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1. Misurazione dell'adesione utilizzando conteggi cellulari vitali
- Determina il numero di batteri vitali legati alle piante coltivate nella sabbia
- Togli la pianta dal contenitore e la sabbia. Per rimuovere le piante dai contenitori, prima rimuovi il materiale sigillante sulla parte superiore e inferiore del contenitore. Posiziona il contenitore su un foglio di carta sterile e rimuovi delicatamente tutta la sabbia o il terreno e pianta come un grande cilindro conico, sbattendo delicatamente il contenitore contro una superficie per allentare il materiale.
1. Se necessario, usa una spatola o una barra per allentare il materiale intorno ai bordi che entra dal fondo del contenitore.
- Quando il cilindro di sabbia o terra contenente la pianta è libero sulla carta, dividilo a metà per rivelare la radice della pianta. Se desiderato, preleva campioni di sabbia sia vicino al bordo del contenitore che vicino alla radice. Questo può essere utile per determinare la diffusione (e l'accumulo e la crescita) dei batteri.
- Misura la lunghezza della radice. Raccogli la radice e rimuovi la sabbia e i batteri che aderiscono debolmente alla radice (il materiale della rizosfera) immergendo la radice in un volume misurato di acqua o buffer e scuotendola delicatamente. Determinare il conteggio cellulare vitale dei batteri nella sospensione risultante corazzando un mezzo adatto come il Luria agar. Questo rappresenta il numero di batteri vagamente associati alla radice.
- Rimuovere i batteri strettamente legati tramite sonicazione e determinarne il numero.