Articolo metodologico

Arricchimento di vescicole extracellulari derivate da astrociti da plasma umano

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DOI:

10.3791/64107

3 agosto 2022

In questo articolo

Sommario

Questo protocollo descrive l'arricchimento di vescicole extracellulari derivate da astrociti (ADEV) dal plasma umano. Si basa sulla separazione delle vescicole extracellulari mediante precipitazione polimerica, seguita dall'immunocattura degli ADEV basata su ACSA-1. L'analisi degli ADEV può offrire indizi per studiare i cambiamenti nelle vie infiammatorie dei pazienti viventi, in modo non invasivo mediante biopsia liquida.

Abstract

Le vescicole extracellulari (EV) sono nanoparticelle biologiche secrete da tutte le cellule per la comunicazione cellulare e l'eliminazione dei rifiuti. Partecipano a una vasta gamma di funzioni agendo e trasferendo i loro carichi ad altre cellule in condizioni fisiologiche e patologiche. Data la loro presenza nei biofluidi, le vescicole extracellulari rappresentano un'ottima risorsa per lo studio dei processi patologici e possono essere considerate una biopsia liquida per la scoperta di biomarcatori. Un aspetto interessante dell'analisi delle vescicole extracellulari è che possono essere selezionate in base ai marcatori della loro cellula di origine, riflettendo così l'ambiente di un tessuto specifico nel loro carico. Tuttavia, uno dei principali svantaggi legati ai metodi di isolamento delle vescicole extracellulari è la mancanza di consensi metodologici e protocolli standardizzati. Gli astrociti sono cellule gliali con ruoli essenziali nel cervello. Nelle malattie neurodegenerative, la reattività degli astrociti può portare a un'alterazione del carico di EV e a una comunicazione cellulare aberrante, facilitando/migliorando la progressione della malattia. Pertanto, l'analisi delle vescicole extracellulari degli astrociti può portare alla scoperta di biomarcatori e potenziali bersagli della malattia. Questo protocollo descrive un metodo in 2 fasi per l'arricchimento di EV derivate da astrociti (ADEV) da plasma umano. In primo luogo, le vescicole extracellulari sono arricchite da plasma defibrinato tramite precipitazione a base di polimeri. Segue l'arricchimento degli ADEV attraverso l'immunocattura basata su ACSA-1 con microsfere magnetiche, in cui le EV risospese vengono caricate su una colonna posta in un campo magnetico. Le EV ACSA-1+ marcate magneticamente sono trattenute all'interno della colonna, mentre altre EV fluiscono attraverso. Una volta rimossa la colonna dal magnete, gli ADEV vengono eluiti e sono pronti per la conservazione e l'analisi. Per convalidare l'arricchimento dei marcatori astrocitari, la proteina acida fibrillare gliale (GFAP), o altri marcatori astrocitici specifici di origine intracellulare, possono essere misurati nell'eluato e confrontati con il flow-through. Questo protocollo propone un metodo semplice ed efficiente in termini di tempo per arricchire gli ADEV dal plasma che può essere utilizzato come piattaforma per esaminare i marcatori rilevanti per gli astrociti.

Introduzione

Le vescicole extracellulari (EV) sono un gruppo eterogeneo di nanoparticelle membranose secrete da tutti i tipi di cellule, che trasportano proteine, lipidi e acidi nucleici1. Le microvescicole (100-1000 nm), gli esosomi (30-100 nm) e i corpi apoptotici (1000-5000 nm) costituiscono i principali tipi di EV, distinti dal loro sito di origine 2,3. Le vescicole extracellulari regolano importanti processi fisiologici, come la presentazione dell'antigene e le risposte immunitarie4, il riciclo dei recettori, l'eliminazione dei metabolit....

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Protocollo

La ricerca descritta in questo protocollo è stata condotta con campioni di plasma umano provenienti da donatori adulti sani di entrambi i sessi (fascia di età 65,9-81,3 anni, 45,5% femmine), provenienti dalla coorte Sant Pau Initiative on Neurodegeneration (SPIN), Barcellona, Spagna36. I partecipanti hanno dato il consenso informato. Lo studio è stato condotto seguendo le linee guida etiche internazionali per la ricerca medica contenute nella dichiarazione di Helsinki e nella legge spagnola. Il Comitato Etico per la Ricerca di Sant Pau (CEIC) ha esaminato e approvato il protocollo per la raccolta e la conservazione di campioni di plasma umano d....

