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Prendi un cervello di topo ripulito con cellule che esprimono proteine fluorescenti e lipidi rimossi per la trasparenza per l'imaging di strutture profonde ad alta risoluzione.
Una rete di idrogel preserva le biomolecole e mantiene le reti neuronali.
Trasferire il cervello in una camera di imaging contenente un anello di agarosio per il supporto.
Fissare il tessuto con adesivo e riempire la camera con una soluzione di corrispondenza dell'indice di rifrazione per ridurre al minimo la dispersione della luce e creare un ambiente di imaging stabile.
Posizionare la camera su un tavolino per microscopio confocale e abbassare delicatamente l'obiettivo nella soluzione per stabilire una colonna di contatto continua.
Utilizzare l'epifluorescenza per localizzare le regioni di interesse. Quindi, regola il laser e i parametri di imaging per ottimizzare la qualità dell'immagine.
Acquisisci una serie di z-stack per creare una rappresentazione tridimensionale del tessuto.
Utilizzare un software appropriato per analizzare la morfologia cellulare, compresi gli alberi dendritici, le loro spine e la distribuzione e la densità dei neuroni.
Per costruire una grande camera di imaging tissutale per tessuti con uno spessore superiore a 5 millimetri, utilizzare un piatto di vetro da 10 centimetri con una parete alta. Posizionare al centro un tubo conico da 50 millilitri, assicurandosi che il diametro del tubo sia abbastanza grande da accogliere il barilotto della lente dell'obiettivo utilizzato. Versare il 3% di agarosio in acqua e versarlo nello spazio tra il piatto di vetro e il tubo conico.
Quindi lasciarlo raffreddare per un'ora. Questo formerà un anello di agarosio solido. Far aderire saldamente il tessuto al fondo della camera utilizzando la supercolla e riempire la camera con una soluzione di corrispondenza dell'indice di rifrazione, che può iniziare a polimerizzare a meno che non venga preservata dall'aria e conservata a 4 gradi Celsius. Acquisire l'immagine utilizzando un microscopio confocale.
Accendere tutte le apparecchiature di imaging pertinenti. Posizionare il campione sul tavolino. Avvicinarsi con attenzione ai mezzi di immersione con l'obiettivo e formare una colonna continua di supporti. Utilizzando l'epifluorescenza, trovare un campo di imaging appropriato. Inizia impostando le impostazioni di risoluzione e velocità di scansione.
Se si utilizza un microscopio confocale, chiudere completamente il foro stenopeico per ottenere la sezione ottica più piccola e quindi la migliore risoluzione Z. Aumentare gradualmente la potenza del laser o il guadagno del sensore fino a ottenere un'immagine adatta con un elevato rapporto segnale/rumore. Se si utilizza l'imaging a due colori EGFP standard o tdTomato, impostare le impostazioni di raccolta della luce.
Imposta i parametri dello stack Z in base all'inizio e ai punti finali osservati del tessuto. Imposta la dimensione del passo in base alla risoluzione Z desiderata. Passi di dimensioni più piccole produrranno una risoluzione Z maggiore, ma possono portare allo sbiancamento del campione.
Quando si è soddisfatti delle impostazioni di acquisizione dell'immagine, acquisire l'immagine. Assicurati che l'immagine abbia un rapporto segnale/rumore elevato e mostri i confini distinti delle strutture.