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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo protocollo dettagliato fornisce una descrizione dettagliata della messa a punto sperimentale e analisi dei dati per la valutazione delle risposte infiammatorie in hiPSC-ECs e l'analisi di adesione del leucocita sotto flusso fisiologico.
Le cellule endoteliali (ECs) sono essenziali per la regolazione delle risposte infiammatorie sia limitando o facilitare il reclutamento leucocitario in tessuti colpiti tramite una cascata ben caratterizzata dei recettori pro-adesivo che sono sovraregolati sul superficie di cellule leucocitarie al momento il grilletto infiammatoria. Le risposte infiammatorie differiscono tra gli individui nella popolazione e il background genetico può contribuire a queste differenze. Cellule staminali umane pluripotenti indotte (hiPSCs) hanno dimostrate di essere una fonte affidabile di ECs (hiPSC-ECs), rappresentando così una fonte illimitata di cellule che catturano l'identità genetica ed eventuali varianti genetiche o mutazioni del donatore. hiPSC-ECs pertanto può essere utilizzato per modellare le risposte infiammatorie in cellule di donatore-specific. Le risposte infiammatorie possono essere modellate determinando l'adesione del leucocita hiPSC-ECS sotto flusso fisiologico. Questo protocollo dettagliato fornisce una descrizione dettagliata della messa a punto sperimentale e analisi dei dati per la valutazione delle risposte infiammatorie in hiPSC-ECs e l'analisi di adesione del leucocita sotto flusso fisiologico.
L'infiammazione svolge un ruolo fondamentale in molte patologie, tra cui cardiovascolari e patologie neurodegenerative, sepsi e risposte avverse al farmaco (ADR). Le cellule endoteliali (ECs) svolgono un ruolo essenziale nella regolazione della risposta infiammatoria attraverso l'induzione di pro-adesivo recettori, quali E-selectina, intercellulare di adesione molecule-1 (ICAM-1) e vascolare delle cellule adesione molecule-1 (VCAM-1) sulla loro superficie 1 , 2. ECs microvascolare in tessuti differenti sono noti per presentano eterogeneità nelle risposte infiammatorie3,4. Inoltre, il background genetico o certe condizioni genetiche potrebbero comportare le differenze nelle risposte infiammatorie tra individui; Pertanto è importante avere accesso a ECs da individui diversi. Più recentemente, umane pluripotenti indotte cellule staminali (hiPSCs)5, che possono essere derivate da praticamente qualsiasi individuo, sono stati indicati per servire come una fonte affidabile e rinnovabile di ECs6,7,8, 9. Pertanto, la valutazione delle risposte infiammatorie e reclutamento leucocitario in hiPSC-ECs è preziosa, non solo per la modellazione di alcune malattie genetiche, ma anche a fornire indicazioni della variabilità inter-individuale e da utilizzare come uno strumento per in futuro la medicina personalizzata.
Analisi di flusso forniscono uno strumento utile per studiare l'interazione leucocita-endoteliali. Advances in dispositivi microfluidici consente la riproduzione di condizioni di flusso del fluido fisiologico con un controllo preciso dei livelli di sollecitazione di taglio specifiche del letto vascolare. Live imaging consente il monitoraggio della cascata di eventi di acquisizione del leucocita, rotolamento, strisciando, adesione e trasmigrazione. Sono stati sviluppati diversi saggi di flusso per studiare l'interazione leucocita-endoteliali, tuttavia, utilizzano primaria ECs10,11,12,13. Qui, descriviamo in dettaglio il test per la valutazione di adesione del leucocita umano hiPSC-ECS sotto flusso fisiologico. In questa procedura, si descrivono condizioni ottimizzate di stimolazione hiPSC-CE con stimoli pro-infiammatori, come il fattore di necrosi tumorale alfa (TNFα), dissociazione, semina in un chip microfluidico con otto canali paralleli. Descriviamo un protocollo passo-passo per la perfusione di hiPSC-ECs con la sospensione di leucociti fluorescente contrassegnati nel chip microfluidici, cella immagini dal vivo e automatizzato di conteggio dei leucociti aderenti.
Questo protocollo è utile per la valutazione delle risposte infiammatorie in hiPSC-ECs in screening di stupefacenti, modellazione di malattia e medicina rigenerativa personalizzata.
1. preparazione di soluzioni e reagenti
2. rivestimento di Microfluidic chip
3. preparazione del hiPSC-ECs
Nota: Nel protocollo descritto qui, hiPSC-ECs erano differenziati, purificata, crioconservati e scongelato come descritto in precedenza8.
4. hiPSC-ECs dissociazione e il Seeding in Chip microfluidico
5. preparazione dei leucociti umani
Nota: Nel protocollo descritto qui, una linea cellulare monocytic commercialmente disponibile (THP-1) è stata utilizzata. In alternativa, possono essere utilizzati cellule mononucleari del sangue periferico o neutrofili. Isolamento dei monociti del sangue periferico e dei neutrofili può essere eseguita utilizzando la procedura standard11. Eseguire tutti i passaggi descritti in questo paragrafo in una cappa di cultura cellulare.
