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Le trappole extracellulari dei macrofagi, MET, sono strutture simili a ragnatele rilasciate dai macrofagi per intrappolare ed eliminare gli agenti patogeni.
I MET comprendono fibre di cromatina extracellulare associate alla metalloproteinasi-9 della matrice, MMP-9 e all'istone citrullinato H3, H3Cit - una proteina istonica modificata in cui l'arginina viene convertita in citrullina.
Per caratterizzare i MET in sezioni di tessuto polmonare murino fissate in formalina e incluse in paraffina, in primo luogo, asciugare i vetrini. Immergere nello xilene per deparaffinare le sezioni. Utilizzare etanolo acquoso per reidratare le sezioni.
Riscaldare le sezioni per rompere i legami incrociati delle proteine indotte dalla formalina, esponendo gli antigeni bersaglio per il successivo legame degli anticorpi.
Aggiungere una soluzione contenente proteine per bloccare i siti di legame non specifici. Incubare con un cocktail di anticorpi primari anti-MMP-9, anti-H3Cit e anti-F4/80.
L'anticorpo anti-F4/80 si lega alla glicoproteina F4/80 della superficie cellulare dei macrofagi. Gli anticorpi anti-MMP-9 e anti-H3Cit si legano rispettivamente a MMP-9 e H3Cit nei MET. Aggiungere diversi anticorpi secondari coniugati con fluorofori che si legano ai rispettivi anticorpi primari legati ai loro bersagli.
Montare le sezioni con un mezzo di montaggio contenente DAPI. DAPI colora le fibre di cromatina dei MET. Utilizzando un microscopio confocale, visualizzare le sezioni per visualizzare la fluorescenza dei marcatori MET.
I MET sono caratterizzati dalle loro fibre di cromatina extracellulare e dalla co-espressione di F4/80, MMP-9 e H3Cit.
Per pretrattare i campioni FFPE con una soluzione di recupero dell'antigene, asciugare i vetrini in forno a 60 gradi Celsius per 60 minuti. Quindi, trasferire i vetrini in una soluzione di xilene per 30 minuti, prima di trasferire i campioni in etanolo al 70% a temperatura ambiente per 5 minuti.
Dopo aver usato l'acqua del rubinetto per sciacquare i vetrini, metterli in un involucro di plastica resistente al calore e sottoporli a un recupero più elevato dell'antigene mettendoli in una pentola a pressione in Tris-EDTA pH 9.0 per 10 minuti. Raffreddare i campioni per 20 minuti e trasferirli in acqua di rubinetto. Quindi, posizionateli su un bilanciere per 5 minuti. Ripetere il lavaggio con acqua di rubinetto, quindi lavare le diapositive una volta in PBS sul bilanciere.
Per bloccare i campioni, aggiungere il 10% di siero di pollo al 5% di BSA/PBS e incubarli a temperatura ambiente per 30 minuti. Quindi, per definire le trappole extracellulari dei macrofagi, o MET nei macrofagi, aggiungere una diluizione da 1 a 100 di anticorpi primari in BSA/PBS all'1% e incubare i vetrini a 4 gradi Celsius per 16 ore.
Utilizzare PBS per lavare i campioni due volte su un bilanciere per 5 minuti ciascuno. Aggiungere i corrispondenti anticorpi secondari fluorescenti all'1% di BSA/PBS e incubare i vetrini a temperatura ambiente per 40 minuti. Dopo i lavaggi PBS, utilizzare un mezzo di montaggio contenente DAPI per colorare la cromatina e montare i campioni.
Utilizzando una testa di scansione laser confocale collegata a un microscopio invertito, è possibile acquisire immagini fluorescenti utilizzando obiettivi 20X 0,1 NA aria e 40X 1,0 NA olio. Cattura immagini su un singolo piano da 512 x 512 pixel facendo clic sul pulsante di livellamento sequenziale in linea. Ottieni almeno 10 campi visivi per sezione per l'analisi e i dati per ogni risultato.