La spettrometria di massa di imaging (MSI) fornisce informazioni non mirata molecolare con la più alta specificità e la risoluzione spaziale per studiare i tessuti biologici presso le centinaia a decine di scala micron. Quando eseguito in condizioni ambiente, pretrattamento del campione diventa inutile, semplificando così il protocollo mantenendo l'elevata qualità delle informazioni ottenute. Desorbimento ionizzazione elettrospray (DESI) è una tecnica MSI ambient spruzzo-based che consente il campionamento diretto di superfici all'aperto, anche in vivo. Quando utilizzato con una fase campione comandato da software, il campione viene rastered sotto la sonda di ionizzazione DESI, e attraverso il dominio del tempo, m / z informazione è correlata con la specie chimica 'distribuzione spaziale. La fedeltà dell'uscita DESI-MSI dipende dall'orientamento sorgente e posizionamento rispetto alla superficie del campione e l'ingresso spettrometro di massa. Qui, esaminiamo come preparare sezioni di tessuto per DESI iMAGING e condizioni sperimentali aggiuntive che influenzano direttamente la qualità dell'immagine. In particolare, si descrive il protocollo per l'imaging di sezioni di tessuto cerebrale di ratto da DESI-MSI.