman Lab. 
 <a target="_blank" href="https://github.com/BackmanLab/sSMLM-for-DNA-intrinsic-fluorescence">https://github.com/BackmanLab/sSMLM-for-DNA-intrinsic-fluorescence</a> (2025).</li>
<li>N-STORM protocol. , Molecular Vista. Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.mvi-inc.com/wp-content/uploads/N-STORM+Protocol.pdf">https://www.mvi-inc.com/wp-content/uploads/N-STORM+Protocol.pdf</a> (2014).</li>
<li>Abdelsayed, V., Boukhatem, H., Olivier, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimized+buffer+for+repeatable+multicolor+STORM%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Photonics%22%5BJournal%5D)">An optimized buffer for repeatable multicolor STORM.</a> ACS Photonics. 9 (12), 3926-3934 (2022).</li>
<li>Zumbusch, A., Holtom, G. R., Xie, X. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+vibrational+imaging+by+coherent+anti-Stokes+Raman+scattering%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Rev+Lett%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional vibrational imaging by coherent anti-Stokes Raman scattering.</a> Phys Rev Lett. 82 (20), 4142(1999).</li>
<li>Benninger, R. K. P., Piston, D. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two%E2%80%90photon+excitation+microscopy+for+the+study+of+living+cells+and+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Two‐photon excitation microscopy for the study of living cells and tissues.</a> Curr Protoc Cell Biol. 59 (1), 4-11 (2013).</li>
<li>Zhang, C., Zhang, D., Cheng, J. X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coherent+Raman+scattering+microscopy+in+biology+and+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+Rev+Biomed+Eng%22%5BJournal%5D)">Coherent Raman scattering microscopy in biology and medicine.</a> Ann Rev Biomed Eng. 17 (1), 415-445 (2015).</li>
<li>Song, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((SNR+enhanced+high-speed+two-photon+microscopy+using+a+pulse+picker+and+time+gating+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">SNR enhanced high-speed two-photon microscopy using a pulse picker and time gating detection.</a> Sci Rep. 13 (1), 14244(2023).</li>
<li>Luu, P., Fraser, S. E., Schneider, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((More+than+double+the+fun+with+two-photon+excitation+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Comm+Biol%22%5BJournal%5D)">More than double the fun with two-photon excitation microscopy.</a> Comm Biol. 7 (1), 364(2024).</li>
<li>Van de Linde, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+with+standard+fluorescent+probes%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Protoc%22%5BJournal%5D)">Direct stochastic optical reconstruction microscopy with standard fluorescent probes.</a> Nat Protoc. 6 (7), 991-1009 (2011).</li>
<li>Wang, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+progress+on+the+luminescence+of+biomacromolecules%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mater+Sci+Technol%22%5BJournal%5D)">Research progress on the luminescence of biomacromolecules.</a> J Mater Sci Technol. 76, 60-75 (2021).</li>
<li>Varejão, N., Reverter, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Using+intrinsic+fluorescence+to+measure+protein+stability+upon+thermal+and+chemical+denaturation%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Using intrinsic fluorescence to measure protein stability upon thermal and chemical denaturation.</a> Methods Mol Biol. 2581, 229-241 (2023).</li>
<li>Sindrewicz, P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Intrinsic+tryptophan+fluorescence+spectroscopy+reliably+determines+galectin-ligand+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Intrinsic tryptophan fluorescence spectroscopy reliably determines galectin-ligand interactions.</a> Sci Rep. 9 (1), 11851(2019).</li>
<li>Ho, C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+pathogenic+bacteria+using+Raman+spectroscopy+and+deep+learning%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Commun%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of pathogenic bacteria using Raman spectroscopy and deep learning.</a> Nat Commun. 10 (1), 4927(2019).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>מסנן פליטה 488 ננומטר להדמיה</td><td>Chroma Technology Corp.</td><td>ET525/50M</td><td></td></tr><tr><td>מסנן פס 532 ננומטר לכיול</td><td>Thorlabs</td><td>FL532-3</td><td></td></tr><tr><td>מסנן פליטה 532 ננומטר להדמיה</td><td>Chroma Technology Corp.</td><td>ET620/60M</td><td></td></tr><tr><td>מסנן פס 580 ננומטר לכיול</td><td>Thorlabs</td><td>FB580-10</td><td></td></tr><tr><td>מסנן פס 633 ננומטר לכיול</td><td>Thorlabs</td><td>FL632.8-3</td><td></td></tr><tr><td>מסנן פס 680 ננומטר לכיול</td><td>Thorlabs</td><td>FB680-10</td><td></td></tr><tr><td>מסנן פס 750 ננומטר לכיול</td><td>Thorlabs</td><td>FB750-10</td><td></td></tr><tr><td>בטא-מרקפטואנול&nbsp;</td><td>סיגמא</td><td>M6250</td><td></td></tr><tr><td>בופר הדמיה BME</td><td>NA</td><td>NA</td><td>7 & mu; L GLOX, 7 & mu; L בטא-מרקפטואנול ו-690 & mu; בופר גלוקוז L</td></tr><tr><td>קטלאז מכבד בקר</td><td>סיגמא</td><td>C100</td><td></td></tr><tr><td>DABCO (1,4-די-אזוביציקלו-(2.2.2.)-אוקטן)</td><td>סיגמא</td><td>D27802</td><td></td></tr><tr><td>בופר הדמיה של DABCO</td><td>NA</td><td>NA</td><td>65 mM DABCO+30 mM סולפיט נתרן + 30 mM DTT 1 M&nbsp; ב-DNAse, RNAse מים דה-יוניים חופשיים. סולפיט הנתרן צריך להיות מומס ב-PBS 10&; ל-1 M לפני יצירת בופר ההדמיה.</td></tr><tr><td>דיפלקס DNA עבור SMLM ספקטרוסקופי</td><td>IDT</td><td>NA</td><td>זוג 20 בסיסים GC_alter, GC_conti, AT_alter ו-AT_conti. לדוגמה GC_alter עם שני הגדילים בגודל 5' - GCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGCGC - 3'; GC_conti יש לו חוט אחד בגודל 5' - GGGGGGGGGGGGGGGGGG - 3' והשנייה כ-5' - CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC - 3' כל הדגימות הן בתקן HPLC.</td></tr><tr><td>DNA אוליגונוקלאוטיד/DNA דו-גדילי</td><td>IDT</td><td>NA</td><td></td></tr><tr><td>אוליגוסי DNA ל-SMLM ספקטרוסקופי</td><td>IDT</td><td>NA</td><td>20 בסיסים A, G, C, T; שרשרת AC חד-גדילית עם 40 בסיסים (A1C1, A5C5, A10C10, A20C20); &nbsp; גואנין בסיסי חד-גדילי 5, 8, 12, 16. לדוגמה: A10C10 הוא 5'- AAAAAAAAACCCCC CCCCCAAAAAAAA AACCCCCCCCCC - 3' כל הדגימות הן בתקן HPLC.</td></tr><tr><td>מים מזוקקים ללא DNase/RNase</td><td>Invitrogen</td><td>10977015</td><td></td></tr><tr><td>DTT (DL-דיתיותרייטול)</td><td>סיגמא</td><td>43816</td><td></td></tr><tr><td>GLOX</td><td>NA</td><td>NA</td><td>14 מ"ג גלוקוז אוקסידאז, 50 & mu; L קטלז (17 מ"ג/מ"ל) + 200 & mu; בופר L A, שהוא 10 mM Tris (pH 8.0) ו-50 mM NaCl.&nbsp;</td></tr><tr><td>בופר גלוקוז</td><td>NA</td><td>NA</td><td>50 mM Tris (pH 8.0), 50 mM NaCl ו-10% גלוקוז.</td></tr><tr><td>גלוקוז אוקסידאז</td><td>סיגמא</td><td>G7141</td><td></td></tr><tr><td>גלוקוז, אבקה</td><td>תרמו פישר</td><td>15023021</td><td></td></tr><tr><td>PBS (10X)</td><td>תרמו פישר</td><td>J62036. K3</td><td></td></tr><tr><td>PBS (1X)</td><td>גיבקו</td><td>10010023</td><td></td></tr><tr><td>כלוריד נתרן</td><td>תרמו פישר</td><td>424290010</td><td></td></tr><tr><td>סולפיט נתרן &nbsp;</td><td>סיגמא</td><td>S0505</td><td></td></tr><tr><td>טריס (1M) pH 8.0</td><td>Invitrogen</td><td>AM9856</td><td></td></tr></tbody></table>