6. preparazione della pompa microfluidica
7. preparazione del Chip microfluidici per Live Imaging
8. flusso di analisi di adesione e acquisizione immagini
9. completare il test e pulizia della pompa di microfluidica
10. conteggio dei leucociti aderenti
In primo luogo, la risposta di hiPSC-ECs alla stimolazione con agente pro-infiammatorio TNFα dovrebbero essere esaminati, come descritto in precedenza7. Trattamento di TNFα per 12 h innesca il upregulation di E-selectin con il picco a 6 h dopo l'inizio del trattamento. Inoltre, ICAM-1 è upregulated 6-12 h post-trattamento. Anche se non abbiamo osservato il upregulation previsto di VCAM-1, si osserva tipicamente in cellule endoteliali di vena ombelicale umana primaria (HUVECs). Abbiamo trovato il trattamento di TNFα (12 h) durante la notte per essere la più conveniente per l'analisi di adesione del leucocita.
Dissociazione hiPSC-ECs ottimale dovrebbe comportare una sospensione unicellulare gratuita dei cespi di cella. Figura 2 illustra la densità ottimale hiPSC-CE subito dopo l'iniezione. In genere, 15 minuti dopo l'iniezione, hiPSC-ECs fissare alla parte inferiore del canale e iniziare a diffondere (Figura 2D). 1 h dopo l'iniezione, hiPSC-ECs formano un monostrato ben diffuso lungo il canale e sarà pronto per iniziare l'analisi di flusso (Figura 2E).
Etichettatura dei leucociti con tracciante fluorescente è vantaggioso per fase immagini di contrasto in automatizzato quantificazione di immagine, in quanto facilita il passaggio di identificazione delle cellule, soprattutto perché i leucociti rispettano il monostrato di cellule endoteliali e spesso è difficile per software di distinguere diversi tipi di cellule.
Gratis software di elaborazione di immagini open source sono molto utile per la quantificazione automatizzata dei leucociti aderenti. La pipeline descritta nel protocollo qui è basata sull'identificazione di oggetto primario utilizzando Sogliatura adattiva delle immagini fluorescenti dei leucociti (Figura 4A). Filtraggio di oggetti basati su un'area minima inoltre identificati Filtra oggetti falsamente identificati, come detriti cellulari, autofluorescenza o qualsiasi altro non-specifico segnale fluorescente (Figura 4 C, D).
Un chip microfluidico con otto canali paralleli permette il confronto di due gruppi indipendenti, per esempio, ECs differenziati da hiPSCs indipendente, come donatori sani o pazienti con i disordini genetici. Ulteriori controlli, ad esempio ECs non trattata o pre-trattamento con un anticorpo blocco di ICAM-1 possono essere inclusi come ben10,11. Due o tre chip microfluidici possono essere elaborati in un momento. Per la robustezza delle conclusioni, si consiglia un minimo di tre esperimenti biologici indipendenti eseguite su giorni indipendente.

Figura 1 : Preparazione di hiPSC-ECs e leucociti per il dosaggio di flusso. (A) pre-trattamento di hiPSC-ECs con lo stimolo pro-infiammatorio (TNFα). (B) rappresentazione schematica della dissociazione enzimatica hiPSC-ECs, centrifugazione e risospensione. (C) rappresentazione schematica di rivestimento dei canali (C, a sinistra), iniezione della sospensione hiPSC-CE (C, medio) e aggiunta di terreno di coltura dopo hiPSC-ECs allegato nel chip microfluidici di cella. (D) rappresentazione schematica della fase di lavaggio del leucocita, etichettatura con colorante fluorescente DiOC6 e risospensione. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2 : Chip microfluidico con hiPSC-ECs. (A) Microfluidic chip un 10cm di Petri. (B) la camera umidificata utilizzata per l'incubazione. (C, D, E) Immagini rappresentative di hiPSC-ECs nella microfluidica canale 0 min (C), 15 min (D), 1 h (E) dopo l'iniezione. Barra della scala = 200 µm. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3 : Messa a punto sperimentale del dosaggio live cell imaging e del leucocita aspersione. (A, B) Foto (A) e schematica rappresentazione (B) dell'apparato sperimentale del dosaggio live cell imaging e flusso: pompa di microfluidica - microscopio fluorescente invertito con montato dal vivo imaging camera (5% CO2, 37 ° C, umidificare), (2) - (1), (3) - 8 canali collettore, (4) - PC per l'acquisizione di controllo e immagine di microscopio, (5) - PC per controllo pompa microfluidica. (C) Microfluidic chip con il tubo inserito del collettore 8 canali fissi in un portatarga e montato nella fase motorizzata del microscopio. (D) rappresentazione schematica delle fasi principali dell'analisi di flusso. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4 : Analisi dell'immagine e il rilevamento automatico dei leucociti aderenti. (A) la finestra di dialogo del software con le impostazioni specificate per l'identificazione dei leucociti di elaborazione delle immagini. (B), la finestra di dialogo del software di elaborazione immagine con i filtri specificati criteri di oggetti identificati sulla base minimamente accettano superficie (SAmin = 70 px). (C) esempio di corretta identificazione dei leucociti e filtraggio di oggetti non specifici della piccola superficie (SA) (diametro tipico pixel (Min, Max) = (9, 15); Filtraggio criteri SAmin = 70 px). Oggetti accettati sono raffigurati in verde e oggetti di scarto sono raffigurati in viola. (D) esempio di errata identificazione dei leucociti a causa della non corretta gamma di diametro tipico (diametro tipico pixel (Min, Max) = (3, 15); Filtraggio criteri SAmin = 70 px). Oggetti accettati sono raffigurati in verde e oggetti di scarto sono raffigurati in viola. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla a rivelare.