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Risultati

L'isolamento degli ADEV dal plasma raccolto da donatori sani è stato realizzato con successo. Per ottenere la frazione EV totale è stato impiegato un metodo di precipitazione a base di polimeri, seguito da un'immunocattura con microsfere magnetiche per ottenere ADEV.

L'analisi Western blot della frazione EV totale prima della fase di immunocattura ha indicato la mancanza di calnexina (marcatore di contaminazione cellulare) e la presenza di Alix e della proteina transmembrana CD9 nelle preparaz.......

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Discussione

Le vescicole extracellulari hanno suscitato un forte interesse nella ricerca biomedica grazie al loro potenziale diagnostico e terapeutico. Attualmente, uno dei principali svantaggi legati ai metodi di isolamento delle vescicole extracellulari è la mancanza di consenso metodologico e di protocolli standardizzati. Questo studio fornisce un protocollo dettagliato per l'arricchimento delle vescicole extracellulari degli astrociti dal plasma umano tramite precipitazione a base di po.......

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Dichiarazioni

Il Dr. Belbin ha riferito di aver ricevuto compensi personali da ADx NeuroSciences al di fuori del lavoro presentato. Il Dr. Alcolea ha riferito di aver ricevuto compensi personali per servizi di advisory board e/o onorari di relatori da Fujirebio-Europe, Roche, Nurtricia, Krka Farmacéutica, Zambon S.A.U. ed Esteve al di fuori del lavoro presentato. Il Dr. Lleó ha lavorato come consulente o presso comitati consultivi per Fujirebio-Europe, Roche, Biogen, Grifols e Nutricia al di fuori del lavoro presentato. Il Dr. Fortea ha riferito di aver ricevuto compensi personali per il servizio nei comitati consultivi, nei comitati di aggiudicazione o negli onorari dei relatori da AC Immune, Novartis, Lundbeck, Roche, Fujirebio e Biogen al di fuori del lavoro presentato. I dottori Alcolea, Belbin, LLeó e Fortea riferiscono di essere in possesso di un brevetto per marcatori di sinaptopatia nelle malattie neurodegenerative (concesso in licenza ad ADx, EPI8382175.0). Non sono state segnalate altre divulgazioni. Tutti gli altri autori non hanno nient'altro da rivelare.

Ringraziamenti

Gli autori desiderano ringraziare Soraya Torres, Shaimaa El Bounasri El Bennadi e Oriol Sanchez Lopez per la gestione e la preparazione dei campioni. Ringraziamo anche José Amable Bernabé, dell'ICTS "NANBIOSIS", unità 6 (Unità del CIBER in Bioingineering, Biomateriali e Nanomedicina) dell'Istituto di Scienza dei Materiali di Barcellona, Marti de Cabo Jaume dell'Unità di Microscopia Elettronica dell'Universitat Autonoma de Barcelona, la Dott.ssa Marta Soler Castany e Lia Ros Blanco della Piattaforma di Citometria a Flusso dell'Istituto di Ricerca Biomedica Sant Pau (IIB-Sant Pau), così come la dottoressa Joan Carles Escolà-Gil del gru....

