CRISPR/Cas9は、非モデル生物の遺伝子機能を特徴付けるためにますます使用されています。このプロトコルは、注射ミックスの調製から蚊の胚の取得と注入に、および必要な突然変異のために注入された蚊とその子孫を飼育、横断、およびスクリーニングする方法に 、Culex pipiensのノックアウトラインを生成する方法を記述します。
方法論記事
CRISPR/Cas9は、非モデル生物の遺伝子機能を特徴付けるためにますます使用されています。このプロトコルは、注射ミックスの調製から蚊の胚の取得と注入に、および必要な突然変異のために注入された蚊とその子孫を飼育、横断、およびスクリーニングする方法に 、Culex pipiensのノックアウトラインを生成する方法を記述します。
Culex蚊は、西ナイルウイルスやイヌの心臓虫やゾウガシスなどのフィラリア線虫によって引き起こされる病気を含む人間と動物の健康に悪影響を及ぼすいくつかの疾患の主要なベクターです。最近では、CRISPR/Cas9ゲノム編集は、アノフェレス属に属する蚊を含むいくつかの昆虫種の新たに敷設された胚にガイドRNA(gRNA)と複合体化されたCas9タンパク質を注入することによって、部位指向の突然変異を誘導するために使用されている。Culex蚊の操作と注入は、これらの蚊が他の種の蚊のように個別に卵をいかだに置くのではなく、いかだで直立させるので、少し難しいです。ここでは、gRNAを設計し、Cas9タンパク質とそれらを複雑にする方法、卵を産むためにCulexピピエンの雌の蚊を誘導する方法、およびCas9 / gRNAを用いたマイクロインジェクションのために新しく産卵した胚を調製して注入する方法について説明します。また、必要な突然変異のために注入された蚊を飼育およびスクリーニングする方法についても説明する。代表的な結果は、この技術がCulex蚊のゲノムに部位指向突然変異を誘導するために使用され、わずかな改変を伴って、他の蚊種でもヌル突然変異体を生成するために使用できることを示している。
Culex蚊は、世界の温帯および熱帯地域全体に分布し、西ナイルウイルス1、セントルイス脳炎2だけでなく、イヌ心虫3および象の毛虫症を引き起こすフィラリア線虫を含むいくつかの致命的なウイルスを伝播する。Cx.クインケファシアトゥス、Cx.ピピエンスピピエンス、Cx.ピピエンス痴漢を含むCulex pipiens複合体のメンバーは、彼らの生物学の多くの側面で顕著なバリエーションを示しています。例えば、Cx.quinquefasciatusおよびCx.ピピエンス痴漢は越冬休眠5、6、Cx.ピピエンスピピエンは堅牢な季節応答を表示し、短い日7、8に応答してジアポーズに入ることができない。さらに、Cx.ピピエンス痴漢はより人類愛的である傾向があり、Cx.ピピエンとCx.キンケファシアトゥスはより動物性の6です。しかし、米国および世界の他の多くの場所で、これらの種は、Cx.ピピエンスピピエンとCx.ピピエンス痴漢のハイブリッドとして病気の伝染に強い影響を与える交雑種は日和見フィーダーであり、鳥と人間の両方を噛み、それによって西ナイルウイルスの橋梁ベクトルとして機能します。Culex蚊の生物学のこれらの側面やその他の魅力的な側面を研究することは、Culex蚊が静止と乾燥耐性卵10を生成するAedes蚊よりも実験室で飼育するのがわずかに難しく、機能的な分子ツールがCulex種のために十分に開発されていないため、部分的に妨げられております。
CRISPR/Cas9ゲノム編集は、南部の家の蚊、カレックスキンケファシアトゥス14、15、16を含むいくつかの重要な蚊種11、12、13の生物学を評価するために使用されている強力な技術です。ジェニファー・ダウドナとエマニュエル・シャルパンティエによって開発されたこの技術は、細菌由来のCRISPR関連エンドヌクレアーゼ(Casタンパク質、ファン・デル・ウーストらによるレビューを参照)によってウイルスに対する自然な細菌防御を利用しています。動物の胚に注入されると、Cas9タンパク質と適切なガイドRNAを組み合わせて、ゲノム内で二本鎖破断を生じさせることができる。これは、エンドヌクレアーゼ活性をゲノムの特定の領域に導くガイドRNAと複合体化されたCas9タンパク質を使用することによって最も頻繁に行われます。Cas9タンパク質が部位特異的な二本鎖破断を作成した後、細胞機械は2つのメカニズムのいずれかを使用して破断を修復しようとします。1つ目は、非相同の端結合(NHEJ)を通じて2つの端を結び付ける必要があり、これはエラーが起こりやすいため、ゲノムにアウトフレーム挿入および欠失を生じさせ、非機能的なタンパク質を引き起こし、ノックアウト突然変異を生じさせる。あるいは、細胞機械は、正しく破断を修復するために類似した配列を見つけることによって相同性指向の修復(HDR)を使用するかもしれません。同様の配列は、生物内の第2染色体によって提供され得る(レビュー18を参照)。しかし、修復された配列が元の配列と正確に一致する場合、Cas9タンパク質は再びDNAを切断することができます。あるいは、標的配列の切断部位の両側に相同配列を含むドナープラスミドを、代替修復配列(蛍光マーカータンパク質、元遺伝子の改変版、またはその他の改変)を含み、ゲノムにコピーして挿入したり、「ノックイン」したりすることもできます。