Questo protocollo dettagliato fornisce una descrizione dettagliata della messa a punto sperimentale e analisi dei dati per la valutazione delle risposte infiammatorie in hiPSC-ECs e l'analisi di adesione del leucocita sotto flusso fisiologico.
Gli autori si desidera ringraziare le seguenti sovvenzioni: Consiglio europeo della ricerca (ERCAdG 323182 STEMCARDIOVASC); Paesi Bassi organo-on-Chip iniziativa, un progetto di gravitazione NWO finanziato dal Ministero dell'istruzione, della cultura e della scienza del governo dei Paesi Bassi (024.003.001).
| Vena8 Endothelial+ biochip | Cellix Ltd | V8EP-800-120-02P10 | |
| Mirus Evo Nanopump | Cellix Ltd | MIRUS-EVO-PUMP | 1 x pompa a siringa; 1 x VenaFluxAssay Software; 1 x kit di tubi; Alimentatore e cavi . |
| Collettore 8 canali MultiFlow8 | Cellix Ltd | MIRUS-MULTIFLOW8 | |
| Scatola umidificata | Cellix Ltd | HUMID-BOX | |
| Sistema di imaging a fluorescenza Leica AF6000 | Leica Microsystems | ||
| Dispositivo di moltiplicazione elettronica ad accoppiamento di carica Fotocamera | Hamamatsu | C9100 | |
| Cabina di sicurezza biologica/cappa a flusso laminare | Cleanair | ||
| Incubatore per colture cellulari CO2 | Panasonic | MCO-170AICUV | |
| Centrifuga | Hitachi | himac-CT6EL | |
| pipettatore portatile (P-10 (10 mL), P-200 (200 &; L), P-1000 (1.000 µ L) | Gilson international | 4807 (10µ l), 4810 (200µ l), 4809 (1000µ l) | |
| Pipetta sterile in plastica | Greiner Bio-One | 606180 (5ml), 607180 (10ml) | |
| Piastra di Petri | VWR/ Duran Group | 391-0860 | |
| Palloni di coltura (75 cm2) | CELLSTAR | 658,170 | |
| Provetta da centrifuga (15 mL) | CELLSTAR | 188271 | |
| Name | Azienda | Numero di catalogo | Comments |
| Gelatina da pelle suina, tipo A | Sigma-Aldrich | G1890 | |
| Fibronectina (plasma bovino) | Sigma-Aldrich | F1141 | |
| DPBS, senza calcio, senza magnesio | Life Technologies | 14190-169 | |
| Human Endothelial-SFM | Life Tecnologie | 11111-044 | |
| VEGF umano 165 IS, | Miltenyi Biotec | di qualità premium130-109-386 | |
| FGF-2 umano, | Miltenyi Biotec | di qualità premium130-093-842 | |
| Siero derivato dal plasma povero di piastrine, bovino | Biomedical Technologies | BT-214 | |
| TNF umano ricombinante-&alfa; | Tebu-bio | 300-01A-A | |
| TrypLE Select | Life Technologies | 12563029 | |
| DiOC6(3) | Sigma-Aldrich | 318426 | |
| RPMI 1640 Medium | Life Technologies | 21875-034 | |
| 2-Mercaptoetanolo (50 mM) | Life Technologies | 31350010 | |
| FBS | Life Technologies | 10270-106 | |
| L-glutammina | Life Technologies | 25030-024 | |
| Penicillina-streptomicina (5.000 U/mL) | Life Technologies | 15070-063 | |
| Acqua distillata | Life Technologies | 15230-089 | |
| Etanolo assoluto | Merck | 1.00983.2500 | |
| VCAM-1 | R& Sistemi D | FAB5649P | |
| E-Selectin | R& D systems | BBA21 | |
| ICAM-1 | R& D systems | BBA20 | |
| Nome | Azienda | Versione software | Comments |
| Cellrofiler | CellProfiler | 2.1.1 | |
| VenaFluxAssay Software | Cellix Ltd | 2.3.a |