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Research Article
Rachel Iritani1, Tiphaine Belloir1, Devon J. Griggs2, Zachary Ip1, Zada Anderson3, Azadeh Yazdan-Shahmorad1,2
1Department of Bioengineering, Washington National Primate Research Center,University of Washington, 2Department of Electrical and Computer Engineering, Washington National Primate Research Center,University of Washington, 3Department of Biomedical Engineering,Purdue University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo documento delinea i processi automatizzati per la pianificazione neurochirurgica dei primati non umani basata su scansioni di risonanza magnetica (MRI). Queste tecniche utilizzano passaggi procedurali nella programmazione e nelle piattaforme di progettazione per supportare la progettazione di impianti personalizzati per NHP. La validità di ogni componente può quindi essere confermata utilizzando modelli anatomici tridimensionali (3D) stampati a grandezza naturale.
Questo documento descrive un metodo interno di modellazione 3D del cervello e del cranio dalla risonanza magnetica (MRI) su misura per la pianificazione neurochirurgica dei primati non umani (NHP). Questa tecnica automatizzata e computazionale basata su software fornisce un modo efficiente per estrarre le caratteristiche del cervello e del cranio dai file di risonanza magnetica rispetto alle tradizionali tecniche di estrazione manuale che utilizzano software di imaging. Inoltre, la procedura fornisce un metodo per visualizzare il cervello e il cranio craniotomizzato insieme per una pianificazione chirurgica intuitiva e virtuale. Questo genera una drastica riduzione di tempo e risorse rispetto a quelle richieste dal lavoro passato, che si basava sulla stampa 3D iterativa. Il processo di modellazione del cranio crea un'impronta che viene esportata nel software di modellazione per progettare camere craniche e copricapi su misura per l'impianto chirurgico. Gli impianti chirurgici su misura riducono al minimo gli spazi tra l'impianto e il cranio che potrebbero introdurre complicazioni, tra cui infezioni o diminuzione della stabilità. Implementando queste fasi pre-chirurgiche, si riducono le complicanze chirurgiche e sperimentali. Queste tecniche possono essere adattate ad altri processi chirurgici, facilitando una pianificazione sperimentale più efficiente ed efficace per i ricercatori e, potenzialmente, i neurochirurghi.
I primati non umani (NHP) sono modelli inestimabili per la ricerca medica traslazionale perché sono evolutivamente e comportamentalmente simili agli esseri umani. Gli NHP hanno acquisito particolare importanza negli studi preclinici di ingegneria neurale perché i loro cervelli sono modelli altamente rilevanti della funzione e della disfunzione neurale1,2,3,4,5,6,7,8. Alcune potenti tecniche di stimolazione e registrazione del cervello, come l'optogenetica, l'imaging del calcio e altre, sono meglio servite con l'accesso diretto al cervello attraverso le finestre craniche9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,23. Nelle NHP, le finestre craniche sono spesso ottenute con una camera e una dura artificiale per proteggere il cervello e supportare la sperimentazione a lungo termine8,10,12,17,18,24,25,26,27. Allo stesso modo, i pali della testa spesso accompagnano le camere per stabilizzare e allineare la testa durante gli esperimenti14,15,25,26,28,29,30. L'efficacia di questi componenti dipende fortemente da quanto bene si adattano al cranio. Un adattamento più vicino al cranio promuove l'integrazione ossea e la salute del cranio diminuendo la probabilità di infezione, osteonecrosi e instabilità dell'impianto31. Metodi di progettazione convenzionali, come la piegatura manuale del palo durante l'intervento chirurgico25,29 e stimare la curvatura del cranio adattando i cerchi alle fette coronali e sagittali delle scansioni di risonanza magnetica (RM)9,12 può introdurre complicazioni dovute all'imprecisione. Anche il più preciso di questi crea spazi di 1-2 mm tra l'impianto e il cranio, fornendo spazio per l'accumulo del tessuto di granulazione29. Queste lacune introducono inoltre difficoltà nel posizionamento delle viti in chirurgia9, compromettendo la stabilità dell'impianto. Più recentemente sono stati sviluppati impianti personalizzati per migliorare l'osteointegrazione e la longevità dell'impianto9,29,30,32. I costi aggiuntivi hanno accompagnato i progressi nella progettazione di impianti personalizzati a causa della dipendenza dai modelli computazionali. I metodi più accurati richiedono attrezzature sofisticate come le macchine per la tomografia computerizzata (TC) oltre alle macchine per l'imaging RM (MRI)30,32,33 e persino fresatrici a controllo numerico computerizzato (CNC) per lo sviluppo di prototipi di impianti25,29,32,34. Ottenere l'accesso sia alla risonanza magnetica che alla TC, in particolare per l'uso con NHP, potrebbe non essere fattibile per i laboratori che necessitano di impianti su misura come camere craniche e copricapo.
