ここでは、マイクロRNA-200ファミリーメンバーとgrainyhead様2(GRHL2)の合成異所性発現に基づく肉腫細胞における間葉上皮移行(MET)を誘導する細胞培養方法を提示します。この方法は、癌の悪性度や治療上の表現型可塑性の生物学的影響をよりよく理解するために適しています。
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ここでは、マイクロRNA-200ファミリーメンバーとgrainyhead様2(GRHL2)の合成異所性発現に基づく肉腫細胞における間葉上皮移行(MET)を誘導する細胞培養方法を提示します。この方法は、癌の悪性度や治療上の表現型可塑性の生物学的影響をよりよく理解するために適しています。
表現型の可塑性は、細胞が一過別系統の形質を獲得する現象をいいます。癌の進行中に、表現型可塑性が侵略、普及および転移を駆動します。表現型の可塑性の研究のほとんどは、上皮由来の癌の文脈でされているが実際に、それはmesenchymal-に似た現象を受け肉腫のサブセットで、また、表現型の可塑性を示し、起源に間葉ある肉腫を、判明します上皮移行(MET)。ここで、我々は、それぞれ、順次GRHL2およびmiR-200ファミリーは、細胞形質導入およびトランスフェクションを使用して発現肉腫患者samples.Weで観察されたこのMET状現象を模倣するためのmiR-200ファミリーとgrainyhead様2(GRHL2)を含む方法を開発しました、より良い肉腫細胞におけるこれらの表現型の遷移の分子基盤を理解します。 miR-200SとGRHL2を表現肉腫細胞が強化された上皮characteristを実証しました細胞形態および上皮および間葉バイオマーカーの変化にICS。これらのメソッドを使用して今後の研究では、より良い、このような移動、浸潤、転移性の傾向、および治療抵抗として肉腫細胞にMETのようなプロセスの表現型の結果を理解するために使用することができます。
表現型の可塑性は、細胞の表現型との間の可逆的な遷移を指し、一般に二つのタイプ、上皮 - 間葉(EMT)遷移と間葉ツー上皮移行(MET)に分割されています。この表現型の可塑性は、このような開発や創傷治癒1と多細胞生物の正常なプロセスにおいて重要な役割を果たしています。しかしながら、これらの同じ経路および遺伝子発現プログラムはまた、線維症のような疾患につながることができ、(2に概説、3、4)、癌転移(参考文献5、6、7、8に概説)。転移の間に、例えば、EMTは、細胞極性、細胞-細胞相互作用を破壊、および浸潤9,10を促進します。一緒に、EMTが貢献します癌細胞の普及を促進する表現型状態秒。また、EMTはまた、癌細胞の代謝6の規制緩和、薬物抵抗11、12の開発を含む積極的な表現型を駆動する他の表現型の変化、増加腫瘍開始能13,14及び免疫回避15をホストのホストにつながります。
表現型可塑性はよく癌の進行に研究されてきました。しかし、肉腫はまた、表現型の可塑性を示します。癌における表現型の可塑性の同じドライバーのいくつかはまた、肉腫の可塑性と積極性に貢献しているかのよう興味深いことに、それが表示されます。例えば、肉腫患者からの循環腫瘍細胞(CTCのは)のEpCAM、典型的には上皮細胞16に見出される細胞表面タンパク質を発現することが示されています。 ADDItionally、250個の軟部組織肉腫サンプルは遺伝子発現に基づいて、上皮様または間葉様に分類しました。上皮様バイオマーカーの署名の患者は間葉様バイオマーカーの署名17の患者よりも良い予後を持っていました。これは、より多くの上皮様癌の患者は、より間葉様腫瘍18の患者と比較して、より良い結果を持っている多くの癌腫、と一致しています。
いくつかの肉腫は、バイオマーカーおよびMETと一致した遺伝子発現の経路を表示しますが、この表現型可塑性の分子基盤はよくわかっていないまま。肉腫にMETのメカニズムおよびドライバを研究するために、我々は2上皮固有の要因を使用してMET誘導のモデルを開発し、マイクロRNA(MIR)-200家族とgrainyheadのような2(GRHL2)。 MIR-200S messenの3' のUTRに結合することによって遺伝子発現を調節する小さな非コードRNAのファミリーでありますGERのRNAとタンパク質への翻訳を阻止します。 miR-141およびmiR-200Aを含むもの、およびmiR-200B、MIR-200C、およびmiR-429を含む他の - のmiR-200ファミリーは、2つのサブグループから成ります。 miR-200ファミリーのメンバーは、上皮組織に富んでいる、とのmiR-200Sの損失は癌19に転移と関連しています。 miR-200ファミリーはまた、正常組織20と比較して、軟組織肉腫にダウンレギュレートされます。 miR-200Sと同様に、GRHL2は、上皮の開発21のために重要である重要な調節因子です。例えばE-カドヘリンなどの上皮の遺伝子をアップレギュレートする2つの方法でGRHL2転写因子が作用する:1)上皮細胞において、GRHL2直接EMTマスタレギュレータ、ZEB1 22を抑制する。 2)GRHL2直接上皮遺伝子23の転写を活性化します。私たちの以前の研究は、肉腫細胞におけるmiR-200SとGRHL2の組み合わせ表現を示していますMET様表現型24を誘導します。ここで、我々は、miR-200SとGRHL2の異所性発現を使用して肉腫細胞におけるMET誘導のin vitroモデルを作成するための詳細なプロトコルを提示します。
