Gli studi per comprendere la trasmissione interspecie delle encefalopatie spongiformi trasmissibili (TSE, malattie da prioni) sono impegnativi in quanto in genere si basano su lunghi e costosi studi di provocazione animale in vivo. Sono stati sviluppati numerosi saggi in vitro per aiutare a misurare le barriere tra le specie di prioni, riducendo così l'uso da parte degli animali e fornendo risultati più rapidi rispetto ai biotest sugli animali. Qui, presentiamo il protocollo per un test di conversione rapida dei prioni in vitro chiamato test del rapporto di efficienza di conversione (CER). In questo saggio, la proteina prionica cellulare (PrPC) proveniente da un cervello ospite non infetto viene denaturata sia a pH 7,4 che a 3,5 per produrre due substrati. Quando il substrato a pH 7,4 viene incubato con l'agente TSE, la quantità di PrPC che si converte in uno stato resistente alla proteinasi K (PK) viene modulata dalla barriera della specie dell'ospite originale all'agente TSE. Al contrario, la PrPC nel substrato a pH 3,5 è mal ripiegata da qualsiasi agente TSE. Confrontando la quantità di proteina prionica resistente alla PK nei due substrati, è possibile effettuare una valutazione della barriera di specie dell'ospite. Mostriamo che il test CER predice correttamente le barriere note tra le specie di prioni dei topi di laboratorio e, ad esempio, mostriamo alcuni risultati preliminari che suggeriscono che le linci rosse (Lynx rufus) possono essere suscettibili all'agente della malattia del deperimento cronico del cervo dalla coda bianca (Odocoileus virginianus).