胚を注入する際にはタイミングが重要であり、CRISPR/Cas9ゲノム編集を使用して昆虫の突然変異を作り出す場合は特にそうです。これは、Cas9タンパク質とgRNAは、胚が間合状態にある場合、細胞膜が形成される前、および胚内で複数の核がアクセス可能である場合にのみ突然変異を生成する最大の能力を有するためである。蚊の場合、原子核は、温度19に応じて、卵子から〜2〜4時間後に周囲に到達するため、この時間までにマイクロインジェクションが成功する必要があります。さらに、Cas9タンパク質は、注射に起因する個体が細胞のモザイクを含み、所望の突然変異を有する個体が含まれるなど、アクセス可能な核DNAを切断する。これらの突然変異を正常に継承するためには、Cas9タンパク質は、将来の卵子と精子を生み出す生殖細胞系列に存在するDNAを切断する必要があります。生殖細胞系列に突然変異が発生することを確実にするためには、昆虫生殖細胞系の前駆体である胚内の極細胞の位置に近い全ての物質を注入するのが最善である。極細胞は 、Culex 胚20の後端付近に位置する。胚を注入することに加えて、所望の突然変異を検出するためには、子孫の交育とスクリーニングのための慎重な計画を策定することが不可欠である。
このプロトコルは、gRNAを生成し、注射ミックスを準備するためにCas9タンパク質でそれらを複雑にする方法だけでなく、卵を産むためにCulexピピエンのメスの蚊を誘導する方法とCRISPR / Cas9媒介ゲノム編集のためにそれらの卵を準備し、注入する方法を説明します。さらに、注射された胚の後部、横断、スクリーニングの方法とその子孫を説明し、所望の突然変異が得られたことを確認する。このプロトコルを使用して、私たちは、カレックスピピエンのバックアイ株で、関心のある遺伝子、サイクル、ヌル突然変異を生成しました。この株はもともとオハイオ州コロンバスのフィールド収集蚊から2013年に設立され、Meutiラボによって維持されています。このプロトコルは、Culex蚊および他の蚊種におけるCRISPR/Cas9ゲノム編集を必要とする追加の研究に使用することができ、より一般的には、任意の昆虫種にCRISPR / Cas9ゲノム編集を採用することに関連しています。
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ほとんどの研究機関では、遺伝子組み換え生物が脱出したり実験室施設から取り除かれたりしないように、トランスジェニック昆虫が生成または維持される前に、承認されたバイオセーフティプロトコルを実施する必要があります。追加の政府規制も適用される可能性があります。この種のプロジェクトを開始する前に、すべての機関の方針と手順を確認して、必要な書類と承認を決定してください。
1. gRNAの設計と注入ミックスの準備
2. 針を引っ張り、ベベルする
注意:胚の正常な注射と生存には鋭い針が必要です(図1)。
3. 親の蚊の世代に血液を与える
4. 成虫の蚊に産卵を誘発する
5. 生きた てのキュレックス エッグをマイクロ操作する
6. キュレックス 胚の注入
7. 注入胚(F0)を成人期に飼育し、十字架を設定する
8.F1 蚊の入手と飼育と変異のスクリーニング
9.F2 およびF3 蚊の入手と飼育と変異のスクリーニング
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記載されたプロトコルを用いて、Cx.pipiensの胚を正常に注入することができ、注入された胚の間で高い生存率を観察した(〜55%、図1)。以前の試験では、卵胞の前部が医療ドレッシングストリップに取り付けられ、蚊の幼虫が絨毛膜から脱出するのを防ぎ、水に泳ぐことに成功したため、生存率が低かった。前端が医療用ドレッシングのストリップを超えて延びることを保証することは幼虫生存率を大幅に増加させ、そして成人期に発達し再生することができる高品質の子孫をもたらす(図2B)。
その後の実験とスクリーニングは、概日時計遺伝子周期(cyc;KM355981)は、注入された胚の生殖系列にした(図3)。私たちのプライマーがカットサイトの近くでcyc遺伝子の大きな領域を増幅したことを考えると、ヘテロ接合の2つの別々のバンド、F1蚊を観察...
