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Assumere piastre per microtitolazione contenenti un antibiotico aminoglicosidico diluito in serie. Una delle piastre contiene NTBC, un farmaco sintetico.
Introdurre Pseudomonas aeruginosa, un batterio gram-negativo, e incubare.
I batteri producono piomelanina – un pigmento extracellulare protettivo – nei pozzetti non trattati con NTBC, mentre il farmaco impedisce la produzione di piomelanina.
L'antibiotico cationico si lega ai lipopolisaccaridi anionici, o LPS, sulla membrana esterna batterica, spostando i ponti cationici e destabilizzando la membrana.
Entrando nei batteri, l'antibiotico si lega al sito amminoacilico, o sito A, nella subunità ribosomiale 30S.
L'antibiotico legato impedisce il legame con l'amminoacil-tRNA e il movimento ribosomiale attraverso l'mRNA, interferendo con la sintesi proteica e inibendo la crescita batterica.
Dopo l'incubazione, misurare la densità ottica della coltura per valutare la crescita batterica.
La concentrazione minima di antibiotico che impedisce la crescita batterica è la concentrazione inibitoria minima o MIC.
Valori di MIC simili per i pozzetti trattati con NTBC e non trattati con NTBC non indicano alcun impatto di NTBC sulla sensibilità agli antibiotici dei batteri.
Un giorno prima del test MIC, preparare le colture dei ceppi da testare in LB con e senza 2-[2-nitro-4-trifluorometil)benzoil]-1-3 cicloesandione o NTBC. Questa dimostrazione utilizza il livello rappresentativo di 300 micromolari di NTBC. Il metodo di titolazione per determinare la concentrazione appropriata di NTBC è descritto nel testo del protocollo. Incubare le colture durante la notte a 37 gradi Celsius con aerazione. Il giorno successivo, realizzare le soluzioni master LB più NTBC e LB più DMSO per il test MIC.
Per testare un antibiotico per un ceppo, aggiungere 600 micromolari di NTBC a 2 millilitri di LB e mescolare per ottenere la soluzione master NTBC. NTBC viene aggiunto a una concentrazione di 600 micromolari perché sarà diluito due volte quando viene aggiunto l'inoculo, ottenendo una concentrazione finale di 300 micromolari. Aggiungere un volume equivalente di DMSO del veicolo a 2 millilitri di LB e mescolare per ottenere la soluzione master no-NTBC. Queste due soluzioni master saranno utilizzate per la creazione di soluzioni madre antibiotiche e per l'impostazione della serie di diluizione in piastre a 96 pozzetti.
Successivamente, preparare le soluzioni antibiotiche nelle soluzioni master LB più NTBC o LB più DMSO. Preparare la soluzione madre di gentamicina più o meno NTBC a 64 microgrammi per millilitro. Preparare la soluzione madre NTBC più o meno kanamicina a 256 microgrammi per millilitro. Preparare la soluzione madre di tobramicina più o meno NTBC a 8 microgrammi per millilitro.
Dopo aver preparato le soluzioni antibiotiche 2X, aggiungere 100 microlitri di ciascuna soluzione antibiotica a quattro pozzetti in una piastra da 96 pozzetti nella fila A. Ad esempio, la gentamicina dovrebbe essere collocata da A1 a A4. La kanamicina deve essere collocata da A5 a A8 e la tobramicina deve essere collocata da A9 a A12.
Aggiungere 50 microlitri della soluzione master LB più NTBC o LB più DMSO alle file da B a H della piastra a 96 pozzetti. Assicurarsi che una piastra sia LB più NTBC e una piastra sia LB più DMSO. Utilizzando un connettore per micropipette, eseguire due diluizioni seriali degli antibiotici trasferendo 50 microlitri di soluzione dalla fila A alla riga B. Mescolare la soluzione, cambiare i puntali delle pipette e trasferire 50 microlitri di soluzione dalla riga B alla riga C. Ripetere per le file rimanenti.
Dopo aver diluito la riga G, rimuovere 50 microlitri di soluzione da quella fila e gettarla. Utilizzare la riga H come controllo non antibiotico per la crescita batterica. Recupera le colture notturne. Dopo aver lavato tutte le colture per eliminare la biomelanina presente nei terreni, misurare l'OD600 delle colture. Diluire le colture notturne in LB.
Utilizzando una micropipetta multicanale, aggiungere 50 microlitri di coltura batterica diluita nei pozzetti appropriati. Aggiungere i batteri a tre pozzetti per ogni ceppo e concentrazione di antibiotici. Aggiungere 50 microlitri di LB al quarto pozzetto per fungere da controllo della contaminazione batterica. Coprire le piastre a 96 pozzetti con parafilm e incubare per circa 24 ore a 37 gradi Celsius.
Il giorno seguente, esaminare visivamente le piastre per verificare la presenza di batteri nei pozzetti. La MIC è la concentrazione più bassa di antibiotico in cui non si osserva alcuna crescita batterica per tutte e tre le repliche di ciascun ceppo.