Di conseguenza, c'è bisogno nella comunità di tecniche di pianificazione neurochirurgica e sperimentale poco costose, accurate e non invasive che facilitino la progettazione e la convalida degli impianti prima dell'uso. Questo documento descrive un metodo per generare rappresentazioni virtuali 3D del cervello e del cranio dai dati RM per la pianificazione della posizione della craniotomia e la progettazione di camere craniche e copricapi personalizzati che si adattano al cranio. Questa procedura semplificata fornisce un disegno standardizzato che può avvantaggiare i risultati sperimentali e il benessere degli animali da ricerca. Per questa modellazione è necessaria solo la risonanza magnetica perché sia l'osso che i tessuti molli sono rappresentati nella risonanza magnetica. Invece di utilizzare una fresatrice CNC, i modelli possono essere stampati in 3D a basso costo, anche quando sono necessarie più iterazioni. Ciò consente anche di stampare in 3D il design finale in metalli biocompatibili come il titanio per l'impianto. Inoltre, descriviamo la fabbricazione di una dura artificiale, che viene posizionata all'interno della camera cranica al momento dell'impianto. Questi componenti possono essere convalidati pre-chirurgicamente inserendo tutte le parti su un modello stampato in 3D a grandezza naturale del cranio e del cervello.
Tutte le procedure che coinvolgono gli animali sono state approvate dall'Institute for Animal Care and Use Committee dell'Università di Washington. In questo studio sono stati utilizzati un totale di quattro macachi rhesus maschi adulti (Macaca mulatta). Al momento dell'acquisizione della risonanza magnetica, la scimmia H aveva 7 anni, la scimmia L 6 anni, la scimmia C 8,5 anni e la scimmia B 5,5 anni. Alle scimmie H e L sono state impiantate camere croniche personalizzate all'età di 9 anni.
1. Isolamento del cranio e del cervello (Figura 1)
2. Pianificazione della localizzazione della craniotomia (Figura 2)
3. Design della camera cranica (Figura 3)
4. Design del palo della testa (Figura 4)
5. Fabbricazione di dura artificiale 11 (Figura 5)
6. Procedura di fissaggio dei fori
Questi componenti sono stati precedentemente convalidati utilizzando una combinazione di visualizzazioni MRI e modelli anatomici stampati in 3D. Confrontando la visualizzazione automatica della craniotomia con la craniotomia stampata in 3D e la risonanza magnetica nella posizione della craniotomia, è evidente che la rappresentazione virtuale della craniotomia riflette accuratamente la regione del cervello a cui è possibile accedere con la posizione della craniotomia specificata (Figura 2A-F). Inoltre, l'accuratezza della visualizzazione automatica della craniotomia è stata ulteriormente valutata confrontando la rappresentazione virtuale con le craniotomie esistenti da interventi chirurgici di impianto (Figura 2E,G). Il modello stampato in 3D, la visualizzazione automatizzata, la risonanza magnetica e la craniotomia effettiva evidenziano la stessa regione, mostrando i solchi principali nella stessa posizione e con coerenza proporzionale. Il processo di isolamento del cervello e del cranio e la successiva visualizzazione della craniotomia richiedono meno di 15 minuti per essere completati, consentendo di testare diverse posizioni in meno di 1 ora.
L'efficacia della procedura di isolamento cerebrale è stata confermata confrontando la craniotomia virtuale con la rappresentazione RM della posizione della craniotomia (Figura 2B,C,E,F). Le somiglianze hanno indicato che la procedura di isolamento cerebrale ha la capacità di rappresentare le dimensioni, la posizione e la forma corrette delle strutture anatomiche del cervello che vengono prese di mira, come i solchi.
Il cervello e il cranio combinati stampati in 3D sono stati utilizzati come modello anatomicamente accurato per convalidare i progetti della camera e del copricapo. Prima di investire in parti in titanio, la camera e il testante erano stampati in 3D in plastica. È stato confermato che gli impianti si inseriscono nel cranio e che non si sovrapponevano l'uno all'altro o ostruivano importanti marcatori anatomici. Il processo di progettazione della camera e del palo della testa ha prodotto componenti che corrispondevano alla curvatura del cranio (Figura 3G, I, Figura 4E, Figura 6, Figura 7). È stato anche confermato che la dura artificiale si adatta alle pareti interne della camera con un piccolo spazio per tenere conto delle regolazioni apportate durante l'impianto. Camere personalizzate sono state impiantate in due macachi. Contrariamente ai precedenti metodi di progettazione della camera9, ogni vite che si tentava di inserire poteva essere avvitata. Ciò è dovuto alla drastica riduzione degli spazi tra la camera e il cranio con l'adattamento personalizzato rispetto alla camera progettata dalle approssimazioni di curvatura della risonanza magnetica9 (Figura 6A-F). Una camera su misura è stata impiantata per oltre 2 anni e l'altra per un anno e mezzo. Con una corretta manutenzione, non si sono verificati problemi di perdita di viti, infezioni o stabilità a causa di questi impianti (Figura 3I).