הדמיה סופר-רזולוציה ספקטרוסקופית של מולקולות dna באמצעות ניגוד פנימי

Spectroscopic Super-resolution Imaging of DNA Molecules using Intrinsic Contrast

הדמיה סופר-רזולוציה ספקטרוסקופית של מולקולות DNA באמצעות ניגוד פנימי

Super-resolution imaging has revolutionized biological research by revealing structural details at the nanoscale. Most optical super-resolution methods ...

spectroscopic-super-resolution-imaging-dna-molecules-using-intrinsic

Research

JoVE Journal

Bioengineering

הנדסה ביולוגית

סרטון וידאו זה מתאר שיטה להמחשת הרכבה של חלבון היתוך מעובה על מולקולות DNA באתרים ספציפיים באמצעות הדמיה של מולקולה יחידה. עיבויים אלה נוצרים כתוצאה מאינטראקציות LCD-LCD ו-LCD-DBD, המאפשרות גיוס של RNA פולימראז II ושעתוק גנים משופר.

הדמיה של מולקולה בודדת להדמיית חלבון היתוך מעבה הרכבה על וילונות DNA

אנו מתארים רזולוצית סופר שיטת הדמיה כדי לבחון את המבנה הארגוני של FtsZ טבעת החיידקים, מנגנון חיוני לחלוקת תא. שיטה זו מבוססת על ניתוחים כמותיים של מיקרוסקופיה תמונות לוקליזציה photoactivated (PALM) ויכולה להיות מיושמת על חלבוני cytoskeletal חיידקים אחרים.