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試薬の調製
GRHL2 2.レンチウイルス形質導入
1日目
2日目
3日目
4日目
5日目
7日目
miR-200Sの3リバーストランスフェクション
4. RNA抽出、逆転写、および定量PCR
5.免疫蛍光染色
6.ウェスタンブロッティング
7.足場非依存性増殖アッセイ
注:詳細軟寒天アッセイプロトコルの場合、28を参照してください。
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肉腫細胞におけるMETの誘導のためのスキーマ
肉腫細胞におけるMET状変化の誘導のための一般的なタイムラインは、 図1に示されています。プロトコルは、miR-200ファミリー( 図1B)のトランスフェクションに続いてGRHL2( 図1A)を 、形質導入することによって開始します。 GRHL2またはmiR-200ファミリーメンバーは、単独で発現された場合に、RD細胞の外観に影響を与えることができなかったが、一緒にGRHL2及びmiR-200Sの異所性発現RD細胞における上皮様形態学的変化をもたらします。増加した細胞-細胞接触( 図1C)とより丸みを帯びた外観に紡錘状の形態からの細胞転移。
肉腫細胞におけるMETのよ...
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肉腫はまれですが、間葉系細胞系譜の非常に攻撃的な癌。彼らの間葉系統にもかかわらず、肉腫のサブセットは、より多くの上皮様状態への表現型の転移を起こすように見えます。より多くの上皮様腫瘍の患者は、24あまり積極的であるとして、このMET-のようなスイッチは、予後関連性を持っています。その臨床的関連性にもかかわらず、肉腫でこれらの表現型の遷移を駆動する分子メカニズムを扱ういくつかの研究があります。
肉腫細胞におけるMETのような遷移を調べるために、我々は、上皮要因GRHL2とのmiR-200ファミリーの発現を組み合わせることによって、MET-誘導モデルを開発しました。この方法は、急速に上皮様形態および遺伝子発現の変化によって測定されるようになること肉腫細胞を誘導します。肉腫細胞にMETを誘導するためにこのプロトコルを使用すると、このような、肉腫の侵略を駆動表現型のこれらの遷移の影響の研究を促進します移動、浸潤、増殖と死の抵抗として、どのように生物学におけるこれらの変化のそれぞれは、薬剤耐性に影響を与えることができます。
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著者は、開示することは何もありません。
JASはデュークがん研究所、デューク大学泌尿生殖器腫瘍学研究所、および整形外科のデューク大学の学部からの支援を認めています。 HLは、理論生物物理学のための国立科学財団(NSF)センターによってサポートされていました(NSF PHY-1427654)およびNSF DMS-1361411、およびテキサス州の癌研究におけるCPRITとして(がん予防とテキサス州の研究所)奨学生ライス大学。 KEWはメアリー・C・ファラック-カーソン、JN Onuchic、サミル・M・ハナッシュ、ケネス・J・ピエンタ、ドナルドS. Coffeyのに有用な議論の恩恵を受けたNIH F32 CA192630 MKJ及びHLによって支持されました。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| Countess 自動カウンター | ライフテクノロジー | AMQAX1000 | |
| Countess cell counting chamber slides | Invitrogen | C10283 | |
| SimpliAmp Thermal Cycler | Thermo Fisher | A24811 | |
| Odyssey Fc | LI-COR Inc | ||
| ViiA7 Real Time PCR System | Thermo Fisher | 4453536 | |
| PCRマイクロプレート | Corning | 321-29-051 | |
| KAPA SYBR Fast Universal qPCR Kit | KAPA Biosystems | KK4602 | |
| Starting Block (PBS) Blocking Buffer | Thermo Fisher | 37538 | BSAベースのブロッキングバッファー |
| Agarose General Purpose LE | Genesee Scientific | 20-102 | |
| 10x Tris/Glycine/SDS Buffer | Bio-Rad Laboratories Inc | 161-0732 | ランニングバッファー |
| 10x Tris/Glycine Buffer | Bio-Rad Laboratories Inc | 161-0734 | Transfer buffer |
| RIPA Buffer | Sigma Life Sciences | SLBG8489 | |
| Amersham Protran 0.45 μm ニトロセルロース | GE Healthcare Lifesciences | 10600012 | |
| Quick-RNA MiniPrep Kit | Genesee Scientific | 11-358 | |
