Scambio idrogeno/deuterio basato sull'elettroforesi capillare per la caratterizzazione conformazionale di proteine con spettrometria di massa top-down

Questo metodo consente di separare le specie proteiche coesistenti, inclusi diversi conformatori o varianti e di completare online le loro differenze di struttura di ordine superiore in un'unica misurazione CEMS. Utilizza l'effetto elettroforetico per fornire un ambiente di durata quasi del 100% per le reazioni HDX e la separazione ortogonale delle specie proteiche coesistenti durante l'HDX per l'analisi della SM dall'alto verso il basso. Inizia con il precondizionamento dell'elettroforesi capillare, dello scambio di idrogeno deuterio o della configurazione CE HDX.

Utilizzando l'ultrasonicazione in una miscela di 50% metanolo, 49% acqua e 1% acido formico, pulire il flusso attraverso l'interfaccia microviale CE-MS per almeno 30 minuti a temperatura ambiente. Montare il capillare modificato HPC sull'elettroferesi capillare o sullo strumento CE. Risciacquare il capillare con soluzione di elettrolita di fondo o BGE per 10 minuti utilizzando il campionatore automatico e lasciarlo riempire con il BGE.