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このプロトコルは 、Culex 蚊のゲノムに特定の突然変異を導入する方法を提示し、他の蚊のゲノムを編集するためにも使用することができます。このプロトコルは、注射材料を準備する方法だけでなく、蚊に卵を産む方法の詳細なビデオ概要、ならびにそれらの卵を準備して注入する方法の詳細なビデオ概要を提供するという点で重要です。また、メスの Cx.ピピエン の生物学を利用して個々のいかだに卵を産み、それによって各女性から所望の突然変異に対する子孫の割合を小さくスクリーニングする方法についても要約する。ここで示す方法は Cx.pipiens 用に最適化されていますが、小さな調整で他の蚊や昆虫のゲノムを編集するように適応することができます。さらに、ここで説明するマイクロマニピュレーションおよびマイクロインジェクションプロトコルは、トランスポゾン、dsRNAまたはTALENまたはジンクフィンガーヌクレアーゼなどの他のエンドヌクレアーゼを含む昆虫胚にいくつかの異なる材料を注入するのに適しています。さらに、ベベルプロトコルは可変的な開口サイズのマイクロ注入の針を生成し、広範囲の注入材料を注入するために使用する...
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RHは昆虫の遺伝子組み換えでサービスを提供する昆虫変換施設で働いています。
私たちは、デビッド・オブロフタ博士と昆虫遺伝技術調整研究ネットワークのすべてのメンバーに、彼らが遺伝技術の実施に関して私たちや他の人々に提供する助けと訓練に感謝します。我々は特に 、Culex 胚を注入し、孵化できるようにマイクロマニピュレーションプロトコルを最適化してくれたチャンナ・アルヴィヘアに感謝する。また、ムーティラボで働く学部生のデバンテ・シモンズとジョセフ・ウルソは、トランスジェニック蚊の世話とスクリーニングを支援し、ITFのゾラ・エルムカに対して、蚊の注射の飼育と準備を支援してくれたことに感謝します。この研究は、MEMに提供されたOSUの感染症研究所からの学際的種子助成金によって支えられた。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 人工膜フィーダー | Hemotek | SP5W1-3 | 会社所在地:英国ブラックバーン |
| ATP | Invitrogen | 18330019 | 会社所在地:米国カリフォルニア州カールスバッド |
| ホウケイ酸ガラス ミロカピラリーチューブ、外径1 mm | World Precision Instruments | 1B100-6 | 会社所在地:米国フロリダ州サラソタ |
| BV10 ニードルベベラー | サッター機器 | BV-10-B | 会社所在地:米国カリフォルニア州ノバト |
| Whatman 円形濾紙(12.5 cm) | Sigma Aldrich | WHA1001125 | 会社所在地:米国ミズーリ州セントルイス |
| コニカルチューブ(50 mL) | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 339652 | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| 流量のフィッシャーブランドコース濾紙 | モフィッシャーサイエンティフィック | 09-800 | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| カバーガラス(24 x 40 mm) | Thermo Fisher Scientific | 50-311-20 | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| タルダム | Henry Schein Inc | 1010171 | 会社所在地:米国ニューヨーク州メルビル |
| スコッチ両面テープ | サーモフィッシャーサイエンティフィック | NC0879005 | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| FemtoJet 4iマイクロインジェクター | ッペンドルフ | 5252000021 | 会社所在地: ドイツ、ハンブルク |
| ガラスバイアル (2 dram) | Thermo Fisher Scientific | 033401C | 会社所在地: 米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| ハロカーボンオイル | Sigma Aldrich | H8898-50ML | 会社所在地: 米国ミズーリ州セントルイス |
| P-2000 レーザーニードルプーラー | サッター機器 | P-2000/G | 会社所在地: 米国カリフォルニア州ノバト |
| パラフィルム | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 50-998-944 | 会社の所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| PC-100加重ニードルプーラー | ナリシゲ | PC-100 | これは、製造中止になった以前のPC-10モデルと互換性があります。会社所在地:米国ニューヨーク州アミティビル |
| Phire Direct PCR Kit | Thermo Fisher Scientific | F140WH | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| Kodak Photo-Flo (1%) | Thermo Fisher Scientific | 50-268-05 | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| 石英ガラスミロカピラリーチューブ、外径1 mm | ピラリーチューブサプライズ | Limited QGCT 1.0 | 会社所在地:英国 |
| コーンウォールガイド-it™sgRNAスクリーニングキット | Takara, Bio USA | 632639 | このキットでは、gRNAがin vitroでDNA配列を切断するかどうかを判断できます。会社の所在地:米国カリフォルニア州マウンテンビュー |
| Sigmacote | Sigma Aldrich | SL2-100ML | 会社の所在地:米国ミズーリ州セントルイス |
| 小型ペトリ皿(35X10 mm) | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 50-190-0273 | 会社の所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| エン酸ナトリウム鶏の血 | Lampire 生物製剤 | 7201406 | 会社の所在地:米国ペンシルベニア州エベレット |
| フィッシャーブランドスクエアペトリ皿(10 cm x10 cm) | サーモフィッシャーサイエンティフィック | FB0875711A | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| テガダーム | リーシャイン社 | 7771180 | 会社所在地:米国ニューヨーク州メルビル |
| 熱帯魚食品 | テトラミン | N/A | |
| Whatman濾紙 | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 09-927-826 | 会社所在地:米国マサチューセッツ州ウォルサム |
| Whatman濾紙、4.25cm | シグマ・アルドリッチ | 1001-042 | 会社所在地:米国ミズーリ州セントルイス |
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