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Protein Function

Predicting Protein Ligand-Binding Pockets

Description

Protein ligand-binding pockets help explain how proteins work. A ligand is a small molecule that binds to a specific spot on a protein. These sites are often conserved in related proteins because they are important for function.

When the exact site on a protein surface is not known, it can be pre...

Transcript

In generale, i siti di legame del ligando si trovano all'interno di specifici cluster di aminoacidi o domini dedicati ad un certo tipo di interazione. Le parti che sono cruciali per la funzione di un dominio, come il legame del ligando, rimangono invariate durante l'evoluzione, perché di regola le mutazioni che eliminano funzioni vitali sono eli...

Tags

Siti di legame dei ligandiTracciamento evolutivoAnalisi della sequenza proteicaConservazione strutturaleConservazione degli amminoacidiPredizione dei siti di legameStrumenti computazionaliAlgoritmo ConCavityStrumento MONKEY

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