הדמית סופר רזולוציה של מכונות אגף קטריאלי

חדשות שהתגלו מחמצנים צורות של 5-methylcytosine (oxi-mCs), 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-formylcytosine (5fC), 5-carboxylcytosine (5caC) עשוי לייצג שינויים ברורים DNA עם תפקידים פונקציונליים ייחודיים. כאן מתוארת זרימת עבודה כמותית למחצה עבור ויזואליזציה של התפוצה המרחבית של oxi-mCs, פרופיל עוצמת האות ו colocalization.

Immunostaining עבור שינויים DNA: ניתוח חישובית של תמונות קונפוקלי

המטרה הכוללת של מתודולוגיה זו היא לתת את התנאים ניסיוני אופטימלית של הכנת הדוגמא ייבוא תמונות ושיחזור על מנת לבצע צבע כפול 2D תמונות dSTORM של microtubules חוטים ביניים בתאים...

הדמיה חוטים ביניים Microtubules עם מיקרוסקופ 2-ממדי ישירה שחזור אופטי סטוכסטי

הוראה מפורטת מתואר כיצד לבנות מאוד נוטה נסחף מיקרוסקופ אריח (HIST) ואת השימוש עבור הדמיה מולקולה בודדת.

מדריך לבניית מאוד נוטה נסחף מיקרוסקופ אריח עבור הדמיה מולקולה בודדת שדה-of-view מורחבת

3d-DNA דגים ססגוניות מייצג כלי להמחיש המקום גנומית מרובים בתוך גרעיני תלת-ממד משומרים, חד משמעית הגדרת אינטראקציות הדדית שלהם לוקליזציה בתוך החלל הגרעיני ברמת תא בודד. כאן, פרוטוקול צעד אחר צעד מתואר עבור קשת רחבה של תאים ראשוניים אנושיים.

3D מרובת צבעים דג DNA כלי ללמוד אדריכלות גרעינית בתאים ראשוניים אנושיים

הפרוטוקול הנוכחי מתאר שיטה המודדת צפיפות DNA מוחלטת בתוך גרעיני תאים דבקים באמצעות טסלציה של וורונוי של נתוני מיקרוסקופיה של לוקליזציה של מולקולה בודדת, נפח ידוע, גודל גנום ושלב מחזור התא.

מיפוי צפיפות ה-DNA המוחלטת בגרעיני התא באמצעות מיקרוסקופ לוקליזציה של מולקולה בודדת

פרוטוקול זה מדגים ביצוע בדיקת מולקולה בודדת להדמיה חיה של שחרור DNA על ידי מנחת מסוקים CMG. הוא מתאר (1) הכנת מצע דנ"א, (2) טיהור פלואורסצנטי המסומן כמנחת מסוקים Drosophila melanogaster CMG, (3) הכנת תא זרימה מיקרופלואידי למיקרוסקופ פלואורסצנטי של השתקפות פנימית כוללת (TIRF), ו-(4) בדיקת שחרור DNA של מולקולה יחידה.

הדמיה בזמן אמת של מולקולה בודדת של שחרור DNA על ידי מנחת מסוקים CMG

פרוטוקול זה מפרט את ההליך לביצוע מיקרוסקופ לוקליזציה עמוק של תא שלם, עם מולקולה בודדת (SMLM) באמצעות מיקרוסקופ קונפוקלי בדיסק מסתובב עם הקצאת פוטונים אופטית, ובכך מאפשר הדמיית DNA-PAINT ללא צורך באופטיקה מותאמת אישית או תאורה מורכבת.

דימות סופר-רזולוציה של תא שלם באמצעות DNA-PAINT על דיסק מסתובב עם הקצאת פוטונים אופטית

"ה-DNA" חיישנים, reagentless, biosensors אלקטרוכימיים כי ביצועים טובים גם כאשר תיגר ישירות בדם מטריצות מורכבות אחרות, הותאמו זיהוי של מגוון רחב של חומצת גרעין חלבון, ו analytes מולקולה קטנה. כאן אנו מציגים הליך כללי עבור ייצור ושימוש של חיישנים כאלה.

המצאה של אלקטרוכימי-DNA Biosensors לגילוי Reagentless של חומצות, חלבונים ומולקולות קטנות גרעין

למד הדמיה סופר-רזולוציה ספקטרוסקופית של מולקולות DNA באמצעות ניגוד פנימי ללא תיוג חיצוני. השיטה מאפשרת ניתוח ספקטרלי ומיפוי מולקולרי תוך שימור תכונות DNA המקוריות.

הדמיה סופר-רזולוציה ספקטרוסקופית של מולקולות DNA באמצעות ניגוד פנימי

גלה סרטונים נוספים