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Per rilevare le interazioni antigene-anticorpo utilizzando la fotometria di massa, incubare innanzitutto la concentrazione desiderata di antigeni e anticorpi purificati per il periodo di tempo richiesto, facilitando il legame antigene-anticorpo. Sulla base della stechiometria del legame dell'antigene, le regioni paratopiche di questi anticorpi possono avere un numero variabile di antigeni attaccati.
Far fluire nella soluzione contenente gli anticorpi liberi insieme ai complessi antigene-anticorpo attraverso una camera di flusso preassemblata. Fissare la camera sul tavolino del microscopio di un fotometro di massa. Quindi, dirigere il raggio laser attraverso la camera di flusso per ottenere un imaging ottimale.
A seconda del numero di antigeni attaccati a ciascun anticorpo, la massa molecolare dei complessi cambia. Queste variazioni di massa fanno sì che i complessi diffondano la luce in modo diverso.
I complessi con masse molecolari più elevate, in cui due antigeni sono legati a entrambi i paratopi di un singolo anticorpo, diffondono più luce rispetto ai complessi contenenti un singolo antigene. Inoltre, gli anticorpi liberi mostrano la minor quantità di diffusione della luce.
Un rilevatore raccoglie la luce diffusa e ne misura la frequenza e l'intensità. Il fotometro registra le fluttuazioni della luce diffusa come un modello di interferenza, rappresentandolo come macchie.
Le macchie deboli corrispondono agli anticorpi liberi. Al contrario, le macchie molto scure rappresentano complessi con due antigeni e la macchia meno scura contiene un antigene legato.
La presenza di macchie scure è conforme alle interazioni antigene-anticorpo.
Per valutare l'affinità anticorpo-antigene mediante fotometria di massa, applicare una goccia di olio da immersione per microscopio all'obiettivo dello strumento e posizionare la camera di flusso sul tavolino del microscopio. Aggiungere 10 microlitri di PBS filtrato a un'estremità del canale della camera di flusso. Il tampone entrerà nel canale per azione capillare.
Nella scheda Controllo messa a fuoco del software di raccolta dati, utilizzare i pulsanti Su e Giù per eseguire le regolazioni iniziali e fare clic su Nitidezza per visualizzare la lettura del segnale di nitidezza. Utilizzare i pulsanti di regolazione fine Su e Giù per massimizzare il valore di Nitidezza e fare clic su Imposta messa a fuoco e Blocca messa a fuoco per attivare la funzione di tracciamento della messa a fuoco. Un'immagine di un vetrino pulito dovrebbe avere un valore di "segnale" uguale o inferiore allo 0,05%.
Caricare 20 microlitri del primo campione di anticorpo-antigene come dimostrato, tamponando il liquido dall'altra estremità con un piccolo pezzo di carta assorbente. Subito dopo il caricamento, fare clic su Registra per acquisire il numero appropriato di fotogrammi equivalente a 100 secondi di dati. Al termine del periodo di raccolta dei dati, immettere un nome per i dati e fare clic su OK, quindi su Campione per salvare il file.
Per analizzare i dati della fotometria di massa, aprire il file di interesse e fare clic su Analizza. Fare clic su Carica per caricare la funzione di calibrazione, quindi fare clic su File e salva risultati con nome per salvare i dati analizzati.
Per ottenere le concentrazioni relative di ciascuna specie nel campione, aprire il file "eventsFitted.csv", copiare i dati nella colonna M nell'apposito software di tracciatura e analisi e utilizzare la funzione Traccia/Statistiche/Istogramma per tracciare la distribuzione della massa molecolare. Fare doppio clic sull'istogramma per aprire la finestra Proprietà grafico, disabilitare il binning automatico e selezionare una dimensione del contenitore di 2,5 kiloDalton.
Per creare i centri di collocazione e i dati di conteggio, fare clic su Applica e Vai. Per adattare l'istogramma con le funzioni gaussiane, selezionare le colonne Centri contenitori e Conteggi e fare clic sulle funzioni di menu Analisi/Picchi e Linea di base/Adattamento picchi multipli. Fare doppio clic per indicare le posizioni di picco approssimative sul grafico di distribuzione, quindi fare clic su Apri NLFit.
Seleziona le caselle di controllo Fisso per i centri "xc" e imposta i loro valori sulle masse molecolari previste dell'anticorpo libero e dei complessi antigene-anticorpo singolo e doppio. Seleziona l'opzione Condividi per i parametri di larghezza e fai clic su Adatta.
I valori di altezza di picco adattati delle componenti gaussiane rappresentano la concentrazione relativa di ciascuna specie nel campione. Quindi, usa l'equazione per calcolare la frazione di concentrazione di ciascuna specie dai valori di altezza di picco.