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Materiali

Elenco dei materiali utilizzati in questo articolo
NomeAziendaNumero di catalogoCommenti
Anticorpo primario anti-Alix per Western blottingEMD MilliporeABC40
µ Separatore MACSMiltenyi Biotec130-042-602Il µ Il separatore MACS viene utilizzato in combinazione con µ Colonne e microsfere MACS.
Anticorpo primario anti-calnexina per Western blottingGenetexGTX109669
Anticorpo primario anti-CD9 per Western blottingSegnalazione cellulare13174
Blocker BSA (10%) 200 mLThermo Fisher37525
Bransonic 1510E-MT Bagno ad ultrasuoniAutoanalizzatore Branson
COBAS 6000Roche DiagnosticsAnalizzatore per la determinazione immunoturbidimetrica di ApoB; autoanalizzatore commerciale
cOmplete Cocktail di inibitori della proteasi (senza EDTA)Roche11873580001
Digital Micrograph 1.8 software per micrografie
Dulbecco's PBS Mg++, Ca++ free 500 mLThermo Fisher14190144
EveryBlot Blocking BufferBioRad12010020
Exoquick (soluzione di precipitazione dell'esosoma 5 mL) + Trombina System BioscienceEXOQ5TM-1ExoQuick 20 mL può essere acquistato anche (EXOQ20A-1)
Gatan 895 USC 4000 sistema
imaging per chemiluminescenza GeneGnome XRQSyngene
Antigene umano CD81 (CD81) Kit ELISACusabioCSB-EL004960HU
Morte cellulare programmata umana 6-interagente proteina (PDCD6IP) Kit ELISACusabioCSB-EL017673HU
Immun-Blot PVDF MembranaBioRad1620177
Microscopio elettronico a trasmissione JEOL 2011JEOL LTDDotato di  una telecamera CCD Gatan 895 USC 4000 (Gatan 626, Gatan, Pleasanton, Stati Uniti)
Lavanda EDTA BD Vacutainer K2E tubiBecton dickinson367525
Leica EM GP Congelatore ad immersione commercialeLeica Microsystem
Microprovette a basso legame 1,5 mLDeltalab4092.3NS
MACS µ Colonne con pistoni Miltenyi Biotec130-110-905µ Le colonne con pistoni sono progettate appositamente per l'isolamento di esosomi dai fluidi corporei
MACS MultistandMiltenyi Biotec130-042-303
Lettore di piastre MAGPIXLuminex Corporation80-073Unità di multiplexing xMAP di Luminex (software Luminex xPonent v 4.3)
MicroBead Kit100 μ L Anti-GLAST (ACSA-1)-Biotina, uomo, topo, ratto – di piccole dimensioni; 100 μ L Microsfere anti-biotinaMiltenyi Biotec130-095-825
Kit MAP MILLIPLEX Pannello citochine/chemochine/fattore di crescita umano Pannello A di perline magneticheEMD MilliporeHCYTA-60K-25
M-PER Reagente per l'estrazione di proteine di mammifero 25 mLThermo Fisher78503Per alcune applicazioni come il Western blot, è possibile utilizzare tamponi di lisi più aggressivi (ad es. RIPA)
MultiSkan SkyHigh Spettrofotometro per micropiastreThermofisherA51119500C
NanoSight NS300Malvern PanalyticalNTA; versione 3.4
Pierce Halt Cocktail di inibitori della proteasi e della fosfatasi ThermoFisher78441
Siringa in polipropilene (G29)PeroxFarmasiringa da 1 ml; 0,33x12mm-G29x1/2"
Anti-coniglio secondario anticorpoThermo Fisher10794347
Simoa GFAP Discovery KitQuanterix102336
Simoa, strumento SR-Xrilevamento di biomarcatori ultrasensibili Quanterix SR-X; tecnologia di rilevamento di biomarcatori commerciale Test di
West FemtoThermo Fisher34095Substrato HRP chemiluminescente avanzato (ECL) ultrasensibile 
Sistema di trasferimento turbo Trans-BlotBioRad1704150
di Sistema di proteine specifiche Apolipoproteina B - APOB (100 det) COBAS C/CI Roche Diagnostics 3032574122 SuperSignal

Riferimenti

  1. Pathan, M., et al. Vesiclepedia 2019: a compendium of RNA, proteins, lipids and metabolites in extracellular vesicles. Nucleic Acids Research. 47, 516-519 (2019).
  2. Raposo, G., Stoorvogel, W. Extracellular vesicles: Exo....

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Vescicole extracellulari degli astrocitiarricchimento di EVprecipitazione polimericaimmunocatturamicroperle magnetichemarcatore ACSA 1proteina gliale fibrillare acidabiopsia liquida
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