| Laemmli Sample Buffer (4X) | Bio-Rad Laboratories Inc | 1610747 | |
| Mini Trans-Blot Cell | Bio-Rad Laboratories Inc | 1703930 | |
| Mini-Protean Tetra Cell | Bio-Rad Laboratories Inc | 1658005EDU | |
| DPBS | Life Technologies | 14190-144 | |
| 0.05% Trypsin-EDTA | Life Technologies | 11995-065 | |
| DMEM | Life Technologies | 11995-065 | |
| Lipofectamine RNAi Max | Thermo Fisher | 13778150 | |
| Lipofectamine 2000 Ragents | Thermo Fisher | 11668019 | |
| Penicillin Streptomycin | Life technologies | 15140-122 | |
| miRVana miRNA mimic negative control #1 | Thermo Fisher | 4464058 | neg miRNA |
| has-miR-200 mirVana miRNA mimic | Thermo Fisher | 4464066 | miR200A |
| has-miR-200 mirVana miRNA mimic | Thermo Fisher | 4404066 | miR200B |
| has-miR-200 mirVana miRNA mimic | Thermo Fisher | 4404066 | miR200C |
| Opti-MEM | Life technologies | 11088-021 | 無血清培地 |
| 抗エカドヘリン抗体 | BD Bioscience | 610182 | |
| 抗βアクチン | Santa Cruz Biotechnology | sc-69879 | |
| anti-EpCam | Ab Serotec | MCA18706 | |
| anti-ZO1 | Invitrogen | 402200 | |
| IRDye 800W | LI-COR Inc | 925-32210 | |
| IRDye 680 | LI-COR Inc | 926-32223 | |
| 抗マウス AlexaFluor 647 | Thermo Fisher | A211241 | |
| 抗ウサギ AlexaFluor 647 | Thermo Fisher | ab150075 | |
| Halt Protease and Phosphatesse Inhibitor | Thermo Fisher | 1861281 | |
| Precision Plus Protein Dual Color | Bio-Rad(株)ラボラトリ | 161-0374 | |
| パルテックセルトリクス | シスメックス | 04-004-2326 | 30 &m 流れ用フィルター |
| GAPDH-F | IDT | AGCCACATCGCTCAGACAC | |
| GAPDH-R | IDT | GCCCAATACGACCAAATCC | |
| エカドヘリン-F | IDT | TGGAGGAATTCTTGCTTTGC | |
| エカドヘリン-R | IDT | CGCTCTCCTCCGAAGAAAC | |
| ZEB1-F | IDT | GCATACAGAACCCAACTTGAACGTC | |
| ZEB1-R | IDT | CGATTACカガガクトGC | |
| NOTCH-F | IDT | GGCAATCCGAGGACTATGAG | |
| NOTCH-R | IDT | CTCAGAACGCACTCGTTGAT | |
| ニトロブルーテトラゾリウム | シグマ | N5514 | |
| 臭化ヘキサジメトリン | シグマ | H9268 | ポリブレン |
| 3 mL シリンジ | BD バイオサイエンス | 309657シリン | |
| フィルター | VWR | 28145-505 | |
| 5mL ポリプロピレン丸底チューブ | 352063 | フローサイトメトリーチューブ | |
| 大容量 cDNA 逆転写キット | サーモフィッシャー | 4368814 | 逆転写キット |
| 4% パラホルムアルジヒド | サンタクルス バイオテクノロジー | sc-281612 | |
| Triton-X100 | Sigma | 93443 | |
| ウシ血清アルブミン | ΣA7906 |
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An erratum was issued for: Induction of Mesenchymal-Epithelial Transitions in Sarcoma Cells. An author name was updated.
One of the authors' names was corrected from:
Shenghan Xu
to:
Shengnan Xu