Come membro del phylum Cnidaria, il gruppo gemello di tutti i bilateriani, Hydra può far luce sui processi biologici fondamentali condivisi tra gli animali pluricellulari. Hydra è usato come modello per lo studio della rigenerazione, della formazione di modelli e delle cellule staminali. Tuttavia, gli sforzi della ricerca sono stati ostacolati dalla mancanza di un metodo affidabile per le perturbazioni geniche per studiare la funzione molecolare. Lo sviluppo di metodi transgenici ha rivitalizzato lo studio della biologia dell'idra 1. Le idre transgeniche consentono il tracciamento di cellule vive, lo smistamento per produrre popolazioni cellulari pure per l'analisi biochimica, la manipolazione della funzione genica mediante knockdown e sovraespressione e l'analisi della funzione del promotore. Il DNA plasmidico iniettato negli embrioni in fase iniziale si integra casualmente nel genoma all'inizio dello sviluppo. Ciò si traduce in piccoli che esprimono transgeni in chiazze di tessuto in uno o più dei tre lignaggi (epiteliale ectodermico, epiteliale endodermico o interstiziale). Il tasso di successo nell'ottenere un cucciolo con tessuto transgenico è compreso tra il 10% e il 20%. La propagazione asessuata del cucciolo transgenico viene utilizzata per stabilire una linea uniformemente transgenica in un particolare lignaggio. Generare Hydra transgenico è sorprendentemente semplice e robusto, e qui descriviamo un protocollo che può essere facilmente implementato a basso costo.