JoVE Encyclopedia of Experiments
Microbiologia
0 visualizzazioni • 2:46 min • February 26th, 2026
Si inizia con il soprannatante prodotto dal microbiota intestinale umano durante la fermentazione in vitro degli esosaccacaridi. Il soprantantante contiene acidi grassi a catena corta deprotonati (SCFA) e altri metaboliti.
Aggiungi acido metafosforico per abbassare il pH del soprandanante e vortice per mescolare a fondo. Questo converte gli SCFA nelle loro forme protone, adatte all'analisi della cromatografia a gas.
Centrifuga per separare i detriti e raccogliere il sovrantantante contenente SCFA e altri metaboliti.
Filtrare il soprandanante per eliminare i residui e evitare interferenze con la cromatografia.
In un sistema di cromatografia gasso-cromatografia ad alte prestazioni, si inietta il soprantantante nell'ingresso riscaldato per vaporizzarlo. Poi, si mescola il vapore con un gas inerte e si fa passare attraverso una colonna di fase statica polare per la separazione.
Gli SCFA interagiscono con la fase stazionaria della colonna e si separano in base alla loro volatilità, con gli acidi a catena più corta che eluiscono prima di quelli più lunghi.
Identificare le concentrazioni dei diversi SCFA confrontando i risultati con gli standard interni. Questo riflette la degradazione microbica degli esosaccaridi in condizioni simili all'intestino
Per studiare gli effetti dell'EPS sulla produzione di SCFA, aggiungere 1 millilitro di soprantativi fermentati a tubi centrifughe da 2 millilitri e aggiungere 0,2 millilitri di acido metafosforico al 25 peso/volume a ciascun campione. Vortice per mescolare accuratamente le soluzioni. Centrifuga le miscele a 13.000 volte g per 20 minuti.
Nel frattempo, preparare soluzioni di 120 millimolari di acidi acetici, propionici, butirici, isobutirici, valerici e isovalerici in tubette. Poi aggiungi 1 millilitro di ciascun acido preparato in un tubo contenente 1,2 millilitri di acido metafosforico al 25 peso/volume e caricali nella bottiglia campione dello strumento gascromatografia come cocktail standard.
Estrai i tubi dalla centrifuga e trasferisci i soprantanti in tubi nuovi. Utilizzare una siringa dotata di filtro da 0,22 micron per filtrare i soprantativi in nuovi tubi per l'analisi gas-cromatografia.
Questo articolo illustra un protocollo per l'analisi della produzione di acidi grassi a catena corta (SCFA) da parte della microbiota intestinale umana in risposta a esopolisaccaridi (EPS), mediante sistemi di fermentazione batch in vitro. Il metodo si concentra sulla separazione e quantificazione dei prodotti della fermentazione microbica, in particolare gli SCFA, attraverso cromatografia gassosa, fornendo informazioni su come gli EPS modulino i metaboliti microbici coinvolti nelle interazioni ospite-patogeno a livello intestinale.
L'analisi quantitativa della produzione di acidi grassi a catena corta (SCFA) da parte del microbiota intestinale umano in risposta a esopolisaccaridi (EPS) fornisce informazioni utili per la validazione precoce di bersagli e la riduzione dei rischi meccanicistici nella scoperta di farmaci mirata al microbioma. Questo flusso di lavoro consente una misurazione precisa degli output metabolici microbici, sostenendo la previsione attendibile della modulazione delle interazioni ospite-microbo rilevanti per i portafogli di malattie gastrointestinali e metaboliche.
Questo metodo si integra nel percorso di scoperta, dalla verifica iniziale delle ipotesi fino all'identificazione dei composti promettenti e alla validazione preclinica per programmi mirati al microbioma.
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Ultimo aggiornamento: 29 agosto 2026