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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
このビデオでは、文書の沿岸海洋水のサンプルを収集し、バイオマス濃度、核酸精製、細胞の豊富さ、栄養および微量ガス分析を含む様々なダウンストリームアプリケーションのためにそれらを処理するための方法を。
このビデオでは、文書の沿岸海洋水のサンプルを収集し、バイオマス濃度、核酸精製、細胞の豊富さ、栄養および微量ガス分析を含む様々なダウンストリームアプリケーションのためにそれらを処理するための方法を。今日のデモのサンプルについてはサーニッチのインレットでHMSジョンストリックランドの動作のデッキから採取された。多目的ウインチとケーブルシステムとフレームデリックは、、ニスキンまたは移動 - FLO採水ボトルと組み合わせて使用されています。導電率、温度、および奥行き(CTD)のセンサーはまた、基礎となる水塊をサンプリングするために使用されます。アウトガス最小限に抑えるために、微量のガス試料が最初に収集されます。次に、栄養素、水の化学、および細胞数が決定されます。最後に、水がバイオマスのろ過のために収集されます。シングルキャストのセットアップおよび収集時間は、215メートルの最大深さで〜1.5時間です。したがって、6時間の合計は、一般的にここで説明するコレクションのシリーズを完了するために必要です。
パート1:水コレクション
第2部:ガスサンプルの収集
パート3:栄養のサンプルコレクション
パート4:アンモニアのサンプルコレクション
パート5:セルの列挙のサンプルコレクション
パート6:硫化水素測定用のサンプルコレクション
パート7:バイオマス濃度のため少量コレクション
パート8:バイオマス濃度のための大ボリュームのコレクション
パート9:代表的な結果
約12溶存酸素のサンプルを、32から48までガス試料、16栄養素のサンプル、32アンモニウムのサンプル、16硫化水素のサンプル、細胞数の16試料、6 20リットルその他これら、16 1リットルボトルで結果をサンプリング海水の最終結果以降RNAで保存微生物バイオマスを含む4 Sterivex0.22μmフィルター。
著者らは開示するものは何もない。
このビデオでは、文書の沿岸海洋水のサンプルを収集し、バイオマス濃度、核酸精製、細胞の豊富さ、栄養および微量ガス分析を含む様々なダウンストリームアプリケーションのためにそれらを処理するための方法を。
我々は、沿岸と外洋水の低酸素領域で進行中の研究を支援するためのイノベーション、ブリティッシュコロンビア州の知識開発基金と国立科学およびカナダの工学研究審議会(NSERC)のためのカナダの財団に感謝の意を表します。さらに、DAWはNSERC、キラムとトゥーラ基礎微生物の多様性と進化のための資金を供給センターからの奨学金によって支えられている。
| 20L カーボーイズ | フィッシャー サイエンティフィ | ック02-960-15 | ||
| 3/8" タイゴン | コール パーマー | 06429-36 | ||
| ステリベックス フィルター | フィ | ッシャー サイエンティフィ | ックSVG010RS | |
| プレフィルター ハウジング ユニット | AMD | 501200 | ||
| ルアー フィッティング | コール パーマー | 31507-27 | ||
| 1/4 "タイゴンチューブ | コールパー | マー06429-24 | ||
| 1/4 "タイゴンチューブ | コールパー | マー06429-24 | ||
| 1/4 "タイゴンチューブ | コールパー | マー06429-24 | ||
| 50mlプラスチックチューブガラス | ||||
| 血清ボトル | ガラスサンプルコレクション | |||
| ガラス血清ボトル | 用セプタムとアルミキャップ | |||
| ハンドクリンパー | ||||
| 20-200ul ピペットとチップ | ||||
| ガラス管 | アンモニウムサンプルコレクション | |||
| 30mlペットボトル | 栄養コレクション | |||
| アクロディスクフィルター | EMDミリポア | |||
| 5 ml チューブ | 亜硝酸塩サンプルコレクション | |||
| 37% ホルムアルデヒド | 試薬 | 細胞数用試薬 | ||
| サンプル数 20% 酢酸亜鉛 | 試薬 | 硫化物サンプル用 | ||
| 塩化水銀 | 試薬 | ガスサンプル用 | ||
| ミリQ水 | 試薬 | |||
| アンモニウム作動試薬 | 試薬 | ホウ酸緩衝液、亜硫酸ナトリウム、オルトファラジアルデヒド | ||
| スルファニルアミド | 試薬 | 5gを450mlの水に、50mlのHCl | ||
| N-(1-ナフチ)-エチレンジアミン二塩酸塩溶液 | 試薬 | 0.5gを500mlの水に |