I processi di progettazione personalizzati del copritesta e della camera evitano la necessità di regolazioni manuali durante l'intervento chirurgico, che altrimenti potrebbero aggiungere ore alla durata dell'intervento. Queste tecniche riducono anche gli spazi di 1-2 mm che derivano dalle approssimazioni di curvatura29, favorendo una migliore salute dell'impianto e migliorando i risultati sperimentali. I perfezionamenti prevengono le complicazioni con l'impianto e prolungano la longevità dell'impianto, migliorando così anche il benessere degli animali.

Figura 1: Isolamento del cervello e del cranio. (A) Sezioni coronali stratificate di risonanza magnetica (MRI). (B) Maschera binaria stratificata dalla soglia del cranio. (C) Sezioni stratificate del cranio isolato da una maschera binaria invertita. (D) Cranio 3D ricostruito. (E) Maschera binaria stratificata dalla soglia cerebrale. (F) Sezioni stratificate di risonanza magnetica di cervello isolato. (G) Cervello 3D ricostruito. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Pianificazione della craniotomia. (A) Visualizzazione della craniotomia con modello di cervello e cranio stampato in 3D per Monkey B. (B) Visualizzazione della craniotomia in software computazionale per Monkey B. (C) Visualizzazione della craniotomia in risonanza magnetica (RM) per Monkey B. (D) Visualizzazione della craniotomia con modello di cervello e cranio stampato in 3D per Monkey H. (E) Visualizzazione della craniotomia nel software computazionale per Monkey H. (F) Visualizzazione della craniotomia nell'immagine di risonanza magnetica (RM) per la scimmia H. (G) Immagine della craniotomia nella scimmia H. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 3: Progettazione dell'impianto della camera. (A) Regione del cranio (grigia) utilizzata per la riduzione della risoluzione STL. (B) Riduzione della risoluzione STL del cranio in SOLIDWORKS. (C) Anello interno della camera, evidenziato. (D) Progettazione del gonna della camera in SOLIDWORKS. (E) Gonna e parte superiore della camera di collegamento. (F) STL della camera in SOLIDWORKS. (G) Cervello, cranio e camera stampati in 3D. (H) Camera in titanio. (I) Camera impiantata nella scimmia H. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 4: Design del palo di testata. (A) Contorno inferiore del palo di testa sulla riduzione della risoluzione STL del cranio. (B) Impronta del palo su misura. (C) Parte inferiore del palo della testata. (D) Progettazione del montante della testa in SOLIDWORKS. (E) Copricapo stampato in 3D sul cranio. (F) Reggisella in titanio. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 5: Fabbricazione di dura artificiale. (A) Serraggio della miscela di silicone mediante stampo. (b) Dura artificiale. Questa figura è stata adattata con il permesso di Griggs et al.11. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 6: Camera di adattamento personalizzata rispetto a quella di curvatura del cranio. Camera progettata a partire da stime di curvatura della risonanza magnetica sul cranio9 da una vista anteriore (A), una vista laterale (B) e una vista posteriore (C). Camera progettata su misura da una vista anteriore (D), una vista laterale (E) e una vista posteriore (F). Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 7: Camera, palo della testa e dura artificiale su cervello e cranio sovrapposti Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura supplementare 1: Pianificazione della soglia e della localizzazione della craniotomia. (A) Esempio di maschera binaria con una soglia adeguata. (B) Sezione coronale sulla risonanza magnetica per identificare la posizione della craniotomia. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura 2 supplementare: Processo di riduzione del file STL in MATLAB per la progettazione della camera. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura supplementare 3: Rappresentazione visiva di un foro nella riduzione della risoluzione STL del cranio. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura 4 supplementare: Schermate del software della gonna della camera. (A) L'anello interno della gonna della camera e la superficie interna della parte superiore della camera come accoppiamenti concentrici. (B) Traslazione della gonna della camera verso il basso. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura supplementare 5: Gonna e parte superiore della camera con e senza sovrapposizione. (A) Esempio di sovrapposizione tra la gonna della camera e la parte superiore della camera (Modifica la superficie inferiore della gonna della camera). (B) Esempio di assenza di sovrapposizione tra gonna e parte superiore della camera. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura 6 supplementare: Piani che ostruiscono i fori delle viti ed eliminano l'ostruzione. (A) Esempio di piani che ostruiscono i fori delle viti dopo il posizionamento dei fori delle viti. (B) Contorno del taglio estruso per eliminare le superfici all'interno dei fori delle viti. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura 7 supplementare: Selezione del punto e piano assiale del cranio. (A) Selezione del punto per la progettazione del palo di testa. (B) Vista superiore del piano parallelo al piano assiale del cranio. (C) Vista laterale del piano parallelo al piano assiale del cranio. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura supplementare 8: Esempio di accoppiamenti. (A) Primo accoppiamento - La superficie superiore della piattaforma circolare del montante e la superficie inferiore della parte superiore del palo della testa come accoppiamenti concentrici. (B) Secondo accoppiamento - Bordo della superficie superiore della piattaforma circolare del palo di testa e bordo della superficie inferiore della parte superiore del palo di testa come accoppiamenti concentrici. (C) Terzo accoppiamento - Una linea che corre verticalmente lungo la gamba posteriore del palo del testamento e una linea che corre orizzontalmente lungo la parte posteriore della parte superiore del palo della testa come accoppiamenti perpendicolari. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura supplementare 9: Procedura di fissaggio dei fori. (A) Superfici lavorate a maglia che circondano lo spazio nella superficie importata. (B) Asse su ciascun punto in corrispondenza del bordo della superficie lavorata. (C) Risultato finale della procedura di fissaggio dei fori. Clicca qui per scaricare questo file.
