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Articolo metodologico

Auustofori microfluidica per la separazione flowthrough di batteri Gram-negativi utilizzando perline di affinità aptamero

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DOI:

10.3791/63300

17 ottobre 2022

In questo articolo

Sommario

Questo articolo descrive la fabbricazione e il funzionamento di chip acustoforetici microfluidici utilizzando la tecnica dell'acoustophoresis microfluidica e microsfere modificate con aptamero che possono essere utilizzate per un isolamento rapido ed efficiente di batteri Gram-negativi da un mezzo.

Abstract

Questo articolo descrive la fabbricazione e il funzionamento di chip acustoforetici microfluidici utilizzando una tecnica di acoustophoresis microfluidica e microsfere modificate con aptamero che possono essere utilizzate per l'isolamento rapido ed efficiente di batteri Gram-negativi da un mezzo. Questo metodo migliora l'efficienza di separazione utilizzando un mix di microcanali lunghi e quadrati. In questo sistema, il campione e il buffer vengono iniettati nella porta di ingresso attraverso un regolatore di flusso. Per il centraggio delle sfere e la separazione del campione, l'alimentazione CA viene applicata al trasduttore piezoelettrico tramite un generatore di funzioni con un amplificatore di potenza per generare forza di radiazione acustica nel microcanale. C'è un canale biforcato sia all'ingresso che all'uscita, consentendo la separazione, la purificazione e la concentrazione simultanee. Il dispositivo ha un tasso di recupero del >98% e una purezza del 97,8% fino a una concentrazione di dose 10x. Questo studio ha dimostrato un tasso di recupero e una purezza superiori ai metodi esistenti per separare i batteri, suggerendo che il dispositivo può separare i batteri in modo efficiente.

Introduzione

Sono in fase di sviluppo piattaforme microfluidiche per isolare batteri da campioni medici e ambientali, oltre a metodi basati su trasferimento dielettrico, magnetoforesi, estrazione di perline, filtraggio, microfluidica centrifuga ed effetti inerziali e onde acustiche superficiali 1,2. La rilevazione di batteri patogeni viene continuata utilizzando la reazione a catena della polimerasi (PCR), ma di solito è laboriosa, complessa e richiede tempo 3,4. I sistemi di acoustophoresis microfluidica sono un'alternativa per affrontare questo problema attravers....

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Protocollo

1. Progettazione di chip di acoustophoresis microfluidica

NOTA: La Figura 1 mostra uno schema della separazione e della raccolta delle microsfere target dai microcanali mediante acustoforesi. Il chip di acoustophoresis microfluidica è progettato con un programma CAD.

  1. Progettare un chip di acoustophoresis microfluidica che utilizza una miscela di perle modificate con aptamero e perle di polistirene (PS) rivestite di streptavidina corrispondenti alle dimensioni dei batteri per studiare le prestazioni di separazione del dispositivo.
  2. Progettare un chip di acoustophoresis microfl....

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Risultati

La figura 5 mostra l'immagine del flusso del tallone in funzione della tensione PZT (OFF, 0,1 V, 0,5 V, 5 V). Nel caso del chip acustoforetico introdotto in questo studio, è stato confermato che all'aumentare della tensione del PZT, la concentrazione centrale delle perle di dimensioni 10 μm è aumentata. La maggior parte delle perle di dimensioni 10 μm erano concentrate al centro a 5 V della tensione PZT. Attraverso questo risultato, è stata generata una frequenza di risonanza di 3,66 MHz in .......

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Discussione

Abbiamo sviluppato un dispositivo microfluidico a levitazione sonica per catturare e trasferire i batteri GN da campioni di coltura ad alta velocità basato su un metodo di funzionamento continuo in base alle loro dimensioni e tipo e microsfere modificate con aptamero. Il microcanale lungo e quadrato consente una progettazione più semplice e una maggiore efficienza in termini di costi per l'acoustophoresis 2D rispetto a 20,21,22,23,24,25,26 precedentemente riportati.

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Dichiarazioni

Gli autori non hanno conflitti di interesse da rivelare.

Ringraziamenti

Questo lavoro è stato sostenuto dalla sovvenzione della National Research Foundation of Korea (NRF) finanziata dal governo coreano (Ministero della Scienza e delle TIC). (No. NRF-2021R1A2C1011380)

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
1 µ m microsfere di polistireneBang LaboratoriesPS04001Perline di dimensione delle celle
10 & micro; m Microsfere rivestite di streptavidinaBang LaboratoriesCP01007Perle di affinità Aptamero
Wafer di silicio da 4 pollici / stampo SU-84science29-03573-01Componenti del chip
AptameroTecnologie DNA integrateGN3-6'RNAper la coniugazione dei batteri
Vetro borosilicatoSchottBOROFLOAT 33Componenti della
centrifugaDaihanCF-10Spreco di particelle
Colla cianoacrilica3MAD100Attacca PZT al microchip
Escherichia coli DH5αKCTCKCTC2571Batteri bersaglio
Generatore funzionaleGW InstekAFG-2225Genera
frequenza Telecamera ad alta velocitàPhotronFASTCAM MiniOsservazione della separazione
Piastra riscaldanteCome unoHI-1000Piastra riscaldante per la polimerizzazione di liquidi PDMS
KOVAX-SIRINGA 10 mL SiringaKoreavaccine22G-10MLRiempire il canale dell'acustoforesi microfluidica con acqua demineralizzata priva di bolle.
Polidimetilsilossano liquido, PDMSDow Corning Inc.Sylgard 184Componenti del chip
LB Brodo MillerBD Difco244620Coltura cellulare (terreno Luria-Bertani)
MicroscopioOlympus Corp.IX-81Osservazione della separazione
tampone PBSCapricorn scientificPBS-1APerdita di batteri
Tubi in PEEKSaint-Gobain Ppl Corp.AAD04103Iniettare o raccogliere particelle
Trasduttore piezoelettricoFuji CeramicsC-213Generare un'onda specifica nel canale
Amplificatorepotenza Ricerca75A250AAmplificare la frequenza
Regolatore di pressione/μ fluconAMEDAMED-μ fluconControllo del regolatore di pressione/flusso dell'aria
Tampone Tris-HCl15567027Dispersione di particelle
Rotatore a tuboSeouLin BioscienceSLRM-3Modificatore di aptamero e perlina
per chip di amplificatore

Riferimenti

  1. Wu, M., et al. Acoustofluidic separation of cells and particles. Microsystem & Nanoengineering. 5 (1), 1-18 (2019).
  2. Lee, S. W., et al. Aptamer affinity-bead mediated capture and displacement of Gram-negative bacteria using acous....

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Ristampe e permessi

Tag

Separazione battericaChip microfluidicoForza di radiazione acusticaMicrosfere rivestite di streptavidinaMicroscopia a fluorescenzaControllore di pressioneRilevazione di biomarcatori batterici