Figura supplementare 10: Esecuzione del taglio estruso. (A) Procedura di taglio estruso che circonda le estrusioni dai fori di fissaggio. (B) Esempio di taglio estruso su un piano sulla superficie superiore del fondo della camera. Clicca qui per scaricare questo file.
File di codifica supplementare 1: file di codifica per il protocollo. Clicca qui per scaricare questo file.
Nulla da rivelare.
Questo documento delinea i processi automatizzati per la pianificazione neurochirurgica dei primati non umani basata su scansioni di risonanza magnetica (MRI). Queste tecniche utilizzano passaggi procedurali nella programmazione e nelle piattaforme di progettazione per supportare la progettazione di impianti personalizzati per NHP. La validità di ogni componente può quindi essere confermata utilizzando modelli anatomici tridimensionali (3D) stampati a grandezza naturale.
Ringraziamo Toni Haun, Keith Vogel e Shawn Fisher per il loro aiuto tecnico e supporto. Questo lavoro è stato sostenuto dall'Università di Washington Mary Gates Endowment (R.I.), dal National Institute of Health NIH 5R01NS116464 (T.B., A.Y.), dal NIH R01 NS119395 (D.J.G., A.Y.), dal Washington National Primate Research Center (WaNPRC, NIH P51 OD010425, U42 OD011123), dal Center for Neurotechnology (EEC-1028725, Z.A., D.J.G.) e dal Weill Neurohub (Z.I.).
| Software di stampa 3D (Semplifica 3D) (a pagamento) | Simplify3D | Versione 4.1 | Utilizzato per la stampa 3D con la stampante MakerGear |
| C-Clamp | Bessey | CM22 | Utilizzato per la fabbricazione di dura artificiale, capacità di 2-1/2 pollici, gola da 1-3/8 pollici |
| Formlabs Form 3+ Stampante 3D | Formlabs | Form 3+ | Utilizzato per la stampa 3D precisa |
| MakerGear M2 Stampante 3D | MakerGear | M2 revG | Utilizzato per la stampa 3D di prototipi di impianti |
| MATLAB (a pagamento) | MathWorks | R2021b | Utilizzato per l'isolamento del cervello e del cranio, la visualizzazione della craniotomia virtuale e la riduzione STL del cranio |
| Sistema di risonanza magnetica Phillips Acheiva | Philips | 4522 991 19391 | Utilizzato per l'imaging di primati non umani |
| Resina fotopolimerica | Formlabs | FLGPGR04 | 1L, grigio, utilizzato per stampe 3D precise con la stampante Formlabs... |
| Software per la preparazione della stampa PreForm | Formlabs | versione 2.17.0 | utilizzato per la stampa 3D con la stampante Formlabs. |
| Filamento di Stampa (PLA) | MatterHackers | 88331 | PLA 1,75 mm Bianco. Utilizzato per la stampa 3D con la stampante MakerGear |
| Silicone CAT-1300 | Shin-Etsu | Utilizzato per la fabbricazione di durate artificiali | |
| Silicone KE1300-T | Shin-Etsu | Utilizzato per la fabbricazione di durate artificiali | |
| SolidWorks (a pagamento) | Dassault Systems | 2020 | Utilizzato per la progettazione di camere e paletti di sterzo |
| Syn.Flex-S Multicoil | Philips | 45221318123 | Utilizzato per non umani imaging dei primati |